MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_004113	GGCGCC	2	12	866979	866990	0 %	0 %	50 %	50 %	22298388
14502	NC_004113	CTGG	2	8	867245	867252	0 %	25 %	50 %	25 %	22298388
14503	NC_004113	CCG	2	6	867355	867360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298388
14504	NC_004113	CTGA	2	8	867567	867574	25 %	25 %	25 %	25 %	22298389
14505	NC_004113	CCTTA	2	10	867863	867872	20 %	40 %	0 %	40 %	22298389
14506	NC_004113	CGG	4	12	867882	867893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298389
14507	NC_004113	TCC	2	6	867916	867921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298389
14508	NC_004113	ATC	2	6	868027	868032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298390
14509	NC_004113	GT	3	6	868086	868091	0 %	50 %	50 %	0 %	22298390
14510	NC_004113	ATG	2	6	868382	868387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298390
14511	NC_004113	CGG	2	6	868388	868393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298390
14512	NC_004113	ATG	2	6	868484	868489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298390
14513	NC_004113	TGG	2	6	868494	868499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298390
14514	NC_004113	TGG	2	6	868530	868535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298390
14515	NC_004113	GTT	2	6	868565	868570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298390
14516	NC_004113	GAG	2	6	868600	868605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298390
14517	NC_004113	TAA	2	6	868670	868675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298390
14518	NC_004113	TCA	2	6	868676	868681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298390
14519	NC_004113	ATC	2	6	868697	868702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298390
14520	NC_004113	TGCC	2	8	868923	868930	0 %	25 %	25 %	50 %	22298391
14521	NC_004113	AAG	2	6	868973	868978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298391
14522	NC_004113	GCGA	2	8	869011	869018	25 %	0 %	50 %	25 %	22298391
14523	NC_004113	CCT	2	6	869028	869033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298391
14524	NC_004113	CCAAG	2	10	869053	869062	40 %	0 %	20 %	40 %	22298391
14525	NC_004113	CAG	2	6	869068	869073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298391
14526	NC_004113	CAAAA	2	10	869082	869091	80 %	0 %	0 %	20 %	22298391
14527	NC_004113	A	6	6	869126	869131	100 %	0 %	0 %	0 %	22298391
14528	NC_004113	TTG	2	6	869339	869344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298392
14529	NC_004113	AGCA	2	8	869345	869352	50 %	0 %	25 %	25 %	22298392
14530	NC_004113	GCAA	2	8	869498	869505	50 %	0 %	25 %	25 %	22298392
14531	NC_004113	TCA	2	6	869507	869512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298392
14532	NC_004113	GAA	2	6	869521	869526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298392
14533	NC_004113	GCC	2	6	869557	869562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298392
14534	NC_004113	TGC	2	6	869604	869609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298392
14535	NC_004113	GCC	2	6	869628	869633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298392
14536	NC_004113	CCA	2	6	869642	869647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298392
14537	NC_004113	CAGCGG	2	12	869668	869679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	22298392
14538	NC_004113	AAG	2	6	869684	869689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298392
14539	NC_004113	TC	3	6	869818	869823	0 %	50 %	0 %	50 %	22298392
14540	NC_004113	ACC	2	6	869895	869900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298393
14541	NC_004113	TC	3	6	869927	869932	0 %	50 %	0 %	50 %	22298393
14542	NC_004113	G	6	6	869999	870004	0 %	0 %	100 %	0 %	22298393
14543	NC_004113	T	7	7	870036	870042	0 %	100 %	0 %	0 %	22298393
14544	NC_004113	ACA	2	6	870065	870070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298393
14545	NC_004113	TCG	2	6	870098	870103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298393
14546	NC_004113	GGC	2	6	870116	870121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298393
14547	NC_004113	AGA	2	6	870122	870127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298393
14548	NC_004113	AGC	2	6	870149	870154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298393
14549	NC_004113	ACGG	2	8	870277	870284	25 %	0 %	50 %	25 %	22298393
14550	NC_004113	TTGG	2	8	870383	870390	0 %	50 %	50 %	0 %	22298393
14551	NC_004113	GTG	2	6	870438	870443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298393
14552	NC_004113	G	6	6	870464	870469	0 %	0 %	100 %	0 %	22298393
14553	NC_004113	ATG	2	6	870499	870504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298393
14554	NC_004113	GGC	2	6	870530	870535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298393
14555	NC_004113	GCC	2	6	870691	870696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298393
14556	NC_004113	GAT	2	6	870726	870731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298393
14557	NC_004113	G	6	6	870770	870775	0 %	0 %	100 %	0 %	22298393
14558	NC_004113	TGG	2	6	870835	870840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298393
14559	NC_004113	ATT	3	9	870855	870863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298393
14560	NC_004113	GCAG	2	8	870869	870876	25 %	0 %	50 %	25 %	22298393
14561	NC_004113	GCA	2	6	870929	870934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298393
14562	NC_004113	GGC	2	6	870998	871003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298393
14563	NC_004113	AGCT	2	8	871007	871014	25 %	25 %	25 %	25 %	22298393
14564	NC_004113	CTG	2	6	871020	871025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298393
14565	NC_004113	AGG	2	6	871030	871035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298393
14566	NC_004113	GAG	2	6	871164	871169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298393
14567	NC_004113	CGG	3	9	871177	871185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298393
14568	NC_004113	CGG	2	6	871312	871317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298393
14569	NC_004113	TGG	2	6	871333	871338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298393
14570	NC_004113	CCT	2	6	871399	871404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298393
14571	NC_004113	CCT	2	6	871477	871482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298393
14572	NC_004113	CTG	2	6	871614	871619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298394
14573	NC_004113	GTT	2	6	871637	871642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298394
14574	NC_004113	T	6	6	871641	871646	0 %	100 %	0 %	0 %	22298394
14575	NC_004113	GGC	2	6	871698	871703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298394
14576	NC_004113	CCT	2	6	871747	871752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298394
14577	NC_004113	CATGG	2	10	871808	871817	20 %	20 %	40 %	20 %	22298394
14578	NC_004113	GTC	2	6	871820	871825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298394
14579	NC_004113	ACT	2	6	871851	871856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298394
14580	NC_004113	CGG	2	6	871882	871887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298394
14581	NC_004113	CCACC	2	10	871912	871921	20 %	0 %	0 %	80 %	22298394
14582	NC_004113	GTT	2	6	871937	871942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298394
14583	NC_004113	TGC	2	6	872013	872018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298394
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14586	NC_004113	TGCC	2	8	872205	872212	0 %	25 %	25 %	50 %	22298394
14587	NC_004113	GCG	2	6	872358	872363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298395
14588	NC_004113	CCT	2	6	872439	872444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298395
14589	NC_004113	TGG	2	6	872501	872506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298395
14590	NC_004113	CTG	2	6	872578	872583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298395
14591	NC_004113	GAT	2	6	872619	872624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298395
14592	NC_004113	TAC	2	6	872634	872639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298395
14593	NC_004113	CCA	2	6	872712	872717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298395
14594	NC_004113	A	6	6	872744	872749	100 %	0 %	0 %	0 %	22298395
14595	NC_004113	GCT	2	6	872757	872762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298395
14596	NC_004113	CTG	2	6	872776	872781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298395
14597	NC_004113	G	6	6	872805	872810	0 %	0 %	100 %	0 %	22298395
14598	NC_004113	GCT	2	6	872879	872884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298396
14599	NC_004113	TTC	2	6	872904	872909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298396
14600	NC_004113	CTC	4	12	873009	873020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298396
14601	NC_004113	GAC	2	6	873041	873046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298396
14602	NC_004113	GCC	2	6	873050	873055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298396
14603	NC_004113	GCTGCG	2	12	873087	873098	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	22298396
14604	NC_004113	G	7	7	873101	873107	0 %	0 %	100 %	0 %	22298396
14605	NC_004113	TCG	2	6	873178	873183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298396
14606	NC_004113	AGG	2	6	873192	873197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298396
14607	NC_004113	AAATC	2	10	873368	873377	60 %	20 %	0 %	20 %	22298396
14608	NC_004113	ATCA	2	8	873459	873466	50 %	25 %	0 %	25 %	22298396
14609	NC_004113	CAT	3	9	873503	873511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298396
14610	NC_004113	GAA	2	6	873557	873562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298396
14611	NC_004113	CCA	2	6	873608	873613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298396
14612	NC_004113	GCA	2	6	873713	873718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298396
14613	NC_004113	GCG	2	6	873775	873780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298396
14614	NC_004113	GAC	2	6	873963	873968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298397
14615	NC_004113	GCC	2	6	873997	874002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298397
14616	NC_004113	TGA	2	6	874022	874027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298397
14617	NC_004113	AAG	2	6	874045	874050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298397
14618	NC_004113	GCA	2	6	874103	874108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298397
14619	NC_004113	AC	3	6	874128	874133	50 %	0 %	0 %	50 %	22298397
14620	NC_004113	T	6	6	874232	874237	0 %	100 %	0 %	0 %	22298397
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14622	NC_004113	GCC	2	6	874261	874266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298397
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14853	NC_004113	TGA	2	6	888814	888819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298415
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14984	NC_004113	TGC	2	6	896272	896277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298422
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14987	NC_004113	TGAT	2	8	896409	896416	25 %	50 %	25 %	0 %	22298422
14988	NC_004113	A	6	6	896418	896423	100 %	0 %	0 %	0 %	22298422
14989	NC_004113	AG	3	6	896465	896470	50 %	0 %	50 %	0 %	22298422
14990	NC_004113	CAC	2	6	896598	896603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298422
14991	NC_004113	GAT	2	6	896760	896765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298423
14992	NC_004113	TCG	2	6	896773	896778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298423
14993	NC_004113	CAT	2	6	896963	896968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298423
14994	NC_004113	CAC	2	6	896976	896981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298423
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14999	NC_004113	CTC	2	6	897280	897285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298424
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