MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_004113	CGA	2	6	837493	837498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298351
14002	NC_004113	GTG	2	6	837502	837507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298351
14003	NC_004113	AGG	2	6	837544	837549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298351
14004	NC_004113	CAA	2	6	837657	837662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298351
14005	NC_004113	ATCG	2	8	837708	837715	25 %	25 %	25 %	25 %	22298351
14006	NC_004113	AGA	2	6	837737	837742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298351
14007	NC_004113	C	6	6	837876	837881	0 %	0 %	0 %	100 %	22298352
14008	NC_004113	TAAA	2	8	837948	837955	75 %	25 %	0 %	0 %	22298352
14009	NC_004113	TGC	2	6	837999	838004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298352
14010	NC_004113	CGT	2	6	838005	838010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298352
14011	NC_004113	GCT	2	6	838057	838062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298352
14012	NC_004113	CGA	2	6	838072	838077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298352
14013	NC_004113	GGT	2	6	838092	838097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298352
14014	NC_004113	C	8	8	838179	838186	0 %	0 %	0 %	100 %	22298352
14015	NC_004113	GA	3	6	838227	838232	50 %	0 %	50 %	0 %	22298352
14016	NC_004113	CTG	2	6	838298	838303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298352
14017	NC_004113	TTG	2	6	838332	838337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298352
14018	NC_004113	TCG	2	6	838401	838406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298352
14019	NC_004113	GCCT	2	8	838415	838422	0 %	25 %	25 %	50 %	22298352
14020	NC_004113	GTT	2	6	838550	838555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298352
14021	NC_004113	ATC	2	6	838557	838562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298352
14022	NC_004113	CAT	2	6	838606	838611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298352
14023	NC_004113	CCA	2	6	838636	838641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298352
14024	NC_004113	GCG	2	6	838655	838660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298352
14025	NC_004113	GCA	2	6	838810	838815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298352
14026	NC_004113	CAA	2	6	838834	838839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298352
14027	NC_004113	TCCCGT	2	12	839019	839030	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22298352
14028	NC_004113	GGCA	2	8	839051	839058	25 %	0 %	50 %	25 %	22298352
14029	NC_004113	A	6	6	839082	839087	100 %	0 %	0 %	0 %	22298352
14030	NC_004113	GCA	2	6	839149	839154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298352
14031	NC_004113	TGG	2	6	839191	839196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298352
14032	NC_004113	CGG	2	6	839461	839466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298352
14033	NC_004113	CCAAGG	2	12	839511	839522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298352
14034	NC_004113	CAG	2	6	839537	839542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298352
14035	NC_004113	CCA	2	6	839561	839566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298352
14036	NC_004113	GCC	2	6	839575	839580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298353
14037	NC_004113	C	6	6	839612	839617	0 %	0 %	0 %	100 %	22298353
14038	NC_004113	GTT	2	6	839627	839632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298353
14039	NC_004113	GAG	2	6	839745	839750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298353
14040	NC_004113	ATGA	2	8	839761	839768	50 %	25 %	25 %	0 %	22298353
14041	NC_004113	CAG	2	6	839781	839786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298353
14042	NC_004113	GCC	2	6	839887	839892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298354
14043	NC_004113	ATC	2	6	839900	839905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298354
14044	NC_004113	GAC	2	6	839971	839976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298354
14045	NC_004113	TCA	2	6	840008	840013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298354
14046	NC_004113	CCA	2	6	840024	840029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298354
14047	NC_004113	CTT	3	9	840093	840101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298354
14048	NC_004113	CAA	2	6	840358	840363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298355
14049	NC_004113	CTT	2	6	840425	840430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298355
14050	NC_004113	GCC	2	6	840435	840440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298355
14051	NC_004113	GGC	2	6	840535	840540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298356
14052	NC_004113	TGC	3	9	840576	840584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298356
14053	NC_004113	AAT	2	6	840599	840604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298356
14054	NC_004113	GAT	2	6	840634	840639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298356
14055	NC_004113	ATC	2	6	840687	840692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298356
14056	NC_004113	CAA	2	6	840721	840726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298356
14057	NC_004113	CTTG	2	8	840727	840734	0 %	50 %	25 %	25 %	22298356
14058	NC_004113	GCC	2	6	840851	840856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298356
14059	NC_004113	AAG	2	6	840881	840886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298356
14060	NC_004113	ACT	2	6	840992	840997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298357
14061	NC_004113	AG	3	6	841104	841109	50 %	0 %	50 %	0 %	22298357
14062	NC_004113	GAA	2	6	841237	841242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298357
14063	NC_004113	GCAAA	2	10	841249	841258	60 %	0 %	20 %	20 %	22298357
14064	NC_004113	CAA	2	6	841261	841266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298357
14065	NC_004113	GGT	2	6	841293	841298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298357
14066	NC_004113	TGG	2	6	841376	841381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298357
14067	NC_004113	TTG	2	6	841560	841565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298358
14068	NC_004113	GGC	2	6	841588	841593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298358
14069	NC_004113	GTG	2	6	841598	841603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298358
14070	NC_004113	GGC	2	6	841633	841638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298358
14071	NC_004113	TGG	2	6	841677	841682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298358
14072	NC_004113	CTC	2	6	841826	841831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298358
14073	NC_004113	ATCAG	2	10	841914	841923	40 %	20 %	20 %	20 %	22298358
14074	NC_004113	C	6	6	841934	841939	0 %	0 %	0 %	100 %	22298358
14075	NC_004113	ACC	2	6	842015	842020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298358
14076	NC_004113	CGA	2	6	842057	842062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298358
14077	NC_004113	GCG	2	6	842165	842170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298358
14078	NC_004113	CTG	2	6	842174	842179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298358
14079	NC_004113	CGG	2	6	842205	842210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298358
14080	NC_004113	CGT	2	6	842215	842220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298358
14081	NC_004113	GCC	2	6	842283	842288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298358
14082	NC_004113	ACAGG	2	10	842324	842333	40 %	0 %	40 %	20 %	22298358
14083	NC_004113	TAA	2	6	842379	842384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298358
14084	NC_004113	CTG	2	6	842390	842395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298358
14085	NC_004113	CCA	2	6	842428	842433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298358
14086	NC_004113	TGC	2	6	842460	842465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298358
14087	NC_004113	GTG	2	6	842481	842486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298358
14088	NC_004113	C	6	6	842529	842534	0 %	0 %	0 %	100 %	22298358
14089	NC_004113	GTG	2	6	842553	842558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298358
14090	NC_004113	CTG	2	6	842631	842636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298358
14091	NC_004113	TGAT	2	8	842673	842680	25 %	50 %	25 %	0 %	22298358
14092	NC_004113	GC	4	8	842681	842688	0 %	0 %	50 %	50 %	22298358
14093	NC_004113	CAA	2	6	842726	842731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298358
14094	NC_004113	ATCT	2	8	842753	842760	25 %	50 %	0 %	25 %	22298358
14095	NC_004113	CG	3	6	842805	842810	0 %	0 %	50 %	50 %	22298358
14096	NC_004113	GTCA	2	8	842840	842847	25 %	25 %	25 %	25 %	22298358
14097	NC_004113	GCG	3	9	842848	842856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298358
14098	NC_004113	TCCTG	2	10	842888	842897	0 %	40 %	20 %	40 %	22298358
14099	NC_004113	GTT	2	6	842957	842962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298358
14100	NC_004113	CATTGC	2	12	842998	843009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22298358
14101	NC_004113	GGC	2	6	843080	843085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298358
14102	NC_004113	T	6	6	843089	843094	0 %	100 %	0 %	0 %	22298358
14103	NC_004113	TGT	2	6	843115	843120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298358
14104	NC_004113	CAA	2	6	843124	843129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298358
14105	NC_004113	ACCCCT	2	12	843223	843234	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	22298358
14106	NC_004113	GCT	2	6	843292	843297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298359
14107	NC_004113	CAAC	2	8	843329	843336	50 %	0 %	0 %	50 %	22298359
14108	NC_004113	C	6	6	843363	843368	0 %	0 %	0 %	100 %	22298359
14109	NC_004113	GCA	2	6	843370	843375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298359
14110	NC_004113	AGC	2	6	843431	843436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298359
14111	NC_004113	ATA	2	6	843443	843448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298359
14112	NC_004113	CTG	2	6	843826	843831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298360
14113	NC_004113	AAC	2	6	843850	843855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298360
14114	NC_004113	GGCT	2	8	844085	844092	0 %	25 %	50 %	25 %	22298360
14115	NC_004113	ATT	2	6	844104	844109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298360
14116	NC_004113	GAT	2	6	844185	844190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298360
14117	NC_004113	AAAG	2	8	844203	844210	75 %	0 %	25 %	0 %	22298360
14118	NC_004113	CAT	2	6	844229	844234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298360
14119	NC_004113	TGC	2	6	844282	844287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298360
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14121	NC_004113	TGTT	2	8	844389	844396	0 %	75 %	25 %	0 %	22298360
14122	NC_004113	CCT	2	6	844432	844437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298360
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14127	NC_004113	CTG	2	6	844623	844628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298360
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14130	NC_004113	TGCCC	2	10	844820	844829	0 %	20 %	20 %	60 %	22298360
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14227	NC_004113	A	6	6	849962	849967	100 %	0 %	0 %	0 %	22298366
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14237	NC_004113	CAAT	2	8	850995	851002	50 %	25 %	0 %	25 %	22298368
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14240	NC_004113	AG	3	6	851075	851080	50 %	0 %	50 %	0 %	22298368
14241	NC_004113	GCT	2	6	851218	851223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298368
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14485	NC_004113	TCC	2	6	865871	865876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485765
14486	NC_004113	GCC	2	6	865922	865927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161485765
14487	NC_004113	CTT	2	6	866094	866099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161485765
14488	NC_004113	TGT	2	6	866142	866147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485765
14489	NC_004113	TTG	2	6	866162	866167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485765
14490	NC_004113	GCT	2	6	866268	866273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485765
14491	NC_004113	AGC	2	6	866297	866302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161485765
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