MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_004113	GCG	2	6	808532	808537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298320
13502	NC_004113	GGT	2	6	808714	808719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298320
13503	NC_004113	T	6	6	808745	808750	0 %	100 %	0 %	0 %	22298320
13504	NC_004113	AAGC	2	8	808916	808923	50 %	0 %	25 %	25 %	22298320
13505	NC_004113	CCT	2	6	808968	808973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298321
13506	NC_004113	CCT	2	6	808977	808982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298321
13507	NC_004113	CCA	2	6	809028	809033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298321
13508	NC_004113	GTT	2	6	809079	809084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298321
13509	NC_004113	CAT	2	6	809087	809092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298321
13510	NC_004113	C	6	6	809194	809199	0 %	0 %	0 %	100 %	22298321
13511	NC_004113	G	6	6	809204	809209	0 %	0 %	100 %	0 %	22298321
13512	NC_004113	TCC	2	6	809213	809218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298321
13513	NC_004113	G	6	6	809327	809332	0 %	0 %	100 %	0 %	22298321
13514	NC_004113	G	6	6	809416	809421	0 %	0 %	100 %	0 %	22298321
13515	NC_004113	ACA	2	6	809460	809465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298321
13516	NC_004113	TGC	2	6	809558	809563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298322
13517	NC_004113	CAA	2	6	809604	809609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298322
13518	NC_004113	GC	3	6	809624	809629	0 %	0 %	50 %	50 %	22298322
13519	NC_004113	TCAGC	2	10	809724	809733	20 %	20 %	20 %	40 %	22298322
13520	NC_004113	TCA	3	9	809805	809813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298322
13521	NC_004113	CCG	3	9	810009	810017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298322
13522	NC_004113	GAT	2	6	810052	810057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298322
13523	NC_004113	CCA	2	6	810162	810167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298322
13524	NC_004113	GGC	2	6	810220	810225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298322
13525	NC_004113	CAT	2	6	810226	810231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298322
13526	NC_004113	TGG	2	6	810291	810296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298322
13527	NC_004113	ACA	2	6	810308	810313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298322
13528	NC_004113	C	6	6	810394	810399	0 %	0 %	0 %	100 %	22298322
13529	NC_004113	CCA	2	6	810432	810437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298322
13530	NC_004113	A	7	7	810451	810457	100 %	0 %	0 %	0 %	22298322
13531	NC_004113	G	6	6	810487	810492	0 %	0 %	100 %	0 %	22298322
13532	NC_004113	CGA	2	6	810587	810592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298322
13533	NC_004113	GGCAC	2	10	810608	810617	20 %	0 %	40 %	40 %	22298322
13534	NC_004113	GCT	2	6	810635	810640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298322
13535	NC_004113	CCTCA	2	10	810691	810700	20 %	20 %	0 %	60 %	22298322
13536	NC_004113	C	6	6	810716	810721	0 %	0 %	0 %	100 %	22298322
13537	NC_004113	GCG	2	6	810753	810758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298322
13538	NC_004113	CCA	2	6	810967	810972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298323
13539	NC_004113	CCA	2	6	810975	810980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298323
13540	NC_004113	AGC	2	6	811024	811029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298323
13541	NC_004113	AAC	2	6	811068	811073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298323
13542	NC_004113	TAG	2	6	811158	811163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298323
13543	NC_004113	CCCAAT	2	12	811268	811279	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	22298323
13544	NC_004113	AAT	2	6	811488	811493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298324
13545	NC_004113	TTCA	2	8	811519	811526	25 %	50 %	0 %	25 %	22298324
13546	NC_004113	CTG	2	6	811543	811548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298324
13547	NC_004113	GC	3	6	811616	811621	0 %	0 %	50 %	50 %	22298324
13548	NC_004113	CTG	2	6	811719	811724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298324
13549	NC_004113	CGG	2	6	811728	811733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298324
13550	NC_004113	GGT	2	6	811772	811777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298324
13551	NC_004113	AAC	2	6	811821	811826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298324
13552	NC_004113	CAAA	2	8	811851	811858	75 %	0 %	0 %	25 %	22298324
13553	NC_004113	CT	3	6	811967	811972	0 %	50 %	0 %	50 %	22298324
13554	NC_004113	TGGC	2	8	812048	812055	0 %	25 %	50 %	25 %	22298324
13555	NC_004113	TGAAG	2	10	812126	812135	40 %	20 %	40 %	0 %	22298324
13556	NC_004113	CAC	2	6	812201	812206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298324
13557	NC_004113	A	6	6	812350	812355	100 %	0 %	0 %	0 %	22298324
13558	NC_004113	ACA	2	6	812395	812400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298324
13559	NC_004113	C	6	6	812401	812406	0 %	0 %	0 %	100 %	22298324
13560	NC_004113	TGCGGC	2	12	812419	812430	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	22298324
13561	NC_004113	CTG	2	6	812577	812582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298324
13562	NC_004113	ACCA	2	8	812646	812653	50 %	0 %	0 %	50 %	22298324
13563	NC_004113	GCT	2	6	812657	812662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298324
13564	NC_004113	CG	3	6	812789	812794	0 %	0 %	50 %	50 %	22298324
13565	NC_004113	AGG	2	6	812914	812919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298324
13566	NC_004113	GCT	2	6	812996	813001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298324
13567	NC_004113	C	6	6	813012	813017	0 %	0 %	0 %	100 %	22298324
13568	NC_004113	AGA	2	6	813071	813076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298324
13569	NC_004113	GCA	2	6	813128	813133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298324
13570	NC_004113	CAA	2	6	813146	813151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298324
13571	NC_004113	CAA	2	6	813179	813184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298324
13572	NC_004113	GCA	2	6	813251	813256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298324
13573	NC_004113	CAT	2	6	813272	813277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298324
13574	NC_004113	ATTT	2	8	813332	813339	25 %	75 %	0 %	0 %	22298324
13575	NC_004113	TGG	2	6	813341	813346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298324
13576	NC_004113	GGC	2	6	813350	813355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298324
13577	NC_004113	GAT	2	6	813377	813382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298324
13578	NC_004113	GTG	2	6	813450	813455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298324
13579	NC_004113	ACT	2	6	813466	813471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298324
13580	NC_004113	TC	3	6	813509	813514	0 %	50 %	0 %	50 %	22298324
13581	NC_004113	CTT	2	6	813647	813652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298324
13582	NC_004113	TGA	2	6	813679	813684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298324
13583	NC_004113	TAC	2	6	813717	813722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298324
13584	NC_004113	AAG	2	6	813741	813746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298324
13585	NC_004113	ACT	2	6	813769	813774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298324
13586	NC_004113	AT	3	6	813836	813841	50 %	50 %	0 %	0 %	22298324
13587	NC_004113	CAA	2	6	813876	813881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298324
13588	NC_004113	GC	3	6	813942	813947	0 %	0 %	50 %	50 %	22298324
13589	NC_004113	CCTGTT	2	12	814011	814022	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22298324
13590	NC_004113	AATG	2	8	814136	814143	50 %	25 %	25 %	0 %	22298325
13591	NC_004113	GGC	2	6	814188	814193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298325
13592	NC_004113	TTG	2	6	814201	814206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298325
13593	NC_004113	TTGAC	2	10	814277	814286	20 %	40 %	20 %	20 %	22298325
13594	NC_004113	CGG	3	9	814381	814389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298325
13595	NC_004113	CTG	2	6	814399	814404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298325
13596	NC_004113	GCT	2	6	814410	814415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298325
13597	NC_004113	GCT	2	6	814686	814691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298325
13598	NC_004113	GGGT	2	8	814697	814704	0 %	25 %	75 %	0 %	22298325
13599	NC_004113	CCG	2	6	814753	814758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298325
13600	NC_004113	T	6	6	814794	814799	0 %	100 %	0 %	0 %	22298325
13601	NC_004113	ATT	2	6	814828	814833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298325
13602	NC_004113	ATG	2	6	814882	814887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298325
13603	NC_004113	GCA	2	6	814902	814907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298325
13604	NC_004113	G	6	6	814941	814946	0 %	0 %	100 %	0 %	22298325
13605	NC_004113	CCA	2	6	814961	814966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298325
13606	NC_004113	G	6	6	815034	815039	0 %	0 %	100 %	0 %	22298325
13607	NC_004113	TC	3	6	815058	815063	0 %	50 %	0 %	50 %	22298325
13608	NC_004113	TTTTG	2	10	815067	815076	0 %	80 %	20 %	0 %	22298325
13609	NC_004113	TGG	2	6	815105	815110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298325
13610	NC_004113	GCT	2	6	815152	815157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298325
13611	NC_004113	GCT	2	6	815214	815219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298325
13612	NC_004113	GGC	2	6	815253	815258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298325
13613	NC_004113	ATG	2	6	815281	815286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298325
13614	NC_004113	T	6	6	815299	815304	0 %	100 %	0 %	0 %	22298325
13615	NC_004113	T	6	6	815350	815355	0 %	100 %	0 %	0 %	22298325
13616	NC_004113	TGA	2	6	815397	815402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298325
13617	NC_004113	GAC	2	6	815455	815460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161485766
13618	NC_004113	CGG	2	6	815519	815524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161485766
13619	NC_004113	GGC	2	6	815604	815609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161485766
13620	NC_004113	CGG	2	6	815676	815681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161485766
13621	NC_004113	ATG	2	6	815721	815726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485766
13622	NC_004113	GCA	2	6	815807	815812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161485766
13623	NC_004113	GGT	2	6	815836	815841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161485766
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13650	NC_004113	CTG	2	6	817322	817327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298328
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13744	NC_004113	CCT	2	6	822369	822374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298333
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