MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_004113	ATT	2	6	749471	749476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298273
12502	NC_004113	GCACA	2	10	749480	749489	40 %	0 %	20 %	40 %	22298273
12503	NC_004113	C	6	6	749501	749506	0 %	0 %	0 %	100 %	22298273
12504	NC_004113	CAACT	2	10	749532	749541	40 %	20 %	0 %	40 %	22298273
12505	NC_004113	CAC	2	6	749555	749560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298273
12506	NC_004113	TGG	2	6	749569	749574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298273
12507	NC_004113	G	6	6	749587	749592	0 %	0 %	100 %	0 %	22298273
12508	NC_004113	TGC	2	6	749593	749598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298273
12509	NC_004113	AAC	2	6	749648	749653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298273
12510	NC_004113	CAT	2	6	749686	749691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298273
12511	NC_004113	TCT	2	6	749715	749720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298273
12512	NC_004113	GTC	2	6	749775	749780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298273
12513	NC_004113	TTCAGC	2	12	749808	749819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22298273
12514	NC_004113	GGT	2	6	749864	749869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298273
12515	NC_004113	GCA	2	6	749882	749887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298273
12516	NC_004113	ATG	2	6	749945	749950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298273
12517	NC_004113	CAT	2	6	749984	749989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298273
12518	NC_004113	CTG	2	6	750026	750031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298273
12519	NC_004113	GCTTCC	2	12	750087	750098	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22298273
12520	NC_004113	GGC	2	6	750119	750124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298273
12521	NC_004113	TCT	2	6	750153	750158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298273
12522	NC_004113	TGGC	2	8	750310	750317	0 %	25 %	50 %	25 %	22298273
12523	NC_004113	TGT	2	6	750390	750395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298273
12524	NC_004113	CAA	2	6	750493	750498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298273
12525	NC_004113	GCCGT	2	10	750549	750558	0 %	20 %	40 %	40 %	22298273
12526	NC_004113	CCT	2	6	750574	750579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298273
12527	NC_004113	G	6	6	750581	750586	0 %	0 %	100 %	0 %	22298273
12528	NC_004113	TTC	2	6	750605	750610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298273
12529	NC_004113	ATT	2	6	750620	750625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298273
12530	NC_004113	CGCCAT	2	12	750729	750740	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22298274
12531	NC_004113	GAG	2	6	750775	750780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298274
12532	NC_004113	CAT	2	6	750825	750830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298274
12533	NC_004113	TGG	2	6	751027	751032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298274
12534	NC_004113	CTG	2	6	751084	751089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298274
12535	NC_004113	CT	3	6	751106	751111	0 %	50 %	0 %	50 %	22298274
12536	NC_004113	GCTG	3	12	751114	751125	0 %	25 %	50 %	25 %	22298274
12537	NC_004113	CT	3	6	751153	751158	0 %	50 %	0 %	50 %	22298274
12538	NC_004113	ACC	2	6	751187	751192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298274
12539	NC_004113	CTTT	2	8	751331	751338	0 %	75 %	0 %	25 %	22298274
12540	NC_004113	GGCAC	2	10	751393	751402	20 %	0 %	40 %	40 %	22298274
12541	NC_004113	CAC	3	9	751483	751491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298274
12542	NC_004113	GAT	2	6	751569	751574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298274
12543	NC_004113	ACA	2	6	751649	751654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298274
12544	NC_004113	TGG	2	6	751712	751717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298274
12545	NC_004113	CTT	2	6	751812	751817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298274
12546	NC_004113	TGG	2	6	751820	751825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298274
12547	NC_004113	TCT	2	6	751847	751852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298274
12548	NC_004113	TGC	2	6	751904	751909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298274
12549	NC_004113	CTT	2	6	751953	751958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298274
12550	NC_004113	TGG	3	9	751997	752005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298274
12551	NC_004113	TTCA	2	8	752056	752063	25 %	50 %	0 %	25 %	22298274
12552	NC_004113	AGC	2	6	752064	752069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298274
12553	NC_004113	ACT	2	6	752079	752084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298274
12554	NC_004113	CT	3	6	752199	752204	0 %	50 %	0 %	50 %	22298274
12555	NC_004113	CTT	2	6	752229	752234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298274
12556	NC_004113	CAC	2	6	752239	752244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298274
12557	NC_004113	CAC	3	9	752265	752273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298274
12558	NC_004113	AAGA	2	8	752329	752336	75 %	0 %	25 %	0 %	22298274
12559	NC_004113	CGG	2	6	752373	752378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298274
12560	NC_004113	ACCT	2	8	752521	752528	25 %	25 %	0 %	50 %	22298274
12561	NC_004113	TG	3	6	752646	752651	0 %	50 %	50 %	0 %	22298274
12562	NC_004113	TGC	2	6	752844	752849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298274
12563	NC_004113	TTA	2	6	753388	753393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298275
12564	NC_004113	AAG	2	6	753398	753403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298275
12565	NC_004113	AAT	2	6	753463	753468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298275
12566	NC_004113	GGT	2	6	753489	753494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298275
12567	NC_004113	GTT	3	9	753507	753515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298275
12568	NC_004113	TTG	2	6	753527	753532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298275
12569	NC_004113	CA	3	6	753552	753557	50 %	0 %	0 %	50 %	22298275
12570	NC_004113	G	7	7	753606	753612	0 %	0 %	100 %	0 %	22298275
12571	NC_004113	T	6	6	753662	753667	0 %	100 %	0 %	0 %	22298275
12572	NC_004113	CTG	2	6	753679	753684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298275
12573	NC_004113	GTG	2	6	753688	753693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298275
12574	NC_004113	CTT	2	6	753696	753701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298275
12575	NC_004113	CT	3	6	753858	753863	0 %	50 %	0 %	50 %	22298275
12576	NC_004113	CTT	2	6	753966	753971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298275
12577	NC_004113	TGT	2	6	754086	754091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298275
12578	NC_004113	TTG	2	6	754100	754105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298275
12579	NC_004113	TTA	2	6	754127	754132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298275
12580	NC_004113	TGA	2	6	754136	754141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298275
12581	NC_004113	TCC	2	6	754521	754526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298275
12582	NC_004113	CCCTG	2	10	754620	754629	0 %	20 %	20 %	60 %	22298275
12583	NC_004113	TCGG	2	8	754661	754668	0 %	25 %	50 %	25 %	22298275
12584	NC_004113	TGG	2	6	754673	754678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298275
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12587	NC_004113	CAA	2	6	755143	755148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298276
12588	NC_004113	CCA	2	6	755185	755190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298276
12589	NC_004113	CCA	2	6	755197	755202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298276
12590	NC_004113	GAC	2	6	755213	755218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298276
12591	NC_004113	TGC	2	6	755259	755264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298276
12592	NC_004113	GTG	2	6	755460	755465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298276
12593	NC_004113	ATCA	2	8	755708	755715	50 %	25 %	0 %	25 %	22298276
12594	NC_004113	ACC	2	6	755739	755744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298276
12595	NC_004113	CGA	2	6	755790	755795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298276
12596	NC_004113	TGC	2	6	755810	755815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298276
12597	NC_004113	GAG	2	6	755822	755827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298276
12598	NC_004113	T	6	6	755900	755905	0 %	100 %	0 %	0 %	22298276
12599	NC_004113	TGC	2	6	755999	756004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298276
12600	NC_004113	GCA	2	6	756030	756035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298276
12601	NC_004113	ATG	2	6	756042	756047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298276
12602	NC_004113	CCAT	2	8	756066	756073	25 %	25 %	0 %	50 %	22298276
12603	NC_004113	GAG	2	6	756080	756085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298276
12604	NC_004113	TTTC	2	8	756190	756197	0 %	75 %	0 %	25 %	22298276
12605	NC_004113	CAA	2	6	756238	756243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298276
12606	NC_004113	AAG	2	6	756276	756281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298276
12607	NC_004113	GCCT	2	8	756287	756294	0 %	25 %	25 %	50 %	22298276
12608	NC_004113	CAG	2	6	756347	756352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298276
12609	NC_004113	CTG	2	6	756379	756384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298276
12610	NC_004113	CTT	2	6	756398	756403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298276
12611	NC_004113	ACC	2	6	756414	756419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298276
12612	NC_004113	TTC	2	6	756428	756433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298276
12613	NC_004113	GCG	2	6	756557	756562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298276
12614	NC_004113	C	6	6	756579	756584	0 %	0 %	0 %	100 %	22298276
12615	NC_004113	CAT	2	6	756634	756639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298276
12616	NC_004113	TGC	2	6	756669	756674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298276
12617	NC_004113	TACCCG	2	12	756719	756730	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22298276
12618	NC_004113	GGCT	2	8	756882	756889	0 %	25 %	50 %	25 %	22298276
12619	NC_004113	TTGA	2	8	756890	756897	25 %	50 %	25 %	0 %	22298276
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12621	NC_004113	GAG	2	6	757068	757073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298277
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12987	NC_004113	GAA	2	6	778701	778706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298294
12988	NC_004113	CGA	2	6	778773	778778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298294
12989	NC_004113	ATC	2	6	778798	778803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298294
12990	NC_004113	GGC	2	6	778849	778854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298294
12991	NC_004113	CAG	2	6	778945	778950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298294
12992	NC_004113	T	6	6	779162	779167	0 %	100 %	0 %	0 %	22298295
12993	NC_004113	CTT	2	6	779218	779223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298295
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12995	NC_004113	GAC	2	6	779275	779280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298295
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12997	NC_004113	TGGG	2	8	779377	779384	0 %	25 %	75 %	0 %	22298296
12998	NC_004113	GGA	2	6	779385	779390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298296
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