MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_004113	TCC	2	6	718928	718933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485768
12002	NC_004113	CGC	2	6	718954	718959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161485768
12003	NC_004113	G	6	6	718961	718966	0 %	0 %	100 %	0 %	161485768
12004	NC_004113	GC	3	6	719030	719035	0 %	0 %	50 %	50 %	161485768
12005	NC_004113	TGA	2	6	719036	719041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485768
12006	NC_004113	AGT	2	6	719113	719118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485768
12007	NC_004113	TTG	2	6	719153	719158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485768
12008	NC_004113	CGG	2	6	719208	719213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161485768
12009	NC_004113	ACCCA	2	10	719239	719248	40 %	0 %	0 %	60 %	161485768
12010	NC_004113	AAT	2	6	719521	719526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485768
12011	NC_004113	CTT	2	6	719545	719550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161485768
12012	NC_004113	GCC	2	6	719594	719599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161485768
12013	NC_004113	A	6	6	719600	719605	100 %	0 %	0 %	0 %	161485768
12014	NC_004113	CCT	2	6	719679	719684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485768
12015	NC_004113	TCT	2	6	719703	719708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161485768
12016	NC_004113	CAT	2	6	719727	719732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161485768
12017	NC_004113	G	6	6	719782	719787	0 %	0 %	100 %	0 %	161485768
12018	NC_004113	CGG	2	6	719789	719794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161485768
12019	NC_004113	CAG	2	6	719965	719970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298241
12020	NC_004113	CCA	2	6	720021	720026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298241
12021	NC_004113	CGC	2	6	720040	720045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298241
12022	NC_004113	CTGGTG	2	12	720061	720072	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	22298241
12023	NC_004113	TGC	2	6	720272	720277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298241
12024	NC_004113	CAG	2	6	720313	720318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298241
12025	NC_004113	CGG	2	6	720411	720416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298241
12026	NC_004113	CAC	2	6	720473	720478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298241
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12028	NC_004113	TGG	3	9	720851	720859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298242
12029	NC_004113	CCT	2	6	720882	720887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298242
12030	NC_004113	AAG	2	6	720923	720928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298242
12031	NC_004113	TGAT	2	8	720929	720936	25 %	50 %	25 %	0 %	22298242
12032	NC_004113	TGGC	2	8	721008	721015	0 %	25 %	50 %	25 %	22298242
12033	NC_004113	TATG	2	8	721023	721030	25 %	50 %	25 %	0 %	22298242
12034	NC_004113	ACT	2	6	721055	721060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298242
12035	NC_004113	CTT	2	6	721071	721076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298242
12036	NC_004113	GCA	2	6	721077	721082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298242
12037	NC_004113	CCA	2	6	721083	721088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298242
12038	NC_004113	CTTT	2	8	721100	721107	0 %	75 %	0 %	25 %	22298242
12039	NC_004113	CTGC	2	8	721134	721141	0 %	25 %	25 %	50 %	22298242
12040	NC_004113	TGA	2	6	721196	721201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298242
12041	NC_004113	TCA	2	6	721220	721225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298242
12042	NC_004113	AGG	2	6	721241	721246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298242
12043	NC_004113	GCC	2	6	721359	721364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298243
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12045	NC_004113	T	7	7	721458	721464	0 %	100 %	0 %	0 %	22298243
12046	NC_004113	CGC	2	6	721562	721567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298243
12047	NC_004113	GGT	2	6	721588	721593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298243
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12049	NC_004113	CAT	2	6	721725	721730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298244
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12051	NC_004113	ATGA	2	8	721872	721879	50 %	25 %	25 %	0 %	22298245
12052	NC_004113	CCA	2	6	721918	721923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298245
12053	NC_004113	TGG	3	9	722026	722034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298245
12054	NC_004113	T	6	6	722073	722078	0 %	100 %	0 %	0 %	22298245
12055	NC_004113	TCC	2	6	722162	722167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298245
12056	NC_004113	GCAC	2	8	722181	722188	25 %	0 %	25 %	50 %	22298245
12057	NC_004113	GAA	2	6	722196	722201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298245
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12059	NC_004113	TGG	2	6	722281	722286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298245
12060	NC_004113	GTC	2	6	722295	722300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298245
12061	NC_004113	CAG	3	9	722346	722354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298245
12062	NC_004113	CAG	2	6	722451	722456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298245
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12065	NC_004113	AGCA	2	8	722497	722504	50 %	0 %	25 %	25 %	22298245
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12069	NC_004113	CCAA	2	8	722809	722816	50 %	0 %	0 %	50 %	22298245
12070	NC_004113	GTT	2	6	722820	722825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298245
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12095	NC_004113	CAG	2	6	723649	723654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298246
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12098	NC_004113	AGC	2	6	723756	723761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298246
12099	NC_004113	CG	3	6	723810	723815	0 %	0 %	50 %	50 %	22298246
12100	NC_004113	GGC	2	6	723852	723857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298246
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12105	NC_004113	TGC	2	6	724335	724340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298247
12106	NC_004113	TTCGAT	2	12	724357	724368	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22298247
12107	NC_004113	GGCA	2	8	724400	724407	25 %	0 %	50 %	25 %	22298247
12108	NC_004113	ATC	2	6	724414	724419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298247
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12111	NC_004113	ACC	2	6	724858	724863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298247
12112	NC_004113	AAT	2	6	724874	724879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298247
12113	NC_004113	CTG	2	6	724977	724982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298248
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12115	NC_004113	GC	3	6	725016	725021	0 %	0 %	50 %	50 %	22298248
12116	NC_004113	CTTT	2	8	725071	725078	0 %	75 %	0 %	25 %	22298248
12117	NC_004113	T	6	6	725076	725081	0 %	100 %	0 %	0 %	22298248
12118	NC_004113	CTG	2	6	725091	725096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298248
12119	NC_004113	TTA	2	6	725107	725112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298248
12120	NC_004113	TTGGTG	2	12	725178	725189	0 %	50 %	50 %	0 %	22298249
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12122	NC_004113	CCT	2	6	725215	725220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298249
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12247	NC_004113	GTG	2	6	733467	733472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298256
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12487	NC_004113	AC	4	8	748547	748554	50 %	0 %	0 %	50 %	22298273
12488	NC_004113	TGGC	2	8	748676	748683	0 %	25 %	50 %	25 %	22298273
12489	NC_004113	CGG	2	6	748759	748764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298273
12490	NC_004113	TGGC	2	8	748872	748879	0 %	25 %	50 %	25 %	22298273
12491	NC_004113	GC	3	6	748915	748920	0 %	0 %	50 %	50 %	22298273
12492	NC_004113	ACC	3	9	748962	748970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298273
12493	NC_004113	CTTGG	2	10	748982	748991	0 %	40 %	40 %	20 %	22298273
12494	NC_004113	CAA	2	6	749038	749043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298273
12495	NC_004113	GCT	2	6	749063	749068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298273
12496	NC_004113	GTG	2	6	749154	749159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298273
12497	NC_004113	CAC	2	6	749264	749269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298273
12498	NC_004113	TCA	2	6	749292	749297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298273
12499	NC_004113	ACC	2	6	749414	749419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298273
12500	NC_004113	ATG	2	6	749453	749458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298273

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