MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_004113	C	6	6	692814	692819	0 %	0 %	0 %	100 %	22298218
11502	NC_004113	CTT	2	6	692886	692891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298218
11503	NC_004113	GGT	2	6	692949	692954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298218
11504	NC_004113	GCG	2	6	693027	693032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298218
11505	NC_004113	AG	3	6	693060	693065	50 %	0 %	50 %	0 %	22298218
11506	NC_004113	GCA	2	6	693109	693114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298218
11507	NC_004113	CA	3	6	693154	693159	50 %	0 %	0 %	50 %	22298218
11508	NC_004113	ATA	2	6	693184	693189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298218
11509	NC_004113	ACG	2	6	693199	693204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298218
11510	NC_004113	GAG	2	6	693238	693243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298218
11511	NC_004113	AGGA	2	8	693323	693330	50 %	0 %	50 %	0 %	22298218
11512	NC_004113	CAA	2	6	693358	693363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298218
11513	NC_004113	CAG	2	6	693382	693387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298218
11514	NC_004113	GGC	2	6	693419	693424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298218
11515	NC_004113	GGA	2	6	693450	693455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298218
11516	NC_004113	GGC	2	6	693464	693469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298218
11517	NC_004113	GCT	2	6	693504	693509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298218
11518	NC_004113	GGA	2	6	693525	693530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298218
11519	NC_004113	GCA	2	6	693535	693540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298218
11520	NC_004113	CT	4	8	693580	693587	0 %	50 %	0 %	50 %	22298219
11521	NC_004113	CTT	2	6	693763	693768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298219
11522	NC_004113	GGT	2	6	693826	693831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298219
11523	NC_004113	GCG	2	6	693904	693909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298219
11524	NC_004113	CA	3	6	694031	694036	50 %	0 %	0 %	50 %	22298219
11525	NC_004113	ATA	2	6	694061	694066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298219
11526	NC_004113	ACG	2	6	694076	694081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298219
11527	NC_004113	GAG	2	6	694115	694120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298219
11528	NC_004113	AGGA	2	8	694200	694207	50 %	0 %	50 %	0 %	22298219
11529	NC_004113	CAA	2	6	694235	694240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298219
11530	NC_004113	CAG	2	6	694247	694252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298219
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11533	NC_004113	CAA	2	6	694319	694324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298219
11534	NC_004113	CAG	2	6	694331	694336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298219
11535	NC_004113	CAG	2	6	694343	694348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298219
11536	NC_004113	GGC	2	6	694380	694385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298219
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11539	NC_004113	GGA	2	6	694486	694491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298219
11540	NC_004113	GCA	2	6	694496	694501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298219
11541	NC_004113	GGTG	2	8	694913	694920	0 %	25 %	75 %	0 %	22298220
11542	NC_004113	CGG	3	9	694921	694929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298220
11543	NC_004113	CAA	2	6	694948	694953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298220
11544	NC_004113	TGC	2	6	694994	694999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298220
11545	NC_004113	GGT	2	6	695004	695009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298220
11546	NC_004113	TGG	3	9	695018	695026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298220
11547	NC_004113	GGC	2	6	695040	695045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298220
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11549	NC_004113	CTG	2	6	695072	695077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298220
11550	NC_004113	TGA	2	6	695108	695113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298220
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11552	NC_004113	GCG	2	6	695242	695247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298220
11553	NC_004113	CG	3	6	695246	695251	0 %	0 %	50 %	50 %	22298220
11554	NC_004113	TGA	2	6	695369	695374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298220
11555	NC_004113	CAA	2	6	695503	695508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298220
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11557	NC_004113	CGG	2	6	695592	695597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298220
11558	NC_004113	G	6	6	695657	695662	0 %	0 %	100 %	0 %	22298220
11559	NC_004113	CA	3	6	695725	695730	50 %	0 %	0 %	50 %	22298220
11560	NC_004113	GCA	2	6	695735	695740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298220
11561	NC_004113	GGT	2	6	695838	695843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298220
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11564	NC_004113	CGA	2	6	696116	696121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298220
11565	NC_004113	TGA	2	6	696228	696233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298220
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11569	NC_004113	GCG	2	6	696429	696434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298220
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11584	NC_004113	GCTG	2	8	697072	697079	0 %	25 %	50 %	25 %	22298220
11585	NC_004113	GAC	2	6	697146	697151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298220
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11588	NC_004113	TAC	2	6	697197	697202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298220
11589	NC_004113	CAC	2	6	697247	697252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298220
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11592	NC_004113	GTC	2	6	697313	697318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298220
11593	NC_004113	AAG	2	6	697528	697533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298220
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11597	NC_004113	ACAG	2	8	697823	697830	50 %	0 %	25 %	25 %	22298220
11598	NC_004113	CAG	2	6	697835	697840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298220
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11601	NC_004113	TAT	2	6	697974	697979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298220
11602	NC_004113	TCC	2	6	697992	697997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298220
11603	NC_004113	GGT	2	6	698040	698045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298220
11604	NC_004113	AGCACA	2	12	698050	698061	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	22298220
11605	NC_004113	CTACCA	2	12	698062	698073	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	22298220
11606	NC_004113	TGG	2	6	698100	698105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298220
11607	NC_004113	GAA	2	6	698172	698177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298220
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11609	NC_004113	CCTGC	2	10	698224	698233	0 %	20 %	20 %	60 %	22298220
11610	NC_004113	AATCA	2	10	698356	698365	60 %	20 %	0 %	20 %	22298220
11611	NC_004113	TGG	2	6	698435	698440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298220
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11986	NC_004113	TGC	2	6	718438	718443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298239
11987	NC_004113	CGCAC	2	10	718524	718533	20 %	0 %	20 %	60 %	22298239
11988	NC_004113	GCA	2	6	718560	718565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298239
11989	NC_004113	GCA	2	6	718576	718581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298239
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11998	NC_004113	TCA	2	6	718827	718832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298239
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12000	NC_004113	CTG	2	6	718906	718911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485768

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