MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004113	GCC	2	6	664995	665000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298192
11002	NC_004113	ACCC	2	8	665001	665008	25 %	0 %	0 %	75 %	22298192
11003	NC_004113	GAC	2	6	665039	665044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298192
11004	NC_004113	ATG	2	6	665112	665117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298193
11005	NC_004113	T	6	6	665138	665143	0 %	100 %	0 %	0 %	22298193
11006	NC_004113	CAGGA	2	10	665155	665164	40 %	0 %	40 %	20 %	22298193
11007	NC_004113	GCCCTT	2	12	665178	665189	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22298193
11008	NC_004113	AAG	2	6	665194	665199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298193
11009	NC_004113	GTG	2	6	665214	665219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298193
11010	NC_004113	CG	3	6	665229	665234	0 %	0 %	50 %	50 %	22298193
11011	NC_004113	TG	3	6	665241	665246	0 %	50 %	50 %	0 %	22298193
11012	NC_004113	ACC	2	6	665298	665303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298193
11013	NC_004113	CCG	2	6	665306	665311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298193
11014	NC_004113	GCA	3	9	665315	665323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298193
11015	NC_004113	AGC	2	6	665330	665335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298193
11016	NC_004113	ATT	2	6	665349	665354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298193
11017	NC_004113	C	7	7	665457	665463	0 %	0 %	0 %	100 %	22298193
11018	NC_004113	GAC	2	6	665472	665477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298193
11019	NC_004113	TGT	2	6	665491	665496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298193
11020	NC_004113	CTG	2	6	665520	665525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298193
11021	NC_004113	TCAG	2	8	665527	665534	25 %	25 %	25 %	25 %	22298193
11022	NC_004113	ATCG	2	8	665639	665646	25 %	25 %	25 %	25 %	22298194
11023	NC_004113	TGA	2	6	665677	665682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298194
11024	NC_004113	GAG	2	6	665735	665740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298194
11025	NC_004113	GCA	2	6	665773	665778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298194
11026	NC_004113	CCT	2	6	665788	665793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298194
11027	NC_004113	GCT	2	6	665872	665877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298194
11028	NC_004113	T	6	6	665877	665882	0 %	100 %	0 %	0 %	22298194
11029	NC_004113	GCC	2	6	665909	665914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298194
11030	NC_004113	AGCG	2	8	666011	666018	25 %	0 %	50 %	25 %	22298194
11031	NC_004113	GGA	2	6	666037	666042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298194
11032	NC_004113	GCTAT	2	10	666135	666144	20 %	40 %	20 %	20 %	22298194
11033	NC_004113	CTG	2	6	666233	666238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298194
11034	NC_004113	CCTCA	2	10	666340	666349	20 %	20 %	0 %	60 %	22298194
11035	NC_004113	GAC	2	6	666413	666418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298194
11036	NC_004113	TGA	2	6	666436	666441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298194
11037	NC_004113	TGG	2	6	666516	666521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298194
11038	NC_004113	AGG	2	6	666537	666542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298194
11039	NC_004113	CGC	3	9	666545	666553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298194
11040	NC_004113	GAT	2	6	666580	666585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298194
11041	NC_004113	TGT	2	6	666644	666649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298194
11042	NC_004113	CTG	2	6	666794	666799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298194
11043	NC_004113	GCG	2	6	666820	666825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298194
11044	NC_004113	AGTG	2	8	666827	666834	25 %	25 %	50 %	0 %	22298194
11045	NC_004113	CCCG	2	8	666929	666936	0 %	0 %	25 %	75 %	22298194
11046	NC_004113	ATG	2	6	666953	666958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298194
11047	NC_004113	GCC	2	6	666977	666982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298194
11048	NC_004113	C	7	7	667029	667035	0 %	0 %	0 %	100 %	22298194
11049	NC_004113	AGG	2	6	667050	667055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298194
11050	NC_004113	TCG	2	6	667099	667104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298194
11051	NC_004113	ACCCA	2	10	667130	667139	40 %	0 %	0 %	60 %	22298194
11052	NC_004113	CGC	2	6	667193	667198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298194
11053	NC_004113	CTG	2	6	667208	667213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298194
11054	NC_004113	G	6	6	667242	667247	0 %	0 %	100 %	0 %	22298194
11055	NC_004113	ACCCC	2	10	667250	667259	20 %	0 %	0 %	80 %	22298194
11056	NC_004113	TGAA	2	8	667275	667282	50 %	25 %	25 %	0 %	22298194
11057	NC_004113	AACC	2	8	667336	667343	50 %	0 %	0 %	50 %	22298194
11058	NC_004113	CGG	2	6	667367	667372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298194
11059	NC_004113	GTTG	2	8	667407	667414	0 %	50 %	50 %	0 %	22298194
11060	NC_004113	GAG	2	6	667421	667426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298194
11061	NC_004113	GGGCTG	2	12	667427	667438	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	22298194
11062	NC_004113	GGA	2	6	667447	667452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298194
11063	NC_004113	GT	3	6	667504	667509	0 %	50 %	50 %	0 %	22298194
11064	NC_004113	GGA	2	6	667558	667563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298194
11065	NC_004113	TGCC	2	8	667566	667573	0 %	25 %	25 %	50 %	22298194
11066	NC_004113	CTG	2	6	667652	667657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298195
11067	NC_004113	CTTGA	2	10	667662	667671	20 %	40 %	20 %	20 %	22298195
11068	NC_004113	CCA	2	6	667690	667695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298195
11069	NC_004113	TC	3	6	667728	667733	0 %	50 %	0 %	50 %	22298195
11070	NC_004113	CGC	2	6	667776	667781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298195
11071	NC_004113	CTG	2	6	667935	667940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298195
11072	NC_004113	TCG	2	6	667954	667959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298195
11073	NC_004113	TGAG	2	8	668053	668060	25 %	25 %	50 %	0 %	22298196
11074	NC_004113	CAG	3	9	668116	668124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298196
11075	NC_004113	GCG	2	6	668214	668219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298196
11076	NC_004113	TCTT	2	8	668245	668252	0 %	75 %	0 %	25 %	22298196
11077	NC_004113	GCT	2	6	668292	668297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298196
11078	NC_004113	G	6	6	668405	668410	0 %	0 %	100 %	0 %	22298196
11079	NC_004113	TCG	2	6	668471	668476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11080	NC_004113	CTG	2	6	668478	668483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11081	NC_004113	CAAA	2	8	668502	668509	75 %	0 %	0 %	25 %	22298197
11082	NC_004113	G	7	7	668515	668521	0 %	0 %	100 %	0 %	22298197
11083	NC_004113	CCG	2	6	668581	668586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298197
11084	NC_004113	TGA	2	6	668588	668593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298197
11085	NC_004113	GTG	2	6	668622	668627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298197
11086	NC_004113	CTG	3	9	668637	668645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11087	NC_004113	CCT	2	6	668656	668661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298197
11088	NC_004113	TGG	2	6	668716	668721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298197
11089	NC_004113	CCA	2	6	668815	668820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298197
11090	NC_004113	CGG	2	6	668838	668843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298197
11091	NC_004113	TGC	2	6	668867	668872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11092	NC_004113	AGC	2	6	669007	669012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11093	NC_004113	CAA	2	6	669021	669026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298197
11094	NC_004113	AAG	2	6	669097	669102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298197
11095	NC_004113	AGC	2	6	669109	669114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11096	NC_004113	CAG	2	6	669123	669128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11097	NC_004113	G	7	7	669197	669203	0 %	0 %	100 %	0 %	22298197
11098	NC_004113	TGC	2	6	669254	669259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11099	NC_004113	TAC	2	6	669347	669352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298197
11100	NC_004113	G	6	6	669361	669366	0 %	0 %	100 %	0 %	22298197
11101	NC_004113	TGT	2	6	669471	669476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298197
11102	NC_004113	TACC	2	8	669491	669498	25 %	25 %	0 %	50 %	22298197
11103	NC_004113	GCA	2	6	669505	669510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11104	NC_004113	TGG	2	6	669556	669561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298197
11105	NC_004113	CAC	2	6	669734	669739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298197
11106	NC_004113	ACA	2	6	669748	669753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298197
11107	NC_004113	TGC	3	9	669794	669802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11108	NC_004113	CAG	2	6	669843	669848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11109	NC_004113	CT	3	6	669882	669887	0 %	50 %	0 %	50 %	22298197
11110	NC_004113	CTG	2	6	669924	669929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11111	NC_004113	GCCA	2	8	669987	669994	25 %	0 %	25 %	50 %	22298197
11112	NC_004113	GCA	3	9	670062	670070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298197
11113	NC_004113	TGG	2	6	670135	670140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298197
11114	NC_004113	ACG	2	6	670621	670626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298198
11115	NC_004113	GC	3	6	670706	670711	0 %	0 %	50 %	50 %	22298198
11116	NC_004113	ACCC	2	8	670743	670750	25 %	0 %	0 %	75 %	22298198
11117	NC_004113	CTC	2	6	670775	670780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298198
11118	NC_004113	G	6	6	670870	670875	0 %	0 %	100 %	0 %	22298198
11119	NC_004113	GTG	2	6	670911	670916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298198
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11122	NC_004113	CTA	2	6	670948	670953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298198
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11241	NC_004113	TTCA	2	8	677939	677946	25 %	50 %	0 %	25 %	22298203
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