MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004113	TTG	2	6	605546	605551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298140
10002	NC_004113	CCA	2	6	605572	605577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298140
10003	NC_004113	CGC	2	6	605584	605589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298140
10004	NC_004113	AGC	2	6	605629	605634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298140
10005	NC_004113	ACC	2	6	605654	605659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298140
10006	NC_004113	G	6	6	605676	605681	0 %	0 %	100 %	0 %	22298140
10007	NC_004113	TTC	2	6	605694	605699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298140
10008	NC_004113	AGT	2	6	605704	605709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298140
10009	NC_004113	GGT	2	6	605766	605771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298140
10010	NC_004113	AGC	2	6	605787	605792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298140
10011	NC_004113	CGC	2	6	605795	605800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298140
10012	NC_004113	GCCG	2	8	605819	605826	0 %	0 %	50 %	50 %	22298140
10013	NC_004113	CGG	2	6	605858	605863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298140
10014	NC_004113	GAG	2	6	605944	605949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298140
10015	NC_004113	TGG	2	6	605978	605983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298140
10016	NC_004113	GGC	2	6	606026	606031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298140
10017	NC_004113	GAGG	2	8	606040	606047	25 %	0 %	75 %	0 %	22298140
10018	NC_004113	AGG	2	6	606053	606058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298140
10019	NC_004113	CTG	2	6	606068	606073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298140
10020	NC_004113	GCT	2	6	606132	606137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298140
10021	NC_004113	ACT	2	6	606178	606183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298140
10022	NC_004113	CGG	4	12	606238	606249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298140
10023	NC_004113	AGT	2	6	606262	606267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298140
10024	NC_004113	GGC	2	6	606350	606355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298141
10025	NC_004113	G	6	6	606373	606378	0 %	0 %	100 %	0 %	22298141
10026	NC_004113	GCCTTT	2	12	606414	606425	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22298141
10027	NC_004113	TGA	2	6	606484	606489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298141
10028	NC_004113	CTT	2	6	606503	606508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298141
10029	NC_004113	CTG	2	6	606510	606515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298141
10030	NC_004113	GTGG	2	8	606551	606558	0 %	25 %	75 %	0 %	22298141
10031	NC_004113	TGG	2	6	606680	606685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298141
10032	NC_004113	AGG	2	6	606745	606750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298141
10033	NC_004113	CAG	2	6	606954	606959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298141
10034	NC_004113	TGCTCA	2	12	606967	606978	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22298141
10035	NC_004113	C	6	6	607000	607005	0 %	0 %	0 %	100 %	22298141
10036	NC_004113	GTG	2	6	607048	607053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298141
10037	NC_004113	CAC	2	6	607194	607199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298142
10038	NC_004113	GCG	2	6	607203	607208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298142
10039	NC_004113	TTC	2	6	607215	607220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298142
10040	NC_004113	CT	3	6	607249	607254	0 %	50 %	0 %	50 %	22298142
10041	NC_004113	AAC	2	6	607272	607277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298142
10042	NC_004113	CGC	2	6	607279	607284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298142
10043	NC_004113	CTG	3	9	607286	607294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298142
10044	NC_004113	GCC	2	6	607339	607344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298142
10045	NC_004113	CTC	2	6	607422	607427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298142
10046	NC_004113	GTT	2	6	607491	607496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298142
10047	NC_004113	CAG	2	6	607500	607505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298142
10048	NC_004113	CGAT	2	8	607537	607544	25 %	25 %	25 %	25 %	22298142
10049	NC_004113	CAC	2	6	607563	607568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298142
10050	NC_004113	CCA	2	6	607586	607591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298142
10051	NC_004113	GCA	2	6	607651	607656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298142
10052	NC_004113	CTC	2	6	607787	607792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298143
10053	NC_004113	AGC	2	6	607881	607886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298143
10054	NC_004113	CGGC	2	8	607891	607898	0 %	0 %	50 %	50 %	22298143
10055	NC_004113	GAT	2	6	607928	607933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298143
10056	NC_004113	TGC	3	9	607956	607964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298143
10057	NC_004113	GTT	2	6	607967	607972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298143
10058	NC_004113	CTG	2	6	607974	607979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298143
10059	NC_004113	AG	3	6	607988	607993	50 %	0 %	50 %	0 %	22298143
10060	NC_004113	TGA	2	6	608095	608100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298143
10061	NC_004113	ATCA	2	8	608114	608121	50 %	25 %	0 %	25 %	22298143
10062	NC_004113	CAG	2	6	608164	608169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298143
10063	NC_004113	TGG	2	6	608242	608247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298143
10064	NC_004113	AAT	2	6	608264	608269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298143
10065	NC_004113	CCA	2	6	608308	608313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298143
10066	NC_004113	CCT	2	6	608332	608337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298143
10067	NC_004113	CCA	2	6	608356	608361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298143
10068	NC_004113	ACC	2	6	608394	608399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298143
10069	NC_004113	TGG	2	6	608449	608454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298143
10070	NC_004113	GGGCT	2	10	608459	608468	0 %	20 %	60 %	20 %	22298143
10071	NC_004113	AGC	2	6	608580	608585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298143
10072	NC_004113	AGC	2	6	608590	608595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298143
10073	NC_004113	CAC	2	6	608774	608779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298143
10074	NC_004113	A	6	6	608829	608834	100 %	0 %	0 %	0 %	22298143
10075	NC_004113	GCA	2	6	608845	608850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298143
10076	NC_004113	TTG	2	6	608856	608861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298143
10077	NC_004113	GC	3	6	609023	609028	0 %	0 %	50 %	50 %	22298144
10078	NC_004113	CG	3	6	609087	609092	0 %	0 %	50 %	50 %	22298144
10079	NC_004113	GAC	2	6	609100	609105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298144
10080	NC_004113	GCC	2	6	609154	609159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298144
10081	NC_004113	AG	3	6	609201	609206	50 %	0 %	50 %	0 %	22298144
10082	NC_004113	CAGA	2	8	609235	609242	50 %	0 %	25 %	25 %	22298144
10083	NC_004113	TCAC	2	8	609386	609393	25 %	25 %	0 %	50 %	22298144
10084	NC_004113	GCC	2	6	609401	609406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298144
10085	NC_004113	GCC	2	6	609437	609442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298144
10086	NC_004113	AGG	2	6	609452	609457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298144
10087	NC_004113	CGC	2	6	609470	609475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298144
10088	NC_004113	GGA	2	6	609559	609564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298144
10089	NC_004113	GCCA	2	8	609572	609579	25 %	0 %	25 %	50 %	22298144
10090	NC_004113	GTG	2	6	609598	609603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298144
10091	NC_004113	CGC	2	6	609700	609705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298145
10092	NC_004113	GC	4	8	609744	609751	0 %	0 %	50 %	50 %	22298145
10093	NC_004113	GCC	2	6	609786	609791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298145
10094	NC_004113	TTG	2	6	610198	610203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298146
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10096	NC_004113	C	7	7	610294	610300	0 %	0 %	0 %	100 %	22298146
10097	NC_004113	TGT	2	6	610355	610360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298146
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10099	NC_004113	TGATT	2	10	610556	610565	20 %	60 %	20 %	0 %	22298146
10100	NC_004113	GAC	2	6	610635	610640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298146
10101	NC_004113	GGT	2	6	610721	610726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298146
10102	NC_004113	C	7	7	610742	610748	0 %	0 %	0 %	100 %	22298146
10103	NC_004113	GCC	2	6	610908	610913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298146
10104	NC_004113	CATTTC	2	12	610970	610981	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	22298146
10105	NC_004113	GGT	2	6	611069	611074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298146
10106	NC_004113	CGC	3	9	611121	611129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298146
10107	NC_004113	GGC	2	6	611214	611219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298146
10108	NC_004113	CAC	2	6	611228	611233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298146
10109	NC_004113	GACC	2	8	611273	611280	25 %	0 %	25 %	50 %	22298146
10110	NC_004113	AGCC	2	8	611327	611334	25 %	0 %	25 %	50 %	22298146
10111	NC_004113	CTT	2	6	611435	611440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298147
10112	NC_004113	GT	3	6	611501	611506	0 %	50 %	50 %	0 %	22298147
10113	NC_004113	CAA	2	6	611604	611609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298147
10114	NC_004113	TTC	2	6	611768	611773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298147
10115	NC_004113	GTC	2	6	611822	611827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298147
10116	NC_004113	TTTG	2	8	611919	611926	0 %	75 %	25 %	0 %	22298147
10117	NC_004113	GTA	2	6	611962	611967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298147
10118	NC_004113	GCT	2	6	612022	612027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298147
10119	NC_004113	AACC	2	8	612042	612049	50 %	0 %	0 %	50 %	22298147
10120	NC_004113	CT	3	6	612076	612081	0 %	50 %	0 %	50 %	22298147
10121	NC_004113	TCA	2	6	612086	612091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298147
10122	NC_004113	CAG	2	6	612117	612122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298147
10123	NC_004113	CCA	2	6	612266	612271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298147
10124	NC_004113	AAG	2	6	612314	612319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298147
10125	NC_004113	CTG	2	6	612352	612357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298147
10126	NC_004113	CTT	2	6	612403	612408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298147
10127	NC_004113	TC	3	6	612448	612453	0 %	50 %	0 %	50 %	22298147
10128	NC_004113	AACC	2	8	612502	612509	50 %	0 %	0 %	50 %	22298147
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10166	NC_004113	TC	3	6	615774	615779	0 %	50 %	0 %	50 %	22298152
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10230	NC_004113	CCCTG	2	10	618804	618813	0 %	20 %	20 %	60 %	22298155
10231	NC_004113	ACCT	2	8	618826	618833	25 %	25 %	0 %	50 %	22298155
10232	NC_004113	ACTG	2	8	618885	618892	25 %	25 %	25 %	25 %	22298155
10233	NC_004113	GCA	2	6	618906	618911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298155
10234	NC_004113	G	7	7	618960	618966	0 %	0 %	100 %	0 %	22298155
10235	NC_004113	ATG	2	6	619069	619074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298155
10236	NC_004113	T	6	6	619117	619122	0 %	100 %	0 %	0 %	22298155
10237	NC_004113	TGC	2	6	619134	619139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298155
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10239	NC_004113	TTTG	2	8	619283	619290	0 %	75 %	25 %	0 %	22298155
10240	NC_004113	GTT	2	6	619320	619325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298156
10241	NC_004113	GGGT	2	8	619366	619373	0 %	25 %	75 %	0 %	22298156
10242	NC_004113	ATG	2	6	619479	619484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298156
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10244	NC_004113	GAT	2	6	619632	619637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298156
10245	NC_004113	ACA	2	6	619704	619709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298156
10246	NC_004113	TGC	2	6	619766	619771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298156
10247	NC_004113	CGG	2	6	619821	619826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298156
10248	NC_004113	CTG	2	6	619863	619868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298156
10249	NC_004113	TGG	2	6	619918	619923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298156
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10261	NC_004113	GTC	2	6	620871	620876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298157
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10268	NC_004113	TGC	2	6	621991	621996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298159
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10275	NC_004113	GCA	2	6	622358	622363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298160
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10285	NC_004113	CGAC	2	8	622858	622865	25 %	0 %	25 %	50 %	22298160
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10486	NC_004113	CCG	2	6	637162	637167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298170
10487	NC_004113	ACC	2	6	637173	637178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298170
10488	NC_004113	TCC	2	6	637182	637187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298170
10489	NC_004113	GCC	2	6	637191	637196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298170
10490	NC_004113	GGT	2	6	637224	637229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298170
10491	NC_004113	G	6	6	637278	637283	0 %	0 %	100 %	0 %	22298170
10492	NC_004113	GGCG	2	8	637345	637352	0 %	0 %	75 %	25 %	22298170
10493	NC_004113	CCAAAC	2	12	637452	637463	50 %	0 %	0 %	50 %	22298170
10494	NC_004113	CAG	2	6	637535	637540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298170
10495	NC_004113	CCT	2	6	637617	637622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298170
10496	NC_004113	AGC	2	6	637683	637688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298170
10497	NC_004113	GCG	2	6	637693	637698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298170
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10499	NC_004113	AGCC	2	8	637978	637985	25 %	0 %	25 %	50 %	22298171
10500	NC_004113	CCT	2	6	638006	638011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298171

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