MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004113	TGAT	2	8	33487	33494	25 %	50 %	25 %	0 %	22297580
502	NC_004113	CAC	2	6	33513	33518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297580
503	NC_004113	CAA	2	6	33551	33556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297580
504	NC_004113	CGG	2	6	33659	33664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297580
505	NC_004113	GGC	2	6	33711	33716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297580
506	NC_004113	TAGCCA	2	12	33736	33747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22297580
507	NC_004113	AGCA	2	8	33793	33800	50 %	0 %	25 %	25 %	22297580
508	NC_004113	ACC	2	6	33867	33872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297580
509	NC_004113	CTA	2	6	33944	33949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297580
510	NC_004113	TGG	2	6	33990	33995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297580
511	NC_004113	GGT	2	6	33998	34003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297580
512	NC_004113	AAT	2	6	34093	34098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297581
513	NC_004113	CAC	2	6	34243	34248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297581
514	NC_004113	GTG	2	6	34301	34306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297581
515	NC_004113	CTA	2	6	34422	34427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297581
516	NC_004113	T	6	6	34470	34475	0 %	100 %	0 %	0 %	22297581
517	NC_004113	AAGCC	2	10	34496	34505	40 %	0 %	20 %	40 %	22297581
518	NC_004113	CTGGCG	2	12	34663	34674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	22297581
519	NC_004113	AAT	2	6	34690	34695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297581
520	NC_004113	GCT	2	6	34752	34757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297581
521	NC_004113	TCCC	2	8	34810	34817	0 %	25 %	0 %	75 %	22297581
522	NC_004113	GTT	2	6	34845	34850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297581
523	NC_004113	GGC	2	6	34927	34932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297581
524	NC_004113	CTT	2	6	34950	34955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297581
525	NC_004113	CCT	2	6	35058	35063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297582
526	NC_004113	GTTTGC	2	12	35064	35075	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	22297582
527	NC_004113	CGC	2	6	35105	35110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297582
528	NC_004113	T	7	7	35142	35148	0 %	100 %	0 %	0 %	22297582
529	NC_004113	CCT	2	6	35221	35226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297583
530	NC_004113	TGA	2	6	35227	35232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297583
531	NC_004113	ACG	3	9	35242	35250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297583
532	NC_004113	CGC	2	6	35255	35260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297583
533	NC_004113	TGA	2	6	35276	35281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297583
534	NC_004113	CAT	3	9	35304	35312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297583
535	NC_004113	TAAA	2	8	35320	35327	75 %	25 %	0 %	0 %	22297583
536	NC_004113	CTG	2	6	35329	35334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297583
537	NC_004113	GCA	2	6	35348	35353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297583
538	NC_004113	CAG	2	6	35515	35520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297583
539	NC_004113	GCC	2	6	35613	35618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297584
540	NC_004113	CGC	2	6	35654	35659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297584
541	NC_004113	TGGAT	2	10	35693	35702	20 %	40 %	40 %	0 %	22297584
542	NC_004113	TTC	2	6	35716	35721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297584
543	NC_004113	TAT	2	6	35748	35753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297584
544	NC_004113	ATG	2	6	35978	35983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297585
545	NC_004113	GC	3	6	36017	36022	0 %	0 %	50 %	50 %	22297585
546	NC_004113	GGTC	2	8	36051	36058	0 %	25 %	50 %	25 %	22297585
547	NC_004113	CTG	2	6	36064	36069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297585
548	NC_004113	CCCAG	2	10	36108	36117	20 %	0 %	20 %	60 %	22297585
549	NC_004113	TCG	2	6	36126	36131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297585
550	NC_004113	TGG	2	6	36141	36146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297585
551	NC_004113	CT	3	6	36213	36218	0 %	50 %	0 %	50 %	22297585
552	NC_004113	GCG	2	6	36265	36270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297585
553	NC_004113	CGC	2	6	36271	36276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297585
554	NC_004113	TGA	2	6	36279	36284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297585
555	NC_004113	TGC	2	6	36286	36291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297585
556	NC_004113	TGG	2	6	36292	36297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297585
557	NC_004113	TGG	2	6	36306	36311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297585
558	NC_004113	GAG	2	6	36332	36337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297585
559	NC_004113	GCA	2	6	36340	36345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297585
560	NC_004113	GTG	2	6	36401	36406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297585
561	NC_004113	GTG	2	6	36483	36488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297585
562	NC_004113	TCCTG	2	10	36571	36580	0 %	40 %	20 %	40 %	22297585
563	NC_004113	CGAACC	2	12	36589	36600	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22297585
564	NC_004113	AAC	2	6	36601	36606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297585
565	NC_004113	GCG	3	9	36686	36694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297585
566	NC_004113	CAC	2	6	36754	36759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297585
567	NC_004113	TCACAG	2	12	36768	36779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22297585
568	NC_004113	TCGCGA	2	12	36819	36830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22297586
569	NC_004113	CTC	2	6	36847	36852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297586
570	NC_004113	GTG	2	6	36874	36879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297586
571	NC_004113	TGG	3	9	36950	36958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297586
572	NC_004113	TG	3	6	37003	37008	0 %	50 %	50 %	0 %	22297586
573	NC_004113	AGG	2	6	37034	37039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297586
574	NC_004113	ACA	2	6	37149	37154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297586
575	NC_004113	TCT	2	6	37172	37177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297586
576	NC_004113	TGA	2	6	37209	37214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297586
577	NC_004113	CCG	2	6	37360	37365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297586
578	NC_004113	TGC	2	6	37408	37413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297586
579	NC_004113	CCT	2	6	37457	37462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297587
580	NC_004113	CCA	2	6	37487	37492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297587
581	NC_004113	ACT	2	6	37531	37536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297587
582	NC_004113	TGC	2	6	37680	37685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297587
583	NC_004113	CCA	2	6	37733	37738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297587
584	NC_004113	GGC	2	6	37821	37826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297587
585	NC_004113	AAT	2	6	37842	37847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297587
586	NC_004113	GCC	2	6	37866	37871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297587
587	NC_004113	GGT	2	6	37932	37937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297587
588	NC_004113	TGC	2	6	38143	38148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297587
589	NC_004113	CAA	2	6	38186	38191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297587
590	NC_004113	CTG	2	6	38225	38230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297587
591	NC_004113	CAG	2	6	38240	38245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297587
592	NC_004113	GTGG	2	8	38316	38323	0 %	25 %	75 %	0 %	22297587
593	NC_004113	GCA	2	6	38522	38527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297588
594	NC_004113	CCAC	2	8	38540	38547	25 %	0 %	0 %	75 %	22297588
595	NC_004113	CTG	2	6	38572	38577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297588
596	NC_004113	GTG	2	6	38614	38619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297588
597	NC_004113	CTC	2	6	38734	38739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297588
598	NC_004113	CCA	2	6	38802	38807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297588
599	NC_004113	TGCC	2	8	38887	38894	0 %	25 %	25 %	50 %	22297589
600	NC_004113	GTTG	2	8	38928	38935	0 %	50 %	50 %	0 %	22297589
601	NC_004113	AGG	2	6	39010	39015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297589
602	NC_004113	ACC	2	6	39126	39131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297589
603	NC_004113	ATC	2	6	39132	39137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297589
604	NC_004113	GAC	2	6	39140	39145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297589
605	NC_004113	GTA	3	9	39152	39160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297589
606	NC_004113	CAG	2	6	39188	39193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297589
607	NC_004113	AGA	2	6	39229	39234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297589
608	NC_004113	AAG	2	6	39249	39254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297589
609	NC_004113	C	7	7	39272	39278	0 %	0 %	0 %	100 %	22297589
610	NC_004113	CAG	2	6	39311	39316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297589
611	NC_004113	CGGTGC	2	12	39358	39369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	22297589
612	NC_004113	CA	3	6	39386	39391	50 %	0 %	0 %	50 %	22297589
613	NC_004113	GCCT	2	8	39452	39459	0 %	25 %	25 %	50 %	22297589
614	NC_004113	ATC	2	6	39480	39485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297589
615	NC_004113	GGA	2	6	39506	39511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297589
616	NC_004113	CCA	2	6	39550	39555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297589
617	NC_004113	GAAA	2	8	39684	39691	75 %	0 %	25 %	0 %	22297589
618	NC_004113	CAA	2	6	39799	39804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297589
619	NC_004113	GGA	2	6	39818	39823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297589
620	NC_004113	GGC	2	6	39938	39943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297589
621	NC_004113	AGG	2	6	39988	39993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297589
622	NC_004113	CCAC	2	8	40059	40066	25 %	0 %	0 %	75 %	22297589
623	NC_004113	GAA	2	6	40178	40183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297589
624	NC_004113	ATC	2	6	40251	40256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297589
625	NC_004113	C	7	7	40267	40273	0 %	0 %	0 %	100 %	22297589
626	NC_004113	GAC	2	6	40343	40348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297589
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628	NC_004113	GCA	2	6	40665	40670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297590
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