MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_004113	GCA	2	6	517324	517329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298062
8502	NC_004113	GGA	2	6	517333	517338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298062
8503	NC_004113	CCG	3	9	517432	517440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298062
8504	NC_004113	AGCA	2	8	517449	517456	50 %	0 %	25 %	25 %	22298062
8505	NC_004113	AAT	2	6	517494	517499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298062
8506	NC_004113	GAT	2	6	517505	517510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298062
8507	NC_004113	CACT	2	8	517546	517553	25 %	25 %	0 %	50 %	22298062
8508	NC_004113	GA	4	8	517580	517587	50 %	0 %	50 %	0 %	22298062
8509	NC_004113	CCG	2	6	517601	517606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298062
8510	NC_004113	CCCAG	2	10	517619	517628	20 %	0 %	20 %	60 %	22298062
8511	NC_004113	TGA	2	6	517639	517644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298062
8512	NC_004113	GCA	2	6	517676	517681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298062
8513	NC_004113	GCC	2	6	517873	517878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298062
8514	NC_004113	TGC	3	9	517930	517938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298062
8515	NC_004113	C	6	6	517949	517954	0 %	0 %	0 %	100 %	22298062
8516	NC_004113	TGC	2	6	518010	518015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298062
8517	NC_004113	CCA	2	6	518048	518053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298062
8518	NC_004113	AGG	2	6	518098	518103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298062
8519	NC_004113	TGA	2	6	518236	518241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298062
8520	NC_004113	AAC	2	6	518247	518252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298062
8521	NC_004113	TAG	2	6	518351	518356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298063
8522	NC_004113	T	6	6	518371	518376	0 %	100 %	0 %	0 %	22298063
8523	NC_004113	A	6	6	518452	518457	100 %	0 %	0 %	0 %	22298063
8524	NC_004113	A	7	7	518525	518531	100 %	0 %	0 %	0 %	22298063
8525	NC_004113	GATGG	2	10	518545	518554	20 %	20 %	60 %	0 %	22298063
8526	NC_004113	CTC	2	6	518593	518598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298063
8527	NC_004113	GTT	2	6	518623	518628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298063
8528	NC_004113	AC	3	6	518640	518645	50 %	0 %	0 %	50 %	22298063
8529	NC_004113	CCAAG	2	10	518676	518685	40 %	0 %	20 %	40 %	22298063
8530	NC_004113	AGGT	2	8	518710	518717	25 %	25 %	50 %	0 %	22298063
8531	NC_004113	ACC	2	6	518729	518734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298063
8532	NC_004113	CCA	2	6	518803	518808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298063
8533	NC_004113	AGC	3	9	518946	518954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298064
8534	NC_004113	T	6	6	518955	518960	0 %	100 %	0 %	0 %	22298064
8535	NC_004113	TTTG	2	8	518965	518972	0 %	75 %	25 %	0 %	22298064
8536	NC_004113	CAC	2	6	519028	519033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298064
8537	NC_004113	AAC	2	6	519081	519086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298064
8538	NC_004113	C	6	6	519106	519111	0 %	0 %	0 %	100 %	22298064
8539	NC_004113	T	6	6	519198	519203	0 %	100 %	0 %	0 %	22298064
8540	NC_004113	CAT	2	6	519330	519335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298064
8541	NC_004113	AAC	2	6	519394	519399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298064
8542	NC_004113	CGCT	2	8	519435	519442	0 %	25 %	25 %	50 %	22298064
8543	NC_004113	C	6	6	520933	520938	0 %	0 %	0 %	100 %	22298065
8544	NC_004113	ACCA	2	8	520981	520988	50 %	0 %	0 %	50 %	22298065
8545	NC_004113	GAAG	2	8	521073	521080	50 %	0 %	50 %	0 %	22298065
8546	NC_004113	CA	3	6	521211	521216	50 %	0 %	0 %	50 %	22298065
8547	NC_004113	AACCCC	2	12	521264	521275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298065
8548	NC_004113	GCCCTA	2	12	521365	521376	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22298065
8549	NC_004113	CCG	2	6	521421	521426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298065
8550	NC_004113	CTA	2	6	521548	521553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298065
8551	NC_004113	CCCA	2	8	521629	521636	25 %	0 %	0 %	75 %	22298065
8552	NC_004113	AGGG	2	8	521651	521658	25 %	0 %	75 %	0 %	22298065
8553	NC_004113	GATGG	2	10	521692	521701	20 %	20 %	60 %	0 %	22298065
8554	NC_004113	TTC	2	6	521930	521935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298065
8555	NC_004113	TCA	2	6	521936	521941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298065
8556	NC_004113	GAA	3	9	521949	521957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298065
8557	NC_004113	AC	3	6	522032	522037	50 %	0 %	0 %	50 %	22298065
8558	NC_004113	CAAA	2	8	522158	522165	75 %	0 %	0 %	25 %	22298065
8559	NC_004113	TCA	2	6	522194	522199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298065
8560	NC_004113	TGA	2	6	522233	522238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298065
8561	NC_004113	A	6	6	522379	522384	100 %	0 %	0 %	0 %	22298065
8562	NC_004113	CCG	2	6	522408	522413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298065
8563	NC_004113	GAA	2	6	522423	522428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298065
8564	NC_004113	GGT	2	6	522433	522438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298065
8565	NC_004113	CCA	2	6	522489	522494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298065
8566	NC_004113	GGT	2	6	522514	522519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298065
8567	NC_004113	GAC	2	6	522523	522528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298065
8568	NC_004113	CGC	2	6	522847	522852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298066
8569	NC_004113	A	6	6	522941	522946	100 %	0 %	0 %	0 %	22298066
8570	NC_004113	AGCCA	2	10	522955	522964	40 %	0 %	20 %	40 %	22298066
8571	NC_004113	CTCA	2	8	523012	523019	25 %	25 %	0 %	50 %	22298066
8572	NC_004113	CTG	2	6	523097	523102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298066
8573	NC_004113	AGCAC	2	10	523148	523157	40 %	0 %	20 %	40 %	22298066
8574	NC_004113	ATG	2	6	523193	523198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298066
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8579	NC_004113	GTGCC	2	10	523614	523623	0 %	20 %	40 %	40 %	22298066
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8583	NC_004113	CAT	2	6	523941	523946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298067
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8586	NC_004113	TGAAGT	2	12	524058	524069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298067
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8591	NC_004113	GGC	2	6	524768	524773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298068
8592	NC_004113	ATG	2	6	524819	524824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298068
8593	NC_004113	TCA	2	6	524829	524834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298068
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8597	NC_004113	C	6	6	524999	525004	0 %	0 %	0 %	100 %	22298068
8598	NC_004113	CAA	2	6	525064	525069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298068
8599	NC_004113	TGC	2	6	525078	525083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298068
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8601	NC_004113	ACCC	2	8	525172	525179	25 %	0 %	0 %	75 %	22298068
8602	NC_004113	ACC	2	6	525221	525226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298068
8603	NC_004113	TGACT	2	10	525271	525280	20 %	40 %	20 %	20 %	22298068
8604	NC_004113	CCG	2	6	525363	525368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298068
8605	NC_004113	TGA	2	6	525505	525510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298068
8606	NC_004113	CT	3	6	525512	525517	0 %	50 %	0 %	50 %	22298068
8607	NC_004113	CTT	2	6	525562	525567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298068
8608	NC_004113	CTTT	2	8	525576	525583	0 %	75 %	0 %	25 %	22298068
8609	NC_004113	GAA	2	6	525629	525634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298068
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8611	NC_004113	GAT	2	6	525674	525679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298068
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8613	NC_004113	TGA	2	6	525826	525831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298069
8614	NC_004113	TC	3	6	525920	525925	0 %	50 %	0 %	50 %	22298069
8615	NC_004113	C	6	6	525934	525939	0 %	0 %	0 %	100 %	22298069
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8622	NC_004113	CCAT	2	8	526363	526370	25 %	25 %	0 %	50 %	22298070
8623	NC_004113	GCC	2	6	526465	526470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298070
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8995	NC_004113	GTG	2	6	549139	549144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298091
8996	NC_004113	GCG	2	6	549215	549220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298092
8997	NC_004113	CAG	2	6	549260	549265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298092
8998	NC_004113	TGG	2	6	549294	549299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298092
8999	NC_004113	AAT	2	6	549417	549422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298092
9000	NC_004113	GCA	2	6	549432	549437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298092

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