MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_004113	GCC	2	6	458996	459001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298001
7502	NC_004113	TGT	2	6	459004	459009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298001
7503	NC_004113	AT	3	6	459104	459109	50 %	50 %	0 %	0 %	22298001
7504	NC_004113	ATC	2	6	459141	459146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298001
7505	NC_004113	GTT	2	6	459185	459190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298001
7506	NC_004113	GTG	2	6	459227	459232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298001
7507	NC_004113	GCAC	2	8	459237	459244	25 %	0 %	25 %	50 %	22298001
7508	NC_004113	GCA	2	6	459270	459275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298001
7509	NC_004113	G	6	6	459314	459319	0 %	0 %	100 %	0 %	22298001
7510	NC_004113	TGAA	2	8	459363	459370	50 %	25 %	25 %	0 %	22298001
7511	NC_004113	CCGCCA	2	12	459723	459734	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	22298001
7512	NC_004113	TCA	2	6	459748	459753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298001
7513	NC_004113	ACAT	2	8	459832	459839	50 %	25 %	0 %	25 %	22298002
7514	NC_004113	A	7	7	459842	459848	100 %	0 %	0 %	0 %	22298002
7515	NC_004113	AAATCA	2	12	459870	459881	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	22298002
7516	NC_004113	GATG	2	8	459903	459910	25 %	25 %	50 %	0 %	22298002
7517	NC_004113	GGC	3	9	459918	459926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298002
7518	NC_004113	AAG	2	6	459953	459958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298002
7519	NC_004113	ATG	2	6	460097	460102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298002
7520	NC_004113	CAG	2	6	460270	460275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298002
7521	NC_004113	AAG	2	6	460343	460348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298002
7522	NC_004113	CGC	2	6	460461	460466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161485772
7523	NC_004113	AGG	2	6	460478	460483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161485772
7524	NC_004113	CCT	2	6	460497	460502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485772
7525	NC_004113	CCAT	2	8	460508	460515	25 %	25 %	0 %	50 %	161485772
7526	NC_004113	ATCA	2	8	460525	460532	50 %	25 %	0 %	25 %	161485772
7527	NC_004113	TTG	2	6	460598	460603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485772
7528	NC_004113	AGA	2	6	460607	460612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485772
7529	NC_004113	CAA	2	6	460641	460646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161485772
7530	NC_004113	TGA	2	6	460679	460684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485772
7531	NC_004113	ACT	2	6	460837	460842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161485772
7532	NC_004113	TGC	2	6	460858	460863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485772
7533	NC_004113	CTG	3	9	460939	460947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485772
7534	NC_004113	ATC	2	6	460969	460974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161485772
7535	NC_004113	ATCA	2	8	461089	461096	50 %	25 %	0 %	25 %	161485772
7536	NC_004113	GCTT	2	8	461153	461160	0 %	50 %	25 %	25 %	161485772
7537	NC_004113	AG	3	6	461167	461172	50 %	0 %	50 %	0 %	161485772
7538	NC_004113	CAT	2	6	461197	461202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161485772
7539	NC_004113	CTGC	2	8	461259	461266	0 %	25 %	25 %	50 %	161485772
7540	NC_004113	CAC	2	6	461374	461379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161485772
7541	NC_004113	TGC	2	6	461440	461445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485772
7542	NC_004113	TTG	2	6	461511	461516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485772
7543	NC_004113	AAC	2	6	461832	461837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298004
7544	NC_004113	GT	3	6	461881	461886	0 %	50 %	50 %	0 %	22298004
7545	NC_004113	GTGGG	2	10	461893	461902	0 %	20 %	80 %	0 %	22298004
7546	NC_004113	G	6	6	461900	461905	0 %	0 %	100 %	0 %	22298004
7547	NC_004113	CGC	3	9	461994	462002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298004
7548	NC_004113	TCC	2	6	462010	462015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298004
7549	NC_004113	ATGC	2	8	462042	462049	25 %	25 %	25 %	25 %	22298004
7550	NC_004113	CCTTG	2	10	462095	462104	0 %	40 %	20 %	40 %	22298004
7551	NC_004113	GTG	2	6	462223	462228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298004
7552	NC_004113	TCA	2	6	462461	462466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298004
7553	NC_004113	GCC	2	6	462495	462500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298004
7554	NC_004113	TAC	2	6	462615	462620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298004
7555	NC_004113	CCA	2	6	462690	462695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298004
7556	NC_004113	GTT	2	6	462708	462713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298004
7557	NC_004113	C	6	6	462781	462786	0 %	0 %	0 %	100 %	22298005
7558	NC_004113	GGA	2	6	462789	462794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298005
7559	NC_004113	AGT	2	6	462803	462808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298005
7560	NC_004113	GC	3	6	462839	462844	0 %	0 %	50 %	50 %	22298005
7561	NC_004113	TGGG	2	8	462894	462901	0 %	25 %	75 %	0 %	22298005
7562	NC_004113	GGT	2	6	462932	462937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298005
7563	NC_004113	GCC	2	6	462953	462958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298005
7564	NC_004113	C	6	6	462957	462962	0 %	0 %	0 %	100 %	22298005
7565	NC_004113	T	6	6	463013	463018	0 %	100 %	0 %	0 %	22298005
7566	NC_004113	AGC	2	6	463030	463035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298005
7567	NC_004113	AAT	2	6	463046	463051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298005
7568	NC_004113	CTG	2	6	463085	463090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298005
7569	NC_004113	CTG	2	6	463271	463276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298005
7570	NC_004113	GTG	2	6	463277	463282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298005
7571	NC_004113	CTT	2	6	463306	463311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298005
7572	NC_004113	GTG	2	6	463361	463366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298005
7573	NC_004113	GGT	2	6	463384	463389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298005
7574	NC_004113	T	6	6	463394	463399	0 %	100 %	0 %	0 %	22298005
7575	NC_004113	TACC	2	8	463411	463418	25 %	25 %	0 %	50 %	22298005
7576	NC_004113	CGA	2	6	463420	463425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298005
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7578	NC_004113	CTTTAT	2	12	463474	463485	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	22298005
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7580	NC_004113	CCGC	2	8	463602	463609	0 %	0 %	25 %	75 %	22298006
7581	NC_004113	GCA	2	6	463611	463616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298006
7582	NC_004113	CA	3	6	463615	463620	50 %	0 %	0 %	50 %	22298006
7583	NC_004113	GCC	2	6	463629	463634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298006
7584	NC_004113	TCT	2	6	463677	463682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298006
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7587	NC_004113	C	7	7	463761	463767	0 %	0 %	0 %	100 %	22298006
7588	NC_004113	GCAG	2	8	463886	463893	25 %	0 %	50 %	25 %	22298006
7589	NC_004113	AGCCCA	2	12	463944	463955	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22298006
7590	NC_004113	CA	3	6	463972	463977	50 %	0 %	0 %	50 %	22298006
7591	NC_004113	GCC	2	6	464007	464012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298006
7592	NC_004113	CCA	2	6	464022	464027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298006
7593	NC_004113	T	6	6	464037	464042	0 %	100 %	0 %	0 %	22298006
7594	NC_004113	CGG	2	6	464043	464048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298006
7595	NC_004113	GGC	2	6	464050	464055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298006
7596	NC_004113	ATG	2	6	464069	464074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298006
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7598	NC_004113	AAT	2	6	464152	464157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298006
7599	NC_004113	CAT	2	6	464277	464282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298006
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7601	NC_004113	GA	3	6	464408	464413	50 %	0 %	50 %	0 %	22298006
7602	NC_004113	CT	3	6	464429	464434	0 %	50 %	0 %	50 %	22298006
7603	NC_004113	GAC	2	6	464451	464456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298006
7604	NC_004113	GCG	3	9	464467	464475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298006
7605	NC_004113	CACCC	2	10	464545	464554	20 %	0 %	0 %	80 %	22298006
7606	NC_004113	GGT	2	6	464572	464577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298006
7607	NC_004113	CCACAG	2	12	464653	464664	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22298007
7608	NC_004113	C	6	6	464701	464706	0 %	0 %	0 %	100 %	22298007
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7610	NC_004113	CGATCG	2	12	464765	464776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298007
7611	NC_004113	CACT	2	8	464854	464861	25 %	25 %	0 %	50 %	22298007
7612	NC_004113	CGA	2	6	464899	464904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298007
7613	NC_004113	CGC	2	6	464940	464945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298007
7614	NC_004113	CCA	2	6	464957	464962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298007
7615	NC_004113	GAG	2	6	465005	465010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298008
7616	NC_004113	GCA	2	6	465130	465135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298008
7617	NC_004113	GGGC	2	8	465139	465146	0 %	0 %	75 %	25 %	22298008
7618	NC_004113	CAG	2	6	465262	465267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298008
7619	NC_004113	CTG	2	6	465290	465295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298008
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7621	NC_004113	CGC	2	6	465497	465502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298008
7622	NC_004113	GTA	2	6	465539	465544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298008
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7624	NC_004113	CGC	2	6	465841	465846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298008
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7993	NC_004113	GCTC	2	8	487623	487630	0 %	25 %	25 %	50 %	22298033
7994	NC_004113	TTC	2	6	487688	487693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298033
7995	NC_004113	AAT	2	6	487711	487716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298033
7996	NC_004113	TG	3	6	487945	487950	0 %	50 %	50 %	0 %	22298034
7997	NC_004113	GGC	2	6	488025	488030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298034
7998	NC_004113	GCAACT	2	12	488178	488189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22298034
7999	NC_004113	AGC	2	6	488244	488249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298034
8000	NC_004113	GCAG	2	8	488283	488290	25 %	0 %	50 %	25 %	22298034

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