MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004113	TTGGT	2	10	394039	394048	0 %	60 %	40 %	0 %	22297940
6502	NC_004113	CA	3	6	394080	394085	50 %	0 %	0 %	50 %	22297940
6503	NC_004113	AAT	2	6	394113	394118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297940
6504	NC_004113	CAG	2	6	394331	394336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297940
6505	NC_004113	GGC	3	9	394390	394398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297940
6506	NC_004113	ATGGC	2	10	394411	394420	20 %	20 %	40 %	20 %	22297940
6507	NC_004113	CCA	2	6	394444	394449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297940
6508	NC_004113	CCA	2	6	394491	394496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297940
6509	NC_004113	AGC	2	6	394503	394508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297940
6510	NC_004113	ATC	2	6	394524	394529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297940
6511	NC_004113	CCA	2	6	394535	394540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297940
6512	NC_004113	TGC	2	6	394578	394583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297940
6513	NC_004113	CGCC	2	8	394612	394619	0 %	0 %	25 %	75 %	22297940
6514	NC_004113	AG	3	6	394638	394643	50 %	0 %	50 %	0 %	22297940
6515	NC_004113	ATA	2	6	394662	394667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297940
6516	NC_004113	CCAA	2	8	394775	394782	50 %	0 %	0 %	50 %	22297940
6517	NC_004113	CGC	2	6	394785	394790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297940
6518	NC_004113	GC	3	6	394819	394824	0 %	0 %	50 %	50 %	22297941
6519	NC_004113	CACTT	2	10	394825	394834	20 %	40 %	0 %	40 %	22297941
6520	NC_004113	AGG	2	6	394900	394905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297941
6521	NC_004113	CAG	2	6	394941	394946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297941
6522	NC_004113	AGT	2	6	394967	394972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297941
6523	NC_004113	CTT	2	6	394976	394981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297941
6524	NC_004113	CTT	2	6	395042	395047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297941
6525	NC_004113	GCT	2	6	395119	395124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297941
6526	NC_004113	C	7	7	395190	395196	0 %	0 %	0 %	100 %	22297941
6527	NC_004113	CGT	2	6	395270	395275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297941
6528	NC_004113	TTC	2	6	395313	395318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297941
6529	NC_004113	ACC	2	6	395335	395340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297941
6530	NC_004113	GCT	2	6	395438	395443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297941
6531	NC_004113	TCAATG	2	12	395500	395511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22297941
6532	NC_004113	ATGG	2	8	395574	395581	25 %	25 %	50 %	0 %	22297941
6533	NC_004113	CAG	2	6	395586	395591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297941
6534	NC_004113	ATCA	2	8	395643	395650	50 %	25 %	0 %	25 %	22297941
6535	NC_004113	GC	3	6	395716	395721	0 %	0 %	50 %	50 %	22297941
6536	NC_004113	CA	3	6	395835	395840	50 %	0 %	0 %	50 %	22297941
6537	NC_004113	GCC	2	6	395858	395863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297941
6538	NC_004113	CAT	2	6	395888	395893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297941
6539	NC_004113	CTG	2	6	396285	396290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297942
6540	NC_004113	CAA	2	6	396299	396304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297942
6541	NC_004113	G	6	6	396386	396391	0 %	0 %	100 %	0 %	22297942
6542	NC_004113	CTG	2	6	396486	396491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297942
6543	NC_004113	G	7	7	396497	396503	0 %	0 %	100 %	0 %	22297942
6544	NC_004113	G	6	6	396542	396547	0 %	0 %	100 %	0 %	22297942
6545	NC_004113	CGGG	2	8	396581	396588	0 %	0 %	75 %	25 %	22297942
6546	NC_004113	CGG	3	9	396662	396670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297942
6547	NC_004113	G	6	6	396753	396758	0 %	0 %	100 %	0 %	22297942
6548	NC_004113	AATCA	2	10	396804	396813	60 %	20 %	0 %	20 %	22297942
6549	NC_004113	CTG	2	6	396852	396857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297942
6550	NC_004113	CA	3	6	396956	396961	50 %	0 %	0 %	50 %	22297942
6551	NC_004113	GAA	2	6	396986	396991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297942
6552	NC_004113	TCC	2	6	396994	396999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297942
6553	NC_004113	AG	3	6	397002	397007	50 %	0 %	50 %	0 %	22297942
6554	NC_004113	G	6	6	397007	397012	0 %	0 %	100 %	0 %	22297942
6555	NC_004113	TCGG	2	8	397058	397065	0 %	25 %	50 %	25 %	22297942
6556	NC_004113	T	7	7	397231	397237	0 %	100 %	0 %	0 %	22297943
6557	NC_004113	CTC	2	6	397274	397279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297943
6558	NC_004113	TTC	2	6	397317	397322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297943
6559	NC_004113	CGA	2	6	397354	397359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297943
6560	NC_004113	AGG	2	6	397407	397412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297943
6561	NC_004113	TCT	2	6	397475	397480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297943
6562	NC_004113	CAA	2	6	397710	397715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297944
6563	NC_004113	GTT	2	6	397733	397738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297944
6564	NC_004113	ACG	2	6	397762	397767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297944
6565	NC_004113	GAA	2	6	397841	397846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297944
6566	NC_004113	CAG	2	6	397893	397898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297944
6567	NC_004113	CTT	2	6	397931	397936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297944
6568	NC_004113	AAG	2	6	397965	397970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297944
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6570	NC_004113	AGA	2	6	397993	397998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297944
6571	NC_004113	TAC	2	6	398021	398026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297944
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6574	NC_004113	TGC	2	6	398141	398146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297944
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6581	NC_004113	CAA	2	6	398573	398578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297944
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6589	NC_004113	CTG	2	6	399538	399543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297945
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6604	NC_004113	TGGG	2	8	400202	400209	0 %	25 %	75 %	0 %	22297945
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6621	NC_004113	GTAT	2	8	400938	400945	25 %	50 %	25 %	0 %	22297946
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6994	NC_004113	CGA	2	6	425097	425102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297968
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6996	NC_004113	GTTG	2	8	425193	425200	0 %	50 %	50 %	0 %	22297969
6997	NC_004113	T	6	6	425261	425266	0 %	100 %	0 %	0 %	22297969
6998	NC_004113	CGC	2	6	425303	425308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297969
6999	NC_004113	CGC	2	6	425394	425399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297969
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