MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 chromosome

Total Repeats: 52231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003869	TAG	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806543
2	NC_003869	CCA	2	6	429	434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20806543
3	NC_003869	AGA	2	6	478	483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
4	NC_003869	A	6	6	517	522	100 %	0 %	0 %	0 %	20806543
5	NC_003869	TAA	2	6	525	530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806543
6	NC_003869	AT	3	6	538	543	50 %	50 %	0 %	0 %	20806543
7	NC_003869	AGA	2	6	607	612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
8	NC_003869	GAA	3	9	614	622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
9	NC_003869	AG	3	6	626	631	50 %	0 %	50 %	0 %	20806543
10	NC_003869	GGA	2	6	806	811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20806543
11	NC_003869	TCA	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806543
12	NC_003869	AAT	2	6	883	888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806543
13	NC_003869	GAA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
14	NC_003869	CTA	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806543
15	NC_003869	GAT	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806543
16	NC_003869	ATTCA	2	10	1001	1010	40 %	40 %	0 %	20 %	20806543
17	NC_003869	GAAC	2	8	1022	1029	50 %	0 %	25 %	25 %	20806543
18	NC_003869	AGA	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
19	NC_003869	CCA	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20806543
20	NC_003869	A	6	6	1214	1219	100 %	0 %	0 %	0 %	20806543
21	NC_003869	A	6	6	1272	1277	100 %	0 %	0 %	0 %	20806543
22	NC_003869	TAA	2	6	1311	1316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806543
23	NC_003869	AACAA	2	10	1397	1406	80 %	0 %	0 %	20 %	20806543
24	NC_003869	AAG	3	9	1431	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
25	NC_003869	ACA	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20806543
26	NC_003869	AGA	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
27	NC_003869	AAGA	2	8	1480	1487	75 %	0 %	25 %	0 %	20806543
28	NC_003869	A	6	6	1492	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	20806543
29	NC_003869	CT	4	8	1550	1557	0 %	50 %	0 %	50 %	20806543
30	NC_003869	GAA	2	6	1571	1576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
31	NC_003869	ACCAC	2	10	1587	1596	40 %	0 %	0 %	60 %	20806543
32	NC_003869	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	20806543
33	NC_003869	GAA	2	6	1664	1669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806543
34	NC_003869	A	7	7	1673	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	20806543
35	NC_003869	TTA	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806543
36	NC_003869	TG	4	8	1942	1949	0 %	50 %	50 %	0 %	20806544
37	NC_003869	TTG	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806544
38	NC_003869	G	6	6	1989	1994	0 %	0 %	100 %	0 %	20806544
39	NC_003869	TCC	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806544
40	NC_003869	ACC	2	6	2006	2011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20806544
41	NC_003869	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806544
42	NC_003869	GTT	2	6	2135	2140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806544
43	NC_003869	A	7	7	2167	2173	100 %	0 %	0 %	0 %	20806544
44	NC_003869	AGA	2	6	2269	2274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806544
45	NC_003869	CAAT	2	8	2324	2331	50 %	25 %	0 %	25 %	20806544
46	NC_003869	A	6	6	2347	2352	100 %	0 %	0 %	0 %	20806544
47	NC_003869	T	6	6	2358	2363	0 %	100 %	0 %	0 %	20806544
48	NC_003869	AGA	2	6	2371	2376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806544
49	NC_003869	T	6	6	2492	2497	0 %	100 %	0 %	0 %	20806544
50	NC_003869	GAA	2	6	2501	2506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806544
51	NC_003869	CT	3	6	2518	2523	0 %	50 %	0 %	50 %	20806544
52	NC_003869	TAA	2	6	2586	2591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806544
53	NC_003869	CTT	2	6	2651	2656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806544
54	NC_003869	TAAA	2	8	2718	2725	75 %	25 %	0 %	0 %	20806544
55	NC_003869	TTC	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806544
56	NC_003869	TGGAAG	2	12	2859	2870	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20806544
57	NC_003869	GAA	3	9	2939	2947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806544
58	NC_003869	TAA	3	9	2982	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806544
59	NC_003869	TGA	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806545
60	NC_003869	TA	3	6	3087	3092	50 %	50 %	0 %	0 %	20806545
61	NC_003869	AAG	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806545
62	NC_003869	AGGA	2	8	3203	3210	50 %	0 %	50 %	0 %	20806545
63	NC_003869	GGAA	2	8	3239	3246	50 %	0 %	50 %	0 %	20806545
64	NC_003869	GAG	2	6	3265	3270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20806545
65	NC_003869	A	6	6	3318	3323	100 %	0 %	0 %	0 %	20806546
66	NC_003869	AT	3	6	3358	3363	50 %	50 %	0 %	0 %	20806546
67	NC_003869	TGA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806546
68	NC_003869	GAAAA	2	10	3517	3526	80 %	0 %	20 %	0 %	20806546
69	NC_003869	TTA	2	6	3560	3565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806546
70	NC_003869	GA	3	6	3596	3601	50 %	0 %	50 %	0 %	20806546
71	NC_003869	ATA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806546
72	NC_003869	AAG	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806546
73	NC_003869	AGA	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806546
74	NC_003869	ATT	2	6	3716	3721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806546
75	NC_003869	T	7	7	3720	3726	0 %	100 %	0 %	0 %	20806546
76	NC_003869	CTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20806546
77	NC_003869	GCTT	2	8	3767	3774	0 %	50 %	25 %	25 %	20806546
78	NC_003869	AGA	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806546
79	NC_003869	TGA	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806546
80	NC_003869	AAT	2	6	3852	3857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806546
81	NC_003869	AAT	2	6	3868	3873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806546
82	NC_003869	A	6	6	3888	3893	100 %	0 %	0 %	0 %	20806546
83	NC_003869	AT	3	6	3943	3948	50 %	50 %	0 %	0 %	20806546
84	NC_003869	GAA	2	6	3979	3984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806546
85	NC_003869	A	6	6	4005	4010	100 %	0 %	0 %	0 %	20806546
86	NC_003869	AGA	3	9	4182	4190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806546
87	NC_003869	AGAA	2	8	4249	4256	75 %	0 %	25 %	0 %	20806546
88	NC_003869	A	6	6	4266	4271	100 %	0 %	0 %	0 %	20806546
89	NC_003869	TGT	2	6	4330	4335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806546
90	NC_003869	ATG	2	6	4346	4351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806546
91	NC_003869	GA	3	6	4362	4367	50 %	0 %	50 %	0 %	20806546
92	NC_003869	CATT	2	8	4389	4396	25 %	50 %	0 %	25 %	20806547
93	NC_003869	GTA	3	9	4408	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806547
94	NC_003869	ATC	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20806547
95	NC_003869	TCC	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806547
96	NC_003869	GAA	2	6	4498	4503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806547
97	NC_003869	TGT	2	6	4512	4517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806547
98	NC_003869	GAAA	2	8	4527	4534	75 %	0 %	25 %	0 %	20806547
99	NC_003869	A	7	7	4567	4573	100 %	0 %	0 %	0 %	20806547
100	NC_003869	TATC	2	8	4582	4589	25 %	50 %	0 %	25 %	20806547
101	NC_003869	GAG	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20806547
102	NC_003869	A	6	6	4698	4703	100 %	0 %	0 %	0 %	20806548
103	NC_003869	GAA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
104	NC_003869	AAGAG	2	10	4764	4773	60 %	0 %	40 %	0 %	20806548
105	NC_003869	AGAAA	2	10	4787	4796	80 %	0 %	20 %	0 %	20806548
106	NC_003869	A	6	6	4794	4799	100 %	0 %	0 %	0 %	20806548
107	NC_003869	A	7	7	4881	4887	100 %	0 %	0 %	0 %	20806548
108	NC_003869	T	6	6	4890	4895	0 %	100 %	0 %	0 %	20806548
109	NC_003869	TAAAGA	2	12	4904	4915	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20806548
110	NC_003869	AAG	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
111	NC_003869	AGA	2	6	4994	4999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
112	NC_003869	A	6	6	5040	5045	100 %	0 %	0 %	0 %	20806548
113	NC_003869	T	6	6	5127	5132	0 %	100 %	0 %	0 %	20806548
114	NC_003869	GAAT	2	8	5137	5144	50 %	25 %	25 %	0 %	20806548
115	NC_003869	T	7	7	5164	5170	0 %	100 %	0 %	0 %	20806548
116	NC_003869	ACA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20806548
117	NC_003869	T	6	6	5190	5195	0 %	100 %	0 %	0 %	20806548
118	NC_003869	GAA	2	6	5205	5210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
119	NC_003869	TAT	2	6	5223	5228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806548
120	NC_003869	ATT	2	6	5254	5259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806548
121	NC_003869	GTA	2	6	5289	5294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806548
122	NC_003869	TCC	2	6	5330	5335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806548
123	NC_003869	CAG	2	6	5355	5360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20806548
124	NC_003869	CTC	2	6	5377	5382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806548
125	NC_003869	TGTGA	2	10	5433	5442	20 %	40 %	40 %	0 %	20806548
126	NC_003869	AGT	2	6	5552	5557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806548
127	NC_003869	TTG	2	6	5563	5568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20806548
128	NC_003869	ATT	2	6	5626	5631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20806548
129	NC_003869	GCTT	2	8	5685	5692	0 %	50 %	25 %	25 %	20806548
130	NC_003869	TGG	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20806548
131	NC_003869	GAAC	2	8	5786	5793	50 %	0 %	25 %	25 %	20806548
132	NC_003869	ATA	2	6	5833	5838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806548
133	NC_003869	AAG	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806548
134	NC_003869	AGC	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20806548
135	NC_003869	TGC	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20806548
136	NC_003869	ATA	2	6	6016	6021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806548
137	NC_003869	CCT	2	6	6038	6043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20806548
138	NC_003869	ATG	3	9	6045	6053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806548
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140	NC_003869	AGG	2	6	6107	6112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20806548
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275	NC_003869	AGA	2	6	11839	11844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806553
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307	NC_003869	AAGA	2	8	13143	13150	75 %	0 %	25 %	0 %	20806553
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394	NC_003869	GTTA	2	8	17912	17919	25 %	50 %	25 %	0 %	20806556
395	NC_003869	AGGT	2	8	17920	17927	25 %	25 %	50 %	0 %	20806556
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398	NC_003869	TAA	2	6	18122	18127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20806556
399	NC_003869	AGA	2	6	18212	18217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806557
400	NC_003869	CATGCG	2	12	18247	18258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20806557
401	NC_003869	GA	3	6	18267	18272	50 %	0 %	50 %	0 %	20806557
402	NC_003869	AAAG	2	8	18319	18326	75 %	0 %	25 %	0 %	20806557
403	NC_003869	AAG	2	6	18335	18340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806557
404	NC_003869	GAA	2	6	18361	18366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20806557
405	NC_003869	ATG	2	6	18391	18396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20806557
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