MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma volcanium GSS1 chromosome

Total Repeats: 26512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002689	AGA	2	6	121	126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540832
2	NC_002689	AGA	2	6	142	147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540832
3	NC_002689	AGG	2	6	247	252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540832
4	NC_002689	TTG	2	6	303	308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13540832
5	NC_002689	CTT	2	6	471	476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540832
6	NC_002689	ATTGTT	2	12	530	541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	13540832
7	NC_002689	TAG	2	6	600	605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540832
8	NC_002689	AGA	2	6	611	616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540832
9	NC_002689	AGA	2	6	636	641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540832
10	NC_002689	A	6	6	673	678	100 %	0 %	0 %	0 %	13540832
11	NC_002689	AT	3	6	697	702	50 %	50 %	0 %	0 %	13540832
12	NC_002689	TAAA	2	8	828	835	75 %	25 %	0 %	0 %	13540832
13	NC_002689	A	6	6	904	909	100 %	0 %	0 %	0 %	13540832
14	NC_002689	GAATAG	2	12	912	923	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	13540832
15	NC_002689	AGGG	2	8	932	939	25 %	0 %	75 %	0 %	13540832
16	NC_002689	CT	3	6	949	954	0 %	50 %	0 %	50 %	13540832
17	NC_002689	GTT	2	6	992	997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13540832
18	NC_002689	A	6	6	1105	1110	100 %	0 %	0 %	0 %	13540832
19	NC_002689	CATG	2	8	1428	1435	25 %	25 %	25 %	25 %	13540833
20	NC_002689	TG	3	6	1444	1449	0 %	50 %	50 %	0 %	13540833
21	NC_002689	AAAT	2	8	1473	1480	75 %	25 %	0 %	0 %	13540833
22	NC_002689	ACA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13540833
23	NC_002689	TTC	4	12	1579	1590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540833
24	NC_002689	A	6	6	1618	1623	100 %	0 %	0 %	0 %	13540833
25	NC_002689	TAA	2	6	1693	1698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540833
26	NC_002689	TCT	2	6	1727	1732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540833
27	NC_002689	GAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
28	NC_002689	AAG	2	6	1813	1818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
29	NC_002689	CAG	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540833
30	NC_002689	AGC	2	6	1938	1943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540833
31	NC_002689	ATT	2	6	1949	1954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13540833
32	NC_002689	A	7	7	1976	1982	100 %	0 %	0 %	0 %	13540833
33	NC_002689	TAG	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540833
34	NC_002689	AAGA	2	8	2011	2018	75 %	0 %	25 %	0 %	13540833
35	NC_002689	CTT	2	6	2078	2083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540833
36	NC_002689	TAT	2	6	2089	2094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13540833
37	NC_002689	AGA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
38	NC_002689	TGC	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540833
39	NC_002689	AAG	2	6	2236	2241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
40	NC_002689	AGC	2	6	2242	2247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540833
41	NC_002689	TATGG	2	10	2285	2294	20 %	40 %	40 %	0 %	13540833
42	NC_002689	TGA	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540833
43	NC_002689	TA	3	6	2462	2467	50 %	50 %	0 %	0 %	13540833
44	NC_002689	AAG	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
45	NC_002689	GCG	2	6	2561	2566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13540833
46	NC_002689	ATT	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13540833
47	NC_002689	CTG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540833
48	NC_002689	GAG	2	6	2773	2778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540833
49	NC_002689	CCG	2	6	2807	2812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13540833
50	NC_002689	TGG	2	6	2831	2836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13540833
51	NC_002689	AT	3	6	2952	2957	50 %	50 %	0 %	0 %	13540833
52	NC_002689	CA	3	6	3017	3022	50 %	0 %	0 %	50 %	13540833
53	NC_002689	GAA	2	6	3120	3125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
54	NC_002689	ACT	2	6	3126	3131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13540833
55	NC_002689	ATG	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540833
56	NC_002689	AAC	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13540833
57	NC_002689	GGCCA	2	10	3245	3254	20 %	0 %	40 %	40 %	13540833
58	NC_002689	ATA	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540833
59	NC_002689	TTCCA	2	10	3333	3342	20 %	40 %	0 %	40 %	13540833
60	NC_002689	AAG	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540833
61	NC_002689	TCT	2	6	3364	3369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540833
62	NC_002689	TGC	2	6	3421	3426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540833
63	NC_002689	AT	3	6	3442	3447	50 %	50 %	0 %	0 %	13540833
64	NC_002689	GACA	2	8	3453	3460	50 %	0 %	25 %	25 %	13540834
65	NC_002689	TTTG	2	8	3474	3481	0 %	75 %	25 %	0 %	13540834
66	NC_002689	GAA	2	6	3520	3525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540834
67	NC_002689	T	6	6	3603	3608	0 %	100 %	0 %	0 %	13540834
68	NC_002689	AT	3	6	3626	3631	50 %	50 %	0 %	0 %	13540834
69	NC_002689	A	6	6	3650	3655	100 %	0 %	0 %	0 %	13540834
70	NC_002689	A	6	6	3782	3787	100 %	0 %	0 %	0 %	13540834
71	NC_002689	G	6	6	3817	3822	0 %	0 %	100 %	0 %	13540834
72	NC_002689	TGA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540834
73	NC_002689	ATG	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540834
74	NC_002689	TGA	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540834
75	NC_002689	GAA	2	6	3946	3951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540834
76	NC_002689	AAG	2	6	3955	3960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540834
77	NC_002689	ATT	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13540834
78	NC_002689	GAC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540834
79	NC_002689	GGAA	2	8	4126	4133	50 %	0 %	50 %	0 %	13540834
80	NC_002689	CAG	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540834
81	NC_002689	GAT	2	6	4297	4302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540834
82	NC_002689	AGG	2	6	4325	4330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540834
83	NC_002689	GAAG	2	8	4474	4481	50 %	0 %	50 %	0 %	13540835
84	NC_002689	AATG	2	8	4573	4580	50 %	25 %	25 %	0 %	13540835
85	NC_002689	G	6	6	4663	4668	0 %	0 %	100 %	0 %	13540835
86	NC_002689	TTGA	2	8	4694	4701	25 %	50 %	25 %	0 %	13540835
87	NC_002689	AGG	2	6	4800	4805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540835
88	NC_002689	TGA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540835
89	NC_002689	ACT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13540835
90	NC_002689	TGC	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540835
91	NC_002689	ATG	2	6	4937	4942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540835
92	NC_002689	GCT	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540835
93	NC_002689	AGA	2	6	4981	4986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540835
94	NC_002689	AT	3	6	4989	4994	50 %	50 %	0 %	0 %	13540835
95	NC_002689	GAG	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540835
96	NC_002689	ATGC	2	8	5064	5071	25 %	25 %	25 %	25 %	13540835
97	NC_002689	CAT	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13540836
98	NC_002689	TTC	2	6	5672	5677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540836
99	NC_002689	TGGG	2	8	5734	5741	0 %	25 %	75 %	0 %	13540836
100	NC_002689	TCT	2	6	5785	5790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540836
101	NC_002689	GAA	2	6	5841	5846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540836
102	NC_002689	G	7	7	5969	5975	0 %	0 %	100 %	0 %	13540836
103	NC_002689	GAA	2	6	6019	6024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540836
104	NC_002689	TC	3	6	6053	6058	0 %	50 %	0 %	50 %	13540836
105	NC_002689	TAA	2	6	6087	6092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540836
106	NC_002689	A	6	6	6264	6269	100 %	0 %	0 %	0 %	13540836
107	NC_002689	GAA	2	6	6576	6581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540836
108	NC_002689	TAA	2	6	6606	6611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540836
109	NC_002689	T	6	6	6703	6708	0 %	100 %	0 %	0 %	13540836
110	NC_002689	AGA	2	6	6947	6952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540836
111	NC_002689	AT	3	6	6982	6987	50 %	50 %	0 %	0 %	13540836
112	NC_002689	A	6	6	7010	7015	100 %	0 %	0 %	0 %	13540836
113	NC_002689	ATGC	2	8	7172	7179	25 %	25 %	25 %	25 %	13540837
114	NC_002689	CTG	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540837
115	NC_002689	ATG	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540837
116	NC_002689	AAG	2	6	7384	7389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540837
117	NC_002689	CTT	2	6	7420	7425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13540837
118	NC_002689	GAC	2	6	7832	7837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540838
119	NC_002689	AT	3	6	7841	7846	50 %	50 %	0 %	0 %	13540838
120	NC_002689	GCA	2	6	7853	7858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13540838
121	NC_002689	TGC	2	6	7863	7868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13540838
122	NC_002689	AGT	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540838
123	NC_002689	AGA	2	6	8025	8030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540838
124	NC_002689	ATA	2	6	8093	8098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540838
125	NC_002689	TGA	3	9	8159	8167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13540839
126	NC_002689	A	6	6	8176	8181	100 %	0 %	0 %	0 %	13540839
127	NC_002689	AAG	3	9	8183	8191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540839
128	NC_002689	GAA	2	6	8199	8204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540839
129	NC_002689	GAA	2	6	8244	8249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13540839
130	NC_002689	AGG	2	6	8274	8279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540839
131	NC_002689	CAA	2	6	8280	8285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13540839
132	NC_002689	AG	3	6	8316	8321	50 %	0 %	50 %	0 %	13540839
133	NC_002689	AAC	2	6	8328	8333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13540839
134	NC_002689	GCTT	2	8	8387	8394	0 %	50 %	25 %	25 %	13540839
135	NC_002689	GGA	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13540839
136	NC_002689	ATA	2	6	8415	8420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540839
137	NC_002689	AG	3	6	8423	8428	50 %	0 %	50 %	0 %	13540839
138	NC_002689	ATA	2	6	8433	8438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13540839
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