MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002578	GCC	2	6	152936	152941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081313
2502	NC_002578	GTC	2	6	152996	153001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081313
2503	NC_002578	ACA	2	6	153009	153014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081313
2504	NC_002578	TCCG	2	8	153026	153033	0 %	25 %	25 %	50 %	16081313
2505	NC_002578	TAT	2	6	153038	153043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081313
2506	NC_002578	CT	3	6	153052	153057	0 %	50 %	0 %	50 %	16081313
2507	NC_002578	CTTTGC	2	12	153134	153145	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081313
2508	NC_002578	TCG	2	6	153153	153158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081313
2509	NC_002578	TTC	3	9	153219	153227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081313
2510	NC_002578	TCT	2	6	153243	153248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081313
2511	NC_002578	AGA	2	6	153298	153303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081313
2512	NC_002578	CTTT	2	8	153343	153350	0 %	75 %	0 %	25 %	16081313
2513	NC_002578	ATG	2	6	153689	153694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081314
2514	NC_002578	TCG	2	6	153801	153806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081314
2515	NC_002578	ACAG	2	8	153821	153828	50 %	0 %	25 %	25 %	16081314
2516	NC_002578	GAG	2	6	153869	153874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081314
2517	NC_002578	GCA	2	6	153917	153922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081314
2518	NC_002578	GA	3	6	153927	153932	50 %	0 %	50 %	0 %	16081314
2519	NC_002578	ATGG	2	8	153944	153951	25 %	25 %	50 %	0 %	16081314
2520	NC_002578	CCGA	2	8	153965	153972	25 %	0 %	25 %	50 %	16081314
2521	NC_002578	TGT	2	6	153973	153978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081314
2522	NC_002578	GAA	2	6	154186	154191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081314
2523	NC_002578	ATG	2	6	154314	154319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081314
2524	NC_002578	TGAA	2	8	154399	154406	50 %	25 %	25 %	0 %	16081315
2525	NC_002578	GAT	2	6	154440	154445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081315
2526	NC_002578	CCTG	2	8	154487	154494	0 %	25 %	25 %	50 %	16081315
2527	NC_002578	ATG	2	6	154608	154613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081315
2528	NC_002578	ATG	2	6	154705	154710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081315
2529	NC_002578	GGA	2	6	154736	154741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081315
2530	NC_002578	TGA	2	6	154748	154753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081315
2531	NC_002578	TAT	2	6	154760	154765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081315
2532	NC_002578	ATG	2	6	154794	154799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081315
2533	NC_002578	AGAA	2	8	154869	154876	75 %	0 %	25 %	0 %	16081315
2534	NC_002578	CTTC	2	8	154937	154944	0 %	50 %	0 %	50 %	16081315
2535	NC_002578	TC	3	6	154943	154948	0 %	50 %	0 %	50 %	16081315
2536	NC_002578	AGC	2	6	154992	154997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081315
2537	NC_002578	AAG	2	6	155084	155089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081315
2538	NC_002578	GA	3	6	155121	155126	50 %	0 %	50 %	0 %	16081315
2539	NC_002578	GTT	2	6	155171	155176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081315
2540	NC_002578	ATG	2	6	155268	155273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081315
2541	NC_002578	TCA	2	6	155281	155286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081315
2542	NC_002578	A	6	6	155299	155304	100 %	0 %	0 %	0 %	16081315
2543	NC_002578	TCG	2	6	155317	155322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081315
2544	NC_002578	TGC	2	6	155375	155380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081315
2545	NC_002578	CAG	2	6	155399	155404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081315
2546	NC_002578	A	6	6	155417	155422	100 %	0 %	0 %	0 %	16081315
2547	NC_002578	CGCGAA	2	12	155456	155467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081315
2548	NC_002578	GTA	2	6	155483	155488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081315
2549	NC_002578	AAG	2	6	155702	155707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082490
2550	NC_002578	AGA	2	6	155715	155720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082490
2551	NC_002578	GGA	2	6	155779	155784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082490
2552	NC_002578	CTG	2	6	155828	155833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082490
2553	NC_002578	TGG	2	6	155871	155876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082490
2554	NC_002578	ATC	2	6	155902	155907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082490
2555	NC_002578	ATGATA	2	12	155981	155992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16082490
2556	NC_002578	ATT	2	6	156159	156164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081316
2557	NC_002578	GTG	2	6	156225	156230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081316
2558	NC_002578	GCC	2	6	156248	156253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081316
2559	NC_002578	GAG	2	6	156272	156277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081316
2560	NC_002578	CTG	2	6	156311	156316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081316
2561	NC_002578	T	6	6	156324	156329	0 %	100 %	0 %	0 %	16081316
2562	NC_002578	TTA	2	6	156355	156360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081316
2563	NC_002578	CCA	2	6	156372	156377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081316
2564	NC_002578	GAAT	2	8	156380	156387	50 %	25 %	25 %	0 %	16081316
2565	NC_002578	CCG	2	6	156397	156402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081316
2566	NC_002578	ATG	2	6	156405	156410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081316
2567	NC_002578	GTT	2	6	156590	156595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081316
2568	NC_002578	ATGACC	2	12	156609	156620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081316
2569	NC_002578	GTACG	2	10	156623	156632	20 %	20 %	40 %	20 %	16081316
2570	NC_002578	AAG	2	6	156633	156638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081316
2571	NC_002578	GTT	2	6	156710	156715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081316
2572	NC_002578	T	6	6	156714	156719	0 %	100 %	0 %	0 %	16081316
2573	NC_002578	CT	3	6	156768	156773	0 %	50 %	0 %	50 %	16081316
2574	NC_002578	TTC	2	6	156817	156822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081316
2575	NC_002578	ATA	2	6	156849	156854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081316
2576	NC_002578	GTA	2	6	156914	156919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081316
2577	NC_002578	ATG	2	6	157035	157040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081316
2578	NC_002578	TGA	2	6	157081	157086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081316
2579	NC_002578	GAAC	2	8	157114	157121	50 %	0 %	25 %	25 %	16081316
2580	NC_002578	GAA	2	6	157151	157156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081316
2581	NC_002578	GA	3	6	157197	157202	50 %	0 %	50 %	0 %	16081316
2582	NC_002578	ATA	2	6	157210	157215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081316
2583	NC_002578	TGC	2	6	157232	157237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081316
2584	NC_002578	AGA	2	6	157267	157272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081316
2585	NC_002578	ACC	2	6	157360	157365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081316
2586	NC_002578	AAC	2	6	157543	157548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081317
2587	NC_002578	TCT	2	6	157563	157568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2588	NC_002578	TAT	2	6	157666	157671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081317
2589	NC_002578	TCC	2	6	157686	157691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081317
2590	NC_002578	GTC	2	6	157879	157884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081317
2591	NC_002578	CT	3	6	157987	157992	0 %	50 %	0 %	50 %	16081317
2592	NC_002578	CAT	2	6	158004	158009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081317
2593	NC_002578	TTC	2	6	158027	158032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2594	NC_002578	ACTC	2	8	158181	158188	25 %	25 %	0 %	50 %	16081317
2595	NC_002578	AGC	2	6	158324	158329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081317
2596	NC_002578	AGG	2	6	158358	158363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081317
2597	NC_002578	TCA	2	6	158561	158566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081317
2598	NC_002578	TCA	2	6	158618	158623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081317
2599	NC_002578	CTT	2	6	158722	158727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2600	NC_002578	GAT	2	6	158757	158762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081317
2601	NC_002578	TCC	2	6	158811	158816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081317
2602	NC_002578	TCC	2	6	158900	158905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081317
2603	NC_002578	TTC	2	6	158980	158985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2604	NC_002578	TCGC	2	8	159002	159009	0 %	25 %	25 %	50 %	16081317
2605	NC_002578	ATCTC	2	10	159041	159050	20 %	40 %	0 %	40 %	16081317
2606	NC_002578	CTT	2	6	159064	159069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2607	NC_002578	TTC	2	6	159076	159081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2608	NC_002578	CTT	3	9	159085	159093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2609	NC_002578	GA	3	6	159115	159120	50 %	0 %	50 %	0 %	16081317
2610	NC_002578	ATC	2	6	159148	159153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081317
2611	NC_002578	TGATCA	2	12	159200	159211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081317
2612	NC_002578	CTT	2	6	159229	159234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2613	NC_002578	GAT	2	6	159295	159300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081317
2614	NC_002578	TC	3	6	159376	159381	0 %	50 %	0 %	50 %	16081317
2615	NC_002578	TCT	2	6	159428	159433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2616	NC_002578	TCA	2	6	159449	159454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081317
2617	NC_002578	CAT	2	6	159463	159468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081317
2618	NC_002578	CCT	3	9	159531	159539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081317
2619	NC_002578	T	6	6	159539	159544	0 %	100 %	0 %	0 %	16081317
2620	NC_002578	CAT	2	6	159603	159608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081317
2621	NC_002578	TTC	2	6	159721	159726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2622	NC_002578	CAG	2	6	159754	159759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081317
2623	NC_002578	CTT	2	6	159760	159765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081317
2624	NC_002578	TGAGA	2	10	159784	159793	40 %	20 %	40 %	0 %	16081317
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2993	NC_002578	CAGC	2	8	183904	183911	25 %	0 %	25 %	50 %	16082494
2994	NC_002578	TGC	2	6	183931	183936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082494
2995	NC_002578	TAC	3	9	184009	184017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082494
2996	NC_002578	AAG	2	6	184170	184175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082638
2997	NC_002578	GCAA	2	8	184180	184187	50 %	0 %	25 %	25 %	16082638
2998	NC_002578	ATT	2	6	184197	184202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082638
2999	NC_002578	AT	3	6	185074	185079	50 %	50 %	0 %	0 %	16081336
3000	NC_002578	AACA	2	8	185098	185105	75 %	0 %	0 %	25 %	16081336

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