MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_002578	GA	3	6	1527670	1527675	50 %	0 %	50 %	0 %	16082443
24502	NC_002578	GAG	2	6	1527727	1527732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082443
24503	NC_002578	GGC	2	6	1527735	1527740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082443
24504	NC_002578	GAC	2	6	1527810	1527815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082443
24505	NC_002578	AAG	2	6	1527879	1527884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082443
24506	NC_002578	GAA	2	6	1527899	1527904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082443
24507	NC_002578	GAG	2	6	1527909	1527914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082443
24508	NC_002578	GAT	2	6	1527966	1527971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082443
24509	NC_002578	TCC	2	6	1528029	1528034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082443
24510	NC_002578	GA	3	6	1528132	1528137	50 %	0 %	50 %	0 %	16082443
24511	NC_002578	ACC	2	6	1528427	1528432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082627
24512	NC_002578	CAC	2	6	1528450	1528455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082627
24513	NC_002578	CAA	2	6	1528465	1528470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082627
24514	NC_002578	TGA	2	6	1528498	1528503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082627
24515	NC_002578	GAG	2	6	1528659	1528664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082627
24516	NC_002578	AAT	2	6	1528667	1528672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082627
24517	NC_002578	GTG	2	6	1528701	1528706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082627
24518	NC_002578	ATA	2	6	1528743	1528748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082627
24519	NC_002578	CAG	2	6	1528779	1528784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082627
24520	NC_002578	TGT	3	9	1528817	1528825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082627
24521	NC_002578	GCC	2	6	1528835	1528840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082627
24522	NC_002578	CGC	2	6	1528912	1528917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082627
24523	NC_002578	AAG	2	6	1528941	1528946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082627
24524	NC_002578	ATA	2	6	1528989	1528994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082627
24525	NC_002578	TG	3	6	1529012	1529017	0 %	50 %	50 %	0 %	16082627
24526	NC_002578	CATA	2	8	1529038	1529045	50 %	25 %	0 %	25 %	16082627
24527	NC_002578	CGG	3	9	1529054	1529062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082627
24528	NC_002578	CGT	2	6	1529156	1529161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082627
24529	NC_002578	CT	3	6	1532563	1532568	0 %	50 %	0 %	50 %	16082444
24530	NC_002578	AAC	2	6	1532639	1532644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082444
24531	NC_002578	AAC	2	6	1532681	1532686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082444
24532	NC_002578	CGC	2	6	1532687	1532692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082444
24533	NC_002578	CGAT	2	8	1532862	1532869	25 %	25 %	25 %	25 %	16082444
24534	NC_002578	CAT	2	6	1532912	1532917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082444
24535	NC_002578	TTC	2	6	1532942	1532947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082445
24536	NC_002578	GAA	2	6	1532956	1532961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082445
24537	NC_002578	TCC	2	6	1532975	1532980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082445
24538	NC_002578	TGT	2	6	1532994	1532999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082445
24539	NC_002578	AGG	2	6	1533089	1533094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082445
24540	NC_002578	CTC	2	6	1533118	1533123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082445
24541	NC_002578	GGAT	2	8	1533179	1533186	25 %	25 %	50 %	0 %	16082445
24542	NC_002578	TTC	2	6	1533242	1533247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082445
24543	NC_002578	GTA	2	6	1533271	1533276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082445
24544	NC_002578	CAG	2	6	1533387	1533392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082445
24545	NC_002578	ATCTC	2	10	1533410	1533419	20 %	40 %	0 %	40 %	16082445
24546	NC_002578	TAT	2	6	1533430	1533435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082445
24547	NC_002578	TTC	2	6	1533443	1533448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082445
24548	NC_002578	TGGCA	2	10	1533457	1533466	20 %	20 %	40 %	20 %	16082445
24549	NC_002578	CCT	2	6	1533827	1533832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082446
24550	NC_002578	GC	3	6	1533838	1533843	0 %	0 %	50 %	50 %	16082446
24551	NC_002578	AATGT	2	10	1533935	1533944	40 %	40 %	20 %	0 %	16082446
24552	NC_002578	GTT	2	6	1533953	1533958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082446
24553	NC_002578	CCA	2	6	1533978	1533983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082446
24554	NC_002578	ACGG	2	8	1534061	1534068	25 %	0 %	50 %	25 %	16082446
24555	NC_002578	ATC	2	6	1534087	1534092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082446
24556	NC_002578	ACC	2	6	1534097	1534102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082446
24557	NC_002578	TTC	2	6	1534175	1534180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082446
24558	NC_002578	ATTATG	2	12	1534191	1534202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16082446
24559	NC_002578	CAG	2	6	1534701	1534706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082628
24560	NC_002578	CCG	2	6	1534786	1534791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082628
24561	NC_002578	GAT	2	6	1534869	1534874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082628
24562	NC_002578	GTA	2	6	1534890	1534895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082628
24563	NC_002578	ATT	3	9	1534921	1534929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082628
24564	NC_002578	GT	3	6	1534972	1534977	0 %	50 %	50 %	0 %	16082628
24565	NC_002578	GCA	2	6	1534990	1534995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082628
24566	NC_002578	GAC	2	6	1535166	1535171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082628
24567	NC_002578	AGA	2	6	1535219	1535224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082628
24568	NC_002578	TCTG	2	8	1535259	1535266	0 %	50 %	25 %	25 %	16082628
24569	NC_002578	T	6	6	1535278	1535283	0 %	100 %	0 %	0 %	16082628
24570	NC_002578	GAG	2	6	1535340	1535345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082628
24571	NC_002578	AT	3	6	1535355	1535360	50 %	50 %	0 %	0 %	16082628
24572	NC_002578	AGC	2	6	1535364	1535369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082628
24573	NC_002578	ACC	2	6	1535407	1535412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082628
24574	NC_002578	GGAAGA	2	12	1535492	1535503	50 %	0 %	50 %	0 %	16082628
24575	NC_002578	CCT	2	6	1535634	1535639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082629
24576	NC_002578	CAT	2	6	1535713	1535718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082629
24577	NC_002578	ATC	2	6	1535735	1535740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082629
24578	NC_002578	ACAT	2	8	1535768	1535775	50 %	25 %	0 %	25 %	16082629
24579	NC_002578	TCC	2	6	1535828	1535833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082629
24580	NC_002578	CCAT	2	8	1535877	1535884	25 %	25 %	0 %	50 %	16082629
24581	NC_002578	GCT	2	6	1535898	1535903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082629
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24583	NC_002578	ATG	2	6	1536048	1536053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082629
24584	NC_002578	CAG	2	6	1536070	1536075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082629
24585	NC_002578	CGA	2	6	1536105	1536110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082629
24586	NC_002578	CGA	2	6	1536155	1536160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082629
24587	NC_002578	AGG	2	6	1536167	1536172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082629
24588	NC_002578	AGA	2	6	1536303	1536308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082629
24589	NC_002578	ATC	2	6	1536313	1536318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082629
24590	NC_002578	TCC	2	6	1536355	1536360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082629
24591	NC_002578	GCAA	2	8	1536377	1536384	50 %	0 %	25 %	25 %	16082629
24592	NC_002578	AAC	2	6	1536394	1536399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082629
24593	NC_002578	AGGA	2	8	1536416	1536423	50 %	0 %	50 %	0 %	16082629
24594	NC_002578	GT	3	6	1536504	1536509	0 %	50 %	50 %	0 %	16082629
24595	NC_002578	AGT	2	6	1536615	1536620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082629
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24598	NC_002578	ACC	2	6	1536701	1536706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082629
24599	NC_002578	GAA	2	6	1536709	1536714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082629
24600	NC_002578	GAA	2	6	1536775	1536780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082629
24601	NC_002578	AAG	2	6	1536811	1536816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082629
24602	NC_002578	TTG	2	6	1536876	1536881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082629
24603	NC_002578	TAT	2	6	1536901	1536906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082629
24604	NC_002578	AGG	2	6	1537248	1537253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082447
24605	NC_002578	GTG	2	6	1537395	1537400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082447
24606	NC_002578	TTC	2	6	1537514	1537519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082447
24607	NC_002578	CATG	2	8	1537558	1537565	25 %	25 %	25 %	25 %	16082447
24608	NC_002578	TAC	2	6	1537614	1537619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082447
24609	NC_002578	ATA	3	9	1538053	1538061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082448
24610	NC_002578	T	6	6	1538132	1538137	0 %	100 %	0 %	0 %	16082448
24611	NC_002578	AGG	2	6	1538147	1538152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082448
24612	NC_002578	GTG	2	6	1538209	1538214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082448
24613	NC_002578	GAA	2	6	1538277	1538282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082448
24614	NC_002578	GAC	2	6	1538311	1538316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082448
24615	NC_002578	CAT	2	6	1538427	1538432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082448
24616	NC_002578	GATC	2	8	1538434	1538441	25 %	25 %	25 %	25 %	16082448
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24618	NC_002578	GGCAA	2	10	1538635	1538644	40 %	0 %	40 %	20 %	16082448
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24971	NC_002578	ACG	2	6	1560476	1560481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082631
24972	NC_002578	TCC	2	6	1560492	1560497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082631
24973	NC_002578	ACC	2	6	1560534	1560539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082631
24974	NC_002578	GCCC	2	8	1560549	1560556	0 %	0 %	25 %	75 %	16082631
24975	NC_002578	TGTA	2	8	1560573	1560580	25 %	50 %	25 %	0 %	16082631
24976	NC_002578	CGC	2	6	1560702	1560707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082631
24977	NC_002578	CTT	3	9	1560721	1560729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082631
24978	NC_002578	TCCT	2	8	1560865	1560872	0 %	50 %	0 %	50 %	16082631
24979	NC_002578	ATCG	2	8	1560895	1560902	25 %	25 %	25 %	25 %	16082631
24980	NC_002578	CTT	2	6	1560940	1560945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082631
24981	NC_002578	TTG	2	6	1560956	1560961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082631
24982	NC_002578	ATA	2	6	1560967	1560972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082631
24983	NC_002578	AAT	2	6	1561041	1561046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082631
24984	NC_002578	TTC	2	6	1561076	1561081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082631
24985	NC_002578	GGC	2	6	1561356	1561361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082466
24986	NC_002578	ATA	2	6	1561380	1561385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082466
24987	NC_002578	AAGGC	2	10	1561528	1561537	40 %	0 %	40 %	20 %	16082466
24988	NC_002578	TTC	2	6	1561560	1561565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082466
24989	NC_002578	TGC	2	6	1561625	1561630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082632
24990	NC_002578	TTA	2	6	1561648	1561653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082632
24991	NC_002578	TAT	2	6	1561689	1561694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082632
24992	NC_002578	TCTT	2	8	1561736	1561743	0 %	75 %	0 %	25 %	16082632
24993	NC_002578	TGCG	2	8	1561749	1561756	0 %	25 %	50 %	25 %	16082632
24994	NC_002578	ACG	2	6	1561831	1561836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082632
24995	NC_002578	TCG	2	6	1561864	1561869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082632
24996	NC_002578	GAG	2	6	1561911	1561916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082632
24997	NC_002578	GAC	2	6	1561954	1561959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082632
24998	NC_002578	CGT	2	6	1561967	1561972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082632
24999	NC_002578	AAAC	2	8	1561982	1561989	75 %	0 %	0 %	25 %	16082632
25000	NC_002578	TGT	2	6	1562136	1562141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082632

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