MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_002578	TTGC	2	8	1494485	1494492	0 %	50 %	25 %	25 %	16082415
24002	NC_002578	TCA	2	6	1494590	1494595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082415
24003	NC_002578	AGC	2	6	1494812	1494817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082415
24004	NC_002578	AAC	2	6	1494871	1494876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082415
24005	NC_002578	CGC	2	6	1494900	1494905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082415
24006	NC_002578	ATT	2	6	1494983	1494988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082415
24007	NC_002578	AT	3	6	1495020	1495025	50 %	50 %	0 %	0 %	16082415
24008	NC_002578	CTA	2	6	1495068	1495073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082415
24009	NC_002578	ATA	2	6	1495127	1495132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082415
24010	NC_002578	TCT	2	6	1495160	1495165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082415
24011	NC_002578	CTG	2	6	1495184	1495189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082415
24012	NC_002578	CTTC	2	8	1495340	1495347	0 %	50 %	0 %	50 %	16082416
24013	NC_002578	ATC	2	6	1495420	1495425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082416
24014	NC_002578	TGTC	2	8	1495769	1495776	0 %	50 %	25 %	25 %	16082626
24015	NC_002578	CTC	2	6	1495791	1495796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082626
24016	NC_002578	CATG	2	8	1495884	1495891	25 %	25 %	25 %	25 %	16082626
24017	NC_002578	GCA	2	6	1495905	1495910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082626
24018	NC_002578	CAT	2	6	1496006	1496011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082626
24019	NC_002578	CTC	2	6	1496094	1496099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082626
24020	NC_002578	CCTGA	2	10	1496853	1496862	20 %	20 %	20 %	40 %	16082417
24021	NC_002578	CGG	2	6	1496886	1496891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082417
24022	NC_002578	CCA	2	6	1496948	1496953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082417
24023	NC_002578	ATC	2	6	1497064	1497069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082417
24024	NC_002578	CCG	2	6	1497151	1497156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082417
24025	NC_002578	GAA	2	6	1497169	1497174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082417
24026	NC_002578	TCAA	2	8	1497178	1497185	50 %	25 %	0 %	25 %	16082417
24027	NC_002578	CAT	2	6	1497269	1497274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082417
24028	NC_002578	AGG	2	6	1497400	1497405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082417
24029	NC_002578	TCT	2	6	1497437	1497442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082417
24030	NC_002578	TGA	2	6	1497446	1497451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082417
24031	NC_002578	GAG	2	6	1497567	1497572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082417
24032	NC_002578	GAA	3	9	1497613	1497621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082417
24033	NC_002578	ACA	2	6	1497622	1497627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082417
24034	NC_002578	TTCT	2	8	1497631	1497638	0 %	75 %	0 %	25 %	16082417
24035	NC_002578	AT	3	6	1497659	1497664	50 %	50 %	0 %	0 %	16082417
24036	NC_002578	TTC	2	6	1497691	1497696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082417
24037	NC_002578	TC	3	6	1497762	1497767	0 %	50 %	0 %	50 %	16082417
24038	NC_002578	ATA	2	6	1497861	1497866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082417
24039	NC_002578	TCA	2	6	1497944	1497949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082417
24040	NC_002578	CTC	2	6	1497984	1497989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082417
24041	NC_002578	GAG	2	6	1498008	1498013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082417
24042	NC_002578	GCG	2	6	1498064	1498069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082417
24043	NC_002578	CGC	2	6	1498086	1498091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082417
24044	NC_002578	TCA	2	6	1498111	1498116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082417
24045	NC_002578	ATATC	2	10	1498322	1498331	40 %	40 %	0 %	20 %	16082418
24046	NC_002578	AGGT	2	8	1498390	1498397	25 %	25 %	50 %	0 %	16082418
24047	NC_002578	CAG	2	6	1498461	1498466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082418
24048	NC_002578	GCC	2	6	1498500	1498505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082418
24049	NC_002578	CCT	2	6	1498520	1498525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082418
24050	NC_002578	CTT	2	6	1498575	1498580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082418
24051	NC_002578	TCGG	2	8	1498606	1498613	0 %	25 %	50 %	25 %	16082418
24052	NC_002578	CAA	2	6	1498721	1498726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082418
24053	NC_002578	TGC	2	6	1498761	1498766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082418
24054	NC_002578	CAT	2	6	1498775	1498780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082418
24055	NC_002578	CAG	2	6	1498803	1498808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082418
24056	NC_002578	ATT	2	6	1498873	1498878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082418
24057	NC_002578	GCG	2	6	1498957	1498962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082418
24058	NC_002578	GAT	2	6	1498978	1498983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082418
24059	NC_002578	GCC	2	6	1498998	1499003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082418
24060	NC_002578	GGAT	2	8	1499040	1499047	25 %	25 %	50 %	0 %	16082418
24061	NC_002578	ATT	2	6	1499125	1499130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082418
24062	NC_002578	ATTC	2	8	1499148	1499155	25 %	50 %	0 %	25 %	16082418
24063	NC_002578	CTC	2	6	1499355	1499360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082418
24064	NC_002578	GCC	2	6	1499385	1499390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082418
24065	NC_002578	GTT	2	6	1499502	1499507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082418
24066	NC_002578	CAA	2	6	1499519	1499524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082418
24067	NC_002578	CA	3	6	1499525	1499530	50 %	0 %	0 %	50 %	16082418
24068	NC_002578	TTC	2	6	1499551	1499556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082418
24069	NC_002578	TTC	2	6	1499587	1499592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082418
24070	NC_002578	ATC	2	6	1499634	1499639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082418
24071	NC_002578	TGC	2	6	1499641	1499646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082418
24072	NC_002578	CAT	2	6	1499776	1499781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082419
24073	NC_002578	GAA	2	6	1499822	1499827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082419
24074	NC_002578	GGC	2	6	1499879	1499884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082419
24075	NC_002578	AAT	2	6	1499945	1499950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082419
24076	NC_002578	GA	3	6	1500084	1500089	50 %	0 %	50 %	0 %	16082419
24077	NC_002578	CTT	2	6	1500366	1500371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082419
24078	NC_002578	GGA	2	6	1500390	1500395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082419
24079	NC_002578	AGGAG	2	10	1500414	1500423	40 %	0 %	60 %	0 %	16082419
24080	NC_002578	TTC	3	9	1500462	1500470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082419
24081	NC_002578	CGA	2	6	1500479	1500484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082419
24082	NC_002578	ATGG	2	8	1500490	1500497	25 %	25 %	50 %	0 %	16082419
24083	NC_002578	AGC	2	6	1500616	1500621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082419
24084	NC_002578	AT	3	6	1500705	1500710	50 %	50 %	0 %	0 %	16082419
24085	NC_002578	TATT	2	8	1500805	1500812	25 %	75 %	0 %	0 %	16082420
24086	NC_002578	TTC	2	6	1500847	1500852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082420
24087	NC_002578	CATTC	2	10	1500886	1500895	20 %	40 %	0 %	40 %	16082420
24088	NC_002578	CCTG	2	8	1501072	1501079	0 %	25 %	25 %	50 %	16082420
24089	NC_002578	CAG	2	6	1501180	1501185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082420
24090	NC_002578	CATG	2	8	1501284	1501291	25 %	25 %	25 %	25 %	16082421
24091	NC_002578	ACGG	2	8	1501379	1501386	25 %	0 %	50 %	25 %	16082421
24092	NC_002578	AAG	2	6	1501397	1501402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082421
24093	NC_002578	ATA	2	6	1501448	1501453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082421
24094	NC_002578	GAT	2	6	1501499	1501504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082421
24095	NC_002578	CATA	2	8	1501636	1501643	50 %	25 %	0 %	25 %	16082422
24096	NC_002578	GA	3	6	1501687	1501692	50 %	0 %	50 %	0 %	16082422
24097	NC_002578	ATAC	2	8	1501718	1501725	50 %	25 %	0 %	25 %	16082422
24098	NC_002578	GCT	2	6	1501779	1501784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082422
24099	NC_002578	AGAA	2	8	1501800	1501807	75 %	0 %	25 %	0 %	16082422
24100	NC_002578	TTG	2	6	1501885	1501890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082422
24101	NC_002578	AGGC	2	8	1501948	1501955	25 %	0 %	50 %	25 %	16082422
24102	NC_002578	TCA	2	6	1502092	1502097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082422
24103	NC_002578	GAT	2	6	1502106	1502111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082422
24104	NC_002578	GGA	2	6	1502167	1502172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082422
24105	NC_002578	GA	3	6	1502171	1502176	50 %	0 %	50 %	0 %	16082422
24106	NC_002578	GA	3	6	1502200	1502205	50 %	0 %	50 %	0 %	16082422
24107	NC_002578	TCA	2	6	1502239	1502244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082422
24108	NC_002578	CGG	2	6	1502245	1502250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082422
24109	NC_002578	GAT	3	9	1502255	1502263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082422
24110	NC_002578	CCA	2	6	1502309	1502314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082422
24111	NC_002578	GAG	2	6	1502361	1502366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082422
24112	NC_002578	GAT	2	6	1502423	1502428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082422
24113	NC_002578	CTC	2	6	1502438	1502443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082422
24114	NC_002578	TGAC	2	8	1502530	1502537	25 %	25 %	25 %	25 %	16082422
24115	NC_002578	GAG	2	6	1502544	1502549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082422
24116	NC_002578	AGA	2	6	1502578	1502583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082422
24117	NC_002578	AAG	3	9	1502631	1502639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082422
24118	NC_002578	ATA	2	6	1502640	1502645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082422
24119	NC_002578	CAT	2	6	1502673	1502678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082423
24120	NC_002578	GAGCA	2	10	1502833	1502842	40 %	0 %	40 %	20 %	16082423
24121	NC_002578	GCG	2	6	1502857	1502862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082423
24122	NC_002578	GCG	2	6	1502932	1502937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082423
24123	NC_002578	ACG	2	6	1502975	1502980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082423
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24138	NC_002578	CT	3	6	1503972	1503977	0 %	50 %	0 %	50 %	16082424
24139	NC_002578	AG	3	6	1503992	1503997	50 %	0 %	50 %	0 %	16082424
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24145	NC_002578	GCA	2	6	1504249	1504254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082425
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24147	NC_002578	T	6	6	1504319	1504324	0 %	100 %	0 %	0 %	16082425
24148	NC_002578	CCTG	3	12	1504483	1504494	0 %	25 %	25 %	50 %	16082425
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24151	NC_002578	CGT	2	6	1504534	1504539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082425
24152	NC_002578	TCC	2	6	1504593	1504598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082425
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24155	NC_002578	TCT	2	6	1504706	1504711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082425
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24221	NC_002578	ATA	3	9	1510902	1510910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082429
24222	NC_002578	ATA	2	6	1510914	1510919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082429
24223	NC_002578	TGG	2	6	1511087	1511092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082429
24224	NC_002578	CTGAGG	2	12	1511128	1511139	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16082429
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24226	NC_002578	CAA	2	6	1511174	1511179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082429
24227	NC_002578	TGT	2	6	1511207	1511212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082429
24228	NC_002578	AG	3	6	1511262	1511267	50 %	0 %	50 %	0 %	16082429
24229	NC_002578	CTG	2	6	1511287	1511292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082429
24230	NC_002578	AT	3	6	1511460	1511465	50 %	50 %	0 %	0 %	16082429
24231	NC_002578	TGG	2	6	1511473	1511478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082429
24232	NC_002578	CTTCG	2	10	1511501	1511510	0 %	40 %	20 %	40 %	16082429
24233	NC_002578	GTT	2	6	1511511	1511516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082429
24234	NC_002578	TAC	2	6	1511538	1511543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082429
24235	NC_002578	ACT	2	6	1511674	1511679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082429
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24354	NC_002578	GGC	2	6	1519215	1519220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082436
24355	NC_002578	CTT	2	6	1519337	1519342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082436
24356	NC_002578	TATC	2	8	1519413	1519420	25 %	50 %	0 %	25 %	16082436
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24358	NC_002578	ATC	2	6	1519577	1519582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082436
24359	NC_002578	CTT	2	6	1519607	1519612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082436
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24361	NC_002578	CTT	3	9	1519652	1519660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082436
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24454	NC_002578	TAC	2	6	1524657	1524662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082440
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24461	NC_002578	GCC	2	6	1525299	1525304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082441
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24470	NC_002578	GCA	2	6	1525996	1526001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082442
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24472	NC_002578	AGA	2	6	1526066	1526071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082442
24473	NC_002578	CAT	2	6	1526178	1526183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082442
24474	NC_002578	AGA	2	6	1526219	1526224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082442
24475	NC_002578	GAGG	2	8	1526229	1526236	25 %	0 %	75 %	0 %	16082442
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24477	NC_002578	GCC	2	6	1526389	1526394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082442
24478	NC_002578	GCA	2	6	1526401	1526406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082442
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24500	NC_002578	GA	3	6	1527652	1527657	50 %	0 %	50 %	0 %	16082443

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