MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_002578	TGG	2	6	1461970	1461975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082384
23502	NC_002578	TCC	2	6	1462233	1462238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082622
23503	NC_002578	CGC	2	6	1462297	1462302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082622
23504	NC_002578	CTT	2	6	1462334	1462339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082622
23505	NC_002578	TCT	2	6	1462489	1462494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082622
23506	NC_002578	CAT	2	6	1462510	1462515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082622
23507	NC_002578	AGCA	2	8	1462535	1462542	50 %	0 %	25 %	25 %	16082622
23508	NC_002578	TCCTG	2	10	1462576	1462585	0 %	40 %	20 %	40 %	16082622
23509	NC_002578	CAT	2	6	1462615	1462620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082622
23510	NC_002578	TCA	3	9	1462663	1462671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082622
23511	NC_002578	ATT	2	6	1462804	1462809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082385
23512	NC_002578	T	6	6	1462814	1462819	0 %	100 %	0 %	0 %	16082385
23513	NC_002578	CAG	2	6	1462889	1462894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082385
23514	NC_002578	CTC	2	6	1462949	1462954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082385
23515	NC_002578	CAGG	2	8	1462963	1462970	25 %	0 %	50 %	25 %	16082385
23516	NC_002578	TCCTC	2	10	1463002	1463011	0 %	40 %	0 %	60 %	16082385
23517	NC_002578	AAG	2	6	1463024	1463029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082385
23518	NC_002578	CAT	2	6	1463033	1463038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082385
23519	NC_002578	CAG	2	6	1463054	1463059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082385
23520	NC_002578	GAA	2	6	1463084	1463089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082385
23521	NC_002578	GAT	2	6	1463150	1463155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082385
23522	NC_002578	CCT	2	6	1463161	1463166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082385
23523	NC_002578	AGG	2	6	1463178	1463183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082385
23524	NC_002578	TGC	2	6	1463333	1463338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082386
23525	NC_002578	GAA	2	6	1463340	1463345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082386
23526	NC_002578	AGT	2	6	1463372	1463377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082386
23527	NC_002578	GGC	2	6	1463404	1463409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082386
23528	NC_002578	TGCA	2	8	1463462	1463469	25 %	25 %	25 %	25 %	16082386
23529	NC_002578	CT	3	6	1463743	1463748	0 %	50 %	0 %	50 %	16082386
23530	NC_002578	TCT	2	6	1463765	1463770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082386
23531	NC_002578	TTC	2	6	1463773	1463778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082386
23532	NC_002578	TTA	2	6	1463813	1463818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082386
23533	NC_002578	CTC	2	6	1463826	1463831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082386
23534	NC_002578	GATA	2	8	1463888	1463895	50 %	25 %	25 %	0 %	16082386
23535	NC_002578	CTC	2	6	1463940	1463945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082386
23536	NC_002578	TGCC	2	8	1463997	1464004	0 %	25 %	25 %	50 %	16082386
23537	NC_002578	GAC	2	6	1464009	1464014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082386
23538	NC_002578	GCC	2	6	1464018	1464023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082386
23539	NC_002578	TAT	2	6	1464138	1464143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082386
23540	NC_002578	GCC	2	6	1464168	1464173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082386
23541	NC_002578	CTT	2	6	1464273	1464278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082386
23542	NC_002578	CCA	2	6	1464284	1464289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082386
23543	NC_002578	TCCG	2	8	1464309	1464316	0 %	25 %	25 %	50 %	16082386
23544	NC_002578	CAA	2	6	1464344	1464349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082386
23545	NC_002578	CGA	2	6	1464425	1464430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082386
23546	NC_002578	CTT	2	6	1464460	1464465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082387
23547	NC_002578	GTA	2	6	1464478	1464483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082387
23548	NC_002578	TCCTG	2	10	1464512	1464521	0 %	40 %	20 %	40 %	16082387
23549	NC_002578	CTT	2	6	1464547	1464552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082387
23550	NC_002578	TCC	2	6	1464722	1464727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082388
23551	NC_002578	CGCCGA	2	12	1464744	1464755	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16082388
23552	NC_002578	GAT	2	6	1464766	1464771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082388
23553	NC_002578	CTT	2	6	1464787	1464792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082388
23554	NC_002578	CCT	2	6	1464846	1464851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082388
23555	NC_002578	ATC	2	6	1464863	1464868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082388
23556	NC_002578	TCT	2	6	1464900	1464905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082388
23557	NC_002578	GCT	2	6	1464916	1464921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082388
23558	NC_002578	TTG	2	6	1464947	1464952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082388
23559	NC_002578	CAG	2	6	1465050	1465055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082388
23560	NC_002578	TATCT	2	10	1465060	1465069	20 %	60 %	0 %	20 %	16082388
23561	NC_002578	GAA	2	6	1465445	1465450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082389
23562	NC_002578	GAT	2	6	1465466	1465471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082389
23563	NC_002578	ATA	2	6	1465480	1465485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082389
23564	NC_002578	TTG	2	6	1465501	1465506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082389
23565	NC_002578	AAT	2	6	1465846	1465851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082390
23566	NC_002578	GGA	2	6	1465921	1465926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082390
23567	NC_002578	CTG	2	6	1465953	1465958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082390
23568	NC_002578	CGT	2	6	1466080	1466085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082390
23569	NC_002578	CCA	2	6	1466086	1466091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082390
23570	NC_002578	TCT	2	6	1466097	1466102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082390
23571	NC_002578	GGT	2	6	1466113	1466118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082390
23572	NC_002578	AAG	2	6	1466132	1466137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082390
23573	NC_002578	GA	3	6	1466147	1466152	50 %	0 %	50 %	0 %	16082390
23574	NC_002578	TTC	2	6	1466171	1466176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082390
23575	NC_002578	GATC	2	8	1466251	1466258	25 %	25 %	25 %	25 %	16082390
23576	NC_002578	ATG	2	6	1466322	1466327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082390
23577	NC_002578	AT	3	6	1466391	1466396	50 %	50 %	0 %	0 %	16082390
23578	NC_002578	ACA	2	6	1466397	1466402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082390
23579	NC_002578	TCG	2	6	1466559	1466564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082390
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23581	NC_002578	TCAC	2	8	1466642	1466649	25 %	25 %	0 %	50 %	16082390
23582	NC_002578	TCGA	2	8	1466813	1466820	25 %	25 %	25 %	25 %	16082623
23583	NC_002578	GAA	2	6	1466872	1466877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082623
23584	NC_002578	TTC	2	6	1466972	1466977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082623
23585	NC_002578	AGGG	2	8	1467134	1467141	25 %	0 %	75 %	0 %	16082623
23586	NC_002578	ACGG	2	8	1467155	1467162	25 %	0 %	50 %	25 %	16082623
23587	NC_002578	GAA	2	6	1467199	1467204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082623
23588	NC_002578	TGG	2	6	1467220	1467225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082623
23589	NC_002578	TCA	2	6	1467242	1467247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082623
23590	NC_002578	AAT	2	6	1467286	1467291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082623
23591	NC_002578	GAG	2	6	1467359	1467364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082623
23592	NC_002578	GGCA	2	8	1467376	1467383	25 %	0 %	50 %	25 %	16082623
23593	NC_002578	CCG	2	6	1467423	1467428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082623
23594	NC_002578	TAC	2	6	1467485	1467490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082623
23595	NC_002578	GAT	2	6	1467554	1467559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082623
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23598	NC_002578	AAGG	2	8	1467787	1467794	50 %	0 %	50 %	0 %	16082623
23599	NC_002578	ATGG	2	8	1467809	1467816	25 %	25 %	50 %	0 %	16082623
23600	NC_002578	GAAG	2	8	1467894	1467901	50 %	0 %	50 %	0 %	16082623
23601	NC_002578	AGG	2	6	1467927	1467932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082623
23602	NC_002578	AGC	2	6	1467939	1467944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082623
23603	NC_002578	AGA	3	9	1467969	1467977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082623
23604	NC_002578	GCAG	2	8	1468046	1468053	25 %	0 %	50 %	25 %	16082623
23605	NC_002578	AAG	2	6	1468082	1468087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082623
23606	NC_002578	AGG	2	6	1468095	1468100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082623
23607	NC_002578	AT	3	6	1468104	1468109	50 %	50 %	0 %	0 %	16082623
23608	NC_002578	ATA	2	6	1468145	1468150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082623
23609	NC_002578	ATC	2	6	1468153	1468158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082623
23610	NC_002578	CAG	2	6	1468233	1468238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082623
23611	NC_002578	CCAG	2	8	1468272	1468279	25 %	0 %	25 %	50 %	16082623
23612	NC_002578	ATA	2	6	1468328	1468333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082623
23613	NC_002578	TCT	2	6	1468427	1468432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082623
23614	NC_002578	ATC	2	6	1468514	1468519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082623
23615	NC_002578	GAG	2	6	1468532	1468537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082623
23616	NC_002578	TGC	2	6	1468548	1468553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082623
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23855	NC_002578	TGC	2	6	1484405	1484410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082404
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