MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_002578	CAC	2	6	1430438	1430443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082362
23002	NC_002578	GCC	2	6	1430591	1430596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082362
23003	NC_002578	GCA	2	6	1430617	1430622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082362
23004	NC_002578	CTG	2	6	1430637	1430642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082362
23005	NC_002578	GAAG	2	8	1430666	1430673	50 %	0 %	50 %	0 %	16082362
23006	NC_002578	GGA	2	6	1430699	1430704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082362
23007	NC_002578	GGT	2	6	1430794	1430799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082362
23008	NC_002578	ACG	2	6	1430806	1430811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082362
23009	NC_002578	GGTTC	2	10	1430839	1430848	0 %	40 %	40 %	20 %	16082362
23010	NC_002578	GTT	2	6	1431041	1431046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082362
23011	NC_002578	GAG	2	6	1431107	1431112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082362
23012	NC_002578	TGC	2	6	1431164	1431169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082362
23013	NC_002578	GTT	2	6	1431191	1431196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082362
23014	NC_002578	ACT	2	6	1431231	1431236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082362
23015	NC_002578	GGC	2	6	1431258	1431263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082362
23016	NC_002578	TCACTC	2	12	1431312	1431323	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16082362
23017	NC_002578	GGA	2	6	1431332	1431337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082362
23018	NC_002578	CTG	2	6	1431437	1431442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082362
23019	NC_002578	CA	3	6	1432062	1432067	50 %	0 %	0 %	50 %	16082363
23020	NC_002578	ATG	2	6	1432098	1432103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082363
23021	NC_002578	AAAT	2	8	1432143	1432150	75 %	25 %	0 %	0 %	16082363
23022	NC_002578	AAT	2	6	1432193	1432198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082363
23023	NC_002578	TAT	2	6	1432202	1432207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082363
23024	NC_002578	TTTC	2	8	1432242	1432249	0 %	75 %	0 %	25 %	16082363
23025	NC_002578	ATA	2	6	1432254	1432259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082363
23026	NC_002578	A	7	7	1432274	1432280	100 %	0 %	0 %	0 %	16082363
23027	NC_002578	TCT	2	6	1432310	1432315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082363
23028	NC_002578	CTT	2	6	1432328	1432333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082363
23029	NC_002578	ATT	2	6	1432432	1432437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082363
23030	NC_002578	TTG	2	6	1432503	1432508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082363
23031	NC_002578	GAA	2	6	1432532	1432537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082363
23032	NC_002578	ACC	2	6	1432574	1432579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082363
23033	NC_002578	ATTT	2	8	1432746	1432753	25 %	75 %	0 %	0 %	16082363
23034	NC_002578	TA	3	6	1433179	1433184	50 %	50 %	0 %	0 %	16082364
23035	NC_002578	GAA	2	6	1433205	1433210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082364
23036	NC_002578	TA	3	6	1433305	1433310	50 %	50 %	0 %	0 %	16082364
23037	NC_002578	GCT	2	6	1433323	1433328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082364
23038	NC_002578	TCGA	2	8	1433392	1433399	25 %	25 %	25 %	25 %	16082364
23039	NC_002578	ATA	2	6	1433473	1433478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082364
23040	NC_002578	GAA	3	9	1433497	1433505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082364
23041	NC_002578	AAG	2	6	1433588	1433593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082364
23042	NC_002578	CAT	2	6	1433628	1433633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082364
23043	NC_002578	CTT	2	6	1433727	1433732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082364
23044	NC_002578	AGA	2	6	1433799	1433804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082364
23045	NC_002578	TTA	2	6	1433815	1433820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082364
23046	NC_002578	GAA	2	6	1433842	1433847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082364
23047	NC_002578	ATT	2	6	1433930	1433935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082364
23048	NC_002578	AAGA	2	8	1434072	1434079	75 %	0 %	25 %	0 %	16082364
23049	NC_002578	T	6	6	1434085	1434090	0 %	100 %	0 %	0 %	16082364
23050	NC_002578	AG	3	6	1434118	1434123	50 %	0 %	50 %	0 %	16082364
23051	NC_002578	GAG	2	6	1434169	1434174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082364
23052	NC_002578	ATG	2	6	1434464	1434469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082365
23053	NC_002578	TAT	2	6	1434471	1434476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082365
23054	NC_002578	CT	3	6	1434535	1434540	0 %	50 %	0 %	50 %	16082365
23055	NC_002578	ATA	2	6	1434558	1434563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082365
23056	NC_002578	ATA	2	6	1434597	1434602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082365
23057	NC_002578	AG	3	6	1434609	1434614	50 %	0 %	50 %	0 %	16082365
23058	NC_002578	GGATA	2	10	1434642	1434651	40 %	20 %	40 %	0 %	16082365
23059	NC_002578	TCC	2	6	1434661	1434666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082365
23060	NC_002578	GAG	2	6	1434685	1434690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082365
23061	NC_002578	GAA	2	6	1434735	1434740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082365
23062	NC_002578	GA	3	6	1434784	1434789	50 %	0 %	50 %	0 %	16082365
23063	NC_002578	TCA	2	6	1434799	1434804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082365
23064	NC_002578	GT	3	6	1434830	1434835	0 %	50 %	50 %	0 %	16082365
23065	NC_002578	GTT	2	6	1434837	1434842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082365
23066	NC_002578	ATCC	2	8	1434861	1434868	25 %	25 %	0 %	50 %	16082365
23067	NC_002578	AACCT	2	10	1434899	1434908	40 %	20 %	0 %	40 %	16082365
23068	NC_002578	CAG	2	6	1434978	1434983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082365
23069	NC_002578	TCT	2	6	1434984	1434989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082365
23070	NC_002578	AAG	2	6	1435613	1435618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082366
23071	NC_002578	CTTT	2	8	1435743	1435750	0 %	75 %	0 %	25 %	16082366
23072	NC_002578	CTG	2	6	1435880	1435885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082366
23073	NC_002578	AAGA	2	8	1435886	1435893	75 %	0 %	25 %	0 %	16082366
23074	NC_002578	ATG	2	6	1435917	1435922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082366
23075	NC_002578	ACCC	2	8	1435968	1435975	25 %	0 %	0 %	75 %	16082366
23076	NC_002578	AT	3	6	1436177	1436182	50 %	50 %	0 %	0 %	16082366
23077	NC_002578	GTA	2	6	1436206	1436211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082366
23078	NC_002578	ATC	2	6	1436285	1436290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082367
23079	NC_002578	TCA	2	6	1436388	1436393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082367
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23082	NC_002578	CTT	2	6	1436485	1436490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082367
23083	NC_002578	CTT	2	6	1436524	1436529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082367
23084	NC_002578	GTT	2	6	1436713	1436718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082367
23085	NC_002578	ATT	2	6	1436762	1436767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082367
23086	NC_002578	GTGAA	2	10	1436841	1436850	40 %	20 %	40 %	0 %	16082367
23087	NC_002578	CTG	2	6	1436887	1436892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082367
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23089	NC_002578	GCC	2	6	1437004	1437009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082367
23090	NC_002578	AT	3	6	1437013	1437018	50 %	50 %	0 %	0 %	16082367
23091	NC_002578	CATG	2	8	1437060	1437067	25 %	25 %	25 %	25 %	16082367
23092	NC_002578	ATA	2	6	1437776	1437781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082368
23093	NC_002578	GAA	2	6	1437843	1437848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082368
23094	NC_002578	CCAGC	2	10	1438063	1438072	20 %	0 %	20 %	60 %	16082368
23095	NC_002578	TTC	2	6	1438088	1438093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082368
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23097	NC_002578	ACG	2	6	1438135	1438140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082368
23098	NC_002578	GAA	2	6	1438159	1438164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082368
23099	NC_002578	GAA	3	9	1438239	1438247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082368
23100	NC_002578	AAG	2	6	1438290	1438295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082368
23101	NC_002578	GGT	2	6	1438318	1438323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082368
23102	NC_002578	ATC	2	6	1438356	1438361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082368
23103	NC_002578	CT	3	6	1438372	1438377	0 %	50 %	0 %	50 %	16082368
23104	NC_002578	CTT	2	6	1438403	1438408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082368
23105	NC_002578	T	6	6	1438407	1438412	0 %	100 %	0 %	0 %	16082368
23106	NC_002578	TTC	2	6	1438457	1438462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082368
23107	NC_002578	GGC	2	6	1438476	1438481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082368
23108	NC_002578	GCA	2	6	1438489	1438494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082368
23109	NC_002578	AT	3	6	1438504	1438509	50 %	50 %	0 %	0 %	16082368
23110	NC_002578	CAA	2	6	1438562	1438567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082368
23111	NC_002578	GAA	2	6	1438581	1438586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082368
23112	NC_002578	TAATC	2	10	1438663	1438672	40 %	40 %	0 %	20 %	16082368
23113	NC_002578	GC	3	6	1438695	1438700	0 %	0 %	50 %	50 %	16082368
23114	NC_002578	TAC	2	6	1438701	1438706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082368
23115	NC_002578	ATT	2	6	1438738	1438743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082368
23116	NC_002578	A	6	6	1438746	1438751	100 %	0 %	0 %	0 %	16082368
23117	NC_002578	ATA	2	6	1438757	1438762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082368
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23119	NC_002578	A	6	6	1438873	1438878	100 %	0 %	0 %	0 %	16082368
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23358	NC_002578	TGT	2	6	1453926	1453931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082380
23359	NC_002578	TGC	2	6	1453985	1453990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082380
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23372	NC_002578	CG	3	6	1454720	1454725	0 %	0 %	50 %	50 %	16082380
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23452	NC_002578	TA	3	6	1458846	1458851	50 %	50 %	0 %	0 %	16082619
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23474	NC_002578	CAG	2	6	1460228	1460233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082383
23475	NC_002578	AG	3	6	1460257	1460262	50 %	0 %	50 %	0 %	16082383
23476	NC_002578	AAG	2	6	1460294	1460299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082383
23477	NC_002578	TAC	2	6	1460348	1460353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082383
23478	NC_002578	TAC	2	6	1460384	1460389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082383
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23481	NC_002578	TGC	2	6	1460487	1460492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082383
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23491	NC_002578	TGCT	2	8	1461284	1461291	0 %	50 %	25 %	25 %	16082621
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23495	NC_002578	TCT	2	6	1461569	1461574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082384
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23500	NC_002578	CTG	2	6	1461907	1461912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082384

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