MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_002578	GCT	2	6	1397129	1397134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082333
22503	NC_002578	TA	3	6	1397268	1397273	50 %	50 %	0 %	0 %	16082333
22504	NC_002578	TTG	2	6	1397357	1397362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082333
22505	NC_002578	GCC	2	6	1397450	1397455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082333
22506	NC_002578	GCCT	2	8	1397465	1397472	0 %	25 %	25 %	50 %	16082333
22507	NC_002578	ATT	2	6	1397494	1397499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082333
22508	NC_002578	ATG	2	6	1397573	1397578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082333
22509	NC_002578	TA	3	6	1397607	1397612	50 %	50 %	0 %	0 %	16082333
22510	NC_002578	TCA	2	6	1397639	1397644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082334
22511	NC_002578	ATT	2	6	1397646	1397651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082334
22512	NC_002578	TGG	2	6	1397668	1397673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082334
22513	NC_002578	CCA	2	6	1397797	1397802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082334
22514	NC_002578	GAA	2	6	1397861	1397866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082334
22515	NC_002578	ACG	2	6	1397994	1397999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082334
22516	NC_002578	TCC	2	6	1398019	1398024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082334
22517	NC_002578	TCA	2	6	1398048	1398053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082334
22518	NC_002578	GGCC	2	8	1398070	1398077	0 %	0 %	50 %	50 %	16082334
22519	NC_002578	TTCT	2	8	1398162	1398169	0 %	75 %	0 %	25 %	16082334
22520	NC_002578	TGT	2	6	1398386	1398391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082334
22521	NC_002578	CATA	2	8	1398395	1398402	50 %	25 %	0 %	25 %	16082334
22522	NC_002578	ATC	2	6	1398932	1398937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082335
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22524	NC_002578	CCA	2	6	1399035	1399040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082335
22525	NC_002578	CCG	2	6	1399055	1399060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082335
22526	NC_002578	TTC	2	6	1399067	1399072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082335
22527	NC_002578	CAT	2	6	1399086	1399091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082335
22528	NC_002578	CTTC	2	8	1399098	1399105	0 %	50 %	0 %	50 %	16082335
22529	NC_002578	TC	3	6	1399124	1399129	0 %	50 %	0 %	50 %	16082335
22530	NC_002578	AGG	2	6	1399141	1399146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082335
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22532	NC_002578	CT	3	6	1399352	1399357	0 %	50 %	0 %	50 %	16082335
22533	NC_002578	AGT	2	6	1399401	1399406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082335
22534	NC_002578	AGA	3	9	1399442	1399450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082335
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22536	NC_002578	TCA	2	6	1399688	1399693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082335
22537	NC_002578	AGGC	2	8	1399732	1399739	25 %	0 %	50 %	25 %	16082335
22538	NC_002578	TGG	2	6	1399749	1399754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082335
22539	NC_002578	GCA	2	6	1399760	1399765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082335
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22542	NC_002578	CTATC	2	10	1399896	1399905	20 %	40 %	0 %	40 %	16082335
22543	NC_002578	TCA	2	6	1400033	1400038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082335
22544	NC_002578	CGTA	2	8	1400064	1400071	25 %	25 %	25 %	25 %	16082335
22545	NC_002578	GGA	2	6	1400245	1400250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082613
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22549	NC_002578	ATA	2	6	1400536	1400541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082613
22550	NC_002578	TAC	2	6	1400605	1400610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082613
22551	NC_002578	GAA	2	6	1400626	1400631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082613
22552	NC_002578	AAGA	2	8	1400634	1400641	75 %	0 %	25 %	0 %	16082613
22553	NC_002578	GAA	2	6	1400655	1400660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082613
22554	NC_002578	TGGC	2	8	1400670	1400677	0 %	25 %	50 %	25 %	16082613
22555	NC_002578	GGA	2	6	1400715	1400720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082613
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22557	NC_002578	TGA	2	6	1400885	1400890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082613
22558	NC_002578	TACT	2	8	1400891	1400898	25 %	50 %	0 %	25 %	16082613
22559	NC_002578	AAG	2	6	1400987	1400992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082613
22560	NC_002578	GGC	2	6	1401055	1401060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082613
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22571	NC_002578	ACG	2	6	1401498	1401503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082336
22572	NC_002578	GA	3	6	1401519	1401524	50 %	0 %	50 %	0 %	16082336
22573	NC_002578	TGG	2	6	1401565	1401570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082336
22574	NC_002578	CTGG	2	8	1401639	1401646	0 %	25 %	50 %	25 %	16082336
22575	NC_002578	CTG	2	6	1401708	1401713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082336
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22581	NC_002578	TCTCC	2	10	1402099	1402108	0 %	40 %	0 %	60 %	16082337
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22585	NC_002578	AAGC	2	8	1402512	1402519	50 %	0 %	25 %	25 %	16082614
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22589	NC_002578	TA	3	6	1402722	1402727	50 %	50 %	0 %	0 %	16082614
22590	NC_002578	GA	3	6	1402960	1402965	50 %	0 %	50 %	0 %	16082338
22591	NC_002578	GCA	2	6	1403026	1403031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082338
22592	NC_002578	AT	3	6	1403033	1403038	50 %	50 %	0 %	0 %	16082338
22593	NC_002578	CGG	2	6	1403049	1403054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082338
22594	NC_002578	ACC	2	6	1403056	1403061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082338
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22602	NC_002578	CTC	2	6	1403587	1403592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082338
22603	NC_002578	AG	3	6	1403678	1403683	50 %	0 %	50 %	0 %	16082338
22604	NC_002578	GAT	2	6	1403688	1403693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082338
22605	NC_002578	GTC	2	6	1403938	1403943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082339
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22607	NC_002578	AGA	2	6	1403963	1403968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082339
22608	NC_002578	ATC	2	6	1404023	1404028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082339
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22611	NC_002578	TC	3	6	1404677	1404682	0 %	50 %	0 %	50 %	16082340
22612	NC_002578	ATGG	2	8	1404714	1404721	25 %	25 %	50 %	0 %	16082340
22613	NC_002578	TTG	2	6	1404747	1404752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082340
22614	NC_002578	T	6	6	1404815	1404820	0 %	100 %	0 %	0 %	16082340
22615	NC_002578	CCTGC	2	10	1404863	1404872	0 %	20 %	20 %	60 %	16082340
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22617	NC_002578	CTT	2	6	1405022	1405027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082340
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22619	NC_002578	CTT	2	6	1405178	1405183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082340
22620	NC_002578	CCT	2	6	1405186	1405191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082340
22621	NC_002578	GTT	2	6	1405234	1405239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082340
22622	NC_002578	AGCC	2	8	1405323	1405330	25 %	0 %	25 %	50 %	16082340
22623	NC_002578	TG	3	6	1405346	1405351	0 %	50 %	50 %	0 %	16082340
22624	NC_002578	TCC	2	6	1405380	1405385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082340
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22654	NC_002578	CTATC	2	10	1406938	1406947	20 %	40 %	0 %	40 %	16082341
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22731	NC_002578	ACC	2	6	1412474	1412479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082345
22732	NC_002578	AG	3	6	1412480	1412485	50 %	0 %	50 %	0 %	16082345
22733	NC_002578	CTT	2	6	1412549	1412554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082345
22734	NC_002578	GAT	2	6	1412577	1412582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082345
22735	NC_002578	CAA	3	9	1412592	1412600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082346
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