MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_002578	CCA	2	6	1364548	1364553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082305
22003	NC_002578	TG	3	6	1364720	1364725	0 %	50 %	50 %	0 %	16082305
22004	NC_002578	AGC	2	6	1364889	1364894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082305
22005	NC_002578	AGTA	2	8	1364995	1365002	50 %	25 %	25 %	0 %	16082306
22006	NC_002578	CT	3	6	1365007	1365012	0 %	50 %	0 %	50 %	16082306
22007	NC_002578	ATA	2	6	1365038	1365043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082306
22008	NC_002578	ATC	2	6	1365064	1365069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082306
22009	NC_002578	A	6	6	1365084	1365089	100 %	0 %	0 %	0 %	16082306
22010	NC_002578	GA	3	6	1365093	1365098	50 %	0 %	50 %	0 %	16082306
22011	NC_002578	ATG	2	6	1365127	1365132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082306
22012	NC_002578	AGA	2	6	1365176	1365181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082306
22013	NC_002578	AT	3	6	1365249	1365254	50 %	50 %	0 %	0 %	16082306
22014	NC_002578	CAA	2	6	1365279	1365284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082306
22015	NC_002578	ATG	2	6	1365394	1365399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082306
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22042	NC_002578	GGC	2	6	1367247	1367252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082307
22043	NC_002578	CAT	2	6	1367347	1367352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082307
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22060	NC_002578	TGG	2	6	1368120	1368125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082308
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22063	NC_002578	GCT	2	6	1368364	1368369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082308
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22103	NC_002578	ACCC	2	8	1371388	1371395	25 %	0 %	0 %	75 %	16082311
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22107	NC_002578	CT	3	6	1371544	1371549	0 %	50 %	0 %	50 %	16082311
22108	NC_002578	TCA	2	6	1371554	1371559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082311
22109	NC_002578	T	7	7	1371616	1371622	0 %	100 %	0 %	0 %	16082311
22110	NC_002578	TGC	2	6	1371699	1371704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082311
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22112	NC_002578	ATC	2	6	1371760	1371765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082311
22113	NC_002578	TC	3	6	1371857	1371862	0 %	50 %	0 %	50 %	16082311
22114	NC_002578	TGA	2	6	1371909	1371914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082311
22115	NC_002578	CTGT	2	8	1372010	1372017	0 %	50 %	25 %	25 %	16082311
22116	NC_002578	CATT	2	8	1372122	1372129	25 %	50 %	0 %	25 %	16082311
22117	NC_002578	CATA	2	8	1372244	1372251	50 %	25 %	0 %	25 %	16082311
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22119	NC_002578	GTA	2	6	1372398	1372403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082312
22120	NC_002578	ATC	2	6	1372427	1372432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082312
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22154	NC_002578	TATC	2	8	1374657	1374664	25 %	50 %	0 %	25 %	16082314
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22156	NC_002578	CT	3	6	1374747	1374752	0 %	50 %	0 %	50 %	16082314
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22476	NC_002578	AGAT	2	8	1394682	1394689	50 %	25 %	25 %	0 %	16082331
22477	NC_002578	TCT	2	6	1394743	1394748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082331
22478	NC_002578	GCA	2	6	1394826	1394831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082331
22479	NC_002578	GAG	2	6	1395119	1395124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082331
22480	NC_002578	ATCC	2	8	1395213	1395220	25 %	25 %	0 %	50 %	16082331
22481	NC_002578	GTG	2	6	1395237	1395242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082331
22482	NC_002578	TGC	2	6	1395255	1395260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082331
22483	NC_002578	ACCT	2	8	1395460	1395467	25 %	25 %	0 %	50 %	16082331
22484	NC_002578	AATG	2	8	1395488	1395495	50 %	25 %	25 %	0 %	16082331
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22486	NC_002578	AT	3	6	1395604	1395609	50 %	50 %	0 %	0 %	16082331
22487	NC_002578	TAC	2	6	1395786	1395791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082332
22488	NC_002578	GGAA	2	8	1395990	1395997	50 %	0 %	50 %	0 %	16082332
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22490	NC_002578	A	6	6	1396064	1396069	100 %	0 %	0 %	0 %	16082332
22491	NC_002578	CTTTT	2	10	1396389	1396398	0 %	80 %	0 %	20 %	16082332
22492	NC_002578	CTG	2	6	1396416	1396421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082332
22493	NC_002578	TGA	2	6	1396469	1396474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082332
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22496	NC_002578	CCGT	2	8	1396809	1396816	0 %	25 %	25 %	50 %	16082332
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22498	NC_002578	CAT	2	6	1396895	1396900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082332
22499	NC_002578	CTGT	2	8	1397000	1397007	0 %	50 %	25 %	25 %	16082333
22500	NC_002578	TTC	2	6	1397034	1397039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082333

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