MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_002578	CT	3	6	1334760	1334765	0 %	50 %	0 %	50 %	16082279
21502	NC_002578	ACC	2	6	1334808	1334813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082279
21503	NC_002578	CATC	2	8	1334874	1334881	25 %	25 %	0 %	50 %	16082279
21504	NC_002578	CGG	2	6	1335074	1335079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082279
21505	NC_002578	TCC	2	6	1335164	1335169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082279
21506	NC_002578	CAT	2	6	1335272	1335277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082279
21507	NC_002578	GAT	2	6	1335309	1335314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082279
21508	NC_002578	A	6	6	1335376	1335381	100 %	0 %	0 %	0 %	16082279
21509	NC_002578	ATC	2	6	1335383	1335388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082279
21510	NC_002578	CCA	2	6	1335425	1335430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082280
21511	NC_002578	T	6	6	1335471	1335476	0 %	100 %	0 %	0 %	16082280
21512	NC_002578	CTCC	2	8	1335481	1335488	0 %	25 %	0 %	75 %	16082280
21513	NC_002578	GAAC	2	8	1335623	1335630	50 %	0 %	25 %	25 %	16082280
21514	NC_002578	CAT	2	6	1335634	1335639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082280
21515	NC_002578	TCA	2	6	1335702	1335707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082280
21516	NC_002578	GCA	2	6	1335720	1335725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082280
21517	NC_002578	GAA	2	6	1335811	1335816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082280
21518	NC_002578	TCC	2	6	1335843	1335848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082280
21519	NC_002578	CAA	2	6	1335889	1335894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082280
21520	NC_002578	CT	3	6	1335923	1335928	0 %	50 %	0 %	50 %	16082280
21521	NC_002578	CAA	2	6	1335931	1335936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082280
21522	NC_002578	TGA	2	6	1335940	1335945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082280
21523	NC_002578	CCA	2	6	1336155	1336160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082280
21524	NC_002578	TGTA	2	8	1336428	1336435	25 %	50 %	25 %	0 %	16082604
21525	NC_002578	CCG	2	6	1336441	1336446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082604
21526	NC_002578	CTT	2	6	1336485	1336490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082604
21527	NC_002578	CT	3	6	1336521	1336526	0 %	50 %	0 %	50 %	16082604
21528	NC_002578	GAC	2	6	1336527	1336532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082604
21529	NC_002578	CTG	2	6	1336545	1336550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082604
21530	NC_002578	ATA	2	6	1336556	1336561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082604
21531	NC_002578	TCCA	2	8	1336586	1336593	25 %	25 %	0 %	50 %	16082604
21532	NC_002578	TATC	2	8	1336702	1336709	25 %	50 %	0 %	25 %	16082604
21533	NC_002578	CTT	2	6	1336739	1336744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082604
21534	NC_002578	TAT	2	6	1336745	1336750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082604
21535	NC_002578	CTCTC	2	10	1336759	1336768	0 %	40 %	0 %	60 %	16082604
21536	NC_002578	CCTG	2	8	1336829	1336836	0 %	25 %	25 %	50 %	16082604
21537	NC_002578	CTG	2	6	1336933	1336938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082604
21538	NC_002578	TCT	2	6	1336969	1336974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082604
21539	NC_002578	GATA	2	8	1337883	1337890	50 %	25 %	25 %	0 %	16082281
21540	NC_002578	ATT	2	6	1337894	1337899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082281
21541	NC_002578	CTG	2	6	1337936	1337941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082281
21542	NC_002578	AGCAGA	2	12	1337996	1338007	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16082281
21543	NC_002578	ATCC	2	8	1338035	1338042	25 %	25 %	0 %	50 %	16082281
21544	NC_002578	TTG	2	6	1338047	1338052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082281
21545	NC_002578	ATA	3	9	1338061	1338069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082281
21546	NC_002578	CAA	2	6	1338072	1338077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082281
21547	NC_002578	CTC	2	6	1338121	1338126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082281
21548	NC_002578	GAA	2	6	1338227	1338232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082282
21549	NC_002578	GGAA	2	8	1338295	1338302	50 %	0 %	50 %	0 %	16082282
21550	NC_002578	AGA	2	6	1338313	1338318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082282
21551	NC_002578	AGT	2	6	1338398	1338403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082282
21552	NC_002578	CT	4	8	1338464	1338471	0 %	50 %	0 %	50 %	16082282
21553	NC_002578	TCG	2	6	1338484	1338489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082282
21554	NC_002578	GA	3	6	1338546	1338551	50 %	0 %	50 %	0 %	16082282
21555	NC_002578	GGA	2	6	1338564	1338569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082282
21556	NC_002578	ATA	2	6	1338588	1338593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082282
21557	NC_002578	AGAA	2	8	1338645	1338652	75 %	0 %	25 %	0 %	16082282
21558	NC_002578	ATA	2	6	1338819	1338824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082282
21559	NC_002578	GCA	2	6	1338847	1338852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082282
21560	NC_002578	CCG	2	6	1338874	1338879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082282
21561	NC_002578	TAC	2	6	1338933	1338938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082282
21562	NC_002578	GAT	2	6	1338969	1338974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082282
21563	NC_002578	GAT	2	6	1339005	1339010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082282
21564	NC_002578	TAC	2	6	1339014	1339019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082282
21565	NC_002578	GCGTA	2	10	1339177	1339186	20 %	20 %	40 %	20 %	16082282
21566	NC_002578	GAT	2	6	1339277	1339282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082282
21567	NC_002578	TC	3	6	1339284	1339289	0 %	50 %	0 %	50 %	16082282
21568	NC_002578	CTTT	2	8	1339390	1339397	0 %	75 %	0 %	25 %	16082282
21569	NC_002578	GAA	2	6	1339398	1339403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082282
21570	NC_002578	GAG	2	6	1339425	1339430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082282
21571	NC_002578	GAT	2	6	1339623	1339628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082605
21572	NC_002578	GTG	2	6	1339726	1339731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082605
21573	NC_002578	GGA	2	6	1339750	1339755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082605
21574	NC_002578	AG	3	6	1339762	1339767	50 %	0 %	50 %	0 %	16082605
21575	NC_002578	GAG	2	6	1339782	1339787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082605
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21577	NC_002578	GAA	2	6	1339821	1339826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082605
21578	NC_002578	GAG	2	6	1339846	1339851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082605
21579	NC_002578	AG	3	6	1339850	1339855	50 %	0 %	50 %	0 %	16082605
21580	NC_002578	TAT	2	6	1339894	1339899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082605
21581	NC_002578	AT	3	6	1339961	1339966	50 %	50 %	0 %	0 %	16082605
21582	NC_002578	CTG	2	6	1340036	1340041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082605
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21584	NC_002578	ATTATA	2	12	1340329	1340340	50 %	50 %	0 %	0 %	16082283
21585	NC_002578	TGT	2	6	1340345	1340350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082283
21586	NC_002578	ATT	2	6	1340415	1340420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082283
21587	NC_002578	TTG	2	6	1340566	1340571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082283
21588	NC_002578	TAT	2	6	1340603	1340608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082283
21589	NC_002578	AGA	3	9	1340650	1340658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082283
21590	NC_002578	AAT	2	6	1340859	1340864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082283
21591	NC_002578	ATA	2	6	1340870	1340875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082283
21592	NC_002578	CGG	2	6	1340974	1340979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082283
21593	NC_002578	AT	3	6	1341146	1341151	50 %	50 %	0 %	0 %	16082283
21594	NC_002578	ACA	2	6	1341186	1341191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082283
21595	NC_002578	GA	3	6	1341221	1341226	50 %	0 %	50 %	0 %	16082283
21596	NC_002578	ATT	2	6	1341270	1341275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082283
21597	NC_002578	ATC	2	6	1341288	1341293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082283
21598	NC_002578	AAT	2	6	1341417	1341422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082283
21599	NC_002578	GAAC	2	8	1341428	1341435	50 %	0 %	25 %	25 %	16082283
21600	NC_002578	GCC	2	6	1341519	1341524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082283
21601	NC_002578	TCA	2	6	1341547	1341552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082283
21602	NC_002578	T	6	6	1341891	1341896	0 %	100 %	0 %	0 %	16082284
21603	NC_002578	AAG	2	6	1342004	1342009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082284
21604	NC_002578	AAG	2	6	1342012	1342017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082284
21605	NC_002578	GAT	2	6	1342061	1342066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082284
21606	NC_002578	TGG	2	6	1342092	1342097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082284
21607	NC_002578	CAG	2	6	1342139	1342144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082284
21608	NC_002578	AG	3	6	1342191	1342196	50 %	0 %	50 %	0 %	16082284
21609	NC_002578	GCA	2	6	1342210	1342215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082284
21610	NC_002578	AC	3	6	1342218	1342223	50 %	0 %	0 %	50 %	16082284
21611	NC_002578	AGATC	2	10	1342273	1342282	40 %	20 %	20 %	20 %	16082284
21612	NC_002578	CCG	2	6	1342308	1342313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082284
21613	NC_002578	ATCGG	2	10	1342343	1342352	20 %	20 %	40 %	20 %	16082284
21614	NC_002578	GAAG	2	8	1342408	1342415	50 %	0 %	50 %	0 %	16082284
21615	NC_002578	GAG	2	6	1342454	1342459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082284
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21617	NC_002578	A	6	6	1342538	1342543	100 %	0 %	0 %	0 %	16082284
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21619	NC_002578	AAG	2	6	1342777	1342782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082606
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