MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20001	NC_002578	GCA	2	6	1249526	1249531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082188
20002	NC_002578	TGC	2	6	1249600	1249605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082188
20003	NC_002578	CAG	2	6	1249615	1249620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082188
20004	NC_002578	AT	3	6	1249773	1249778	50 %	50 %	0 %	0 %	16082596
20005	NC_002578	CAA	2	6	1249793	1249798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082596
20006	NC_002578	GAC	2	6	1249824	1249829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082596
20007	NC_002578	TGT	2	6	1249862	1249867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082596
20008	NC_002578	CCTG	2	8	1249874	1249881	0 %	25 %	25 %	50 %	16082596
20009	NC_002578	CTG	2	6	1249889	1249894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082596
20010	NC_002578	TCG	2	6	1249900	1249905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082596
20011	NC_002578	GCC	2	6	1250056	1250061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082596
20012	NC_002578	TCG	2	6	1250071	1250076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082596
20013	NC_002578	TAT	2	6	1250163	1250168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082596
20014	NC_002578	CAA	2	6	1250291	1250296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082596
20015	NC_002578	ATTC	2	8	1250297	1250304	25 %	50 %	0 %	25 %	16082596
20016	NC_002578	TTGCA	2	10	1250406	1250415	20 %	40 %	20 %	20 %	16082596
20017	NC_002578	AT	3	6	1250612	1250617	50 %	50 %	0 %	0 %	16082189
20018	NC_002578	CAC	2	6	1250622	1250627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082189
20019	NC_002578	TA	3	6	1250656	1250661	50 %	50 %	0 %	0 %	16082189
20020	NC_002578	CCAT	2	8	1250713	1250720	25 %	25 %	0 %	50 %	16082189
20021	NC_002578	TCA	2	6	1250729	1250734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082189
20022	NC_002578	GTC	2	6	1250739	1250744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082189
20023	NC_002578	GAT	2	6	1250757	1250762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082189
20024	NC_002578	ATC	2	6	1250787	1250792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082189
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20026	NC_002578	GT	3	6	1250870	1250875	0 %	50 %	50 %	0 %	16082189
20027	NC_002578	AT	3	6	1250888	1250893	50 %	50 %	0 %	0 %	16082189
20028	NC_002578	GCA	2	6	1250920	1250925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082189
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20032	NC_002578	CAC	2	6	1251119	1251124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082189
20033	NC_002578	TA	3	6	1251147	1251152	50 %	50 %	0 %	0 %	16082189
20034	NC_002578	TTA	2	6	1251193	1251198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082189
20035	NC_002578	TTTG	2	8	1251210	1251217	0 %	75 %	25 %	0 %	16082189
20036	NC_002578	TC	3	6	1251280	1251285	0 %	50 %	0 %	50 %	16082189
20037	NC_002578	CCGGA	2	10	1251338	1251347	20 %	0 %	40 %	40 %	16082189
20038	NC_002578	TCT	2	6	1251374	1251379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082189
20039	NC_002578	ACC	2	6	1251451	1251456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082189
20040	NC_002578	TCT	2	6	1251474	1251479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082189
20041	NC_002578	TAT	2	6	1251495	1251500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082189
20042	NC_002578	TAT	2	6	1251540	1251545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082189
20043	NC_002578	CTG	2	6	1251788	1251793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082190
20044	NC_002578	A	7	7	1251808	1251814	100 %	0 %	0 %	0 %	16082190
20045	NC_002578	CAT	2	6	1251822	1251827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082190
20046	NC_002578	TGATAG	2	12	1251834	1251845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082190
20047	NC_002578	AT	3	6	1251925	1251930	50 %	50 %	0 %	0 %	16082190
20048	NC_002578	AT	3	6	1251960	1251965	50 %	50 %	0 %	0 %	16082190
20049	NC_002578	GGT	2	6	1251997	1252002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082190
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20052	NC_002578	GAT	2	6	1252251	1252256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082191
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20054	NC_002578	CTGC	2	8	1252273	1252280	0 %	25 %	25 %	50 %	16082191
20055	NC_002578	GAC	2	6	1252314	1252319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082191
20056	NC_002578	CT	3	6	1252354	1252359	0 %	50 %	0 %	50 %	16082191
20057	NC_002578	GCTG	2	8	1252387	1252394	0 %	25 %	50 %	25 %	16082191
20058	NC_002578	ATT	2	6	1252428	1252433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082191
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20063	NC_002578	TTC	2	6	1252704	1252709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082191
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20065	NC_002578	ATC	2	6	1253035	1253040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082192
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20072	NC_002578	TCCA	2	8	1253454	1253461	25 %	25 %	0 %	50 %	16082192
20073	NC_002578	TTA	2	6	1253487	1253492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082192
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20079	NC_002578	GCA	2	6	1253721	1253726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082192
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20084	NC_002578	TTTC	2	8	1253828	1253835	0 %	75 %	0 %	25 %	16082192
20085	NC_002578	TAT	2	6	1253905	1253910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082192
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20088	NC_002578	GACC	2	8	1254230	1254237	25 %	0 %	25 %	50 %	16082193
20089	NC_002578	GCC	2	6	1254250	1254255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082193
20090	NC_002578	GAAC	2	8	1254326	1254333	50 %	0 %	25 %	25 %	16082193
20091	NC_002578	TGA	2	6	1254414	1254419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082193
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20102	NC_002578	CAG	2	6	1254937	1254942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082194
20103	NC_002578	GATACT	2	12	1255095	1255106	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16082597
20104	NC_002578	CTG	2	6	1255135	1255140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082597
20105	NC_002578	ATC	2	6	1255186	1255191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082597
20106	NC_002578	ATA	2	6	1255267	1255272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082597
20107	NC_002578	AT	3	6	1255306	1255311	50 %	50 %	0 %	0 %	16082597
20108	NC_002578	TCA	2	6	1255391	1255396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082597
20109	NC_002578	CAT	2	6	1255415	1255420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082597
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20113	NC_002578	CTA	2	6	1255568	1255573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082597
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20116	NC_002578	AG	4	8	1255694	1255701	50 %	0 %	50 %	0 %	16082597
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20118	NC_002578	GCT	2	6	1255752	1255757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082597
20119	NC_002578	CTT	2	6	1255806	1255811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082597
20120	NC_002578	ACC	2	6	1255853	1255858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082597
20121	NC_002578	TTC	2	6	1255897	1255902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082597
20122	NC_002578	TCA	2	6	1255961	1255966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082597
20123	NC_002578	C	6	6	1256051	1256056	0 %	0 %	0 %	100 %	16082597
20124	NC_002578	GGA	2	6	1256077	1256082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082597
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20126	NC_002578	CAT	2	6	1256130	1256135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082597
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20137	NC_002578	TCA	2	6	1257218	1257223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082196
20138	NC_002578	AT	3	6	1257239	1257244	50 %	50 %	0 %	0 %	16082196
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20230	NC_002578	TTA	2	6	1262744	1262749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082201
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20238	NC_002578	TCA	2	6	1263031	1263036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082201
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20242	NC_002578	TATGA	2	10	1263151	1263160	40 %	40 %	20 %	0 %	16082201
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20354	NC_002578	GTC	2	6	1269436	1269441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082208
20355	NC_002578	TCT	2	6	1269470	1269475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082208
20356	NC_002578	CTC	2	6	1269498	1269503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082208
20357	NC_002578	CTT	2	6	1269642	1269647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082208
20358	NC_002578	A	6	6	1269707	1269712	100 %	0 %	0 %	0 %	16082208
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20362	NC_002578	TGT	2	6	1269822	1269827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082208
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20378	NC_002578	AAT	2	6	1270717	1270722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082209
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20452	NC_002578	AT	3	6	1275420	1275425	50 %	50 %	0 %	0 %	16082216
20453	NC_002578	TAT	2	6	1275491	1275496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082216
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20456	NC_002578	GATCA	2	10	1275759	1275768	40 %	20 %	20 %	20 %	16082217
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20458	NC_002578	GCG	2	6	1275809	1275814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082217
20459	NC_002578	CAA	2	6	1275850	1275855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082217
20460	NC_002578	GA	3	6	1275925	1275930	50 %	0 %	50 %	0 %	16082217
20461	NC_002578	GAT	2	6	1276070	1276075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082217
20462	NC_002578	CTGGC	2	10	1276177	1276186	0 %	20 %	40 %	40 %	16082217
20463	NC_002578	GCT	2	6	1276205	1276210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082217
20464	NC_002578	TTCCG	2	10	1276317	1276326	0 %	40 %	20 %	40 %	16082217
20465	NC_002578	TCT	2	6	1276342	1276347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082217
20466	NC_002578	CTT	2	6	1276356	1276361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082217
20467	NC_002578	TCCA	2	8	1276391	1276398	25 %	25 %	0 %	50 %	16082217
20468	NC_002578	ATC	2	6	1276421	1276426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082217
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20470	NC_002578	ACA	2	6	1276470	1276475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082217
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20472	NC_002578	TAC	2	6	1276556	1276561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082217
20473	NC_002578	TGCG	2	8	1277014	1277021	0 %	25 %	50 %	25 %	16082598
20474	NC_002578	TTCTCC	2	12	1277023	1277034	0 %	50 %	0 %	50 %	16082598
20475	NC_002578	TCA	2	6	1277054	1277059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082598
20476	NC_002578	GCC	2	6	1277072	1277077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082598
20477	NC_002578	TCG	2	6	1277078	1277083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082598
20478	NC_002578	CAT	2	6	1277088	1277093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082598
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20480	NC_002578	GGCC	2	8	1277107	1277114	0 %	0 %	50 %	50 %	16082598
20481	NC_002578	ATC	2	6	1277177	1277182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082598
20482	NC_002578	GAT	2	6	1277274	1277279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082598
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20484	NC_002578	TA	3	6	1277301	1277306	50 %	50 %	0 %	0 %	16082598
20485	NC_002578	TTG	2	6	1277390	1277395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082598
20486	NC_002578	TCTT	2	8	1277515	1277522	0 %	75 %	0 %	25 %	16082598
20487	NC_002578	GAG	2	6	1277542	1277547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082598
20488	NC_002578	CAGCAT	2	12	1277550	1277561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082598
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20492	NC_002578	CCA	2	6	1277714	1277719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082218
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20494	NC_002578	CTTC	2	8	1277743	1277750	0 %	50 %	0 %	50 %	16082218
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