MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_002578	GAA	2	6	1217599	1217604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082162
19502	NC_002578	CAGC	2	8	1217619	1217626	25 %	0 %	25 %	50 %	16082162
19503	NC_002578	CCTT	2	8	1217713	1217720	0 %	50 %	0 %	50 %	16082162
19504	NC_002578	TGA	2	6	1217727	1217732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082162
19505	NC_002578	AGCC	2	8	1217956	1217963	25 %	0 %	25 %	50 %	16082162
19506	NC_002578	T	6	6	1217966	1217971	0 %	100 %	0 %	0 %	16082162
19507	NC_002578	TCA	2	6	1217978	1217983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082162
19508	NC_002578	CATT	2	8	1218000	1218007	25 %	50 %	0 %	25 %	16082162
19509	NC_002578	CAC	2	6	1218513	1218518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082163
19510	NC_002578	TCA	2	6	1218528	1218533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082163
19511	NC_002578	TTC	2	6	1218558	1218563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082163
19512	NC_002578	CT	3	6	1218603	1218608	0 %	50 %	0 %	50 %	16082163
19513	NC_002578	TTCT	2	8	1218618	1218625	0 %	75 %	0 %	25 %	16082163
19514	NC_002578	ATC	2	6	1218638	1218643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082163
19515	NC_002578	TAT	2	6	1218644	1218649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082163
19516	NC_002578	TTG	2	6	1218759	1218764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082163
19517	NC_002578	TTG	2	6	1218820	1218825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082163
19518	NC_002578	CCA	2	6	1218832	1218837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082163
19519	NC_002578	AGC	2	6	1218948	1218953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082163
19520	NC_002578	TTC	2	6	1219056	1219061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082163
19521	NC_002578	TCT	2	6	1219075	1219080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082163
19522	NC_002578	TG	3	6	1219103	1219108	0 %	50 %	50 %	0 %	16082163
19523	NC_002578	AGATC	2	10	1219183	1219192	40 %	20 %	20 %	20 %	16082163
19524	NC_002578	TCC	2	6	1219196	1219201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082163
19525	NC_002578	ATGT	2	8	1219205	1219212	25 %	50 %	25 %	0 %	16082163
19526	NC_002578	TCT	2	6	1219251	1219256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082163
19527	NC_002578	GCCA	2	8	1219261	1219268	25 %	0 %	25 %	50 %	16082163
19528	NC_002578	TAT	2	6	1219385	1219390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082163
19529	NC_002578	TCAA	2	8	1219485	1219492	50 %	25 %	0 %	25 %	16082163
19530	NC_002578	AAT	2	6	1219543	1219548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082163
19531	NC_002578	TC	3	6	1219590	1219595	0 %	50 %	0 %	50 %	16082163
19532	NC_002578	TTG	2	6	1219644	1219649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082163
19533	NC_002578	GAA	2	6	1219733	1219738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082163
19534	NC_002578	CAC	2	6	1220092	1220097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082164
19535	NC_002578	TCT	2	6	1220119	1220124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082164
19536	NC_002578	AGG	2	6	1220139	1220144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082164
19537	NC_002578	CTT	2	6	1220162	1220167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082164
19538	NC_002578	CTG	2	6	1220174	1220179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082164
19539	NC_002578	AAT	2	6	1220512	1220517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082164
19540	NC_002578	CGA	2	6	1220550	1220555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082164
19541	NC_002578	GAT	2	6	1220704	1220709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082164
19542	NC_002578	AGA	2	6	1220749	1220754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082164
19543	NC_002578	GAA	2	6	1220864	1220869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082164
19544	NC_002578	AGG	2	6	1221005	1221010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082164
19545	NC_002578	GGA	2	6	1221012	1221017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082164
19546	NC_002578	ATC	2	6	1221037	1221042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082164
19547	NC_002578	GAG	2	6	1221121	1221126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082164
19548	NC_002578	CTG	2	6	1221198	1221203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082164
19549	NC_002578	TTC	2	6	1221215	1221220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082164
19550	NC_002578	GGAT	2	8	1221235	1221242	25 %	25 %	50 %	0 %	16082164
19551	NC_002578	TGG	2	6	1221252	1221257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082164
19552	NC_002578	GTGG	2	8	1221300	1221307	0 %	25 %	75 %	0 %	16082164
19553	NC_002578	CGT	2	6	1221367	1221372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082164
19554	NC_002578	AGG	2	6	1221395	1221400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082164
19555	NC_002578	CTT	2	6	1221422	1221427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082164
19556	NC_002578	CGA	2	6	1221490	1221495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082164
19557	NC_002578	GAA	2	6	1221514	1221519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082164
19558	NC_002578	GTAT	2	8	1221529	1221536	25 %	50 %	25 %	0 %	16082164
19559	NC_002578	CTG	2	6	1221594	1221599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082164
19560	NC_002578	AC	3	6	1221643	1221648	50 %	0 %	0 %	50 %	16082164
19561	NC_002578	CAA	2	6	1221744	1221749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082164
19562	NC_002578	A	7	7	1221783	1221789	100 %	0 %	0 %	0 %	16082164
19563	NC_002578	GGA	2	6	1221799	1221804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082164
19564	NC_002578	CTT	3	9	1221823	1221831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082165
19565	NC_002578	GCC	2	6	1221848	1221853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082165
19566	NC_002578	CTT	2	6	1221955	1221960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082165
19567	NC_002578	CAA	2	6	1222201	1222206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082165
19568	NC_002578	GAG	2	6	1222221	1222226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082165
19569	NC_002578	TAC	2	6	1222261	1222266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082165
19570	NC_002578	CTC	2	6	1222548	1222553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082657
19571	NC_002578	TTC	2	6	1222573	1222578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082657
19572	NC_002578	ATAGAT	2	12	1222592	1222603	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16082657
19573	NC_002578	T	6	6	1222643	1222648	0 %	100 %	0 %	0 %	16082657
19574	NC_002578	AGA	2	6	1222681	1222686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082657
19575	NC_002578	GA	3	6	1222785	1222790	50 %	0 %	50 %	0 %	16082657
19576	NC_002578	TA	3	6	1223143	1223148	50 %	50 %	0 %	0 %	16082166
19577	NC_002578	ATA	2	6	1223254	1223259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082166
19578	NC_002578	GGA	2	6	1223277	1223282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082166
19579	NC_002578	GAT	2	6	1223305	1223310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082166
19580	NC_002578	AT	3	6	1223368	1223373	50 %	50 %	0 %	0 %	16082166
19581	NC_002578	CAA	2	6	1223406	1223411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082166
19582	NC_002578	TAC	2	6	1223416	1223421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082166
19583	NC_002578	TGAA	2	8	1223444	1223451	50 %	25 %	25 %	0 %	16082166
19584	NC_002578	AT	3	6	1223530	1223535	50 %	50 %	0 %	0 %	16082166
19585	NC_002578	ATA	2	6	1223559	1223564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082166
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19587	NC_002578	AAT	2	6	1224078	1224083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082167
19588	NC_002578	CA	3	6	1224100	1224105	50 %	0 %	0 %	50 %	16082167
19589	NC_002578	GAA	2	6	1224118	1224123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082167
19590	NC_002578	A	6	6	1224129	1224134	100 %	0 %	0 %	0 %	16082167
19591	NC_002578	ATA	2	6	1224148	1224153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082167
19592	NC_002578	GGAA	2	8	1224181	1224188	50 %	0 %	50 %	0 %	16082167
19593	NC_002578	GGA	2	6	1224195	1224200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082167
19594	NC_002578	TGA	2	6	1224263	1224268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082167
19595	NC_002578	CAT	2	6	1224290	1224295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082167
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19598	NC_002578	ACA	2	6	1224470	1224475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082167
19599	NC_002578	AAG	2	6	1224550	1224555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082167
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19601	NC_002578	CA	3	6	1224611	1224616	50 %	0 %	0 %	50 %	16082167
19602	NC_002578	GC	3	6	1224653	1224658	0 %	0 %	50 %	50 %	16082167
19603	NC_002578	GAA	2	6	1224694	1224699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082167
19604	NC_002578	GCC	2	6	1224732	1224737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082167
19605	NC_002578	TGG	2	6	1224758	1224763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082167
19606	NC_002578	GGC	2	6	1224772	1224777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082167
19607	NC_002578	GAC	2	6	1224841	1224846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082167
19608	NC_002578	GCA	2	6	1224884	1224889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082167
19609	NC_002578	GAA	2	6	1224891	1224896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082167
19610	NC_002578	GAT	2	6	1224964	1224969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082167
19611	NC_002578	CAT	2	6	1225038	1225043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082167
19612	NC_002578	GGT	2	6	1225077	1225082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082167
19613	NC_002578	GAAC	2	8	1225314	1225321	50 %	0 %	25 %	25 %	16082167
19614	NC_002578	TGG	2	6	1225476	1225481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082167
19615	NC_002578	ATACG	2	10	1225524	1225533	40 %	20 %	20 %	20 %	16082167
19616	NC_002578	ATA	2	6	1225534	1225539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082167
19617	NC_002578	GGA	2	6	1225590	1225595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082167
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19619	NC_002578	TG	3	6	1225725	1225730	0 %	50 %	50 %	0 %	16082167
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19973	NC_002578	CAT	2	6	1248058	1248063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082188
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19975	NC_002578	CAA	3	9	1248093	1248101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082188
19976	NC_002578	ATGA	2	8	1248110	1248117	50 %	25 %	25 %	0 %	16082188
19977	NC_002578	TCA	2	6	1248171	1248176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082188
19978	NC_002578	ATC	2	6	1248233	1248238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082188
19979	NC_002578	ATG	2	6	1248308	1248313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082188
19980	NC_002578	TTC	2	6	1248347	1248352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082188
19981	NC_002578	GTA	2	6	1248412	1248417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082188
19982	NC_002578	TAT	2	6	1248553	1248558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082188
19983	NC_002578	AGA	2	6	1248668	1248673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082188
19984	NC_002578	GAGTA	2	10	1248752	1248761	40 %	20 %	40 %	0 %	16082188
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19986	NC_002578	TCT	2	6	1248810	1248815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082188
19987	NC_002578	CTG	2	6	1249007	1249012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082188
19988	NC_002578	TAT	2	6	1249027	1249032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082188
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19990	NC_002578	AT	3	6	1249072	1249077	50 %	50 %	0 %	0 %	16082188
19991	NC_002578	GGC	2	6	1249096	1249101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082188
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19993	NC_002578	TCAC	2	8	1249166	1249173	25 %	25 %	0 %	50 %	16082188
19994	NC_002578	TA	3	6	1249177	1249182	50 %	50 %	0 %	0 %	16082188
19995	NC_002578	GAA	2	6	1249183	1249188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082188
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19998	NC_002578	CCAT	2	8	1249341	1249348	25 %	25 %	0 %	50 %	16082188
19999	NC_002578	AAG	2	6	1249448	1249453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082188
20000	NC_002578	AT	3	6	1249491	1249496	50 %	50 %	0 %	0 %	16082188

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