MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_002578	CGC	2	6	1156320	1156325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082107
18502	NC_002578	TTC	2	6	1156334	1156339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082107
18503	NC_002578	TGC	3	9	1156390	1156398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082107
18504	NC_002578	CAA	2	6	1156418	1156423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082107
18505	NC_002578	TA	3	6	1156440	1156445	50 %	50 %	0 %	0 %	16082107
18506	NC_002578	TTA	2	6	1156538	1156543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082107
18507	NC_002578	GAT	2	6	1156570	1156575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082107
18508	NC_002578	CCG	2	6	1156603	1156608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082107
18509	NC_002578	CTG	2	6	1156631	1156636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082107
18510	NC_002578	GGC	2	6	1156680	1156685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082107
18511	NC_002578	ATCT	2	8	1156695	1156702	25 %	50 %	0 %	25 %	16082107
18512	NC_002578	TCG	2	6	1156705	1156710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082107
18513	NC_002578	TTC	2	6	1156729	1156734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082107
18514	NC_002578	ATG	2	6	1156804	1156809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082107
18515	NC_002578	AT	3	6	1156861	1156866	50 %	50 %	0 %	0 %	16082108
18516	NC_002578	AGCA	2	8	1156950	1156957	50 %	0 %	25 %	25 %	16082108
18517	NC_002578	ATA	2	6	1156965	1156970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082108
18518	NC_002578	GAA	2	6	1157065	1157070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082108
18519	NC_002578	GAT	2	6	1157103	1157108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082108
18520	NC_002578	ATC	2	6	1157142	1157147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082108
18521	NC_002578	TCT	2	6	1157212	1157217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082108
18522	NC_002578	TCC	2	6	1157461	1157466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082109
18523	NC_002578	AT	3	6	1157488	1157493	50 %	50 %	0 %	0 %	16082109
18524	NC_002578	GGC	2	6	1157516	1157521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082109
18525	NC_002578	GCA	2	6	1157557	1157562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082109
18526	NC_002578	TATG	2	8	1157633	1157640	25 %	50 %	25 %	0 %	16082109
18527	NC_002578	CTT	2	6	1157645	1157650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082109
18528	NC_002578	GGA	2	6	1157655	1157660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082109
18529	NC_002578	GTT	2	6	1157667	1157672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082109
18530	NC_002578	TCC	2	6	1157703	1157708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082109
18531	NC_002578	ATCA	2	8	1157906	1157913	50 %	25 %	0 %	25 %	16082109
18532	NC_002578	AGGGA	2	10	1157914	1157923	40 %	0 %	60 %	0 %	16082109
18533	NC_002578	CAC	2	6	1157984	1157989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082109
18534	NC_002578	AGAA	2	8	1158006	1158013	75 %	0 %	25 %	0 %	16082109
18535	NC_002578	GTCT	2	8	1158020	1158027	0 %	50 %	25 %	25 %	16082109
18536	NC_002578	TCC	2	6	1158048	1158053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082109
18537	NC_002578	GCT	2	6	1158062	1158067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082109
18538	NC_002578	CCT	2	6	1158174	1158179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082109
18539	NC_002578	CTGA	2	8	1158245	1158252	25 %	25 %	25 %	25 %	16082109
18540	NC_002578	GA	3	6	1158296	1158301	50 %	0 %	50 %	0 %	16082109
18541	NC_002578	TAT	2	6	1158308	1158313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082109
18542	NC_002578	AGAT	2	8	1158336	1158343	50 %	25 %	25 %	0 %	16082109
18543	NC_002578	AGA	2	6	1158358	1158363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082109
18544	NC_002578	GGTATT	2	12	1158399	1158410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16082109
18545	NC_002578	TCTG	2	8	1158437	1158444	0 %	50 %	25 %	25 %	16082109
18546	NC_002578	GTACT	2	10	1158461	1158470	20 %	40 %	20 %	20 %	16082109
18547	NC_002578	AGA	2	6	1158488	1158493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082109
18548	NC_002578	TGA	2	6	1158538	1158543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082109
18549	NC_002578	CCT	2	6	1158620	1158625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082109
18550	NC_002578	AAG	2	6	1158838	1158843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082110
18551	NC_002578	GAAA	2	8	1158848	1158855	75 %	0 %	25 %	0 %	16082110
18552	NC_002578	ATG	2	6	1158882	1158887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082110
18553	NC_002578	AGA	2	6	1159008	1159013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082110
18554	NC_002578	TCGA	2	8	1159058	1159065	25 %	25 %	25 %	25 %	16082110
18555	NC_002578	TGC	2	6	1159066	1159071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082110
18556	NC_002578	AAC	2	6	1159091	1159096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082110
18557	NC_002578	AG	3	6	1159248	1159253	50 %	0 %	50 %	0 %	16082110
18558	NC_002578	TGA	2	6	1159310	1159315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082110
18559	NC_002578	CTG	3	9	1159359	1159367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082111
18560	NC_002578	AGG	2	6	1159423	1159428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082111
18561	NC_002578	GAG	2	6	1159492	1159497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082111
18562	NC_002578	GCA	2	6	1159532	1159537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082111
18563	NC_002578	CAG	2	6	1159595	1159600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082111
18564	NC_002578	AGA	2	6	1159620	1159625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082111
18565	NC_002578	A	6	6	1159627	1159632	100 %	0 %	0 %	0 %	16082111
18566	NC_002578	TGAA	2	8	1159662	1159669	50 %	25 %	25 %	0 %	16082111
18567	NC_002578	AGGC	2	8	1159709	1159716	25 %	0 %	50 %	25 %	16082111
18568	NC_002578	ATA	2	6	1159760	1159765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082111
18569	NC_002578	AC	3	6	1159917	1159922	50 %	0 %	0 %	50 %	16082111
18570	NC_002578	TA	3	6	1159961	1159966	50 %	50 %	0 %	0 %	16082111
18571	NC_002578	AGA	2	6	1159980	1159985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082111
18572	NC_002578	AGG	2	6	1159986	1159991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082111
18573	NC_002578	GATC	2	8	1160009	1160016	25 %	25 %	25 %	25 %	16082111
18574	NC_002578	AACA	2	8	1160110	1160117	75 %	0 %	0 %	25 %	16082111
18575	NC_002578	AGA	2	6	1160161	1160166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082111
18576	NC_002578	GCT	2	6	1160254	1160259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082111
18577	NC_002578	GGGC	2	8	1160266	1160273	0 %	0 %	75 %	25 %	16082111
18578	NC_002578	GTGGA	2	10	1160334	1160343	20 %	20 %	60 %	0 %	16082111
18579	NC_002578	TGC	2	6	1160368	1160373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082111
18580	NC_002578	GA	3	6	1160397	1160402	50 %	0 %	50 %	0 %	16082111
18581	NC_002578	CTG	2	6	1160417	1160422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082111
18582	NC_002578	CGCTCA	2	12	1160433	1160444	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16082111
18583	NC_002578	TGG	2	6	1160458	1160463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082111
18584	NC_002578	ACC	2	6	1160492	1160497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082111
18585	NC_002578	GTG	2	6	1160564	1160569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082111
18586	NC_002578	AAG	2	6	1160729	1160734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082111
18587	NC_002578	AG	3	6	1160782	1160787	50 %	0 %	50 %	0 %	16082111
18588	NC_002578	GAA	2	6	1160791	1160796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082111
18589	NC_002578	GAA	2	6	1160980	1160985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082111
18590	NC_002578	CAG	2	6	1161056	1161061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082111
18591	NC_002578	CAG	2	6	1161077	1161082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082111
18592	NC_002578	A	6	6	1161150	1161155	100 %	0 %	0 %	0 %	16082111
18593	NC_002578	ACT	2	6	1161187	1161192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082112
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18598	NC_002578	GGA	2	6	1161364	1161369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082112
18599	NC_002578	AT	3	6	1161457	1161462	50 %	50 %	0 %	0 %	16082112
18600	NC_002578	TCT	2	6	1161499	1161504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082112
18601	NC_002578	CAG	2	6	1161702	1161707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082112
18602	NC_002578	ACA	2	6	1161750	1161755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082112
18603	NC_002578	GGCAGG	2	12	1161771	1161782	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	16082112
18604	NC_002578	GGT	2	6	1161824	1161829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082112
18605	NC_002578	GTT	2	6	1161939	1161944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082112
18606	NC_002578	AAAT	2	8	1162006	1162013	75 %	25 %	0 %	0 %	16082112
18607	NC_002578	GTTG	2	8	1162408	1162415	0 %	50 %	50 %	0 %	16082590
18608	NC_002578	AT	3	6	1162423	1162428	50 %	50 %	0 %	0 %	16082590
18609	NC_002578	ATG	2	6	1162464	1162469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082590
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18613	NC_002578	TCC	2	6	1162733	1162738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082590
18614	NC_002578	AGGAA	2	10	1162813	1162822	60 %	0 %	40 %	0 %	16082590
18615	NC_002578	CGTG	2	8	1162852	1162859	0 %	25 %	50 %	25 %	16082590
18616	NC_002578	TAG	2	6	1162866	1162871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082590
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18619	NC_002578	AGG	2	6	1162962	1162967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082590
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18735	NC_002578	CCA	2	6	1170209	1170214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082122
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18738	NC_002578	TTC	2	6	1170298	1170303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082122
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18743	NC_002578	CGA	2	6	1170671	1170676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082122
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18746	NC_002578	TCC	2	6	1170704	1170709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082123
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18770	NC_002578	AT	3	6	1172257	1172262	50 %	50 %	0 %	0 %	16082124
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