MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_002578	TAT	2	6	1126211	1126216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082084
18002	NC_002578	TGC	2	6	1126222	1126227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082084
18003	NC_002578	GT	3	6	1126239	1126244	0 %	50 %	50 %	0 %	16082084
18004	NC_002578	TTG	2	6	1126401	1126406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082084
18005	NC_002578	TCC	2	6	1126443	1126448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082084
18006	NC_002578	CCT	2	6	1126536	1126541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082084
18007	NC_002578	ATCGC	2	10	1126614	1126623	20 %	20 %	20 %	40 %	16082084
18008	NC_002578	GTTG	2	8	1126652	1126659	0 %	50 %	50 %	0 %	16082084
18009	NC_002578	CAG	2	6	1126694	1126699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082084
18010	NC_002578	TCA	2	6	1126776	1126781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082084
18011	NC_002578	ATC	2	6	1126784	1126789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082084
18012	NC_002578	CAT	2	6	1126790	1126795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082084
18013	NC_002578	GCC	2	6	1126839	1126844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082084
18014	NC_002578	CCA	2	6	1126885	1126890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082084
18015	NC_002578	AGCGA	2	10	1126897	1126906	40 %	0 %	40 %	20 %	16082084
18016	NC_002578	CT	3	6	1127033	1127038	0 %	50 %	0 %	50 %	16082084
18017	NC_002578	TCAACT	2	12	1127148	1127159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082084
18018	NC_002578	TTC	2	6	1127217	1127222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082085
18019	NC_002578	TCC	2	6	1127231	1127236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
18020	NC_002578	TC	3	6	1127249	1127254	0 %	50 %	0 %	50 %	16082085
18021	NC_002578	CCT	2	6	1127282	1127287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
18022	NC_002578	GTC	2	6	1127338	1127343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
18023	NC_002578	GCT	2	6	1127351	1127356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
18024	NC_002578	TAT	2	6	1127391	1127396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082085
18025	NC_002578	GGT	2	6	1127488	1127493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082085
18026	NC_002578	GAA	3	9	1127541	1127549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082085
18027	NC_002578	CAG	2	6	1127556	1127561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082085
18028	NC_002578	CATCGG	2	12	1127585	1127596	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16082085
18029	NC_002578	ATT	2	6	1127602	1127607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082085
18030	NC_002578	CTT	2	6	1127625	1127630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082085
18031	NC_002578	ATGA	2	8	1127679	1127686	50 %	25 %	25 %	0 %	16082085
18032	NC_002578	TCC	2	6	1127793	1127798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
18033	NC_002578	CCG	2	6	1127878	1127883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082085
18034	NC_002578	CCTT	2	8	1127921	1127928	0 %	50 %	0 %	50 %	16082085
18035	NC_002578	TAT	2	6	1127967	1127972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082085
18036	NC_002578	GCT	2	6	1128051	1128056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
18037	NC_002578	CTTC	2	8	1128131	1128138	0 %	50 %	0 %	50 %	16082085
18038	NC_002578	TCG	2	6	1128142	1128147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
18039	NC_002578	TTG	2	6	1128175	1128180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082085
18040	NC_002578	CCT	2	6	1128244	1128249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
18041	NC_002578	TGT	2	6	1128263	1128268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082085
18042	NC_002578	CCT	2	6	1128374	1128379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
18043	NC_002578	ATG	2	6	1128423	1128428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082085
18044	NC_002578	TCC	2	6	1128436	1128441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
18045	NC_002578	GA	3	6	1128493	1128498	50 %	0 %	50 %	0 %	16082085
18046	NC_002578	GTC	2	6	1128538	1128543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
18047	NC_002578	TAT	2	6	1128573	1128578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082085
18048	NC_002578	GTA	2	6	1128684	1128689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082085
18049	NC_002578	TC	3	6	1128700	1128705	0 %	50 %	0 %	50 %	16082085
18050	NC_002578	CAC	2	6	1128708	1128713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082085
18051	NC_002578	T	6	6	1128724	1128729	0 %	100 %	0 %	0 %	16082085
18052	NC_002578	TGT	2	6	1128848	1128853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082085
18053	NC_002578	TCC	2	6	1128892	1128897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
18054	NC_002578	CTG	2	6	1128937	1128942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
18055	NC_002578	TCA	2	6	1128961	1128966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082085
18056	NC_002578	TGT	2	6	1128971	1128976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082085
18057	NC_002578	GGT	2	6	1128995	1129000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082085
18058	NC_002578	GTATCT	2	12	1129070	1129081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082085
18059	NC_002578	ATG	2	6	1129324	1129329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082086
18060	NC_002578	GCG	3	9	1129355	1129363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082086
18061	NC_002578	CTC	2	6	1129441	1129446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082086
18062	NC_002578	AAC	2	6	1129528	1129533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082086
18063	NC_002578	GA	3	6	1129535	1129540	50 %	0 %	50 %	0 %	16082086
18064	NC_002578	AGGA	2	8	1129690	1129697	50 %	0 %	50 %	0 %	16082585
18065	NC_002578	GCG	2	6	1129706	1129711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082585
18066	NC_002578	AGA	2	6	1129751	1129756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082585
18067	NC_002578	GAG	2	6	1129789	1129794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082585
18068	NC_002578	CA	3	6	1129810	1129815	50 %	0 %	0 %	50 %	16082585
18069	NC_002578	GAT	2	6	1130020	1130025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082585
18070	NC_002578	CGA	2	6	1130046	1130051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082585
18071	NC_002578	GCA	2	6	1130089	1130094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082585
18072	NC_002578	TC	3	6	1130152	1130157	0 %	50 %	0 %	50 %	16082585
18073	NC_002578	GATCT	2	10	1130160	1130169	20 %	40 %	20 %	20 %	16082585
18074	NC_002578	TA	3	6	1130213	1130218	50 %	50 %	0 %	0 %	16082087
18075	NC_002578	CTG	2	6	1130240	1130245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082087
18076	NC_002578	GCC	2	6	1130361	1130366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082087
18077	NC_002578	CCT	2	6	1130470	1130475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082087
18078	NC_002578	CT	3	6	1130474	1130479	0 %	50 %	0 %	50 %	16082087
18079	NC_002578	TCC	2	6	1130567	1130572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082087
18080	NC_002578	GC	3	6	1130628	1130633	0 %	0 %	50 %	50 %	16082087
18081	NC_002578	GTTT	2	8	1130658	1130665	0 %	75 %	25 %	0 %	16082087
18082	NC_002578	TTC	2	6	1130854	1130859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082087
18083	NC_002578	TGT	2	6	1130991	1130996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082087
18084	NC_002578	TCT	2	6	1131057	1131062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082087
18085	NC_002578	A	6	6	1131069	1131074	100 %	0 %	0 %	0 %	16082087
18086	NC_002578	GCA	2	6	1131176	1131181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082088
18087	NC_002578	GTT	2	6	1131222	1131227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082088
18088	NC_002578	TTC	3	9	1131250	1131258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082088
18089	NC_002578	TAT	2	6	1131261	1131266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082088
18090	NC_002578	TTC	2	6	1131341	1131346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082088
18091	NC_002578	CGA	2	6	1131389	1131394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082088
18092	NC_002578	GTAT	2	8	1131419	1131426	25 %	50 %	25 %	0 %	16082088
18093	NC_002578	CTT	2	6	1131455	1131460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082088
18094	NC_002578	TCG	2	6	1131613	1131618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082586
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18099	NC_002578	GTT	2	6	1131717	1131722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082586
18100	NC_002578	CTT	2	6	1131777	1131782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082586
18101	NC_002578	CTG	2	6	1131852	1131857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082586
18102	NC_002578	TAT	2	6	1131864	1131869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082586
18103	NC_002578	AAG	2	6	1131925	1131930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082586
18104	NC_002578	ATT	2	6	1131939	1131944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082586
18105	NC_002578	CTGT	2	8	1131955	1131962	0 %	50 %	25 %	25 %	16082586
18106	NC_002578	G	6	6	1132005	1132010	0 %	0 %	100 %	0 %	16082586
18107	NC_002578	CTG	2	6	1132129	1132134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082586
18108	NC_002578	CT	3	6	1132171	1132176	0 %	50 %	0 %	50 %	16082586
18109	NC_002578	CTTC	2	8	1132202	1132209	0 %	50 %	0 %	50 %	16082586
18110	NC_002578	GC	3	6	1132267	1132272	0 %	0 %	50 %	50 %	16082586
18111	NC_002578	TCA	2	6	1132282	1132287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082586
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18113	NC_002578	GA	3	6	1132423	1132428	50 %	0 %	50 %	0 %	16082586
18114	NC_002578	ATC	2	6	1132516	1132521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082586
18115	NC_002578	TC	3	6	1132602	1132607	0 %	50 %	0 %	50 %	16082586
18116	NC_002578	GTGC	2	8	1132655	1132662	0 %	25 %	50 %	25 %	16082586
18117	NC_002578	CAC	2	6	1132683	1132688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082586
18118	NC_002578	GATA	2	8	1132950	1132957	50 %	25 %	25 %	0 %	16082587
18119	NC_002578	TGC	2	6	1132975	1132980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082587
18120	NC_002578	GCT	2	6	1133075	1133080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082587
18121	NC_002578	ACC	2	6	1133128	1133133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082587
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18123	NC_002578	TTC	2	6	1133226	1133231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082587
18124	NC_002578	CTG	2	6	1133292	1133297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082587
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18127	NC_002578	CTG	2	6	1133382	1133387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082587
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18130	NC_002578	GAT	2	6	1133481	1133486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082089
18131	NC_002578	TTC	2	6	1133515	1133520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082089
18132	NC_002578	TATCA	2	10	1133562	1133571	40 %	40 %	0 %	20 %	16082089
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18139	NC_002578	TC	3	6	1134004	1134009	0 %	50 %	0 %	50 %	16082089
18140	NC_002578	TCAT	2	8	1134025	1134032	25 %	50 %	0 %	25 %	16082089
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18144	NC_002578	GGAT	2	8	1134161	1134168	25 %	25 %	50 %	0 %	16082089
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18148	NC_002578	GGC	2	6	1134360	1134365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082089
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18151	NC_002578	TAC	2	6	1134445	1134450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082089
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18153	NC_002578	CTG	2	6	1134485	1134490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082089
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18182	NC_002578	AGG	2	6	1136849	1136854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082091
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18225	NC_002578	GAT	2	6	1139734	1139739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082093
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18228	NC_002578	TCATC	2	10	1139971	1139980	20 %	40 %	0 %	40 %	16082093
18229	NC_002578	AG	5	10	1139982	1139991	50 %	0 %	50 %	0 %	16082093
18230	NC_002578	CAT	2	6	1140028	1140033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082093
18231	NC_002578	CCTGAT	2	12	1140041	1140052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082093
18232	NC_002578	ATC	2	6	1140063	1140068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082093
18233	NC_002578	TCT	2	6	1140147	1140152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082094
18234	NC_002578	TCT	2	6	1140169	1140174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082094
18235	NC_002578	GAT	2	6	1140209	1140214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082094
18236	NC_002578	AT	3	6	1140213	1140218	50 %	50 %	0 %	0 %	16082094
18237	NC_002578	TC	3	6	1140295	1140300	0 %	50 %	0 %	50 %	16082094
18238	NC_002578	CTGAT	2	10	1140315	1140324	20 %	40 %	20 %	20 %	16082094
18239	NC_002578	TTC	2	6	1140552	1140557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082094
18240	NC_002578	TATCC	2	10	1140559	1140568	20 %	40 %	0 %	40 %	16082094
18241	NC_002578	GTAT	2	8	1140681	1140688	25 %	50 %	25 %	0 %	16082094
18242	NC_002578	CT	3	6	1140689	1140694	0 %	50 %	0 %	50 %	16082094
18243	NC_002578	CCG	2	6	1140702	1140707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082094
18244	NC_002578	TTC	2	6	1140758	1140763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082094
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18249	NC_002578	GTAC	2	8	1141110	1141117	25 %	25 %	25 %	25 %	16082094
18250	NC_002578	ATC	2	6	1141154	1141159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082094
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18254	NC_002578	CAA	2	6	1141404	1141409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082095
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18257	NC_002578	CCCT	2	8	1141467	1141474	0 %	25 %	0 %	75 %	16082095
18258	NC_002578	TA	3	6	1141538	1141543	50 %	50 %	0 %	0 %	16082095
18259	NC_002578	TCC	2	6	1141559	1141564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082095
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18265	NC_002578	ATC	2	6	1142065	1142070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082095
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18267	NC_002578	CTG	2	6	1142111	1142116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082095
18268	NC_002578	A	6	6	1142165	1142170	100 %	0 %	0 %	0 %	16082095
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18272	NC_002578	TCT	2	6	1142237	1142242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082095
18273	NC_002578	GAA	2	6	1142272	1142277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082095
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18343	NC_002578	AT	3	6	1146568	1146573	50 %	50 %	0 %	0 %	16082100
18344	NC_002578	GAA	2	6	1146686	1146691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082100
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18349	NC_002578	CGA	2	6	1147065	1147070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082100
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18351	NC_002578	AGG	2	6	1147175	1147180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082100
18352	NC_002578	TAC	2	6	1147186	1147191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082100
18353	NC_002578	GAA	2	6	1147213	1147218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082100
18354	NC_002578	AGG	2	6	1147228	1147233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082100
18355	NC_002578	GAA	2	6	1147246	1147251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082100
18356	NC_002578	AT	3	6	1147297	1147302	50 %	50 %	0 %	0 %	16082100
18357	NC_002578	TCCT	2	8	1147465	1147472	0 %	50 %	0 %	50 %	16082101
18358	NC_002578	TTG	2	6	1147508	1147513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082101
18359	NC_002578	ATCTAT	2	12	1147548	1147559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16082101
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18361	NC_002578	ATC	2	6	1147689	1147694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082101
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18365	NC_002578	T	6	6	1147899	1147904	0 %	100 %	0 %	0 %	16082101
18366	NC_002578	AT	3	6	1147935	1147940	50 %	50 %	0 %	0 %	16082101
18367	NC_002578	GGCC	2	8	1148078	1148085	0 %	0 %	50 %	50 %	16082101
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18369	NC_002578	TTC	2	6	1148193	1148198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082102
18370	NC_002578	TGA	2	6	1148200	1148205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082102
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18442	NC_002578	GATC	2	8	1152546	1152553	25 %	25 %	25 %	25 %	16082105
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18446	NC_002578	ATCAGT	2	12	1152800	1152811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298205267
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18459	NC_002578	GCT	2	6	1153773	1153778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082106
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18464	NC_002578	TCT	2	6	1153936	1153941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082106
18465	NC_002578	TGAAC	2	10	1153966	1153975	40 %	20 %	20 %	20 %	16082106
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18469	NC_002578	TCTG	2	8	1154130	1154137	0 %	50 %	25 %	25 %	16082106
18470	NC_002578	GCTC	2	8	1154158	1154165	0 %	25 %	25 %	50 %	16082106
18471	NC_002578	CTT	2	6	1154183	1154188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082106
18472	NC_002578	TGCAG	2	10	1154193	1154202	20 %	20 %	40 %	20 %	16082106
18473	NC_002578	CTG	2	6	1154213	1154218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082106
18474	NC_002578	CAG	2	6	1154357	1154362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082106
18475	NC_002578	GGCCAT	2	12	1154474	1154485	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16082106
18476	NC_002578	GAA	2	6	1154536	1154541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082106
18477	NC_002578	TAT	2	6	1154552	1154557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082106
18478	NC_002578	TCC	2	6	1154727	1154732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082106
18479	NC_002578	CCT	2	6	1154816	1154821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082106
18480	NC_002578	T	6	6	1154834	1154839	0 %	100 %	0 %	0 %	16082106
18481	NC_002578	CTC	2	6	1154939	1154944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082106
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18486	NC_002578	GA	3	6	1155387	1155392	50 %	0 %	50 %	0 %	16082589
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18488	NC_002578	TGCC	2	8	1155633	1155640	0 %	25 %	25 %	50 %	16082107
18489	NC_002578	CTT	2	6	1155763	1155768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082107
18490	NC_002578	AGA	2	6	1155817	1155822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082107
18491	NC_002578	TGT	2	6	1155828	1155833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082107
18492	NC_002578	TGA	2	6	1155861	1155866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082107
18493	NC_002578	GAA	2	6	1155884	1155889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082107
18494	NC_002578	ACA	2	6	1155907	1155912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082107
18495	NC_002578	TAA	2	6	1155959	1155964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082107
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18497	NC_002578	ACCA	2	8	1155993	1156000	50 %	0 %	0 %	50 %	16082107
18498	NC_002578	GATA	2	8	1156082	1156089	50 %	25 %	25 %	0 %	16082107
18499	NC_002578	GAT	2	6	1156204	1156209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082107
18500	NC_002578	TTG	2	6	1156300	1156305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082107

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