MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_002578	ATC	3	9	1096276	1096284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082058
17502	NC_002578	GAAT	2	8	1096629	1096636	50 %	25 %	25 %	0 %	16082058
17503	NC_002578	GCTGT	2	10	1096648	1096657	0 %	40 %	40 %	20 %	16082058
17504	NC_002578	GCA	2	6	1096672	1096677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082058
17505	NC_002578	TGC	2	6	1096716	1096721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082058
17506	NC_002578	TCC	2	6	1096802	1096807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082058
17507	NC_002578	TA	3	6	1096810	1096815	50 %	50 %	0 %	0 %	16082058
17508	NC_002578	GAG	2	6	1096839	1096844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082058
17509	NC_002578	TGT	2	6	1096859	1096864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082058
17510	NC_002578	CAG	2	6	1096881	1096886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082058
17511	NC_002578	ATT	2	6	1096954	1096959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082058
17512	NC_002578	CAT	2	6	1096980	1096985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082058
17513	NC_002578	TGTAC	2	10	1097021	1097030	20 %	40 %	20 %	20 %	16082058
17514	NC_002578	GCA	2	6	1097575	1097580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082059
17515	NC_002578	A	7	7	1097580	1097586	100 %	0 %	0 %	0 %	16082059
17516	NC_002578	AGC	2	6	1097589	1097594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082059
17517	NC_002578	GATA	2	8	1097600	1097607	50 %	25 %	25 %	0 %	16082059
17518	NC_002578	TA	3	6	1097606	1097611	50 %	50 %	0 %	0 %	16082059
17519	NC_002578	TTG	2	6	1097612	1097617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082059
17520	NC_002578	TGT	2	6	1097738	1097743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082059
17521	NC_002578	GTT	2	6	1097796	1097801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082059
17522	NC_002578	GAT	2	6	1097824	1097829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082059
17523	NC_002578	TTGATC	2	12	1097878	1097889	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082059
17524	NC_002578	ATA	2	6	1097895	1097900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082059
17525	NC_002578	TCTGT	2	10	1097933	1097942	0 %	60 %	20 %	20 %	16082059
17526	NC_002578	TTC	2	6	1097965	1097970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082059
17527	NC_002578	ACG	2	6	1098067	1098072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082059
17528	NC_002578	CCT	2	6	1098127	1098132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082060
17529	NC_002578	CTT	2	6	1098149	1098154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082060
17530	NC_002578	AAT	2	6	1098157	1098162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082060
17531	NC_002578	GT	3	6	1098240	1098245	0 %	50 %	50 %	0 %	16082060
17532	NC_002578	TG	3	6	1098255	1098260	0 %	50 %	50 %	0 %	16082060
17533	NC_002578	GAAA	2	8	1098277	1098284	75 %	0 %	25 %	0 %	16082060
17534	NC_002578	GAA	2	6	1098310	1098315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082060
17535	NC_002578	GGTG	2	8	1098316	1098323	0 %	25 %	75 %	0 %	16082060
17536	NC_002578	A	6	6	1098335	1098340	100 %	0 %	0 %	0 %	16082060
17537	NC_002578	CTT	2	6	1098563	1098568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082060
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17539	NC_002578	TA	3	6	1098699	1098704	50 %	50 %	0 %	0 %	16082060
17540	NC_002578	AAT	2	6	1098753	1098758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082060
17541	NC_002578	AGA	2	6	1098774	1098779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082060
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17543	NC_002578	CAA	2	6	1098792	1098797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082060
17544	NC_002578	CAG	2	6	1098868	1098873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082061
17545	NC_002578	ATG	2	6	1098891	1098896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082061
17546	NC_002578	GCACT	2	10	1098970	1098979	20 %	20 %	20 %	40 %	16082061
17547	NC_002578	TTG	2	6	1099014	1099019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082061
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17549	NC_002578	TCA	2	6	1099236	1099241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082061
17550	NC_002578	GTA	2	6	1099330	1099335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082061
17551	NC_002578	GAAA	2	8	1099348	1099355	75 %	0 %	25 %	0 %	16082061
17552	NC_002578	TC	3	6	1099419	1099424	0 %	50 %	0 %	50 %	16082061
17553	NC_002578	C	6	6	1099433	1099438	0 %	0 %	0 %	100 %	16082061
17554	NC_002578	GAAA	2	8	1099463	1099470	75 %	0 %	25 %	0 %	16082061
17555	NC_002578	CTC	2	6	1099471	1099476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082061
17556	NC_002578	TGCC	2	8	1099481	1099488	0 %	25 %	25 %	50 %	16082061
17557	NC_002578	GCC	2	6	1099529	1099534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082061
17558	NC_002578	CAA	2	6	1099597	1099602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082061
17559	NC_002578	CGC	3	9	1099612	1099620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082061
17560	NC_002578	AG	3	6	1099750	1099755	50 %	0 %	50 %	0 %	16082062
17561	NC_002578	ACA	2	6	1099765	1099770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082062
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17564	NC_002578	AG	3	6	1100081	1100086	50 %	0 %	50 %	0 %	16082062
17565	NC_002578	GTT	2	6	1100145	1100150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082062
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17568	NC_002578	AAG	2	6	1100481	1100486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082062
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17571	NC_002578	TAC	2	6	1100787	1100792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082063
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17575	NC_002578	GAAT	2	8	1100979	1100986	50 %	25 %	25 %	0 %	16082063
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17579	NC_002578	ACT	2	6	1101331	1101336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082063
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17584	NC_002578	TCTT	2	8	1103863	1103870	0 %	75 %	0 %	25 %	16082064
17585	NC_002578	GTTT	2	8	1104083	1104090	0 %	75 %	25 %	0 %	16082064
17586	NC_002578	AGTA	2	8	1104095	1104102	50 %	25 %	25 %	0 %	16082064
17587	NC_002578	AG	4	8	1104110	1104117	50 %	0 %	50 %	0 %	16082064
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17591	NC_002578	CT	3	6	1104425	1104430	0 %	50 %	0 %	50 %	16082065
17592	NC_002578	C	6	6	1104433	1104438	0 %	0 %	0 %	100 %	16082065
17593	NC_002578	TTC	2	6	1104439	1104444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082065
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17601	NC_002578	CAG	2	6	1104862	1104867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082066
17602	NC_002578	TGCC	2	8	1104868	1104875	0 %	25 %	25 %	50 %	16082066
17603	NC_002578	CCA	2	6	1104945	1104950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082066
17604	NC_002578	GCCA	2	8	1104976	1104983	25 %	0 %	25 %	50 %	16082066
17605	NC_002578	GCCTG	2	10	1105011	1105020	0 %	20 %	40 %	40 %	16082066
17606	NC_002578	TTC	2	6	1105040	1105045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082066
17607	NC_002578	GTGA	2	8	1105091	1105098	25 %	25 %	50 %	0 %	16082066
17608	NC_002578	CAT	2	6	1105104	1105109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082066
17609	NC_002578	GAG	2	6	1105129	1105134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082066
17610	NC_002578	GCT	2	6	1105170	1105175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082066
17611	NC_002578	GAA	2	6	1105238	1105243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082066
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17613	NC_002578	ATGG	2	8	1105335	1105342	25 %	25 %	50 %	0 %	16082066
17614	NC_002578	CTT	2	6	1105357	1105362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082066
17615	NC_002578	TGA	2	6	1105364	1105369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082066
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17617	NC_002578	TTCC	2	8	1105434	1105441	0 %	50 %	0 %	50 %	16082067
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17619	NC_002578	ATCTT	2	10	1105504	1105513	20 %	60 %	0 %	20 %	16082067
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17976	NC_002578	GCG	2	6	1124541	1124546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082083
17977	NC_002578	CTT	2	6	1124599	1124604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082083
17978	NC_002578	CAC	2	6	1124668	1124673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082083
17979	NC_002578	CAG	2	6	1124803	1124808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082084
17980	NC_002578	TCT	2	6	1124905	1124910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082084
17981	NC_002578	CCTCAT	2	12	1124932	1124943	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16082084
17982	NC_002578	GGT	2	6	1125019	1125024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082084
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17984	NC_002578	TCG	2	6	1125276	1125281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082084
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17986	NC_002578	ATCC	2	8	1125355	1125362	25 %	25 %	0 %	50 %	16082084
17987	NC_002578	GTA	2	6	1125380	1125385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082084
17988	NC_002578	CGG	2	6	1125395	1125400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082084
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17990	NC_002578	AAGG	2	8	1125443	1125450	50 %	0 %	50 %	0 %	16082084
17991	NC_002578	CTT	2	6	1125482	1125487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082084
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