MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_002578	TTA	2	6	1002073	1002078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081980
16002	NC_002578	GAA	2	6	1002083	1002088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081980
16003	NC_002578	CTT	2	6	1002130	1002135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081980
16004	NC_002578	TTG	2	6	1002141	1002146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081980
16005	NC_002578	GGA	2	6	1002155	1002160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081980
16006	NC_002578	TA	3	6	1002173	1002178	50 %	50 %	0 %	0 %	16081980
16007	NC_002578	AAG	2	6	1002194	1002199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081980
16008	NC_002578	CGT	2	6	1002210	1002215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081980
16009	NC_002578	TTC	2	6	1002239	1002244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081980
16010	NC_002578	AT	3	6	1002311	1002316	50 %	50 %	0 %	0 %	16081980
16011	NC_002578	CTG	2	6	1002360	1002365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081980
16012	NC_002578	GAT	3	9	1002400	1002408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081980
16013	NC_002578	GCTG	2	8	1002463	1002470	0 %	25 %	50 %	25 %	16081980
16014	NC_002578	CTG	2	6	1002475	1002480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081980
16015	NC_002578	TG	3	6	1002628	1002633	0 %	50 %	50 %	0 %	16082569
16016	NC_002578	TG	3	6	1002658	1002663	0 %	50 %	50 %	0 %	16082569
16017	NC_002578	TGG	2	6	1002676	1002681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082569
16018	NC_002578	ACCAC	2	10	1002685	1002694	40 %	0 %	0 %	60 %	16082569
16019	NC_002578	GAA	2	6	1002716	1002721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082569
16020	NC_002578	CCT	2	6	1002738	1002743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082569
16021	NC_002578	CTT	3	9	1002773	1002781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082569
16022	NC_002578	TCT	2	6	1002826	1002831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082569
16023	NC_002578	CCTGG	2	10	1002869	1002878	0 %	20 %	40 %	40 %	16082569
16024	NC_002578	TCA	2	6	1002906	1002911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082569
16025	NC_002578	T	7	7	1003008	1003014	0 %	100 %	0 %	0 %	16082569
16026	NC_002578	TCG	2	6	1003021	1003026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082569
16027	NC_002578	GATC	2	8	1003099	1003106	25 %	25 %	25 %	25 %	16082569
16028	NC_002578	TCT	2	6	1003360	1003365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082569
16029	NC_002578	CGT	2	6	1003426	1003431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082569
16030	NC_002578	TCT	2	6	1003654	1003659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082569
16031	NC_002578	TCC	2	6	1003729	1003734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082569
16032	NC_002578	GAT	2	6	1003867	1003872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081981
16033	NC_002578	TTCG	2	8	1004033	1004040	0 %	50 %	25 %	25 %	16081981
16034	NC_002578	CTT	2	6	1004174	1004179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081981
16035	NC_002578	ATT	2	6	1004199	1004204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081981
16036	NC_002578	ATAC	2	8	1004232	1004239	50 %	25 %	0 %	25 %	16081981
16037	NC_002578	GCA	2	6	1004243	1004248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081981
16038	NC_002578	ATACTC	2	12	1004264	1004275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081981
16039	NC_002578	ATA	2	6	1004279	1004284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081981
16040	NC_002578	CTA	2	6	1004305	1004310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081981
16041	NC_002578	TTC	3	9	1004345	1004353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081981
16042	NC_002578	GGC	2	6	1004359	1004364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081981
16043	NC_002578	ATTGAT	2	12	1004389	1004400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081981
16044	NC_002578	CAT	2	6	1004402	1004407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081981
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16047	NC_002578	GTC	2	6	1004450	1004455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081981
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16050	NC_002578	TC	3	6	1004586	1004591	0 %	50 %	0 %	50 %	16081982
16051	NC_002578	CCTT	2	8	1004596	1004603	0 %	50 %	0 %	50 %	16081982
16052	NC_002578	TCC	2	6	1004605	1004610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081982
16053	NC_002578	TATG	2	8	1004614	1004621	25 %	50 %	25 %	0 %	16081982
16054	NC_002578	GAA	2	6	1004627	1004632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081982
16055	NC_002578	ATC	2	6	1004642	1004647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081982
16056	NC_002578	TTCT	3	12	1004729	1004740	0 %	75 %	0 %	25 %	16081982
16057	NC_002578	TA	3	6	1004752	1004757	50 %	50 %	0 %	0 %	16081982
16058	NC_002578	C	7	7	1004776	1004782	0 %	0 %	0 %	100 %	16081982
16059	NC_002578	ATCT	2	8	1004815	1004822	25 %	50 %	0 %	25 %	16081982
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16061	NC_002578	CGG	2	6	1004874	1004879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081982
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16063	NC_002578	GAA	2	6	1005016	1005021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081982
16064	NC_002578	ATATG	2	10	1005028	1005037	40 %	40 %	20 %	0 %	16081982
16065	NC_002578	CCT	2	6	1005085	1005090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081982
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16067	NC_002578	TCA	2	6	1005116	1005121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081982
16068	NC_002578	CCAT	2	8	1005131	1005138	25 %	25 %	0 %	50 %	16081982
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16072	NC_002578	CCA	2	6	1005351	1005356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081983
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16089	NC_002578	CTC	2	6	1006366	1006371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081983
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16102	NC_002578	TAG	2	6	1007615	1007620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081985
16103	NC_002578	CAT	2	6	1007695	1007700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081985
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16105	NC_002578	TTA	2	6	1007872	1007877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081985
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16107	NC_002578	TGA	2	6	1007902	1007907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081985
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16109	NC_002578	CT	3	6	1008658	1008663	0 %	50 %	0 %	50 %	16081986
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16114	NC_002578	GTTA	2	8	1008959	1008966	25 %	50 %	25 %	0 %	16081986
16115	NC_002578	TTTC	2	8	1009137	1009144	0 %	75 %	0 %	25 %	16081986
16116	NC_002578	TTC	2	6	1009242	1009247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081986
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16238	NC_002578	TTG	3	9	1017831	1017839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082653
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