MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_002578	GAT	2	6	970681	970686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081950
15502	NC_002578	TCC	2	6	970784	970789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081950
15503	NC_002578	TGT	2	6	970810	970815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081950
15504	NC_002578	GATC	2	8	970893	970900	25 %	25 %	25 %	25 %	16081950
15505	NC_002578	ATA	2	6	970937	970942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081950
15506	NC_002578	A	7	7	970971	970977	100 %	0 %	0 %	0 %	16081950
15507	NC_002578	ATG	2	6	971033	971038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081950
15508	NC_002578	CAG	2	6	971059	971064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081950
15509	NC_002578	TCG	2	6	971121	971126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081950
15510	NC_002578	AG	3	6	971144	971149	50 %	0 %	50 %	0 %	16081950
15511	NC_002578	ATCC	2	8	971244	971251	25 %	25 %	0 %	50 %	16081950
15512	NC_002578	GAA	2	6	971436	971441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081950
15513	NC_002578	CAGG	2	8	971470	971477	25 %	0 %	50 %	25 %	16081950
15514	NC_002578	AGC	2	6	971559	971564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081951
15515	NC_002578	ATA	2	6	971574	971579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081951
15516	NC_002578	GAA	2	6	971594	971599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081951
15517	NC_002578	GAAT	2	8	971626	971633	50 %	25 %	25 %	0 %	16081951
15518	NC_002578	ATA	2	6	971742	971747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081951
15519	NC_002578	AT	3	6	971769	971774	50 %	50 %	0 %	0 %	16081951
15520	NC_002578	TAC	2	6	971787	971792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081951
15521	NC_002578	ATCAA	2	10	971826	971835	60 %	20 %	0 %	20 %	16081951
15522	NC_002578	AG	3	6	971965	971970	50 %	0 %	50 %	0 %	16081951
15523	NC_002578	ATA	2	6	972084	972089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081951
15524	NC_002578	AGAC	2	8	972119	972126	50 %	0 %	25 %	25 %	16081951
15525	NC_002578	TAC	2	6	972132	972137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081951
15526	NC_002578	GCA	2	6	972189	972194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081951
15527	NC_002578	ATA	2	6	972252	972257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081951
15528	NC_002578	GTTCT	2	10	972276	972285	0 %	60 %	20 %	20 %	16081951
15529	NC_002578	TTCT	2	8	972289	972296	0 %	75 %	0 %	25 %	16081951
15530	NC_002578	ATG	2	6	972297	972302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081951
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15533	NC_002578	A	6	6	972604	972609	100 %	0 %	0 %	0 %	16081952
15534	NC_002578	GGCCAT	2	12	972646	972657	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16081952
15535	NC_002578	GAA	2	6	972661	972666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081952
15536	NC_002578	AGG	2	6	972681	972686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081952
15537	NC_002578	AGA	2	6	972702	972707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081952
15538	NC_002578	TTC	2	6	972709	972714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081952
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15540	NC_002578	ATGA	2	8	972803	972810	50 %	25 %	25 %	0 %	16081952
15541	NC_002578	GA	3	6	972809	972814	50 %	0 %	50 %	0 %	16081952
15542	NC_002578	TGG	2	6	972906	972911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081952
15543	NC_002578	TGC	2	6	972948	972953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081952
15544	NC_002578	ATG	2	6	972968	972973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081952
15545	NC_002578	TGG	2	6	973083	973088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081952
15546	NC_002578	TGA	2	6	973188	973193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081953
15547	NC_002578	TGC	2	6	973197	973202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081953
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15549	NC_002578	GAT	2	6	973252	973257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081953
15550	NC_002578	GAT	2	6	973294	973299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081953
15551	NC_002578	GCA	2	6	973364	973369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081953
15552	NC_002578	TCT	2	6	973382	973387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081953
15553	NC_002578	TCA	2	6	973506	973511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081953
15554	NC_002578	ACA	2	6	973681	973686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081953
15555	NC_002578	TGG	2	6	973736	973741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081953
15556	NC_002578	CCAGG	2	10	973793	973802	20 %	0 %	40 %	40 %	16081953
15557	NC_002578	TAA	2	6	973838	973843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081953
15558	NC_002578	TTC	2	6	973903	973908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081953
15559	NC_002578	GGT	2	6	973954	973959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081953
15560	NC_002578	TGA	2	6	973970	973975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081953
15561	NC_002578	CAT	2	6	974031	974036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081953
15562	NC_002578	TGAGA	2	10	974040	974049	40 %	20 %	40 %	0 %	16081953
15563	NC_002578	CTT	2	6	974104	974109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081953
15564	NC_002578	AAC	2	6	974113	974118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081953
15565	NC_002578	A	6	6	974172	974177	100 %	0 %	0 %	0 %	16081953
15566	NC_002578	AGGAT	2	10	974216	974225	40 %	20 %	40 %	0 %	16081953
15567	NC_002578	AAGA	2	8	974226	974233	75 %	0 %	25 %	0 %	16081953
15568	NC_002578	TCTG	2	8	974286	974293	0 %	50 %	25 %	25 %	16081953
15569	NC_002578	CTT	2	6	974365	974370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081954
15570	NC_002578	ATTT	2	8	974562	974569	25 %	75 %	0 %	0 %	16081954
15571	NC_002578	ACG	2	6	974588	974593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081954
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15573	NC_002578	ATC	2	6	974675	974680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081954
15574	NC_002578	TAT	2	6	974875	974880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081954
15575	NC_002578	CAT	2	6	974922	974927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081954
15576	NC_002578	TCT	3	9	974985	974993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081954
15577	NC_002578	CTG	2	6	975065	975070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081954
15578	NC_002578	TCA	2	6	975119	975124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081954
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15581	NC_002578	GAA	2	6	975373	975378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081954
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15585	NC_002578	AC	3	6	975750	975755	50 %	0 %	0 %	50 %	16081955
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15588	NC_002578	TTC	2	6	975881	975886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081955
15589	NC_002578	TGCT	2	8	975927	975934	0 %	50 %	25 %	25 %	16081955
15590	NC_002578	CGA	2	6	975996	976001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081955
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15593	NC_002578	CCA	2	6	976083	976088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081955
15594	NC_002578	TAT	2	6	976105	976110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081955
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15601	NC_002578	GCC	2	6	976741	976746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081955
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15606	NC_002578	TCT	2	6	977582	977587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081956
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15619	NC_002578	CTATG	2	10	978683	978692	20 %	40 %	20 %	20 %	16081956
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15988	NC_002578	TAA	2	6	1001004	1001009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082568
15989	NC_002578	AATCA	2	10	1001075	1001084	60 %	20 %	0 %	20 %	16082568
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15991	NC_002578	AT	4	8	1001193	1001200	50 %	50 %	0 %	0 %	16082568
15992	NC_002578	ATG	2	6	1001202	1001207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082568
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