MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_002578	GA	3	6	941596	941601	50 %	0 %	50 %	0 %	16081927
15002	NC_002578	TCT	2	6	941612	941617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081927
15003	NC_002578	TCT	2	6	941649	941654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081927
15004	NC_002578	CGT	2	6	941664	941669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081927
15005	NC_002578	GAT	2	6	941830	941835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081928
15006	NC_002578	ATC	2	6	941858	941863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081928
15007	NC_002578	TACA	2	8	941881	941888	50 %	25 %	0 %	25 %	16081928
15008	NC_002578	GGCCAG	2	12	941938	941949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16081928
15009	NC_002578	TCAG	2	8	942113	942120	25 %	25 %	25 %	25 %	16081928
15010	NC_002578	TCG	2	6	942156	942161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081928
15011	NC_002578	CAA	2	6	942568	942573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081929
15012	NC_002578	AT	3	6	942752	942757	50 %	50 %	0 %	0 %	16081929
15013	NC_002578	TTC	2	6	942762	942767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081929
15014	NC_002578	TTA	2	6	942770	942775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081929
15015	NC_002578	ATA	2	6	942963	942968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081929
15016	NC_002578	CTT	2	6	942978	942983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081929
15017	NC_002578	CATAAT	2	12	943001	943012	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16081929
15018	NC_002578	AC	3	6	943027	943032	50 %	0 %	0 %	50 %	16081929
15019	NC_002578	GCGG	2	8	943056	943063	0 %	0 %	75 %	25 %	16081929
15020	NC_002578	AGC	2	6	943150	943155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081929
15021	NC_002578	GAA	3	9	943157	943165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081929
15022	NC_002578	GCT	2	6	943178	943183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081929
15023	NC_002578	ACA	2	6	943255	943260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081929
15024	NC_002578	ATG	2	6	943362	943367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081929
15025	NC_002578	GCTC	2	8	943396	943403	0 %	25 %	25 %	50 %	16081929
15026	NC_002578	CAC	2	6	943405	943410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081929
15027	NC_002578	CAG	2	6	943472	943477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081929
15028	NC_002578	GAAAGA	2	12	943486	943497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081929
15029	NC_002578	AT	3	6	943642	943647	50 %	50 %	0 %	0 %	16081929
15030	NC_002578	TA	3	6	943739	943744	50 %	50 %	0 %	0 %	16081929
15031	NC_002578	CTT	2	6	943751	943756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081929
15032	NC_002578	CAT	2	6	943762	943767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081929
15033	NC_002578	CAAC	2	8	943771	943778	50 %	0 %	0 %	50 %	16081929
15034	NC_002578	GGT	2	6	943796	943801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081929
15035	NC_002578	AGA	2	6	943954	943959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081930
15036	NC_002578	GCT	2	6	943977	943982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081930
15037	NC_002578	CAC	2	6	944024	944029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081930
15038	NC_002578	AGAT	2	8	944167	944174	50 %	25 %	25 %	0 %	16081930
15039	NC_002578	TCA	2	6	944218	944223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081930
15040	NC_002578	CTT	2	6	944241	944246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081930
15041	NC_002578	ACA	2	6	944266	944271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081930
15042	NC_002578	CAG	2	6	944297	944302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081930
15043	NC_002578	GCT	2	6	944313	944318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081930
15044	NC_002578	CA	3	6	944399	944404	50 %	0 %	0 %	50 %	16081930
15045	NC_002578	CGA	2	6	944489	944494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081930
15046	NC_002578	TC	3	6	944514	944519	0 %	50 %	0 %	50 %	16081930
15047	NC_002578	A	6	6	944631	944636	100 %	0 %	0 %	0 %	16081930
15048	NC_002578	GAG	2	6	944637	944642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081930
15049	NC_002578	ATCC	2	8	944660	944667	25 %	25 %	0 %	50 %	16081930
15050	NC_002578	ATCT	2	8	944680	944687	25 %	50 %	0 %	25 %	16081931
15051	NC_002578	TCA	2	6	944813	944818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081931
15052	NC_002578	TCCT	2	8	944867	944874	0 %	50 %	0 %	50 %	16081931
15053	NC_002578	TCC	2	6	944886	944891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081931
15054	NC_002578	ATCTT	2	10	945105	945114	20 %	60 %	0 %	20 %	16081931
15055	NC_002578	ACA	2	6	945245	945250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081931
15056	NC_002578	TCC	2	6	945263	945268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081931
15057	NC_002578	CTGC	2	8	945301	945308	0 %	25 %	25 %	50 %	16081931
15058	NC_002578	CCTG	2	8	945324	945331	0 %	25 %	25 %	50 %	16081931
15059	NC_002578	AGAT	2	8	945461	945468	50 %	25 %	25 %	0 %	16081931
15060	NC_002578	ATC	3	9	945556	945564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081931
15061	NC_002578	ATC	2	6	945619	945624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081931
15062	NC_002578	TCA	2	6	945819	945824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081931
15063	NC_002578	GAA	2	6	945895	945900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081931
15064	NC_002578	TGG	2	6	945916	945921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081931
15065	NC_002578	CTTGCT	2	12	945961	945972	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081931
15066	NC_002578	CCTGC	2	10	945979	945988	0 %	20 %	20 %	60 %	16081931
15067	NC_002578	ATT	2	6	946043	946048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081931
15068	NC_002578	CTGGT	2	10	946082	946091	0 %	40 %	40 %	20 %	16081931
15069	NC_002578	TTC	2	6	946142	946147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081931
15070	NC_002578	CGC	2	6	946233	946238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081931
15071	NC_002578	TA	3	6	946267	946272	50 %	50 %	0 %	0 %	16081931
15072	NC_002578	TCCT	2	8	946319	946326	0 %	50 %	0 %	50 %	16081931
15073	NC_002578	CGA	2	6	946332	946337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081931
15074	NC_002578	CTG	2	6	946397	946402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081931
15075	NC_002578	GTA	2	6	946543	946548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081931
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15078	NC_002578	TTC	3	9	946622	946630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081931
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15080	NC_002578	TCG	2	6	946763	946768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081931
15081	NC_002578	TGC	2	6	946783	946788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081931
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15087	NC_002578	GGAT	2	8	947122	947129	25 %	25 %	50 %	0 %	16081931
15088	NC_002578	TGT	2	6	947232	947237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081931
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15090	NC_002578	ATTG	2	8	947382	947389	25 %	50 %	25 %	0 %	16081931
15091	NC_002578	TG	3	6	947425	947430	0 %	50 %	50 %	0 %	16081931
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15095	NC_002578	TGC	2	6	947625	947630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081931
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15101	NC_002578	ATA	2	6	948343	948348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081932
15102	NC_002578	ACG	2	6	948487	948492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081932
15103	NC_002578	ATGG	2	8	948529	948536	25 %	25 %	50 %	0 %	16081932
15104	NC_002578	A	6	6	948538	948543	100 %	0 %	0 %	0 %	16081932
15105	NC_002578	CCATC	2	10	948557	948566	20 %	20 %	0 %	60 %	16081932
15106	NC_002578	GTG	2	6	948569	948574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081932
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15109	NC_002578	GAT	2	6	948688	948693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081932
15110	NC_002578	GAT	2	6	948850	948855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082565
15111	NC_002578	GGTG	2	8	949000	949007	0 %	25 %	75 %	0 %	16082565
15112	NC_002578	GA	3	6	949053	949058	50 %	0 %	50 %	0 %	16082565
15113	NC_002578	GCA	2	6	949072	949077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082565
15114	NC_002578	AC	3	6	949105	949110	50 %	0 %	0 %	50 %	16082565
15115	NC_002578	CAGG	2	8	949216	949223	25 %	0 %	50 %	25 %	16082565
15116	NC_002578	TGA	2	6	949231	949236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082565
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15118	NC_002578	GAT	3	9	949280	949288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082565
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15120	NC_002578	GGAC	2	8	949302	949309	25 %	0 %	50 %	25 %	16082565
15121	NC_002578	ACA	2	6	949323	949328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082565
15122	NC_002578	GAT	2	6	949371	949376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082565
15123	NC_002578	AGA	2	6	949438	949443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081933
15124	NC_002578	TTC	2	6	949607	949612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081933
15125	NC_002578	GGA	2	6	949718	949723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081933
15126	NC_002578	GCA	3	9	949760	949768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081933
15127	NC_002578	GGA	2	6	949802	949807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081933
15128	NC_002578	GGC	2	6	949847	949852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081933
15129	NC_002578	GCA	2	6	949908	949913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081933
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15131	NC_002578	GAG	2	6	950042	950047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081933
15132	NC_002578	GAA	2	6	950092	950097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081933
15133	NC_002578	GCA	2	6	950126	950131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081933
15134	NC_002578	AC	3	6	950167	950172	50 %	0 %	0 %	50 %	16081933
15135	NC_002578	AGAT	2	8	950193	950200	50 %	25 %	25 %	0 %	16081933
15136	NC_002578	ATATCG	2	12	950207	950218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081933
15137	NC_002578	CTA	2	6	950233	950238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081933
15138	NC_002578	CGA	2	6	950323	950328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081933
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15141	NC_002578	CCA	2	6	950379	950384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081933
15142	NC_002578	ACC	2	6	950498	950503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081933
15143	NC_002578	GAT	2	6	950504	950509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081933
15144	NC_002578	AGA	2	6	950608	950613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081933
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15146	NC_002578	TGA	2	6	950664	950669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081934
15147	NC_002578	TGCGC	2	10	950676	950685	0 %	20 %	40 %	40 %	16081934
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15150	NC_002578	AGGC	2	8	950969	950976	25 %	0 %	50 %	25 %	16081934
15151	NC_002578	TACA	2	8	951083	951090	50 %	25 %	0 %	25 %	16081934
15152	NC_002578	TGGAGA	2	12	951155	951166	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	16081934
15153	NC_002578	GAA	2	6	951167	951172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081934
15154	NC_002578	ATC	2	6	951187	951192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081934
15155	NC_002578	TTCC	2	8	951219	951226	0 %	50 %	0 %	50 %	16081934
15156	NC_002578	ATG	2	6	951262	951267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081934
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15158	NC_002578	ATG	2	6	951292	951297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081934
15159	NC_002578	CGA	2	6	951315	951320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081934
15160	NC_002578	GAG	2	6	951327	951332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081934
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15171	NC_002578	TCG	2	6	952402	952407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081936
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15182	NC_002578	AT	3	6	952836	952841	50 %	50 %	0 %	0 %	16081936
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15231	NC_002578	ATGC	2	8	954793	954800	25 %	25 %	25 %	25 %	16081936
15232	NC_002578	TCG	2	6	954803	954808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081936
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15236	NC_002578	TA	3	6	955081	955086	50 %	50 %	0 %	0 %	16081937
15237	NC_002578	AAT	2	6	955100	955105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081937
15238	NC_002578	TTC	2	6	955162	955167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081937
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15240	NC_002578	GAT	2	6	955232	955237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081937
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