MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_002578	CAT	2	6	879748	879753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081879
14002	NC_002578	CTG	2	6	879801	879806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081879
14003	NC_002578	TC	3	6	879827	879832	0 %	50 %	0 %	50 %	16081879
14004	NC_002578	GGCTT	2	10	879846	879855	0 %	40 %	40 %	20 %	16081879
14005	NC_002578	TGAA	2	8	879927	879934	50 %	25 %	25 %	0 %	16081879
14006	NC_002578	CTT	2	6	879958	879963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081879
14007	NC_002578	GAT	2	6	879989	879994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081879
14008	NC_002578	TAG	2	6	880032	880037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081879
14009	NC_002578	GAGG	2	8	880070	880077	25 %	0 %	75 %	0 %	16081879
14010	NC_002578	GAT	2	6	880103	880108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081879
14011	NC_002578	CAT	2	6	880203	880208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081879
14012	NC_002578	AATGC	2	10	880331	880340	40 %	20 %	20 %	20 %	16081880
14013	NC_002578	TAA	2	6	880348	880353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081880
14014	NC_002578	AGA	2	6	880565	880570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081880
14015	NC_002578	ATAG	2	8	880572	880579	50 %	25 %	25 %	0 %	16081880
14016	NC_002578	GATAT	2	10	880698	880707	40 %	40 %	20 %	0 %	16081880
14017	NC_002578	ATC	2	6	880826	880831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081880
14018	NC_002578	GGATAA	2	12	880894	880905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081880
14019	NC_002578	GAG	2	6	880985	880990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081880
14020	NC_002578	GGA	2	6	881030	881035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081880
14021	NC_002578	CCT	2	6	881074	881079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081880
14022	NC_002578	GGA	2	6	881109	881114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081880
14023	NC_002578	GA	3	6	881283	881288	50 %	0 %	50 %	0 %	16081881
14024	NC_002578	AAAC	2	8	881292	881299	75 %	0 %	0 %	25 %	16081881
14025	NC_002578	ATA	2	6	881309	881314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081881
14026	NC_002578	CAT	2	6	881449	881454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081881
14027	NC_002578	ACA	3	9	881520	881528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081881
14028	NC_002578	AGG	2	6	881597	881602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081881
14029	NC_002578	CCT	2	6	881671	881676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081881
14030	NC_002578	GATC	2	8	882007	882014	25 %	25 %	25 %	25 %	16081882
14031	NC_002578	AGG	2	6	882078	882083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081882
14032	NC_002578	AGGA	2	8	882111	882118	50 %	0 %	50 %	0 %	16081882
14033	NC_002578	GAT	2	6	882120	882125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081882
14034	NC_002578	ATC	2	6	882209	882214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081882
14035	NC_002578	CAGGC	2	10	882242	882251	20 %	0 %	40 %	40 %	16081882
14036	NC_002578	ACCGC	2	10	882330	882339	20 %	0 %	20 %	60 %	16081882
14037	NC_002578	TTG	2	6	882340	882345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081882
14038	NC_002578	CAG	2	6	882346	882351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081882
14039	NC_002578	GCA	2	6	882430	882435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081882
14040	NC_002578	GGCG	2	8	882527	882534	0 %	0 %	75 %	25 %	16081882
14041	NC_002578	GAA	2	6	882547	882552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081882
14042	NC_002578	GTC	2	6	882561	882566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081882
14043	NC_002578	CGG	2	6	882764	882769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081882
14044	NC_002578	CAG	2	6	882849	882854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081882
14045	NC_002578	GGCA	2	8	882900	882907	25 %	0 %	50 %	25 %	16081882
14046	NC_002578	TG	3	6	882915	882920	0 %	50 %	50 %	0 %	16081882
14047	NC_002578	GTC	2	6	882939	882944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081882
14048	NC_002578	ATG	2	6	883106	883111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081883
14049	NC_002578	GAA	2	6	883200	883205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081883
14050	NC_002578	GAT	2	6	883221	883226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081883
14051	NC_002578	GCC	2	6	883240	883245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081883
14052	NC_002578	AAAG	2	8	883248	883255	75 %	0 %	25 %	0 %	16081883
14053	NC_002578	ATA	2	6	883285	883290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081883
14054	NC_002578	CGT	2	6	883320	883325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081883
14055	NC_002578	ATT	2	6	883385	883390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081883
14056	NC_002578	GCAG	2	8	883422	883429	25 %	0 %	50 %	25 %	16081883
14057	NC_002578	TCGGG	2	10	883451	883460	0 %	20 %	60 %	20 %	16081883
14058	NC_002578	GA	3	6	883562	883567	50 %	0 %	50 %	0 %	16081883
14059	NC_002578	ATGCGG	2	12	883602	883613	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16081883
14060	NC_002578	CTT	2	6	883701	883706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081883
14061	NC_002578	AAG	2	6	883756	883761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081883
14062	NC_002578	AT	3	6	883801	883806	50 %	50 %	0 %	0 %	16081883
14063	NC_002578	ATA	2	6	883831	883836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081883
14064	NC_002578	ATA	2	6	883861	883866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081883
14065	NC_002578	GGT	2	6	883867	883872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081883
14066	NC_002578	ACG	2	6	883913	883918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081883
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14068	NC_002578	GGATC	2	10	883981	883990	20 %	20 %	40 %	20 %	16081883
14069	NC_002578	TCTT	2	8	885310	885317	0 %	75 %	0 %	25 %	16081884
14070	NC_002578	ATT	2	6	885377	885382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081884
14071	NC_002578	GGC	2	6	885398	885403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081884
14072	NC_002578	ATT	2	6	885488	885493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081884
14073	NC_002578	CCA	2	6	885530	885535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081884
14074	NC_002578	TGG	2	6	885568	885573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081884
14075	NC_002578	T	6	6	885587	885592	0 %	100 %	0 %	0 %	16081884
14076	NC_002578	GTAA	2	8	885638	885645	50 %	25 %	25 %	0 %	16081884
14077	NC_002578	A	7	7	885665	885671	100 %	0 %	0 %	0 %	16081884
14078	NC_002578	AAT	2	6	885773	885778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081884
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14080	NC_002578	AGA	2	6	885871	885876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081884
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14084	NC_002578	AATT	2	8	885990	885997	50 %	50 %	0 %	0 %	16081884
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14087	NC_002578	A	6	6	886179	886184	100 %	0 %	0 %	0 %	16081884
14088	NC_002578	GTT	2	6	886195	886200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081884
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14090	NC_002578	TCA	2	6	886223	886228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081884
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14092	NC_002578	CTT	2	6	886388	886393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081884
14093	NC_002578	TAA	2	6	886397	886402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081884
14094	NC_002578	TA	3	6	886468	886473	50 %	50 %	0 %	0 %	16081884
14095	NC_002578	CT	3	6	886485	886490	0 %	50 %	0 %	50 %	16081884
14096	NC_002578	TCG	2	6	886589	886594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081884
14097	NC_002578	CGTA	2	8	886710	886717	25 %	25 %	25 %	25 %	16081884
14098	NC_002578	TCC	2	6	886739	886744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081884
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14100	NC_002578	AAG	2	6	886773	886778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081884
14101	NC_002578	ATTT	2	8	886792	886799	25 %	75 %	0 %	0 %	16081884
14102	NC_002578	GTT	2	6	887521	887526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081885
14103	NC_002578	TA	3	6	887571	887576	50 %	50 %	0 %	0 %	16081885
14104	NC_002578	ATC	2	6	887590	887595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081885
14105	NC_002578	CTT	2	6	887614	887619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081885
14106	NC_002578	CATT	2	8	887640	887647	25 %	50 %	0 %	25 %	16081885
14107	NC_002578	TCCTTC	2	12	887663	887674	0 %	50 %	0 %	50 %	16081885
14108	NC_002578	CAG	2	6	887686	887691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081885
14109	NC_002578	GA	4	8	887721	887728	50 %	0 %	50 %	0 %	16081885
14110	NC_002578	TG	3	6	887737	887742	0 %	50 %	50 %	0 %	16081885
14111	NC_002578	AGT	2	6	887844	887849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081885
14112	NC_002578	CAT	2	6	887889	887894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081885
14113	NC_002578	GCT	2	6	887946	887951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081885
14114	NC_002578	TCC	2	6	888074	888079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081885
14115	NC_002578	TCC	2	6	888095	888100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081885
14116	NC_002578	TTC	2	6	888137	888142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081885
14117	NC_002578	AT	3	6	888152	888157	50 %	50 %	0 %	0 %	16081885
14118	NC_002578	ATC	2	6	888188	888193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081885
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14121	NC_002578	GTA	2	6	888361	888366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081885
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14123	NC_002578	TTA	2	6	889178	889183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081886
14124	NC_002578	GAC	2	6	889199	889204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081886
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14126	NC_002578	TAT	2	6	889287	889292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081886
14127	NC_002578	A	7	7	889322	889328	100 %	0 %	0 %	0 %	16081886
14128	NC_002578	GATTT	2	10	889493	889502	20 %	60 %	20 %	0 %	16081886
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14132	NC_002578	TGA	2	6	889578	889583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081886
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14136	NC_002578	TCAA	2	8	889693	889700	50 %	25 %	0 %	25 %	16081886
14137	NC_002578	GAA	2	6	889710	889715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081886
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14145	NC_002578	TC	3	6	890286	890291	0 %	50 %	0 %	50 %	16081887
14146	NC_002578	AT	3	6	890325	890330	50 %	50 %	0 %	0 %	16081887
14147	NC_002578	AAAC	2	8	890344	890351	75 %	0 %	0 %	25 %	16081887
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14154	NC_002578	ACA	2	6	890673	890678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081887
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14157	NC_002578	AAAGC	2	10	892590	892599	60 %	0 %	20 %	20 %	16081888
14158	NC_002578	TC	3	6	892647	892652	0 %	50 %	0 %	50 %	16081888
14159	NC_002578	AAGG	2	8	892665	892672	50 %	0 %	50 %	0 %	16081888
14160	NC_002578	TTCTA	2	10	892681	892690	20 %	60 %	0 %	20 %	16081888
14161	NC_002578	AGAGGC	2	12	892760	892771	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16081888
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14239	NC_002578	CGA	2	6	897357	897362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081891
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14245	NC_002578	GAT	2	6	897978	897983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081891
14246	NC_002578	GGC	2	6	898059	898064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081891
14247	NC_002578	TATC	2	8	898072	898079	25 %	50 %	0 %	25 %	16081891
14248	NC_002578	TCGTA	2	10	898097	898106	20 %	40 %	20 %	20 %	16081891
14249	NC_002578	GCA	2	6	898144	898149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081891
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14261	NC_002578	GAG	2	6	898812	898817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081891
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14263	NC_002578	TA	3	6	898860	898865	50 %	50 %	0 %	0 %	16081891
14264	NC_002578	CAT	2	6	898893	898898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081891
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14273	NC_002578	CTG	2	6	899186	899191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081892
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14285	NC_002578	TAT	2	6	899693	899698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081892
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14346	NC_002578	TACGCC	2	12	902758	902769	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16081894
14347	NC_002578	TAC	2	6	902788	902793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081894
14348	NC_002578	CTAG	2	8	902809	902816	25 %	25 %	25 %	25 %	16081894
14349	NC_002578	AGG	3	9	902854	902862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081894
14350	NC_002578	TGA	2	6	902958	902963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081894
14351	NC_002578	GATC	2	8	903036	903043	25 %	25 %	25 %	25 %	16081894
14352	NC_002578	TCTT	2	8	903064	903071	0 %	75 %	0 %	25 %	16081894
14353	NC_002578	TGT	2	6	903126	903131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081894
14354	NC_002578	ATCC	2	8	903162	903169	25 %	25 %	0 %	50 %	16081894
14355	NC_002578	GAA	2	6	903205	903210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081894
14356	NC_002578	ACG	2	6	903263	903268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081894
14357	NC_002578	CATC	2	8	903341	903348	25 %	25 %	0 %	50 %	16081894
14358	NC_002578	AT	3	6	903388	903393	50 %	50 %	0 %	0 %	16081894
14359	NC_002578	ATC	2	6	903480	903485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081894
14360	NC_002578	CTT	2	6	903501	903506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081894
14361	NC_002578	ATA	2	6	903544	903549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081894
14362	NC_002578	CGT	2	6	903612	903617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081894
14363	NC_002578	TCA	2	6	903641	903646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081894
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14491	NC_002578	AGA	2	6	910804	910809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081900
14492	NC_002578	AAG	2	6	910870	910875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081900
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14494	NC_002578	CTG	2	6	910928	910933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081900
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