MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_002578	TCC	2	6	850611	850616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081858
13502	NC_002578	TCA	2	6	850915	850920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081859
13503	NC_002578	ATA	2	6	850926	850931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081859
13504	NC_002578	TAA	2	6	850957	850962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081859
13505	NC_002578	GGCC	2	8	850963	850970	0 %	0 %	50 %	50 %	16081859
13506	NC_002578	GGC	2	6	851061	851066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081859
13507	NC_002578	AGG	2	6	851088	851093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081859
13508	NC_002578	AAG	2	6	851115	851120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081859
13509	NC_002578	TTC	2	6	851163	851168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081859
13510	NC_002578	CAT	2	6	851177	851182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081859
13511	NC_002578	ATA	2	6	851190	851195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081859
13512	NC_002578	TCA	2	6	851199	851204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081859
13513	NC_002578	GC	3	6	851224	851229	0 %	0 %	50 %	50 %	16081859
13514	NC_002578	ATA	2	6	851256	851261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081859
13515	NC_002578	CGG	2	6	851318	851323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081859
13516	NC_002578	ACGC	2	8	851423	851430	25 %	0 %	25 %	50 %	16081859
13517	NC_002578	ATA	2	6	851442	851447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081859
13518	NC_002578	CTTT	2	8	851464	851471	0 %	75 %	0 %	25 %	16081859
13519	NC_002578	ATG	2	6	851503	851508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081859
13520	NC_002578	GAA	2	6	851567	851572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081859
13521	NC_002578	T	7	7	851604	851610	0 %	100 %	0 %	0 %	16081859
13522	NC_002578	CG	3	6	851700	851705	0 %	0 %	50 %	50 %	16081859
13523	NC_002578	TCC	2	6	851811	851816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082557
13524	NC_002578	TACCG	2	10	851849	851858	20 %	20 %	20 %	40 %	16082557
13525	NC_002578	AT	3	6	851929	851934	50 %	50 %	0 %	0 %	16082557
13526	NC_002578	CTT	2	6	852006	852011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082557
13527	NC_002578	GAA	2	6	852017	852022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082557
13528	NC_002578	GGC	2	6	852040	852045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082557
13529	NC_002578	GTT	2	6	852074	852079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082557
13530	NC_002578	GTC	2	6	852101	852106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082557
13531	NC_002578	CTT	2	6	852215	852220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081860
13532	NC_002578	AAG	2	6	852263	852268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081860
13533	NC_002578	TCC	3	9	852279	852287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081860
13534	NC_002578	TCT	2	6	852289	852294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081860
13535	NC_002578	TCT	3	9	852343	852351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081860
13536	NC_002578	CTT	2	6	852404	852409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081860
13537	NC_002578	ATC	2	6	852416	852421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081860
13538	NC_002578	TCTT	2	8	852459	852466	0 %	75 %	0 %	25 %	16081860
13539	NC_002578	ATC	2	6	852652	852657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081861
13540	NC_002578	TTC	2	6	852698	852703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081861
13541	NC_002578	TC	3	6	852828	852833	0 %	50 %	0 %	50 %	16081861
13542	NC_002578	GAG	2	6	852857	852862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081861
13543	NC_002578	GAG	2	6	852938	852943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081861
13544	NC_002578	TCA	2	6	852996	853001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081861
13545	NC_002578	GAA	2	6	853021	853026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081861
13546	NC_002578	GAA	2	6	853048	853053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081861
13547	NC_002578	GCA	2	6	853068	853073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13548	NC_002578	ACGT	2	8	853088	853095	25 %	25 %	25 %	25 %	16081861
13549	NC_002578	TTC	2	6	853172	853177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081861
13550	NC_002578	AGG	2	6	853230	853235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081861
13551	NC_002578	CAT	2	6	853279	853284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081861
13552	NC_002578	AGC	2	6	853356	853361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13553	NC_002578	GCAG	2	8	853362	853369	25 %	0 %	50 %	25 %	16081861
13554	NC_002578	TTC	2	6	853391	853396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081861
13555	NC_002578	ACCT	2	8	853397	853404	25 %	25 %	0 %	50 %	16081861
13556	NC_002578	AGGA	2	8	853421	853428	50 %	0 %	50 %	0 %	16081861
13557	NC_002578	AAG	2	6	853469	853474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081861
13558	NC_002578	ATC	2	6	853478	853483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081861
13559	NC_002578	GAA	2	6	853492	853497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081861
13560	NC_002578	ATA	2	6	853505	853510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081861
13561	NC_002578	CGA	2	6	853536	853541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13562	NC_002578	GAA	2	6	853561	853566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081861
13563	NC_002578	CGG	2	6	853588	853593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081861
13564	NC_002578	TGA	2	6	853605	853610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081861
13565	NC_002578	GCG	2	6	853629	853634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081861
13566	NC_002578	GCC	3	9	853760	853768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081861
13567	NC_002578	CGA	2	6	853849	853854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13568	NC_002578	AGC	2	6	853905	853910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13569	NC_002578	GCT	2	6	854047	854052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13570	NC_002578	ATC	2	6	854085	854090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081861
13571	NC_002578	GACAGC	2	12	854099	854110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13572	NC_002578	CGA	2	6	854284	854289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13573	NC_002578	CCA	2	6	854376	854381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081861
13574	NC_002578	CTG	2	6	854444	854449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13575	NC_002578	GAA	2	6	854452	854457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081861
13576	NC_002578	TCG	2	6	854460	854465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13577	NC_002578	TAC	2	6	854468	854473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081861
13578	NC_002578	GATG	2	8	854476	854483	25 %	25 %	50 %	0 %	16081861
13579	NC_002578	CAT	2	6	854515	854520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081861
13580	NC_002578	AT	3	6	854519	854524	50 %	50 %	0 %	0 %	16081861
13581	NC_002578	ATA	2	6	854573	854578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081861
13582	NC_002578	AGC	2	6	854580	854585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081861
13583	NC_002578	AGA	2	6	854655	854660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081861
13584	NC_002578	GAA	2	6	854686	854691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081861
13585	NC_002578	TGA	2	6	854750	854755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081862
13586	NC_002578	CTC	2	6	854782	854787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081862
13587	NC_002578	GCCGAC	2	12	854794	854805	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16081862
13588	NC_002578	AAG	2	6	854815	854820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081862
13589	NC_002578	GAA	2	6	854829	854834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081862
13590	NC_002578	CGT	2	6	854855	854860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081862
13591	NC_002578	TCG	2	6	854930	854935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081862
13592	NC_002578	ACA	2	6	854984	854989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081862
13593	NC_002578	TACA	2	8	854995	855002	50 %	25 %	0 %	25 %	16081862
13594	NC_002578	ATG	2	6	855048	855053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081863
13595	NC_002578	GAA	2	6	855071	855076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081863
13596	NC_002578	AAT	2	6	855119	855124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081863
13597	NC_002578	CAG	2	6	855164	855169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081863
13598	NC_002578	AGGG	2	8	855180	855187	25 %	0 %	75 %	0 %	16081863
13599	NC_002578	GAA	2	6	855308	855313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081863
13600	NC_002578	CCTT	2	8	855388	855395	0 %	50 %	0 %	50 %	16081863
13601	NC_002578	GCG	2	6	855457	855462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081863
13602	NC_002578	TTC	2	6	855513	855518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081863
13603	NC_002578	CTT	2	6	855545	855550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081863
13604	NC_002578	GAA	2	6	855572	855577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081863
13605	NC_002578	TTC	2	6	855678	855683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081863
13606	NC_002578	GGAGG	2	10	855716	855725	20 %	0 %	80 %	0 %	16081863
13607	NC_002578	GAA	2	6	855730	855735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081863
13608	NC_002578	ACG	2	6	856703	856708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082558
13609	NC_002578	ATCAGG	2	12	856711	856722	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082558
13610	NC_002578	AAG	2	6	856804	856809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082558
13611	NC_002578	TAC	2	6	856822	856827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082558
13612	NC_002578	TGA	2	6	856904	856909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082558
13613	NC_002578	T	6	6	856927	856932	0 %	100 %	0 %	0 %	16082558
13614	NC_002578	AG	3	6	856941	856946	50 %	0 %	50 %	0 %	16082558
13615	NC_002578	GGA	2	6	857010	857015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082558
13616	NC_002578	AGC	2	6	857022	857027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082558
13617	NC_002578	CGG	2	6	857028	857033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082558
13618	NC_002578	ATG	2	6	857053	857058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082558
13619	NC_002578	CGG	2	6	857124	857129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082558
13620	NC_002578	GAT	2	6	857232	857237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082558
13621	NC_002578	GTCC	2	8	857410	857417	0 %	25 %	25 %	50 %	16081864
13622	NC_002578	GAT	2	6	857446	857451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081864
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13985	NC_002578	CGA	2	6	878451	878456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081878
13986	NC_002578	CGC	2	6	878626	878631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081878
13987	NC_002578	GTT	2	6	878651	878656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081878
13988	NC_002578	CTC	2	6	878665	878670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081878
13989	NC_002578	CCTT	2	8	878799	878806	0 %	50 %	0 %	50 %	16081878
13990	NC_002578	TCAT	2	8	878813	878820	25 %	50 %	0 %	25 %	16081878
13991	NC_002578	CAGGC	2	10	878884	878893	20 %	0 %	40 %	40 %	16081878
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13994	NC_002578	T	6	6	879267	879272	0 %	100 %	0 %	0 %	16081878
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13997	NC_002578	TAC	2	6	879527	879532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081879
13998	NC_002578	GAT	2	6	879572	879577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081879
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14000	NC_002578	CCA	2	6	879654	879659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081879

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