MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002578	TGGC	2	8	784200	784207	0 %	25 %	50 %	25 %	16082551
12502	NC_002578	GAA	2	6	784297	784302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082551
12503	NC_002578	GTT	2	6	784303	784308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082551
12504	NC_002578	TGT	2	6	784317	784322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082551
12505	NC_002578	AGT	2	6	784413	784418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082551
12506	NC_002578	TGT	2	6	784431	784436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082551
12507	NC_002578	AGT	2	6	784764	784769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082551
12508	NC_002578	GTT	2	6	784810	784815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082551
12509	NC_002578	GTT	3	9	784876	784884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082551
12510	NC_002578	GCCG	2	8	784909	784916	0 %	0 %	50 %	50 %	16082551
12511	NC_002578	TGG	2	6	785145	785150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082551
12512	NC_002578	GGA	2	6	785155	785160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082551
12513	NC_002578	TC	3	6	785250	785255	0 %	50 %	0 %	50 %	16082551
12514	NC_002578	AGG	2	6	785320	785325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082551
12515	NC_002578	GTG	2	6	785352	785357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082551
12516	NC_002578	GCGGAG	2	12	785358	785369	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	16082551
12517	NC_002578	GGT	3	9	785372	785380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082551
12518	NC_002578	CAT	2	6	785395	785400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082551
12519	NC_002578	GTAT	2	8	785415	785422	25 %	50 %	25 %	0 %	16082551
12520	NC_002578	CAT	2	6	785431	785436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082551
12521	NC_002578	TGG	2	6	785460	785465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082551
12522	NC_002578	AGG	2	6	785507	785512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082551
12523	NC_002578	AAT	2	6	785643	785648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082551
12524	NC_002578	GTT	2	6	785662	785667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082551
12525	NC_002578	TGG	3	9	785710	785718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082551
12526	NC_002578	CAG	2	6	785808	785813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082551
12527	NC_002578	GCT	2	6	785818	785823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082551
12528	NC_002578	AT	3	6	785832	785837	50 %	50 %	0 %	0 %	16082551
12529	NC_002578	GT	3	6	785857	785862	0 %	50 %	50 %	0 %	16082551
12530	NC_002578	CAT	2	6	785973	785978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082551
12531	NC_002578	ATA	2	6	786037	786042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082551
12532	NC_002578	TGC	2	6	786045	786050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082551
12533	NC_002578	AG	3	6	786120	786125	50 %	0 %	50 %	0 %	16082551
12534	NC_002578	TGC	2	6	786231	786236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082551
12535	NC_002578	ATGG	2	8	786263	786270	25 %	25 %	50 %	0 %	16082551
12536	NC_002578	ATA	3	9	786774	786782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081814
12537	NC_002578	GCC	2	6	786937	786942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081814
12538	NC_002578	CATT	2	8	787078	787085	25 %	50 %	0 %	25 %	16081814
12539	NC_002578	A	6	6	787118	787123	100 %	0 %	0 %	0 %	16081814
12540	NC_002578	AAC	2	6	787197	787202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081814
12541	NC_002578	TGA	2	6	787205	787210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081814
12542	NC_002578	AGG	2	6	787221	787226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081814
12543	NC_002578	GA	3	6	787257	787262	50 %	0 %	50 %	0 %	16081814
12544	NC_002578	TGA	2	6	787316	787321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081814
12545	NC_002578	GAA	2	6	787343	787348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081814
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12548	NC_002578	CGT	2	6	787375	787380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081814
12549	NC_002578	GAT	2	6	787478	787483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081814
12550	NC_002578	CAT	2	6	787528	787533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081814
12551	NC_002578	GAC	2	6	787566	787571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081814
12552	NC_002578	GATCAG	2	12	787583	787594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081814
12553	NC_002578	CCA	2	6	787624	787629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081814
12554	NC_002578	TCC	2	6	787693	787698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081815
12555	NC_002578	TTC	2	6	787710	787715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081815
12556	NC_002578	CTT	2	6	787755	787760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081815
12557	NC_002578	TCA	2	6	787778	787783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081815
12558	NC_002578	CTT	2	6	787830	787835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081815
12559	NC_002578	TCC	2	6	787840	787845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081815
12560	NC_002578	CTT	2	6	787863	787868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081815
12561	NC_002578	TGT	2	6	787922	787927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081815
12562	NC_002578	AGG	2	6	788158	788163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081816
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12564	NC_002578	AAG	2	6	788183	788188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081816
12565	NC_002578	TCT	2	6	788219	788224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081816
12566	NC_002578	ACT	2	6	788245	788250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081816
12567	NC_002578	ATA	2	6	788370	788375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081816
12568	NC_002578	CAG	2	6	788386	788391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081816
12569	NC_002578	AG	3	6	788390	788395	50 %	0 %	50 %	0 %	16081816
12570	NC_002578	TCA	2	6	788485	788490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081817
12571	NC_002578	GA	3	6	788503	788508	50 %	0 %	50 %	0 %	16081817
12572	NC_002578	TGA	2	6	788596	788601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081817
12573	NC_002578	TGA	2	6	788666	788671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081817
12574	NC_002578	TAT	2	6	788694	788699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081817
12575	NC_002578	TCC	2	6	788751	788756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081817
12576	NC_002578	TTC	2	6	788800	788805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081817
12577	NC_002578	CTTC	2	8	788815	788822	0 %	50 %	0 %	50 %	16081817
12578	NC_002578	ATACA	2	10	788835	788844	60 %	20 %	0 %	20 %	16081817
12579	NC_002578	TTC	2	6	788860	788865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081817
12580	NC_002578	GAT	2	6	788885	788890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081817
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12585	NC_002578	ACA	3	9	789013	789021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081817
12586	NC_002578	GCGTCA	2	12	789022	789033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16081817
12587	NC_002578	T	6	6	789037	789042	0 %	100 %	0 %	0 %	16081817
12588	NC_002578	TAT	2	6	789138	789143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081817
12589	NC_002578	AAG	2	6	789189	789194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081817
12590	NC_002578	TTC	2	6	789249	789254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081817
12591	NC_002578	TTA	2	6	789274	789279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081817
12592	NC_002578	CA	3	6	789664	789669	50 %	0 %	0 %	50 %	16081818
12593	NC_002578	GAA	2	6	789867	789872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081818
12594	NC_002578	TGC	2	6	789910	789915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081818
12595	NC_002578	ATA	2	6	789968	789973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081818
12596	NC_002578	TGA	2	6	790053	790058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081818
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12598	NC_002578	CAT	2	6	790168	790173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081818
12599	NC_002578	AGG	2	6	790287	790292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081818
12600	NC_002578	G	6	6	790361	790366	0 %	0 %	100 %	0 %	16081818
12601	NC_002578	TTC	2	6	790430	790435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081818
12602	NC_002578	CGA	2	6	790467	790472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081818
12603	NC_002578	AT	3	6	790496	790501	50 %	50 %	0 %	0 %	16081818
12604	NC_002578	TA	3	6	790531	790536	50 %	50 %	0 %	0 %	16081818
12605	NC_002578	CTG	2	6	790616	790621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081818
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12607	NC_002578	GT	3	6	790701	790706	0 %	50 %	50 %	0 %	16081818
12608	NC_002578	CAGGG	2	10	790761	790770	20 %	0 %	60 %	20 %	16081818
12609	NC_002578	CTC	2	6	790821	790826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081818
12610	NC_002578	GGAT	2	8	790856	790863	25 %	25 %	50 %	0 %	16081818
12611	NC_002578	TTC	2	6	790874	790879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081818
12612	NC_002578	TTG	2	6	790881	790886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081818
12613	NC_002578	GTC	2	6	790895	790900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081818
12614	NC_002578	CTG	2	6	790962	790967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081818
12615	NC_002578	AT	3	6	791243	791248	50 %	50 %	0 %	0 %	16081819
12616	NC_002578	TTC	2	6	791284	791289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081819
12617	NC_002578	ATT	2	6	791342	791347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081819
12618	NC_002578	TCA	2	6	791348	791353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081819
12619	NC_002578	CA	3	6	791352	791357	50 %	0 %	0 %	50 %	16081819
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12987	NC_002578	GTA	2	6	816053	816058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081841
12988	NC_002578	CAA	2	6	816105	816110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081841
12989	NC_002578	CGA	2	6	816112	816117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081841
12990	NC_002578	CTGGTC	2	12	816395	816406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081842
12991	NC_002578	TCGT	2	8	816443	816450	0 %	50 %	25 %	25 %	16081842
12992	NC_002578	AGA	2	6	816521	816526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081842
12993	NC_002578	TTC	2	6	816551	816556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081842
12994	NC_002578	CGA	2	6	816585	816590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081842
12995	NC_002578	AT	3	6	816593	816598	50 %	50 %	0 %	0 %	16081842
12996	NC_002578	GAT	2	6	816601	816606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081842
12997	NC_002578	TTC	2	6	816617	816622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081842
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12999	NC_002578	GGC	2	6	816701	816706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081842
13000	NC_002578	TGC	2	6	816739	816744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081842

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