MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_002578	GA	3	6	682126	682131	50 %	0 %	50 %	0 %	16081734
11002	NC_002578	GAAA	2	8	682163	682170	75 %	0 %	25 %	0 %	16081734
11003	NC_002578	GAT	2	6	682224	682229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081734
11004	NC_002578	CATC	2	8	682232	682239	25 %	25 %	0 %	50 %	16081734
11005	NC_002578	ACCG	2	8	682246	682253	25 %	0 %	25 %	50 %	16081734
11006	NC_002578	ACG	2	6	682361	682366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081734
11007	NC_002578	GAG	2	6	682414	682419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081734
11008	NC_002578	A	6	6	682515	682520	100 %	0 %	0 %	0 %	16081734
11009	NC_002578	AGG	2	6	682552	682557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081734
11010	NC_002578	CGG	2	6	682607	682612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081734
11011	NC_002578	CCAT	2	8	682706	682713	25 %	25 %	0 %	50 %	16081734
11012	NC_002578	AGA	3	9	682727	682735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081734
11013	NC_002578	G	6	6	682845	682850	0 %	0 %	100 %	0 %	16081734
11014	NC_002578	ACGTTC	2	12	682891	682902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081734
11015	NC_002578	T	6	6	682960	682965	0 %	100 %	0 %	0 %	16081735
11016	NC_002578	T	6	6	682981	682986	0 %	100 %	0 %	0 %	16081735
11017	NC_002578	TCC	2	6	682994	682999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081735
11018	NC_002578	TCC	2	6	683030	683035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081735
11019	NC_002578	TCTT	2	8	683070	683077	0 %	75 %	0 %	25 %	16081735
11020	NC_002578	GCA	2	6	683160	683165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081735
11021	NC_002578	ATCGG	2	10	683168	683177	20 %	20 %	40 %	20 %	16081735
11022	NC_002578	CCT	2	6	683226	683231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081735
11023	NC_002578	TCG	2	6	683307	683312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081735
11024	NC_002578	GAG	2	6	683336	683341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081735
11025	NC_002578	TGAG	2	8	683400	683407	25 %	25 %	50 %	0 %	16081735
11026	NC_002578	GTG	2	6	683414	683419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081735
11027	NC_002578	GTA	2	6	683452	683457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081735
11028	NC_002578	AG	3	6	683482	683487	50 %	0 %	50 %	0 %	16081735
11029	NC_002578	ATG	2	6	683525	683530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081735
11030	NC_002578	ATC	2	6	683555	683560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081735
11031	NC_002578	GGCA	2	8	683755	683762	25 %	0 %	50 %	25 %	16081735
11032	NC_002578	GCA	2	6	683781	683786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081735
11033	NC_002578	CAG	2	6	683827	683832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081735
11034	NC_002578	GTTC	2	8	683892	683899	0 %	50 %	25 %	25 %	16081735
11035	NC_002578	TCC	2	6	683978	683983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081735
11036	NC_002578	TGA	2	6	684033	684038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081735
11037	NC_002578	TGA	2	6	684060	684065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081735
11038	NC_002578	GAT	2	6	684087	684092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081735
11039	NC_002578	TCA	2	6	684120	684125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081735
11040	NC_002578	TCCC	2	8	684195	684202	0 %	25 %	0 %	75 %	16081735
11041	NC_002578	GAA	2	6	684256	684261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081736
11042	NC_002578	CCT	2	6	684269	684274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081736
11043	NC_002578	TGT	2	6	684293	684298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081736
11044	NC_002578	TA	3	6	684322	684327	50 %	50 %	0 %	0 %	16081736
11045	NC_002578	TGATCT	2	12	684449	684460	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16081736
11046	NC_002578	CGC	2	6	684461	684466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081736
11047	NC_002578	TGC	2	6	684642	684647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081736
11048	NC_002578	CAA	2	6	684680	684685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081736
11049	NC_002578	T	6	6	684770	684775	0 %	100 %	0 %	0 %	16081736
11050	NC_002578	CCA	2	6	684799	684804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081736
11051	NC_002578	AT	3	6	684929	684934	50 %	50 %	0 %	0 %	16081736
11052	NC_002578	CAT	2	6	685011	685016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081736
11053	NC_002578	ACCTG	2	10	685082	685091	20 %	20 %	20 %	40 %	16081736
11054	NC_002578	TCT	2	6	685139	685144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081736
11055	NC_002578	ATT	2	6	685228	685233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081736
11056	NC_002578	TGAGCG	2	12	685349	685360	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16081736
11057	NC_002578	CATC	2	8	685367	685374	25 %	25 %	0 %	50 %	16081736
11058	NC_002578	AGA	2	6	685432	685437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081736
11059	NC_002578	AGA	2	6	685598	685603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081737
11060	NC_002578	TGC	2	6	685738	685743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081737
11061	NC_002578	TCT	2	6	685796	685801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081737
11062	NC_002578	GCA	2	6	685807	685812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081737
11063	NC_002578	ATCGAT	2	12	685860	685871	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081737
11064	NC_002578	TGA	2	6	685916	685921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081737
11065	NC_002578	GAA	2	6	685931	685936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081737
11066	NC_002578	AG	3	6	685958	685963	50 %	0 %	50 %	0 %	16081737
11067	NC_002578	TC	3	6	685987	685992	0 %	50 %	0 %	50 %	16081737
11068	NC_002578	CGC	2	6	686048	686053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081737
11069	NC_002578	AGA	2	6	686353	686358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081738
11070	NC_002578	CGTC	2	8	686380	686387	0 %	25 %	25 %	50 %	16081738
11071	NC_002578	ATA	2	6	686487	686492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081738
11072	NC_002578	GGA	2	6	686507	686512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081738
11073	NC_002578	ATC	2	6	686613	686618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081738
11074	NC_002578	AAG	2	6	686685	686690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081738
11075	NC_002578	AT	3	6	686702	686707	50 %	50 %	0 %	0 %	16081738
11076	NC_002578	A	6	6	686709	686714	100 %	0 %	0 %	0 %	16081738
11077	NC_002578	ACG	2	6	686734	686739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081738
11078	NC_002578	GAT	2	6	686774	686779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081738
11079	NC_002578	ATC	2	6	686783	686788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081738
11080	NC_002578	GA	3	6	686865	686870	50 %	0 %	50 %	0 %	16081738
11081	NC_002578	GAT	2	6	686900	686905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081738
11082	NC_002578	TCG	2	6	686937	686942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081739
11083	NC_002578	GGC	2	6	687098	687103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081739
11084	NC_002578	AAT	2	6	687112	687117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081739
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11086	NC_002578	GAG	2	6	687209	687214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081739
11087	NC_002578	GAT	2	6	687220	687225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081739
11088	NC_002578	CCGG	2	8	687309	687316	0 %	0 %	50 %	50 %	16081739
11089	NC_002578	AGG	2	6	687361	687366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081739
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11091	NC_002578	TCT	2	6	687457	687462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081739
11092	NC_002578	ATA	2	6	687494	687499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081739
11093	NC_002578	GTT	2	6	687590	687595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081739
11094	NC_002578	GGC	2	6	687791	687796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081740
11095	NC_002578	CAG	2	6	687812	687817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081740
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11098	NC_002578	CGC	2	6	687842	687847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081740
11099	NC_002578	GATC	2	8	687860	687867	25 %	25 %	25 %	25 %	16081740
11100	NC_002578	GTT	2	6	687897	687902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081740
11101	NC_002578	TGC	2	6	687914	687919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081740
11102	NC_002578	TTC	2	6	687963	687968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081740
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11104	NC_002578	ATA	2	6	688005	688010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081740
11105	NC_002578	GTGC	2	8	688026	688033	0 %	25 %	50 %	25 %	16081740
11106	NC_002578	GGT	2	6	688070	688075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081740
11107	NC_002578	TTG	2	6	688209	688214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081740
11108	NC_002578	GAT	2	6	688226	688231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081740
11109	NC_002578	TCG	2	6	688261	688266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081740
11110	NC_002578	TCA	2	6	688282	688287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081740
11111	NC_002578	AGG	2	6	688303	688308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081740
11112	NC_002578	CGG	2	6	688355	688360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081740
11113	NC_002578	CGC	2	6	688370	688375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081740
11114	NC_002578	GCT	2	6	688469	688474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081741
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11116	NC_002578	TCCT	2	8	688526	688533	0 %	50 %	0 %	50 %	16081741
11117	NC_002578	GA	3	6	688534	688539	50 %	0 %	50 %	0 %	16081741
11118	NC_002578	GCG	2	6	688650	688655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081741
11119	NC_002578	AGC	2	6	688675	688680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081741
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11121	NC_002578	TCC	2	6	688754	688759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081741
11122	NC_002578	GCT	2	6	688760	688765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081741
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11124	NC_002578	CG	3	6	688899	688904	0 %	0 %	50 %	50 %	16081741
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11132	NC_002578	GCA	2	6	689218	689223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081742
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11150	NC_002578	AGCGA	2	10	690310	690319	40 %	0 %	40 %	20 %	16081743
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11240	NC_002578	TGA	2	6	695689	695694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081747
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