MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_002578	GGC	2	6	619095	619100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081689
10002	NC_002578	GAATC	2	10	619187	619196	40 %	20 %	20 %	20 %	16081689
10003	NC_002578	GGAA	2	8	619218	619225	50 %	0 %	50 %	0 %	16081689
10004	NC_002578	AGCA	2	8	619258	619265	50 %	0 %	25 %	25 %	16081689
10005	NC_002578	GGA	2	6	619359	619364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081689
10006	NC_002578	TGA	2	6	619443	619448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081689
10007	NC_002578	A	6	6	619488	619493	100 %	0 %	0 %	0 %	16081689
10008	NC_002578	TAT	2	6	619529	619534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081689
10009	NC_002578	GA	3	6	619542	619547	50 %	0 %	50 %	0 %	16081689
10010	NC_002578	AGA	2	6	619563	619568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081689
10011	NC_002578	AGG	2	6	619593	619598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081689
10012	NC_002578	ATA	2	6	619615	619620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081689
10013	NC_002578	AGA	2	6	619625	619630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081689
10014	NC_002578	AAG	2	6	619642	619647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081689
10015	NC_002578	ATC	2	6	619648	619653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081689
10016	NC_002578	TTC	2	6	619807	619812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081689
10017	NC_002578	TGA	2	6	619937	619942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081689
10018	NC_002578	GGC	2	6	620093	620098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081689
10019	NC_002578	TCA	2	6	620132	620137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081689
10020	NC_002578	ATA	2	6	620194	620199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081689
10021	NC_002578	AGA	3	9	620255	620263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081689
10022	NC_002578	ATTT	2	8	620290	620297	25 %	75 %	0 %	0 %	16081689
10023	NC_002578	ATT	2	6	620357	620362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081689
10024	NC_002578	ATC	2	6	620367	620372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081689
10025	NC_002578	CAA	2	6	620417	620422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081689
10026	NC_002578	ATA	2	6	620428	620433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081689
10027	NC_002578	TGG	2	6	620450	620455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081689
10028	NC_002578	GAG	2	6	620476	620481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081689
10029	NC_002578	TGA	2	6	620486	620491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081689
10030	NC_002578	GCGA	2	8	620515	620522	25 %	0 %	50 %	25 %	16081689
10031	NC_002578	AGA	2	6	620655	620660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081689
10032	NC_002578	TGC	2	6	620682	620687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081689
10033	NC_002578	GGA	2	6	620748	620753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081689
10034	NC_002578	CAG	2	6	620826	620831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081689
10035	NC_002578	GAT	2	6	620928	620933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081689
10036	NC_002578	TAT	2	6	620959	620964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081689
10037	NC_002578	GCG	2	6	620983	620988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081689
10038	NC_002578	GAA	2	6	621024	621029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081689
10039	NC_002578	TCC	2	6	621046	621051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081689
10040	NC_002578	ATC	2	6	621096	621101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081689
10041	NC_002578	CAT	2	6	621549	621554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081690
10042	NC_002578	ATC	2	6	621574	621579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081690
10043	NC_002578	TACG	2	8	621600	621607	25 %	25 %	25 %	25 %	16081690
10044	NC_002578	GA	3	6	621631	621636	50 %	0 %	50 %	0 %	16081690
10045	NC_002578	AAG	2	6	621637	621642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081690
10046	NC_002578	ATC	2	6	621652	621657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081690
10047	NC_002578	A	6	6	621738	621743	100 %	0 %	0 %	0 %	16081690
10048	NC_002578	GAG	2	6	621760	621765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081690
10049	NC_002578	ATA	2	6	621781	621786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081690
10050	NC_002578	ATA	2	6	621820	621825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081690
10051	NC_002578	TCAG	2	8	621832	621839	25 %	25 %	25 %	25 %	16081690
10052	NC_002578	CTG	2	6	621968	621973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081691
10053	NC_002578	GAA	2	6	622018	622023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081691
10054	NC_002578	AAG	3	9	622027	622035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081691
10055	NC_002578	GAT	2	6	622044	622049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081691
10056	NC_002578	AATA	2	8	622071	622078	75 %	25 %	0 %	0 %	16081691
10057	NC_002578	TA	3	6	622090	622095	50 %	50 %	0 %	0 %	16081691
10058	NC_002578	AAG	3	9	622111	622119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081691
10059	NC_002578	AG	3	6	622130	622135	50 %	0 %	50 %	0 %	16081691
10060	NC_002578	TC	3	6	622150	622155	0 %	50 %	0 %	50 %	16081691
10061	NC_002578	GAA	2	6	622272	622277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081692
10062	NC_002578	ATTC	2	8	622346	622353	25 %	50 %	0 %	25 %	16081692
10063	NC_002578	TAA	2	6	622409	622414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081692
10064	NC_002578	GAA	2	6	622439	622444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081692
10065	NC_002578	ATAG	2	8	622582	622589	50 %	25 %	25 %	0 %	16081692
10066	NC_002578	GCG	2	6	622765	622770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082648
10067	NC_002578	TATG	2	8	622812	622819	25 %	50 %	25 %	0 %	16082648
10068	NC_002578	ACA	2	6	622894	622899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082648
10069	NC_002578	CCA	2	6	622994	622999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081693
10070	NC_002578	AAT	2	6	623004	623009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081693
10071	NC_002578	TCC	2	6	623035	623040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081693
10072	NC_002578	GTC	2	6	623086	623091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081693
10073	NC_002578	GAA	3	9	623110	623118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081693
10074	NC_002578	TTA	2	6	623178	623183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081693
10075	NC_002578	TTC	2	6	623252	623257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081693
10076	NC_002578	CCT	2	6	623355	623360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081693
10077	NC_002578	GATCA	2	10	623371	623380	40 %	20 %	20 %	20 %	16081693
10078	NC_002578	TAT	2	6	623386	623391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081693
10079	NC_002578	ATCAA	2	10	623432	623441	60 %	20 %	0 %	20 %	16081693
10080	NC_002578	CAG	2	6	623518	623523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081693
10081	NC_002578	TG	3	6	623620	623625	0 %	50 %	50 %	0 %	16081693
10082	NC_002578	AGAT	2	8	623639	623646	50 %	25 %	25 %	0 %	16081693
10083	NC_002578	TCC	2	6	623693	623698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081693
10084	NC_002578	GAA	2	6	623716	623721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081693
10085	NC_002578	GCA	2	6	623726	623731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081693
10086	NC_002578	GAG	2	6	623732	623737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081693
10087	NC_002578	AAG	2	6	623777	623782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081693
10088	NC_002578	CAG	2	6	623967	623972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081693
10089	NC_002578	TCCT	2	8	624005	624012	0 %	50 %	0 %	50 %	16081693
10090	NC_002578	TTCAA	2	10	624026	624035	40 %	40 %	0 %	20 %	16081693
10091	NC_002578	TTG	2	6	624054	624059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081693
10092	NC_002578	T	7	7	624076	624082	0 %	100 %	0 %	0 %	16081693
10093	NC_002578	CGG	2	6	624111	624116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081693
10094	NC_002578	CAA	2	6	624177	624182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081693
10095	NC_002578	AT	3	6	624195	624200	50 %	50 %	0 %	0 %	16081693
10096	NC_002578	TTCT	2	8	624221	624228	0 %	75 %	0 %	25 %	16081693
10097	NC_002578	ATTG	2	8	624335	624342	25 %	50 %	25 %	0 %	16081693
10098	NC_002578	CTT	2	6	624359	624364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081693
10099	NC_002578	CTT	2	6	624432	624437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081693
10100	NC_002578	GCA	2	6	624440	624445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081693
10101	NC_002578	GAATA	2	10	624450	624459	60 %	20 %	20 %	0 %	16081693
10102	NC_002578	GAG	2	6	624484	624489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081693
10103	NC_002578	AGG	2	6	624501	624506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081693
10104	NC_002578	TGT	2	6	624573	624578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081693
10105	NC_002578	TTC	2	6	624920	624925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081694
10106	NC_002578	ATC	2	6	624943	624948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081694
10107	NC_002578	CCG	2	6	624973	624978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081694
10108	NC_002578	AAGG	2	8	625045	625052	50 %	0 %	50 %	0 %	16081694
10109	NC_002578	A	6	6	625071	625076	100 %	0 %	0 %	0 %	16081694
10110	NC_002578	CAT	2	6	625128	625133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081694
10111	NC_002578	GAA	2	6	625145	625150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081694
10112	NC_002578	ATC	2	6	625240	625245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081694
10113	NC_002578	AGA	2	6	625246	625251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081694
10114	NC_002578	GATA	2	8	625319	625326	50 %	25 %	25 %	0 %	16081694
10115	NC_002578	CGAT	2	8	625337	625344	25 %	25 %	25 %	25 %	16081694
10116	NC_002578	CCA	2	6	625411	625416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081694
10117	NC_002578	GAG	2	6	625506	625511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081694
10118	NC_002578	GAG	2	6	625515	625520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081694
10119	NC_002578	TAT	2	6	625596	625601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081694
10120	NC_002578	GATC	2	8	625623	625630	25 %	25 %	25 %	25 %	16081694
10121	NC_002578	AAT	2	6	625640	625645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081694
10122	NC_002578	GTA	2	6	625698	625703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081694
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10126	NC_002578	TC	3	6	626494	626499	0 %	50 %	0 %	50 %	16082534
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10223	NC_002578	TAT	2	6	632456	632461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081700
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10231	NC_002578	GCT	2	6	632806	632811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081700
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10238	NC_002578	TA	3	6	633244	633249	50 %	50 %	0 %	0 %	16081700
10239	NC_002578	AT	3	6	633256	633261	50 %	50 %	0 %	0 %	16081700
10240	NC_002578	TTC	2	6	633284	633289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081700
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10367	NC_002578	TGC	2	6	640134	640139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081705
10368	NC_002578	CAA	2	6	640193	640198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081705
10369	NC_002578	TAA	2	6	640244	640249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081705
10370	NC_002578	AT	3	6	640281	640286	50 %	50 %	0 %	0 %	16081705
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10372	NC_002578	GAA	2	6	640548	640553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082537
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10379	NC_002578	ATA	2	6	640944	640949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082537
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10383	NC_002578	CCCGT	2	10	641168	641177	0 %	20 %	20 %	60 %	16082537
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10402	NC_002578	TA	3	6	641908	641913	50 %	50 %	0 %	0 %	16081706
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