MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_002578	TCGC	2	8	589832	589839	0 %	25 %	25 %	50 %	16081664
9503	NC_002578	ATA	2	6	589862	589867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081664
9504	NC_002578	TGA	2	6	589965	589970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081664
9505	NC_002578	TCAT	2	8	589988	589995	25 %	50 %	0 %	25 %	16081664
9506	NC_002578	CCA	2	6	590047	590052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081664
9507	NC_002578	TGA	2	6	590061	590066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081664
9508	NC_002578	AAC	2	6	590107	590112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081664
9509	NC_002578	TCA	2	6	590123	590128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081664
9510	NC_002578	ATG	2	6	590267	590272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081665
9511	NC_002578	ATC	2	6	590285	590290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081665
9512	NC_002578	AGA	2	6	590313	590318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081665
9513	NC_002578	GAT	2	6	590461	590466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081665
9514	NC_002578	ATG	2	6	590667	590672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081665
9515	NC_002578	GAT	2	6	590708	590713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081665
9516	NC_002578	CAA	2	6	590715	590720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081665
9517	NC_002578	GCTGAA	2	12	590992	591003	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081665
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9519	NC_002578	ATC	2	6	591102	591107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081665
9520	NC_002578	GAT	2	6	591133	591138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081665
9521	NC_002578	GAAG	2	8	591286	591293	50 %	0 %	50 %	0 %	16081665
9522	NC_002578	ATA	2	6	591312	591317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081665
9523	NC_002578	ATA	2	6	591323	591328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081665
9524	NC_002578	TCA	2	6	591396	591401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081665
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9527	NC_002578	AT	3	6	591480	591485	50 %	50 %	0 %	0 %	16081665
9528	NC_002578	GAT	2	6	591500	591505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081665
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9530	NC_002578	ATC	2	6	591591	591596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081665
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9532	NC_002578	TCGAT	2	10	591624	591633	20 %	40 %	20 %	20 %	16081665
9533	NC_002578	TCC	2	6	591677	591682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081665
9534	NC_002578	CAA	2	6	591768	591773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081665
9535	NC_002578	ATC	2	6	591948	591953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081665
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9537	NC_002578	ATG	2	6	592002	592007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081665
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9540	NC_002578	TGA	2	6	592198	592203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081665
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9542	NC_002578	TGA	2	6	592338	592343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081665
9543	NC_002578	AT	3	6	592395	592400	50 %	50 %	0 %	0 %	16081665
9544	NC_002578	ATC	2	6	592409	592414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081665
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9549	NC_002578	G	6	6	592614	592619	0 %	0 %	100 %	0 %	16081665
9550	NC_002578	TCCAG	2	10	592624	592633	20 %	20 %	20 %	40 %	16081665
9551	NC_002578	ATA	2	6	592691	592696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081665
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9553	NC_002578	GGA	2	6	592801	592806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081665
9554	NC_002578	ATA	2	6	592904	592909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081665
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9556	NC_002578	CAT	2	6	592959	592964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081665
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9558	NC_002578	ATA	2	6	593153	593158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081665
9559	NC_002578	AAAG	2	8	593172	593179	75 %	0 %	25 %	0 %	16081665
9560	NC_002578	TGT	2	6	593206	593211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081665
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9583	NC_002578	AT	3	6	594505	594510	50 %	50 %	0 %	0 %	16081667
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9594	NC_002578	CA	3	6	594836	594841	50 %	0 %	0 %	50 %	16081667
9595	NC_002578	TTTGA	2	10	594867	594876	20 %	60 %	20 %	0 %	16081667
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9603	NC_002578	AC	3	6	595105	595110	50 %	0 %	0 %	50 %	16081668
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9611	NC_002578	GTT	2	6	595353	595358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081668
9612	NC_002578	ATA	2	6	595411	595416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081668
9613	NC_002578	A	6	6	595476	595481	100 %	0 %	0 %	0 %	16081668
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9997	NC_002578	TGA	2	6	618969	618974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081689
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9999	NC_002578	AGG	2	6	619024	619029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081689
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