MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_002578	CAT	2	6	559820	559825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081639
9002	NC_002578	ATG	3	9	559849	559857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081639
9003	NC_002578	AT	3	6	559879	559884	50 %	50 %	0 %	0 %	16081639
9004	NC_002578	GCA	2	6	559944	559949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081639
9005	NC_002578	ACG	2	6	560068	560073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081639
9006	NC_002578	CTA	2	6	560108	560113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081639
9007	NC_002578	GCT	2	6	560157	560162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081639
9008	NC_002578	ATA	2	6	560257	560262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081639
9009	NC_002578	TGG	2	6	560294	560299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081639
9010	NC_002578	AT	3	6	560374	560379	50 %	50 %	0 %	0 %	16081640
9011	NC_002578	AAT	2	6	560434	560439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081640
9012	NC_002578	GGA	2	6	560448	560453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081640
9013	NC_002578	TC	3	6	560538	560543	0 %	50 %	0 %	50 %	16081640
9014	NC_002578	CTG	2	6	560545	560550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081640
9015	NC_002578	GAA	2	6	560591	560596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081640
9016	NC_002578	GAT	2	6	560700	560705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081640
9017	NC_002578	GAT	2	6	560800	560805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081640
9018	NC_002578	AAT	2	6	560808	560813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081640
9019	NC_002578	GC	3	6	560829	560834	0 %	0 %	50 %	50 %	16081640
9020	NC_002578	GATC	2	8	560835	560842	25 %	25 %	25 %	25 %	16081640
9021	NC_002578	TCG	2	6	560855	560860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081640
9022	NC_002578	TGC	2	6	560895	560900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081640
9023	NC_002578	TGG	2	6	560904	560909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081640
9024	NC_002578	GTC	2	6	560910	560915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081640
9025	NC_002578	ATC	2	6	560922	560927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081640
9026	NC_002578	A	6	6	560937	560942	100 %	0 %	0 %	0 %	16081640
9027	NC_002578	ATC	2	6	561042	561047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081640
9028	NC_002578	GA	3	6	561097	561102	50 %	0 %	50 %	0 %	16081640
9029	NC_002578	CTA	2	6	561105	561110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081640
9030	NC_002578	A	6	6	561159	561164	100 %	0 %	0 %	0 %	16081640
9031	NC_002578	GAT	2	6	561193	561198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081640
9032	NC_002578	CGT	2	6	561339	561344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081640
9033	NC_002578	GAT	2	6	561397	561402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081640
9034	NC_002578	A	7	7	561418	561424	100 %	0 %	0 %	0 %	16081640
9035	NC_002578	TTG	2	6	561470	561475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081641
9036	NC_002578	AG	3	6	561653	561658	50 %	0 %	50 %	0 %	16081641
9037	NC_002578	AT	3	6	561659	561664	50 %	50 %	0 %	0 %	16081641
9038	NC_002578	CTTT	2	8	561783	561790	0 %	75 %	0 %	25 %	16081641
9039	NC_002578	AG	3	6	562438	562443	50 %	0 %	50 %	0 %	16081642
9040	NC_002578	GCG	2	6	562464	562469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081642
9041	NC_002578	GCT	2	6	562577	562582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081642
9042	NC_002578	TA	3	6	562600	562605	50 %	50 %	0 %	0 %	16081642
9043	NC_002578	GATC	2	8	562611	562618	25 %	25 %	25 %	25 %	16081642
9044	NC_002578	GGA	2	6	562638	562643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081642
9045	NC_002578	TCC	2	6	562704	562709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081642
9046	NC_002578	CCT	2	6	562716	562721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081642
9047	NC_002578	TTAT	2	8	563463	563470	25 %	75 %	0 %	0 %	16081643
9048	NC_002578	GAT	2	6	563475	563480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081643
9049	NC_002578	GGA	2	6	563516	563521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081643
9050	NC_002578	GAACT	2	10	563545	563554	40 %	20 %	20 %	20 %	16081643
9051	NC_002578	ACC	2	6	563570	563575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081643
9052	NC_002578	GTT	2	6	563595	563600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081643
9053	NC_002578	AAAATC	2	12	563639	563650	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16081643
9054	NC_002578	AGAA	2	8	563655	563662	75 %	0 %	25 %	0 %	16081643
9055	NC_002578	GCC	2	6	563670	563675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081643
9056	NC_002578	TAC	2	6	563703	563708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081643
9057	NC_002578	CCA	2	6	563715	563720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081643
9058	NC_002578	TCT	2	6	563734	563739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081643
9059	NC_002578	CCT	2	6	563799	563804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081643
9060	NC_002578	CAC	2	6	563813	563818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081643
9061	NC_002578	GGA	2	6	563873	563878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081643
9062	NC_002578	AT	3	6	563886	563891	50 %	50 %	0 %	0 %	16081643
9063	NC_002578	AGGA	2	8	563910	563917	50 %	0 %	50 %	0 %	16081643
9064	NC_002578	GTT	2	6	563955	563960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081643
9065	NC_002578	AGCA	2	8	563985	563992	50 %	0 %	25 %	25 %	16081643
9066	NC_002578	TCA	2	6	563993	563998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081643
9067	NC_002578	GGC	2	6	564000	564005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081643
9068	NC_002578	TTC	2	6	564054	564059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081643
9069	NC_002578	AAG	2	6	564060	564065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081643
9070	NC_002578	GGT	2	6	564129	564134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081643
9071	NC_002578	CTT	2	6	564155	564160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081643
9072	NC_002578	TTG	2	6	564250	564255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081643
9073	NC_002578	TGA	2	6	564307	564312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081643
9074	NC_002578	TCC	2	6	564319	564324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081643
9075	NC_002578	AGA	2	6	564394	564399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081643
9076	NC_002578	CTC	2	6	564411	564416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081643
9077	NC_002578	GAAT	2	8	564497	564504	50 %	25 %	25 %	0 %	16081643
9078	NC_002578	GGC	2	6	564657	564662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081643
9079	NC_002578	GAT	2	6	564704	564709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081643
9080	NC_002578	GAT	2	6	564717	564722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081644
9081	NC_002578	TGA	2	6	564807	564812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081644
9082	NC_002578	TA	3	6	564816	564821	50 %	50 %	0 %	0 %	16081644
9083	NC_002578	GGTTC	2	10	564845	564854	0 %	40 %	40 %	20 %	16081644
9084	NC_002578	TTC	2	6	564874	564879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081644
9085	NC_002578	ATA	2	6	564880	564885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081644
9086	NC_002578	ATCA	2	8	564993	565000	50 %	25 %	0 %	25 %	16081644
9087	NC_002578	TTC	2	6	565004	565009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081644
9088	NC_002578	GAT	2	6	565132	565137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081644
9089	NC_002578	TAT	2	6	565186	565191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081644
9090	NC_002578	GCA	2	6	565333	565338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081644
9091	NC_002578	AGAGA	2	10	565591	565600	60 %	0 %	40 %	0 %	16081644
9092	NC_002578	CGAAT	2	10	565673	565682	40 %	20 %	20 %	20 %	16081645
9093	NC_002578	TACT	2	8	565688	565695	25 %	50 %	0 %	25 %	16081645
9094	NC_002578	ATA	2	6	565721	565726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081645
9095	NC_002578	CTT	2	6	565728	565733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081645
9096	NC_002578	GAA	2	6	565782	565787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081645
9097	NC_002578	AT	3	6	565834	565839	50 %	50 %	0 %	0 %	16081645
9098	NC_002578	ATG	2	6	565892	565897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081645
9099	NC_002578	TTC	2	6	565926	565931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081645
9100	NC_002578	AGG	2	6	565982	565987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081645
9101	NC_002578	AAG	2	6	566065	566070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081645
9102	NC_002578	ATCG	2	8	566115	566122	25 %	25 %	25 %	25 %	16081645
9103	NC_002578	GTG	2	6	566146	566151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081645
9104	NC_002578	ACT	2	6	566290	566295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081645
9105	NC_002578	AAT	2	6	566334	566339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081645
9106	NC_002578	TCT	2	6	566350	566355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081645
9107	NC_002578	CAT	2	6	566364	566369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081645
9108	NC_002578	ATA	2	6	566533	566538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081645
9109	NC_002578	CGT	3	9	566619	566627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081645
9110	NC_002578	AGA	2	6	566630	566635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081645
9111	NC_002578	CTG	2	6	566828	566833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081645
9112	NC_002578	GTC	2	6	566852	566857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081645
9113	NC_002578	TCG	2	6	566886	566891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081645
9114	NC_002578	CTC	2	6	566951	566956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082530
9115	NC_002578	GAG	2	6	566988	566993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082530
9116	NC_002578	ATG	2	6	567015	567020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082530
9117	NC_002578	GAATGC	2	12	567038	567049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082530
9118	NC_002578	CCG	2	6	567066	567071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082530
9119	NC_002578	TCT	2	6	567121	567126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082530
9120	NC_002578	ATC	2	6	567167	567172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082530
9121	NC_002578	CAT	2	6	567185	567190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082530
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9123	NC_002578	TCA	2	6	567264	567269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082530
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9492	NC_002578	CTG	2	6	589163	589168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081664
9493	NC_002578	TGG	2	6	589170	589175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081664
9494	NC_002578	GAT	2	6	589309	589314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081664
9495	NC_002578	AAT	2	6	589378	589383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081664
9496	NC_002578	AG	3	6	589430	589435	50 %	0 %	50 %	0 %	16081664
9497	NC_002578	AGA	2	6	589440	589445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081664
9498	NC_002578	ATAA	2	8	589568	589575	75 %	25 %	0 %	0 %	16081664
9499	NC_002578	CTT	2	6	589589	589594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081664
9500	NC_002578	GTA	2	6	589724	589729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081664

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