MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_002578	AGA	2	6	528169	528174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081614
8502	NC_002578	A	6	6	528202	528207	100 %	0 %	0 %	0 %	16081614
8503	NC_002578	CTG	2	6	528249	528254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081614
8504	NC_002578	AAG	2	6	528275	528280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081614
8505	NC_002578	GTATT	2	10	528301	528310	20 %	60 %	20 %	0 %	16081614
8506	NC_002578	CAT	2	6	528351	528356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081614
8507	NC_002578	GAC	2	6	528369	528374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081614
8508	NC_002578	AT	3	6	528402	528407	50 %	50 %	0 %	0 %	16081614
8509	NC_002578	ATT	2	6	528424	528429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081614
8510	NC_002578	TGT	2	6	529093	529098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081615
8511	NC_002578	TCT	2	6	529128	529133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081615
8512	NC_002578	TTATCC	2	12	529182	529193	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16081615
8513	NC_002578	TCA	2	6	529199	529204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081615
8514	NC_002578	TCT	2	6	529224	529229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081615
8515	NC_002578	T	6	6	529291	529296	0 %	100 %	0 %	0 %	16081615
8516	NC_002578	TCA	2	6	529379	529384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081615
8517	NC_002578	GCCAG	2	10	529427	529436	20 %	0 %	40 %	40 %	16081615
8518	NC_002578	ATA	2	6	529439	529444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081615
8519	NC_002578	TGTA	2	8	529469	529476	25 %	50 %	25 %	0 %	16081615
8520	NC_002578	TCT	2	6	529494	529499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081615
8521	NC_002578	TA	3	6	529555	529560	50 %	50 %	0 %	0 %	16081615
8522	NC_002578	CGT	2	6	529566	529571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081615
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8524	NC_002578	CGA	2	6	529689	529694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081615
8525	NC_002578	GTC	2	6	529729	529734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081615
8526	NC_002578	CAC	2	6	530227	530232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081616
8527	NC_002578	ATA	2	6	530387	530392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081616
8528	NC_002578	TAA	2	6	530421	530426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081616
8529	NC_002578	CAG	2	6	530435	530440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081616
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8531	NC_002578	CTG	2	6	530468	530473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081616
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8533	NC_002578	GGA	2	6	530536	530541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081616
8534	NC_002578	CGC	2	6	530583	530588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081616
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8537	NC_002578	GGA	2	6	530782	530787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081616
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8540	NC_002578	CAT	2	6	531154	531159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081616
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8542	NC_002578	C	6	6	531372	531377	0 %	0 %	0 %	100 %	16081616
8543	NC_002578	TCA	2	6	531426	531431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081616
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8549	NC_002578	TTG	3	9	531830	531838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081617
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8552	NC_002578	CGA	2	6	532143	532148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081617
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8554	NC_002578	CAT	2	6	532231	532236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081618
8555	NC_002578	AT	3	6	532290	532295	50 %	50 %	0 %	0 %	16081618
8556	NC_002578	CT	3	6	532445	532450	0 %	50 %	0 %	50 %	16081618
8557	NC_002578	ATA	2	6	532454	532459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081618
8558	NC_002578	ATA	2	6	532466	532471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081618
8559	NC_002578	AT	3	6	532476	532481	50 %	50 %	0 %	0 %	16081618
8560	NC_002578	TCG	2	6	532562	532567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081618
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8566	NC_002578	CAT	2	6	532965	532970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081619
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8593	NC_002578	A	6	6	535080	535085	100 %	0 %	0 %	0 %	16081620
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8602	NC_002578	CTG	2	6	535825	535830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081620
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8604	NC_002578	GAT	2	6	535924	535929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081620
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8606	NC_002578	ATA	2	6	536083	536088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082525
8607	NC_002578	TAC	2	6	536097	536102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082525
8608	NC_002578	CAT	2	6	536186	536191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082525
8609	NC_002578	TCAT	2	8	536327	536334	25 %	50 %	0 %	25 %	16082525
8610	NC_002578	A	6	6	536402	536407	100 %	0 %	0 %	0 %	16082525
8611	NC_002578	CCCGG	2	10	536472	536481	0 %	0 %	40 %	60 %	16082525
8612	NC_002578	GAT	2	6	536558	536563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082525
8613	NC_002578	CTGTT	2	10	536592	536601	0 %	60 %	20 %	20 %	16082525
8614	NC_002578	TGT	2	6	536639	536644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082525
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8618	NC_002578	AG	3	6	536885	536890	50 %	0 %	50 %	0 %	16082525
8619	NC_002578	CT	4	8	537002	537009	0 %	50 %	0 %	50 %	16082525
8620	NC_002578	CAT	2	6	537023	537028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082525
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8622	NC_002578	GAA	2	6	537078	537083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082525
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8996	NC_002578	CGC	2	6	559583	559588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081639
8997	NC_002578	CTT	2	6	559596	559601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081639
8998	NC_002578	AGG	2	6	559741	559746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081639
8999	NC_002578	GCTAT	2	10	559756	559765	20 %	40 %	20 %	20 %	16081639
9000	NC_002578	CAT	2	6	559780	559785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081639

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