MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_002578	TTA	2	6	498228	498233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081588
8003	NC_002578	TCC	2	6	498264	498269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081588
8004	NC_002578	CCAT	2	8	498281	498288	25 %	25 %	0 %	50 %	16081588
8005	NC_002578	TGT	2	6	498474	498479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081588
8006	NC_002578	TC	3	6	498541	498546	0 %	50 %	0 %	50 %	16081588
8007	NC_002578	TTC	2	6	498602	498607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081588
8008	NC_002578	TCCT	2	8	498614	498621	0 %	50 %	0 %	50 %	16081588
8009	NC_002578	CGT	2	6	498654	498659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081588
8010	NC_002578	TAT	3	9	498661	498669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081588
8011	NC_002578	ATA	2	6	498706	498711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081588
8012	NC_002578	CTC	2	6	498712	498717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081588
8013	NC_002578	TCC	2	6	498758	498763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081588
8014	NC_002578	TCG	2	6	498785	498790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081588
8015	NC_002578	AGG	2	6	498807	498812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081588
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8017	NC_002578	ACAA	2	8	499323	499330	75 %	0 %	0 %	25 %	16081589
8018	NC_002578	ATA	2	6	499434	499439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081589
8019	NC_002578	CCG	2	6	499564	499569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081589
8020	NC_002578	ATCCG	2	10	499640	499649	20 %	20 %	20 %	40 %	16081589
8021	NC_002578	AT	3	6	499725	499730	50 %	50 %	0 %	0 %	16081589
8022	NC_002578	TAC	2	6	499778	499783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081589
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8026	NC_002578	ACA	2	6	499918	499923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081589
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8029	NC_002578	AT	3	6	500430	500435	50 %	50 %	0 %	0 %	16081589
8030	NC_002578	CAGC	2	8	500459	500466	25 %	0 %	25 %	50 %	16081589
8031	NC_002578	AGG	2	6	500476	500481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081589
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8041	NC_002578	CAT	2	6	500918	500923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081589
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8054	NC_002578	CTA	2	6	501764	501769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081589
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8056	NC_002578	AT	3	6	501847	501852	50 %	50 %	0 %	0 %	16081589
8057	NC_002578	AG	3	6	501870	501875	50 %	0 %	50 %	0 %	16081589
8058	NC_002578	ACC	2	6	501912	501917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081589
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8107	NC_002578	A	6	6	505296	505301	100 %	0 %	0 %	0 %	16081594
8108	NC_002578	AATA	2	8	505317	505324	75 %	25 %	0 %	0 %	16081594
8109	NC_002578	AGAA	2	8	505335	505342	75 %	0 %	25 %	0 %	16081594
8110	NC_002578	AGA	3	9	505351	505359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081594
8111	NC_002578	A	7	7	505374	505380	100 %	0 %	0 %	0 %	16081594
8112	NC_002578	AG	4	8	505389	505396	50 %	0 %	50 %	0 %	16081594
8113	NC_002578	GAA	2	6	505430	505435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081594
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8117	NC_002578	CA	3	6	505512	505517	50 %	0 %	0 %	50 %	16081594
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8121	NC_002578	TGCA	2	8	505780	505787	25 %	25 %	25 %	25 %	16081594
8122	NC_002578	ATGC	2	8	505795	505802	25 %	25 %	25 %	25 %	16081594
8123	NC_002578	ACG	2	6	505842	505847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081594
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8496	NC_002578	ATA	2	6	527844	527849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081614
8497	NC_002578	TAC	2	6	527946	527951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081614
8498	NC_002578	GTT	2	6	527952	527957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081614
8499	NC_002578	ATA	2	6	527988	527993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081614
8500	NC_002578	CTAT	2	8	528140	528147	25 %	50 %	0 %	25 %	16081614

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