MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_002578	GAAA	2	8	407428	407435	75 %	0 %	25 %	0 %	16081510
6503	NC_002578	AGA	2	6	407532	407537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081510
6504	NC_002578	GAA	2	6	407545	407550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081510
6505	NC_002578	GGAA	2	8	407552	407559	50 %	0 %	50 %	0 %	16081510
6506	NC_002578	AGA	2	6	407577	407582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081510
6507	NC_002578	CCA	2	6	407732	407737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081511
6508	NC_002578	ATCA	2	8	407809	407816	50 %	25 %	0 %	25 %	16081511
6509	NC_002578	AT	3	6	407823	407828	50 %	50 %	0 %	0 %	16081511
6510	NC_002578	ATG	2	6	407884	407889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081511
6511	NC_002578	GATA	2	8	407903	407910	50 %	25 %	25 %	0 %	16081511
6512	NC_002578	AAT	2	6	407975	407980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081511
6513	NC_002578	AT	3	6	408016	408021	50 %	50 %	0 %	0 %	16081511
6514	NC_002578	ATTG	2	8	408551	408558	25 %	50 %	25 %	0 %	16081512
6515	NC_002578	CGG	2	6	408583	408588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081512
6516	NC_002578	ATT	2	6	408793	408798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081512
6517	NC_002578	CAA	2	6	408893	408898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081512
6518	NC_002578	TTC	2	6	408950	408955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081512
6519	NC_002578	TTA	2	6	409025	409030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081512
6520	NC_002578	TA	3	6	409029	409034	50 %	50 %	0 %	0 %	16081512
6521	NC_002578	TAT	2	6	409041	409046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081512
6522	NC_002578	AAT	2	6	409232	409237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081513
6523	NC_002578	AAT	2	6	409289	409294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081513
6524	NC_002578	GAAA	2	8	409300	409307	75 %	0 %	25 %	0 %	16081513
6525	NC_002578	AGA	2	6	409315	409320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081513
6526	NC_002578	A	7	7	409328	409334	100 %	0 %	0 %	0 %	16081513
6527	NC_002578	AAG	2	6	409343	409348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081513
6528	NC_002578	AAAAC	2	10	409384	409393	80 %	0 %	0 %	20 %	16081513
6529	NC_002578	TTA	2	6	409407	409412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081513
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6531	NC_002578	TTC	2	6	409468	409473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081513
6532	NC_002578	ATC	2	6	409502	409507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081513
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6534	NC_002578	GAT	2	6	409583	409588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081513
6535	NC_002578	GTT	2	6	409605	409610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081513
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6537	NC_002578	TTC	2	6	409671	409676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081513
6538	NC_002578	T	6	6	409699	409704	0 %	100 %	0 %	0 %	16081513
6539	NC_002578	AT	3	6	409705	409710	50 %	50 %	0 %	0 %	16081513
6540	NC_002578	TAGT	2	8	409723	409730	25 %	50 %	25 %	0 %	16081513
6541	NC_002578	TA	3	6	409731	409736	50 %	50 %	0 %	0 %	16081513
6542	NC_002578	TATT	2	8	409756	409763	25 %	75 %	0 %	0 %	16081513
6543	NC_002578	TGG	2	6	409785	409790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081513
6544	NC_002578	A	6	6	410453	410458	100 %	0 %	0 %	0 %	16081514
6545	NC_002578	TA	3	6	410500	410505	50 %	50 %	0 %	0 %	16081514
6546	NC_002578	AT	3	6	410575	410580	50 %	50 %	0 %	0 %	16081514
6547	NC_002578	GA	3	6	410682	410687	50 %	0 %	50 %	0 %	16081514
6548	NC_002578	TGA	2	6	410741	410746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081515
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6550	NC_002578	ATT	2	6	410953	410958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081515
6551	NC_002578	CCG	2	6	410998	411003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081515
6552	NC_002578	CAT	2	6	411023	411028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081515
6553	NC_002578	ATG	2	6	411050	411055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081515
6554	NC_002578	GGAT	2	8	411089	411096	25 %	25 %	50 %	0 %	16081515
6555	NC_002578	AT	3	6	411095	411100	50 %	50 %	0 %	0 %	16081515
6556	NC_002578	TCA	2	6	411199	411204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081515
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6558	NC_002578	TCA	2	6	411368	411373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081515
6559	NC_002578	T	7	7	411400	411406	0 %	100 %	0 %	0 %	16081515
6560	NC_002578	TGT	2	6	411552	411557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081516
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6562	NC_002578	TCC	2	6	411721	411726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081516
6563	NC_002578	AT	3	6	411774	411779	50 %	50 %	0 %	0 %	16081516
6564	NC_002578	AAG	2	6	411941	411946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081516
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6566	NC_002578	GAT	2	6	411998	412003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081516
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6568	NC_002578	TGT	2	6	412054	412059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081516
6569	NC_002578	CGTCAA	2	12	412138	412149	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081516
6570	NC_002578	GTC	2	6	412226	412231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081516
6571	NC_002578	ACC	2	6	412308	412313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081516
6572	NC_002578	CTTC	2	8	412402	412409	0 %	50 %	0 %	50 %	16081516
6573	NC_002578	GAG	2	6	412522	412527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081516
6574	NC_002578	ATA	2	6	412604	412609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081516
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6581	NC_002578	GAC	2	6	412897	412902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081517
6582	NC_002578	TAT	2	6	413029	413034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081517
6583	NC_002578	TAT	2	6	413050	413055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081517
6584	NC_002578	AATG	2	8	413142	413149	50 %	25 %	25 %	0 %	16081517
6585	NC_002578	ATAA	2	8	413152	413159	75 %	25 %	0 %	0 %	16081517
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6588	NC_002578	TA	3	6	413266	413271	50 %	50 %	0 %	0 %	16081517
6589	NC_002578	A	6	6	413328	413333	100 %	0 %	0 %	0 %	16081517
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6597	NC_002578	TAT	2	6	413925	413930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081518
6598	NC_002578	TTG	2	6	413967	413972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081519
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6602	NC_002578	TAC	2	6	414161	414166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081519
6603	NC_002578	AGG	2	6	414234	414239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081519
6604	NC_002578	TTG	2	6	414327	414332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081519
6605	NC_002578	AGA	2	6	414441	414446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081519
6606	NC_002578	GAG	2	6	414469	414474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081519
6607	NC_002578	AG	3	6	414473	414478	50 %	0 %	50 %	0 %	16081519
6608	NC_002578	GAT	2	6	414506	414511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081519
6609	NC_002578	AGG	2	6	414514	414519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081519
6610	NC_002578	TCA	2	6	414525	414530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081519
6611	NC_002578	AG	3	6	414541	414546	50 %	0 %	50 %	0 %	16081519
6612	NC_002578	GGA	2	6	414562	414567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081519
6613	NC_002578	TGG	2	6	414588	414593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081519
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6615	NC_002578	ACGG	2	8	414686	414693	25 %	0 %	50 %	25 %	16081519
6616	NC_002578	GA	4	8	414767	414774	50 %	0 %	50 %	0 %	16081519
6617	NC_002578	ATA	2	6	414821	414826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081519
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6620	NC_002578	AAG	2	6	414953	414958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081519
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6622	NC_002578	AAGG	2	8	415081	415088	50 %	0 %	50 %	0 %	16081519
6623	NC_002578	TGA	2	6	415176	415181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081519
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6994	NC_002578	GAC	2	6	438496	438501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081534
6995	NC_002578	GTG	2	6	438553	438558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081534
6996	NC_002578	AGC	2	6	438640	438645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081534
6997	NC_002578	AGG	2	6	438719	438724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081534
6998	NC_002578	TCC	2	6	438758	438763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081535
6999	NC_002578	T	6	6	438771	438776	0 %	100 %	0 %	0 %	16081535
7000	NC_002578	CCT	2	6	438777	438782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081535

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