MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002578	GAT	2	6	372790	372795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081479
6002	NC_002578	ATC	2	6	372904	372909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081479
6003	NC_002578	TCT	2	6	372910	372915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081479
6004	NC_002578	CTCGT	2	10	372944	372953	0 %	40 %	20 %	40 %	16081479
6005	NC_002578	ATA	2	6	373010	373015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081479
6006	NC_002578	CAT	2	6	373163	373168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081480
6007	NC_002578	ATTA	2	8	373184	373191	50 %	50 %	0 %	0 %	16081480
6008	NC_002578	TGG	2	6	373237	373242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081480
6009	NC_002578	GAA	2	6	373301	373306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081480
6010	NC_002578	CTATG	2	10	373316	373325	20 %	40 %	20 %	20 %	16081480
6011	NC_002578	ATG	2	6	373327	373332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081480
6012	NC_002578	AAT	2	6	373412	373417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081480
6013	NC_002578	GAG	2	6	373509	373514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081480
6014	NC_002578	GGC	2	6	373638	373643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081480
6015	NC_002578	ATG	2	6	373665	373670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081480
6016	NC_002578	GAC	2	6	373697	373702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081480
6017	NC_002578	AGC	2	6	373708	373713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081480
6018	NC_002578	A	6	6	373730	373735	100 %	0 %	0 %	0 %	16081480
6019	NC_002578	ACGCA	2	10	373799	373808	40 %	0 %	20 %	40 %	16081480
6020	NC_002578	ATC	2	6	373912	373917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081480
6021	NC_002578	GGCACG	2	12	373938	373949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16081480
6022	NC_002578	CAGGG	2	10	374054	374063	20 %	0 %	60 %	20 %	16081480
6023	NC_002578	GAAG	2	8	374075	374082	50 %	0 %	50 %	0 %	16081480
6024	NC_002578	ACG	2	6	374140	374145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081480
6025	NC_002578	CAT	2	6	374152	374157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081480
6026	NC_002578	TCCG	2	8	374261	374268	0 %	25 %	25 %	50 %	16081480
6027	NC_002578	GCA	2	6	374280	374285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081480
6028	NC_002578	GCAG	2	8	374315	374322	25 %	0 %	50 %	25 %	16081480
6029	NC_002578	GCA	2	6	374342	374347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081480
6030	NC_002578	AAG	2	6	374355	374360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081480
6031	NC_002578	ATG	2	6	374368	374373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081480
6032	NC_002578	GGC	2	6	374459	374464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081480
6033	NC_002578	AGA	2	6	374503	374508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081481
6034	NC_002578	ATA	2	6	374540	374545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081481
6035	NC_002578	TACA	2	8	374567	374574	50 %	25 %	0 %	25 %	16081481
6036	NC_002578	TTC	2	6	374597	374602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081481
6037	NC_002578	GAA	2	6	374617	374622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081481
6038	NC_002578	GCA	2	6	374631	374636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081481
6039	NC_002578	ATG	2	6	374684	374689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081481
6040	NC_002578	TG	3	6	374688	374693	0 %	50 %	50 %	0 %	16081481
6041	NC_002578	TGG	2	6	374805	374810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081481
6042	NC_002578	TGA	2	6	374960	374965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081481
6043	NC_002578	GGT	2	6	375073	375078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081482
6044	NC_002578	T	6	6	375078	375083	0 %	100 %	0 %	0 %	16081482
6045	NC_002578	TAA	2	6	375113	375118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081482
6046	NC_002578	AGG	3	9	375128	375136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081482
6047	NC_002578	ACTTT	2	10	375141	375150	20 %	60 %	0 %	20 %	16081482
6048	NC_002578	ATA	2	6	375223	375228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081482
6049	NC_002578	CAC	2	6	375384	375389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081482
6050	NC_002578	TAC	2	6	375403	375408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081482
6051	NC_002578	CGAT	2	8	375485	375492	25 %	25 %	25 %	25 %	16081483
6052	NC_002578	ATC	2	6	375509	375514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081483
6053	NC_002578	ATA	2	6	375551	375556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081483
6054	NC_002578	CAG	2	6	375597	375602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081483
6055	NC_002578	CCTA	2	8	375669	375676	25 %	25 %	0 %	50 %	16081483
6056	NC_002578	CCGT	2	8	375777	375784	0 %	25 %	25 %	50 %	16081483
6057	NC_002578	CCTC	2	8	376025	376032	0 %	25 %	0 %	75 %	16081484
6058	NC_002578	TTCA	2	8	376107	376114	25 %	50 %	0 %	25 %	16081484
6059	NC_002578	CTG	2	6	376160	376165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081484
6060	NC_002578	TAT	3	9	376188	376196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081484
6061	NC_002578	CAG	2	6	376248	376253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081484
6062	NC_002578	AGGG	2	8	376285	376292	25 %	0 %	75 %	0 %	16081484
6063	NC_002578	ATC	2	6	376323	376328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081484
6064	NC_002578	CCT	2	6	376371	376376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081484
6065	NC_002578	TAT	2	6	376401	376406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081484
6066	NC_002578	CAG	2	6	376515	376520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081484
6067	NC_002578	GATC	2	8	376547	376554	25 %	25 %	25 %	25 %	16081484
6068	NC_002578	ACA	2	6	376932	376937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081485
6069	NC_002578	TC	3	6	376940	376945	0 %	50 %	0 %	50 %	16081485
6070	NC_002578	ATA	2	6	376959	376964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081485
6071	NC_002578	GGT	2	6	376994	376999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081485
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6073	NC_002578	ATA	2	6	377022	377027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081485
6074	NC_002578	TAC	2	6	377076	377081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081485
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6076	NC_002578	GA	3	6	377114	377119	50 %	0 %	50 %	0 %	16081485
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6088	NC_002578	AAG	2	6	378017	378022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081486
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6090	NC_002578	AT	3	6	378127	378132	50 %	50 %	0 %	0 %	16081486
6091	NC_002578	A	6	6	378232	378237	100 %	0 %	0 %	0 %	16081486
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6094	NC_002578	TCT	2	6	378508	378513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081487
6095	NC_002578	TTC	2	6	378518	378523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081487
6096	NC_002578	CTT	3	9	378524	378532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081487
6097	NC_002578	CTC	2	6	378533	378538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081487
6098	NC_002578	GGC	2	6	378539	378544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081487
6099	NC_002578	TTC	2	6	378582	378587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081487
6100	NC_002578	TCG	2	6	378594	378599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081487
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6103	NC_002578	TCA	2	6	378798	378803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081488
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6105	NC_002578	CTTC	2	8	378829	378836	0 %	50 %	0 %	50 %	16081488
6106	NC_002578	TAC	2	6	378859	378864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081488
6107	NC_002578	CTGCC	2	10	378947	378956	0 %	20 %	20 %	60 %	16081488
6108	NC_002578	GAA	2	6	379019	379024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081488
6109	NC_002578	CGC	2	6	379061	379066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081488
6110	NC_002578	TC	3	6	379085	379090	0 %	50 %	0 %	50 %	16081488
6111	NC_002578	CTT	2	6	379226	379231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081488
6112	NC_002578	TTTC	2	8	379243	379250	0 %	75 %	0 %	25 %	16081488
6113	NC_002578	CTTTC	2	10	379262	379271	0 %	60 %	0 %	40 %	16081488
6114	NC_002578	TCA	2	6	379309	379314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081488
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6118	NC_002578	CTG	2	6	379685	379690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081488
6119	NC_002578	CTTC	2	8	379696	379703	0 %	50 %	0 %	50 %	16081488
6120	NC_002578	TCA	2	6	379709	379714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081489
6121	NC_002578	TGG	2	6	379743	379748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081489
6122	NC_002578	TGC	2	6	379761	379766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081489
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6124	NC_002578	CCTGG	2	10	379944	379953	0 %	20 %	40 %	40 %	16081489
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