MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000919	GCA	2	6	188103	188108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639159
3502	NC_000919	GGCG	2	8	188131	188138	0 %	0 %	75 %	25 %	15639159
3503	NC_000919	TC	3	6	188163	188168	0 %	50 %	0 %	50 %	15639159
3504	NC_000919	AC	3	6	188255	188260	50 %	0 %	0 %	50 %	15639159
3505	NC_000919	GC	3	6	188326	188331	0 %	0 %	50 %	50 %	15639159
3506	NC_000919	GGC	2	6	188334	188339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639159
3507	NC_000919	GTG	2	6	188344	188349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639159
3508	NC_000919	TGC	2	6	188393	188398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639159
3509	NC_000919	GT	3	6	188414	188419	0 %	50 %	50 %	0 %	15639159
3510	NC_000919	GCA	2	6	188485	188490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639160
3511	NC_000919	ATT	2	6	188495	188500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639160
3512	NC_000919	TCG	2	6	188532	188537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639160
3513	NC_000919	ACGC	2	8	188637	188644	25 %	0 %	25 %	50 %	15639160
3514	NC_000919	TTG	2	6	188713	188718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639160
3515	NC_000919	TTTC	2	8	188725	188732	0 %	75 %	0 %	25 %	15639160
3516	NC_000919	GTG	2	6	188758	188763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639160
3517	NC_000919	AAG	2	6	188768	188773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639160
3518	NC_000919	AGGA	2	8	189111	189118	50 %	0 %	50 %	0 %	15639161
3519	NC_000919	AAG	2	6	189132	189137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639161
3520	NC_000919	CTT	2	6	189165	189170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639161
3521	NC_000919	AGC	2	6	189321	189326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639161
3522	NC_000919	CTC	3	9	189360	189368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639161
3523	NC_000919	CCT	2	6	189408	189413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639161
3524	NC_000919	G	6	6	189417	189422	0 %	0 %	100 %	0 %	15639161
3525	NC_000919	GTG	2	6	189488	189493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639161
3526	NC_000919	GAT	2	6	189523	189528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639161
3527	NC_000919	GC	3	6	189571	189576	0 %	0 %	50 %	50 %	15639161
3528	NC_000919	TGA	2	6	189579	189584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639161
3529	NC_000919	TG	3	6	189678	189683	0 %	50 %	50 %	0 %	15639161
3530	NC_000919	T	6	6	189691	189696	0 %	100 %	0 %	0 %	15639161
3531	NC_000919	TAAC	2	8	189754	189761	50 %	25 %	0 %	25 %	15639161
3532	NC_000919	T	6	6	190022	190027	0 %	100 %	0 %	0 %	15639162
3533	NC_000919	TGC	2	6	190096	190101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639163
3534	NC_000919	GAG	2	6	190109	190114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639163
3535	NC_000919	GC	3	6	190118	190123	0 %	0 %	50 %	50 %	15639163
3536	NC_000919	TGT	2	6	190177	190182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639163
3537	NC_000919	GGTG	2	8	190186	190193	0 %	25 %	75 %	0 %	15639163
3538	NC_000919	GGT	2	6	190201	190206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639163
3539	NC_000919	TG	3	6	190210	190215	0 %	50 %	50 %	0 %	15639163
3540	NC_000919	CGG	2	6	190216	190221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639163
3541	NC_000919	ACT	2	6	190255	190260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639163
3542	NC_000919	TG	3	6	190326	190331	0 %	50 %	50 %	0 %	15639163
3543	NC_000919	TGCAG	2	10	190357	190366	20 %	20 %	40 %	20 %	15639163
3544	NC_000919	ATG	2	6	190368	190373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639163
3545	NC_000919	CT	3	6	190523	190528	0 %	50 %	0 %	50 %	15639163
3546	NC_000919	TTA	2	6	190710	190715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639163
3547	NC_000919	GCG	2	6	190787	190792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639163
3548	NC_000919	GTG	2	6	190880	190885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639163
3549	NC_000919	TGA	2	6	191095	191100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639164
3550	NC_000919	TGG	2	6	191137	191142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639164
3551	NC_000919	GGT	2	6	191155	191160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639164
3552	NC_000919	AAG	2	6	191178	191183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639164
3553	NC_000919	AG	3	6	191261	191266	50 %	0 %	50 %	0 %	15639164
3554	NC_000919	TGCTT	2	10	191275	191284	0 %	60 %	20 %	20 %	15639164
3555	NC_000919	TGG	2	6	191304	191309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639164
3556	NC_000919	TTC	2	6	191332	191337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639164
3557	NC_000919	AGG	2	6	191348	191353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639164
3558	NC_000919	TGC	2	6	191359	191364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639164
3559	NC_000919	GCGCG	2	10	191378	191387	0 %	0 %	60 %	40 %	15639164
3560	NC_000919	GAAG	2	8	191392	191399	50 %	0 %	50 %	0 %	15639164
3561	NC_000919	ATT	2	6	191402	191407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639164
3562	NC_000919	AGC	2	6	191695	191700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639165
3563	NC_000919	GAA	2	6	191738	191743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639165
3564	NC_000919	TCC	2	6	191868	191873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639165
3565	NC_000919	T	7	7	191928	191934	0 %	100 %	0 %	0 %	15639165
3566	NC_000919	AGC	2	6	191946	191951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639165
3567	NC_000919	GGAAGA	2	12	191975	191986	50 %	0 %	50 %	0 %	15639165
3568	NC_000919	C	7	7	191998	192004	0 %	0 %	0 %	100 %	15639165
3569	NC_000919	A	6	6	192037	192042	100 %	0 %	0 %	0 %	15639165
3570	NC_000919	CTC	2	6	192044	192049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639165
3571	NC_000919	GC	3	6	192192	192197	0 %	0 %	50 %	50 %	15639166
3572	NC_000919	CAG	2	6	192212	192217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639166
3573	NC_000919	GC	3	6	192225	192230	0 %	0 %	50 %	50 %	15639166
3574	NC_000919	GGTGAG	2	12	192300	192311	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15639166
3575	NC_000919	A	6	6	192339	192344	100 %	0 %	0 %	0 %	15639166
3576	NC_000919	GAGT	2	8	192356	192363	25 %	25 %	50 %	0 %	15639166
3577	NC_000919	ACA	2	6	192383	192388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639166
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3579	NC_000919	CCA	2	6	192475	192480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639166
3580	NC_000919	GTC	2	6	192495	192500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639166
3581	NC_000919	AAC	2	6	192514	192519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639166
3582	NC_000919	A	6	6	192533	192538	100 %	0 %	0 %	0 %	15639166
3583	NC_000919	TCA	2	6	192559	192564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639166
3584	NC_000919	CG	3	6	192626	192631	0 %	0 %	50 %	50 %	15639166
3585	NC_000919	GCT	2	6	192662	192667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639166
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3587	NC_000919	TCC	2	6	192809	192814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639166
3588	NC_000919	TTTGT	2	10	192860	192869	0 %	80 %	20 %	0 %	15639167
3589	NC_000919	GAG	2	6	192895	192900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639167
3590	NC_000919	A	6	6	192935	192940	100 %	0 %	0 %	0 %	15639167
3591	NC_000919	TAA	2	6	192942	192947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639167
3592	NC_000919	TTGT	2	8	192949	192956	0 %	75 %	25 %	0 %	15639167
3593	NC_000919	CTG	2	6	192975	192980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639167
3594	NC_000919	TCC	2	6	193060	193065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639167
3595	NC_000919	TG	3	6	193067	193072	0 %	50 %	50 %	0 %	15639167
3596	NC_000919	GCG	2	6	193125	193130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639167
3597	NC_000919	GGC	2	6	193264	193269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639167
3598	NC_000919	GCCA	2	8	193270	193277	25 %	0 %	25 %	50 %	15639167
3599	NC_000919	A	6	6	193298	193303	100 %	0 %	0 %	0 %	15639167
3600	NC_000919	GAA	2	6	193310	193315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639167
3601	NC_000919	CCT	2	6	193346	193351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639167
3602	NC_000919	GT	3	6	193457	193462	0 %	50 %	50 %	0 %	15639167
3603	NC_000919	A	7	7	193496	193502	100 %	0 %	0 %	0 %	15639167
3604	NC_000919	AC	3	6	193526	193531	50 %	0 %	0 %	50 %	15639167
3605	NC_000919	T	6	6	193585	193590	0 %	100 %	0 %	0 %	15639167
3606	NC_000919	A	6	6	193808	193813	100 %	0 %	0 %	0 %	15639168
3607	NC_000919	A	7	7	193841	193847	100 %	0 %	0 %	0 %	15639168
3608	NC_000919	GAT	2	6	193856	193861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639168
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3610	NC_000919	ATA	2	6	193941	193946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639168
3611	NC_000919	A	6	6	194072	194077	100 %	0 %	0 %	0 %	15639169
3612	NC_000919	TGC	2	6	194088	194093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639169
3613	NC_000919	GCAG	2	8	194094	194101	25 %	0 %	50 %	25 %	15639169
3614	NC_000919	TTCT	2	8	194104	194111	0 %	75 %	0 %	25 %	15639169
3615	NC_000919	GAGTG	2	10	194136	194145	20 %	20 %	60 %	0 %	15639169
3616	NC_000919	AAG	2	6	194160	194165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639169
3617	NC_000919	TG	4	8	194180	194187	0 %	50 %	50 %	0 %	15639169
3618	NC_000919	T	8	8	194277	194284	0 %	100 %	0 %	0 %	15639169
3619	NC_000919	T	6	6	194375	194380	0 %	100 %	0 %	0 %	15639170
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3622	NC_000919	GTAC	2	8	194609	194616	25 %	25 %	25 %	25 %	15639170
3623	NC_000919	GGT	2	6	194624	194629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639170
3624	NC_000919	GAAG	2	8	194779	194786	50 %	0 %	50 %	0 %	15639170
3625	NC_000919	CGTG	2	8	194795	194802	0 %	25 %	50 %	25 %	15639170
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