MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_000919	T	6	6	1100034	1100039	0 %	100 %	0 %	0 %	15639992
21502	NC_000919	TTG	2	6	1100097	1100102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639992
21503	NC_000919	TTTC	2	8	1100105	1100112	0 %	75 %	0 %	25 %	15639992
21504	NC_000919	T	6	6	1100173	1100178	0 %	100 %	0 %	0 %	15639992
21505	NC_000919	CTTCA	2	10	1100208	1100217	20 %	40 %	0 %	40 %	15639992
21506	NC_000919	TGA	2	6	1100339	1100344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639992
21507	NC_000919	AGC	2	6	1100388	1100393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639992
21508	NC_000919	CAA	2	6	1100402	1100407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639992
21509	NC_000919	TGA	2	6	1100450	1100455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639992
21510	NC_000919	AT	3	6	1100461	1100466	50 %	50 %	0 %	0 %	15639992
21511	NC_000919	TCCG	2	8	1100470	1100477	0 %	25 %	25 %	50 %	15639992
21512	NC_000919	TTCA	2	8	1100937	1100944	25 %	50 %	0 %	25 %	15639993
21513	NC_000919	AGC	2	6	1100956	1100961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639993
21514	NC_000919	T	6	6	1101040	1101045	0 %	100 %	0 %	0 %	15639993
21515	NC_000919	CA	3	6	1101053	1101058	50 %	0 %	0 %	50 %	15639993
21516	NC_000919	CAA	2	6	1101068	1101073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639993
21517	NC_000919	GCA	2	6	1101110	1101115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639993
21518	NC_000919	GCC	2	6	1101133	1101138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639993
21519	NC_000919	CCT	2	6	1101188	1101193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639993
21520	NC_000919	CAA	2	6	1101246	1101251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639993
21521	NC_000919	GCA	2	6	1101349	1101354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639993
21522	NC_000919	GAG	2	6	1101374	1101379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639993
21523	NC_000919	CA	3	6	1101479	1101484	50 %	0 %	0 %	50 %	15639993
21524	NC_000919	TTTCG	2	10	1101524	1101533	0 %	60 %	20 %	20 %	15639993
21525	NC_000919	ACG	2	6	1101561	1101566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639993
21526	NC_000919	GA	3	6	1101600	1101605	50 %	0 %	50 %	0 %	15639993
21527	NC_000919	GCA	2	6	1101607	1101612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639993
21528	NC_000919	CCCCT	2	10	1101669	1101678	0 %	20 %	0 %	80 %	15639993
21529	NC_000919	TTC	2	6	1101690	1101695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639993
21530	NC_000919	TAG	2	6	1101866	1101871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639994
21531	NC_000919	CAC	2	6	1101890	1101895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639994
21532	NC_000919	ACC	2	6	1101988	1101993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639994
21533	NC_000919	GAA	2	6	1102160	1102165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639994
21534	NC_000919	GTT	2	6	1102189	1102194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639994
21535	NC_000919	GC	3	6	1102236	1102241	0 %	0 %	50 %	50 %	15639994
21536	NC_000919	TTCT	2	8	1102256	1102263	0 %	75 %	0 %	25 %	15639994
21537	NC_000919	TAC	2	6	1102403	1102408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639995
21538	NC_000919	AGA	2	6	1102419	1102424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639995
21539	NC_000919	AG	3	6	1102481	1102486	50 %	0 %	50 %	0 %	15639995
21540	NC_000919	TCC	2	6	1102598	1102603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639995
21541	NC_000919	CAC	2	6	1102628	1102633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639995
21542	NC_000919	TAATTC	2	12	1102643	1102654	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15639995
21543	NC_000919	ACT	2	6	1102662	1102667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639995
21544	NC_000919	GCT	2	6	1102672	1102677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639995
21545	NC_000919	TGC	2	6	1102703	1102708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639995
21546	NC_000919	CTT	2	6	1102762	1102767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639995
21547	NC_000919	GATG	2	8	1102835	1102842	25 %	25 %	50 %	0 %	15639995
21548	NC_000919	GCA	2	6	1102869	1102874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639995
21549	NC_000919	TTC	2	6	1102886	1102891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639995
21550	NC_000919	T	7	7	1103035	1103041	0 %	100 %	0 %	0 %	15639996
21551	NC_000919	CTC	2	6	1103214	1103219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639996
21552	NC_000919	CAC	2	6	1103285	1103290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639996
21553	NC_000919	GCG	2	6	1103327	1103332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639996
21554	NC_000919	CTT	2	6	1103348	1103353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639996
21555	NC_000919	AGG	2	6	1103448	1103453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639996
21556	NC_000919	GCA	2	6	1103476	1103481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639996
21557	NC_000919	GAT	2	6	1103505	1103510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639996
21558	NC_000919	GCAC	2	8	1103710	1103717	25 %	0 %	25 %	50 %	15639996
21559	NC_000919	GCA	2	6	1103752	1103757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639996
21560	NC_000919	CATGCA	2	12	1103758	1103769	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15639996
21561	NC_000919	TTC	2	6	1103772	1103777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639996
21562	NC_000919	GTAC	2	8	1103888	1103895	25 %	25 %	25 %	25 %	15639996
21563	NC_000919	ATC	3	9	1104186	1104194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639997
21564	NC_000919	GAG	2	6	1104330	1104335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639997
21565	NC_000919	CTG	2	6	1104339	1104344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639997
21566	NC_000919	AGT	2	6	1104376	1104381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639997
21567	NC_000919	GC	4	8	1104402	1104409	0 %	0 %	50 %	50 %	15639997
21568	NC_000919	CG	3	6	1104422	1104427	0 %	0 %	50 %	50 %	15639997
21569	NC_000919	TGC	2	6	1104446	1104451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639997
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21571	NC_000919	CGC	2	6	1104502	1104507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639998
21572	NC_000919	GC	3	6	1104511	1104516	0 %	0 %	50 %	50 %	15639998
21573	NC_000919	TTC	2	6	1104526	1104531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639998
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21576	NC_000919	CGCTG	2	10	1104667	1104676	0 %	20 %	40 %	40 %	15639998
21577	NC_000919	CCA	2	6	1104702	1104707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639998
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21582	NC_000919	GC	3	6	1104900	1104905	0 %	0 %	50 %	50 %	15639998
21583	NC_000919	GCCC	2	8	1104977	1104984	0 %	0 %	25 %	75 %	15639998
21584	NC_000919	C	6	6	1105083	1105088	0 %	0 %	0 %	100 %	15639998
21585	NC_000919	AG	3	6	1105093	1105098	50 %	0 %	50 %	0 %	15639998
21586	NC_000919	CTGT	2	8	1105120	1105127	0 %	50 %	25 %	25 %	15639998
21587	NC_000919	TGC	2	6	1105129	1105134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639998
21588	NC_000919	CT	3	6	1105148	1105153	0 %	50 %	0 %	50 %	15639998
21589	NC_000919	AC	3	6	1105199	1105204	50 %	0 %	0 %	50 %	15639998
21590	NC_000919	GAG	2	6	1105236	1105241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639998
21591	NC_000919	AGTG	2	8	1105243	1105250	25 %	25 %	50 %	0 %	15639998
21592	NC_000919	TG	3	6	1105268	1105273	0 %	50 %	50 %	0 %	15639998
21593	NC_000919	GCGT	2	8	1105379	1105386	0 %	25 %	50 %	25 %	15639998
21594	NC_000919	GGC	2	6	1105390	1105395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639998
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21598	NC_000919	GGC	2	6	1105685	1105690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639998
21599	NC_000919	C	6	6	1105760	1105765	0 %	0 %	0 %	100 %	15639998
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21601	NC_000919	CT	3	6	1105809	1105814	0 %	50 %	0 %	50 %	15639998
21602	NC_000919	CCT	2	6	1105847	1105852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639998
21603	NC_000919	AGC	2	6	1105870	1105875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639998
21604	NC_000919	CAC	2	6	1105918	1105923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639998
21605	NC_000919	GCA	2	6	1105988	1105993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639998
21606	NC_000919	CAT	2	6	1106001	1106006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639998
21607	NC_000919	CTT	2	6	1106012	1106017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639998
21608	NC_000919	CGA	2	6	1106098	1106103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639998
21609	NC_000919	CG	3	6	1106108	1106113	0 %	0 %	50 %	50 %	15639998
21610	NC_000919	CCA	2	6	1106118	1106123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639998
21611	NC_000919	TC	3	6	1106191	1106196	0 %	50 %	0 %	50 %	15639998
21612	NC_000919	ACCC	2	8	1106248	1106255	25 %	0 %	0 %	75 %	15639998
21613	NC_000919	ACT	2	6	1106258	1106263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639998
21614	NC_000919	AG	3	6	1106272	1106277	50 %	0 %	50 %	0 %	15639998
21615	NC_000919	TAC	2	6	1106289	1106294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639998
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21618	NC_000919	G	6	6	1106396	1106401	0 %	0 %	100 %	0 %	15639999
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21980	NC_000919	CGC	2	6	1126322	1126327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640016
21981	NC_000919	C	6	6	1126339	1126344	0 %	0 %	0 %	100 %	15640016
21982	NC_000919	ACGC	2	8	1126360	1126367	25 %	0 %	25 %	50 %	15640016
21983	NC_000919	CGC	3	9	1126383	1126391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640016
21984	NC_000919	A	6	6	1126418	1126423	100 %	0 %	0 %	0 %	15640017
21985	NC_000919	TGC	2	6	1126446	1126451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640017
21986	NC_000919	CCG	2	6	1126453	1126458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640017
21987	NC_000919	CCA	2	6	1126471	1126476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640017
21988	NC_000919	CGC	2	6	1126509	1126514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640017
21989	NC_000919	CA	3	6	1126526	1126531	50 %	0 %	0 %	50 %	15640017
21990	NC_000919	GC	3	6	1126547	1126552	0 %	0 %	50 %	50 %	15640017
21991	NC_000919	GCA	2	6	1126591	1126596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640017
21992	NC_000919	GCT	2	6	1126633	1126638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640017
21993	NC_000919	GC	5	10	1126681	1126690	0 %	0 %	50 %	50 %	15640017
21994	NC_000919	GTT	2	6	1126706	1126711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640017
21995	NC_000919	CCT	2	6	1126741	1126746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640017
21996	NC_000919	GC	3	6	1126785	1126790	0 %	0 %	50 %	50 %	15640017
21997	NC_000919	C	7	7	1126892	1126898	0 %	0 %	0 %	100 %	15640017
21998	NC_000919	CAG	2	6	1126910	1126915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640017
21999	NC_000919	AGCCCC	2	12	1126941	1126952	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15640017
22000	NC_000919	C	6	6	1127020	1127025	0 %	0 %	0 %	100 %	15640017

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