MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_000919	CGT	2	6	85493	85498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639071
1503	NC_000919	GCA	2	6	85542	85547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639071
1504	NC_000919	CAGA	2	8	85574	85581	50 %	0 %	25 %	25 %	15639071
1505	NC_000919	GTG	2	6	85597	85602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639071
1506	NC_000919	CGTGAA	2	12	85693	85704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15639071
1507	NC_000919	AAG	2	6	85793	85798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639071
1508	NC_000919	A	8	8	85889	85896	100 %	0 %	0 %	0 %	15639072
1509	NC_000919	TGA	2	6	85912	85917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639072
1510	NC_000919	GCA	2	6	85924	85929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639072
1511	NC_000919	CAA	2	6	85939	85944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639072
1512	NC_000919	T	6	6	85955	85960	0 %	100 %	0 %	0 %	15639072
1513	NC_000919	GC	3	6	85987	85992	0 %	0 %	50 %	50 %	15639072
1514	NC_000919	GGAT	2	8	86015	86022	25 %	25 %	50 %	0 %	15639072
1515	NC_000919	ACG	2	6	86024	86029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639072
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1517	NC_000919	GT	3	6	86272	86277	0 %	50 %	50 %	0 %	15639072
1518	NC_000919	A	6	6	86290	86295	100 %	0 %	0 %	0 %	15639072
1519	NC_000919	GC	3	6	86300	86305	0 %	0 %	50 %	50 %	15639072
1520	NC_000919	CCAT	2	8	86322	86329	25 %	25 %	0 %	50 %	15639072
1521	NC_000919	GTG	2	6	86393	86398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639072
1522	NC_000919	GCA	2	6	86405	86410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639072
1523	NC_000919	CCA	2	6	86484	86489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639072
1524	NC_000919	ACC	2	6	86498	86503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639072
1525	NC_000919	AGG	2	6	86509	86514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639072
1526	NC_000919	ATG	2	6	86529	86534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639072
1527	NC_000919	GCACC	2	10	86610	86619	20 %	0 %	20 %	60 %	15639072
1528	NC_000919	AGC	2	6	86674	86679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639072
1529	NC_000919	GGC	2	6	86704	86709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639072
1530	NC_000919	CG	4	8	86726	86733	0 %	0 %	50 %	50 %	15639072
1531	NC_000919	GCC	2	6	86738	86743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639072
1532	NC_000919	T	7	7	86774	86780	0 %	100 %	0 %	0 %	15639072
1533	NC_000919	ATTTGT	2	12	86814	86825	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15639072
1534	NC_000919	ATT	2	6	86875	86880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639072
1535	NC_000919	T	6	6	86936	86941	0 %	100 %	0 %	0 %	15639072
1536	NC_000919	TG	3	6	86952	86957	0 %	50 %	50 %	0 %	15639072
1537	NC_000919	ACGCTT	2	12	87002	87013	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15639072
1538	NC_000919	GTG	2	6	87065	87070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639072
1539	NC_000919	CGCAC	2	10	87071	87080	20 %	0 %	20 %	60 %	15639072
1540	NC_000919	AT	4	8	87103	87110	50 %	50 %	0 %	0 %	15639072
1541	NC_000919	GC	3	6	87133	87138	0 %	0 %	50 %	50 %	15639073
1542	NC_000919	CG	3	6	87173	87178	0 %	0 %	50 %	50 %	15639073
1543	NC_000919	TGC	2	6	87188	87193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639073
1544	NC_000919	CT	3	6	87210	87215	0 %	50 %	0 %	50 %	15639073
1545	NC_000919	GCA	2	6	87241	87246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639073
1546	NC_000919	GGT	2	6	87312	87317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639073
1547	NC_000919	TGA	2	6	87354	87359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639073
1548	NC_000919	TGG	2	6	87389	87394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639073
1549	NC_000919	CA	3	6	87515	87520	50 %	0 %	0 %	50 %	15639073
1550	NC_000919	CTC	2	6	87528	87533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639073
1551	NC_000919	ACT	2	6	87557	87562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639073
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1554	NC_000919	GGC	2	6	87762	87767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639073
1555	NC_000919	CGC	2	6	87882	87887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639073
1556	NC_000919	TGTT	2	8	87905	87912	0 %	75 %	25 %	0 %	15639073
1557	NC_000919	GATC	2	8	87948	87955	25 %	25 %	25 %	25 %	15639073
1558	NC_000919	ATGG	2	8	88064	88071	25 %	25 %	50 %	0 %	15639073
1559	NC_000919	AT	3	6	88133	88138	50 %	50 %	0 %	0 %	15639073
1560	NC_000919	TG	3	6	88214	88219	0 %	50 %	50 %	0 %	15639073
1561	NC_000919	AGGA	2	8	88220	88227	50 %	0 %	50 %	0 %	15639073
1562	NC_000919	TCG	2	6	88233	88238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639073
1563	NC_000919	GC	3	6	88399	88404	0 %	0 %	50 %	50 %	15639073
1564	NC_000919	TCA	2	6	88463	88468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639073
1565	NC_000919	GGA	2	6	88485	88490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639073
1566	NC_000919	T	6	6	88498	88503	0 %	100 %	0 %	0 %	15639073
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1569	NC_000919	AAG	2	6	88669	88674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639073
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1576	NC_000919	GC	3	6	89017	89022	0 %	0 %	50 %	50 %	15639073
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1582	NC_000919	TAC	2	6	89143	89148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639073
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1588	NC_000919	T	6	6	89445	89450	0 %	100 %	0 %	0 %	15639074
1589	NC_000919	T	7	7	89483	89489	0 %	100 %	0 %	0 %	15639074
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1591	NC_000919	GCA	2	6	89531	89536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639074
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1593	NC_000919	TTA	2	6	89592	89597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639074
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1597	NC_000919	TAC	2	6	89803	89808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639075
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1599	NC_000919	TGG	2	6	89960	89965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639075
1600	NC_000919	GCAA	2	8	89978	89985	50 %	0 %	25 %	25 %	15639075
1601	NC_000919	GAA	2	6	89998	90003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639075
1602	NC_000919	A	6	6	90002	90007	100 %	0 %	0 %	0 %	15639075
1603	NC_000919	CGCA	2	8	90037	90044	25 %	0 %	25 %	50 %	15639075
1604	NC_000919	G	6	6	90078	90083	0 %	0 %	100 %	0 %	15639075
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1609	NC_000919	GTA	2	6	90396	90401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639075
1610	NC_000919	AG	3	6	90489	90494	50 %	0 %	50 %	0 %	15639075
1611	NC_000919	CTT	2	6	90539	90544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639075
1612	NC_000919	CTG	2	6	90549	90554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639075
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1614	NC_000919	TTTGC	2	10	90649	90658	0 %	60 %	20 %	20 %	15639076
1615	NC_000919	CTG	2	6	90687	90692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639076
1616	NC_000919	TTGC	2	8	90719	90726	0 %	50 %	25 %	25 %	15639076
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1621	NC_000919	TG	3	6	90803	90808	0 %	50 %	50 %	0 %	15639076
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