MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_000919	TTC	2	6	926892	926897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639840
18003	NC_000919	GCC	2	6	926919	926924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639840
18004	NC_000919	A	6	6	926956	926961	100 %	0 %	0 %	0 %	15639840
18005	NC_000919	GT	3	6	927089	927094	0 %	50 %	50 %	0 %	15639840
18006	NC_000919	TCTCT	2	10	927116	927125	0 %	60 %	0 %	40 %	15639840
18007	NC_000919	CGA	2	6	927187	927192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639840
18008	NC_000919	ACACC	2	10	927223	927232	40 %	0 %	0 %	60 %	15639840
18009	NC_000919	CCA	2	6	927285	927290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639840
18010	NC_000919	GT	3	6	927291	927296	0 %	50 %	50 %	0 %	15639840
18011	NC_000919	T	7	7	927431	927437	0 %	100 %	0 %	0 %	15639840
18012	NC_000919	CGAT	2	8	927531	927538	25 %	25 %	25 %	25 %	15639840
18013	NC_000919	CTGA	2	8	927545	927552	25 %	25 %	25 %	25 %	15639840
18014	NC_000919	CAA	2	6	927580	927585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639840
18015	NC_000919	T	6	6	927614	927619	0 %	100 %	0 %	0 %	15639840
18016	NC_000919	A	6	6	927668	927673	100 %	0 %	0 %	0 %	15639840
18017	NC_000919	GCTC	2	8	927685	927692	0 %	25 %	25 %	50 %	15639840
18018	NC_000919	TTA	2	6	927747	927752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639840
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18020	NC_000919	CTG	2	6	927774	927779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639840
18021	NC_000919	CGTGC	2	10	927782	927791	0 %	20 %	40 %	40 %	15639840
18022	NC_000919	GC	3	6	927813	927818	0 %	0 %	50 %	50 %	15639840
18023	NC_000919	GCT	2	6	927826	927831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639840
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18032	NC_000919	CG	5	10	928284	928293	0 %	0 %	50 %	50 %	15639840
18033	NC_000919	A	6	6	928408	928413	100 %	0 %	0 %	0 %	15639840
18034	NC_000919	AGT	2	6	928481	928486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639840
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18036	NC_000919	CA	4	8	928551	928558	50 %	0 %	0 %	50 %	15639840
18037	NC_000919	TGA	2	6	928594	928599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639840
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18039	NC_000919	ATC	2	6	928727	928732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639840
18040	NC_000919	GA	3	6	928734	928739	50 %	0 %	50 %	0 %	15639840
18041	NC_000919	TCA	2	6	928770	928775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639840
18042	NC_000919	ACAGGC	2	12	928785	928796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639840
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18044	NC_000919	CAG	3	9	929042	929050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639840
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18046	NC_000919	GCA	2	6	929181	929186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639840
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18053	NC_000919	T	6	6	929552	929557	0 %	100 %	0 %	0 %	15639840
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18056	NC_000919	GCT	2	6	929604	929609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639841
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18058	NC_000919	CGA	2	6	929625	929630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639841
18059	NC_000919	GC	3	6	929660	929665	0 %	0 %	50 %	50 %	15639841
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18094	NC_000919	CTGG	2	8	931234	931241	0 %	25 %	50 %	25 %	15639841
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18497	NC_000919	CGTG	2	8	953054	953061	0 %	25 %	50 %	25 %	15639861
18498	NC_000919	CG	3	6	953247	953252	0 %	0 %	50 %	50 %	15639861
18499	NC_000919	T	8	8	953297	953304	0 %	100 %	0 %	0 %	15639861
18500	NC_000919	A	7	7	953369	953375	100 %	0 %	0 %	0 %	15639861

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