MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_000919	TGA	2	6	899958	899963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639818
17503	NC_000919	TGC	2	6	900026	900031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639818
17504	NC_000919	AC	3	6	900032	900037	50 %	0 %	0 %	50 %	15639818
17505	NC_000919	A	6	6	900058	900063	100 %	0 %	0 %	0 %	15639818
17506	NC_000919	AGC	2	6	900084	900089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639818
17507	NC_000919	CG	3	6	900170	900175	0 %	0 %	50 %	50 %	15639819
17508	NC_000919	CTG	2	6	900177	900182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639819
17509	NC_000919	TATCAG	2	12	900257	900268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15639819
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17511	NC_000919	TTC	2	6	900291	900296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639819
17512	NC_000919	TAC	2	6	900428	900433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639819
17513	NC_000919	GCG	2	6	900439	900444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639819
17514	NC_000919	CG	3	6	900447	900452	0 %	0 %	50 %	50 %	15639819
17515	NC_000919	AC	4	8	900525	900532	50 %	0 %	0 %	50 %	15639819
17516	NC_000919	GCG	2	6	900535	900540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639819
17517	NC_000919	GCG	2	6	900555	900560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639819
17518	NC_000919	CG	3	6	900622	900627	0 %	0 %	50 %	50 %	15639819
17519	NC_000919	CGTG	2	8	900660	900667	0 %	25 %	50 %	25 %	15639819
17520	NC_000919	AAC	2	6	900685	900690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639819
17521	NC_000919	GC	3	6	900694	900699	0 %	0 %	50 %	50 %	15639819
17522	NC_000919	TCG	2	6	900753	900758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639819
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17525	NC_000919	CCGTC	2	10	900940	900949	0 %	20 %	20 %	60 %	15639820
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17529	NC_000919	CCG	2	6	901158	901163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639820
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17541	NC_000919	ATT	2	6	901745	901750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639820
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17543	NC_000919	CG	3	6	901884	901889	0 %	0 %	50 %	50 %	15639820
17544	NC_000919	CA	3	6	901930	901935	50 %	0 %	0 %	50 %	15639820
17545	NC_000919	ACT	2	6	901979	901984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639820
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17554	NC_000919	CCT	2	6	902795	902800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639821
17555	NC_000919	GC	3	6	902804	902809	0 %	0 %	50 %	50 %	15639821
17556	NC_000919	CGC	2	6	902812	902817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639821
17557	NC_000919	ACTG	2	8	902822	902829	25 %	25 %	25 %	25 %	15639821
17558	NC_000919	CATA	2	8	902868	902875	50 %	25 %	0 %	25 %	15639821
17559	NC_000919	CTG	2	6	902878	902883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639821
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17561	NC_000919	CCTG	2	8	903215	903222	0 %	25 %	25 %	50 %	15639821
17562	NC_000919	GCA	2	6	903228	903233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639821
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17607	NC_000919	CA	3	6	905318	905323	50 %	0 %	0 %	50 %	15639822
17608	NC_000919	GTA	2	6	905330	905335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639822
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17995	NC_000919	TCC	2	6	926667	926672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639840
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17999	NC_000919	CTT	2	6	926794	926799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639840
18000	NC_000919	GTT	2	6	926856	926861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639840

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