MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_000919	CTA	2	6	821566	821571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639744
16003	NC_000919	GCG	2	6	821599	821604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639744
16004	NC_000919	CG	3	6	821660	821665	0 %	0 %	50 %	50 %	15639744
16005	NC_000919	GCT	2	6	821668	821673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639744
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16009	NC_000919	CCTT	2	8	821911	821918	0 %	50 %	0 %	50 %	15639745
16010	NC_000919	ATC	2	6	821967	821972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639745
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16013	NC_000919	CCT	2	6	822252	822257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639746
16014	NC_000919	TCC	2	6	822314	822319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639747
16015	NC_000919	CTG	2	6	822335	822340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639747
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16017	NC_000919	AC	3	6	822399	822404	50 %	0 %	0 %	50 %	15639747
16018	NC_000919	ACC	2	6	822458	822463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639747
16019	NC_000919	GAA	2	6	822560	822565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639747
16020	NC_000919	CG	4	8	822577	822584	0 %	0 %	50 %	50 %	15639747
16021	NC_000919	CTT	2	6	822589	822594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639747
16022	NC_000919	A	7	7	822605	822611	100 %	0 %	0 %	0 %	15639747
16023	NC_000919	TGA	2	6	822745	822750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639747
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16025	NC_000919	TCGA	2	8	822851	822858	25 %	25 %	25 %	25 %	15639747
16026	NC_000919	ATG	2	6	822875	822880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639747
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16028	NC_000919	TAC	2	6	822895	822900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639747
16029	NC_000919	CGCCC	2	10	823037	823046	0 %	0 %	20 %	80 %	15639747
16030	NC_000919	T	6	6	823080	823085	0 %	100 %	0 %	0 %	15639747
16031	NC_000919	CTGC	2	8	823204	823211	0 %	25 %	25 %	50 %	15639747
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16034	NC_000919	TCTCT	2	10	823375	823384	0 %	60 %	0 %	40 %	15639747
16035	NC_000919	GCA	2	6	823407	823412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639747
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16045	NC_000919	CCGG	2	8	824166	824173	0 %	0 %	50 %	50 %	15639747
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16056	NC_000919	T	7	7	824593	824599	0 %	100 %	0 %	0 %	15639748
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16059	NC_000919	GC	3	6	824687	824692	0 %	0 %	50 %	50 %	15639748
16060	NC_000919	TC	3	6	824706	824711	0 %	50 %	0 %	50 %	15639748
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16496	NC_000919	CCT	2	6	847183	847188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639767
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16498	NC_000919	A	6	6	847273	847278	100 %	0 %	0 %	0 %	15639767
16499	NC_000919	A	7	7	847371	847377	100 %	0 %	0 %	0 %	15639767
16500	NC_000919	CGC	2	6	847396	847401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639767

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