MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000919	GC	3	6	56928	56933	0 %	0 %	50 %	50 %	15639041
1002	NC_000919	T	8	8	56962	56969	0 %	100 %	0 %	0 %	15639041
1003	NC_000919	CT	3	6	56972	56977	0 %	50 %	0 %	50 %	15639041
1004	NC_000919	AGG	2	6	56979	56984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639041
1005	NC_000919	TTG	2	6	57063	57068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639042
1006	NC_000919	TTG	2	6	57123	57128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639042
1007	NC_000919	A	6	6	57168	57173	100 %	0 %	0 %	0 %	15639042
1008	NC_000919	CCA	2	6	57184	57189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639042
1009	NC_000919	TCC	2	6	57278	57283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639042
1010	NC_000919	GAT	2	6	57287	57292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639042
1011	NC_000919	CGC	2	6	57310	57315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639042
1012	NC_000919	CG	4	8	57321	57328	0 %	0 %	50 %	50 %	15639042
1013	NC_000919	ACA	2	6	57402	57407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639042
1014	NC_000919	GAT	2	6	57617	57622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639043
1015	NC_000919	TGC	2	6	57639	57644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639043
1016	NC_000919	ATA	2	6	57708	57713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639043
1017	NC_000919	CAC	2	6	57749	57754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639043
1018	NC_000919	A	6	6	57919	57924	100 %	0 %	0 %	0 %	15639043
1019	NC_000919	GGC	2	6	57989	57994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639043
1020	NC_000919	CAT	2	6	58099	58104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639043
1021	NC_000919	GA	3	6	58186	58191	50 %	0 %	50 %	0 %	15639043
1022	NC_000919	CTG	2	6	58240	58245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639043
1023	NC_000919	CTT	2	6	58246	58251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639043
1024	NC_000919	CCG	2	6	58300	58305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639043
1025	NC_000919	A	8	8	58344	58351	100 %	0 %	0 %	0 %	15639043
1026	NC_000919	AGA	2	6	58376	58381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639043
1027	NC_000919	GTA	2	6	58403	58408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639043
1028	NC_000919	GCG	2	6	58472	58477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639043
1029	NC_000919	GC	3	6	58483	58488	0 %	0 %	50 %	50 %	15639043
1030	NC_000919	TTG	2	6	58828	58833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639044
1031	NC_000919	GCAGG	2	10	58853	58862	20 %	0 %	60 %	20 %	15639044
1032	NC_000919	GTA	3	9	58872	58880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639044
1033	NC_000919	AG	3	6	58908	58913	50 %	0 %	50 %	0 %	15639044
1034	NC_000919	AGT	2	6	58979	58984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639044
1035	NC_000919	ATC	2	6	59121	59126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639044
1036	NC_000919	AGG	2	6	59163	59168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639044
1037	NC_000919	TGA	2	6	59189	59194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639044
1038	NC_000919	CGC	2	6	59197	59202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639044
1039	NC_000919	AGG	2	6	59250	59255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639044
1040	NC_000919	TCA	2	6	59386	59391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639044
1041	NC_000919	GAA	2	6	59592	59597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639045
1042	NC_000919	GC	3	6	59600	59605	0 %	0 %	50 %	50 %	15639045
1043	NC_000919	CAG	2	6	59622	59627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639045
1044	NC_000919	CTGCA	2	10	59833	59842	20 %	20 %	20 %	40 %	15639045
1045	NC_000919	GCT	2	6	59867	59872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639045
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1048	NC_000919	CGG	2	6	59921	59926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639045
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1050	NC_000919	TGA	2	6	59936	59941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639045
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1052	NC_000919	TGC	2	6	59954	59959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639045
1053	NC_000919	GGA	2	6	60042	60047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639045
1054	NC_000919	TGC	2	6	60187	60192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639045
1055	NC_000919	CGTG	2	8	60233	60240	0 %	25 %	50 %	25 %	15639045
1056	NC_000919	TGG	2	6	60266	60271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639045
1057	NC_000919	GT	3	6	60275	60280	0 %	50 %	50 %	0 %	15639045
1058	NC_000919	CTAC	2	8	60315	60322	25 %	25 %	0 %	50 %	15639045
1059	NC_000919	TGTC	2	8	60335	60342	0 %	50 %	25 %	25 %	15639045
1060	NC_000919	TCAAA	2	10	60356	60365	60 %	20 %	0 %	20 %	15639045
1061	NC_000919	GCA	2	6	60394	60399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639045
1062	NC_000919	ATC	2	6	60526	60531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639045
1063	NC_000919	GCGT	2	8	60532	60539	0 %	25 %	50 %	25 %	15639045
1064	NC_000919	GA	3	6	60616	60621	50 %	0 %	50 %	0 %	15639045
1065	NC_000919	CG	3	6	60670	60675	0 %	0 %	50 %	50 %	15639046
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1068	NC_000919	TTGC	2	8	60752	60759	0 %	50 %	25 %	25 %	15639046
1069	NC_000919	CGTG	2	8	60767	60774	0 %	25 %	50 %	25 %	15639046
1070	NC_000919	CAG	2	6	60788	60793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639046
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1072	NC_000919	ATG	2	6	60986	60991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639046
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1074	NC_000919	CT	3	6	61122	61127	0 %	50 %	0 %	50 %	15639046
1075	NC_000919	CG	3	6	61180	61185	0 %	0 %	50 %	50 %	15639046
1076	NC_000919	CG	3	6	61212	61217	0 %	0 %	50 %	50 %	15639046
1077	NC_000919	ATG	2	6	61314	61319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639046
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1082	NC_000919	GCA	2	6	61538	61543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639046
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1085	NC_000919	A	7	7	61791	61797	100 %	0 %	0 %	0 %	15639047
1086	NC_000919	CCA	2	6	61934	61939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639047
1087	NC_000919	C	6	6	61982	61987	0 %	0 %	0 %	100 %	15639047
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1092	NC_000919	AAAT	2	8	62209	62216	75 %	25 %	0 %	0 %	15639047
1093	NC_000919	CAG	2	6	62250	62255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639047
1094	NC_000919	GC	3	6	62313	62318	0 %	0 %	50 %	50 %	15639047
1095	NC_000919	TCG	2	6	62329	62334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639047
1096	NC_000919	TTC	2	6	62364	62369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639047
1097	NC_000919	TGTAAC	2	12	62393	62404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15639047
1098	NC_000919	AAGG	2	8	62523	62530	50 %	0 %	50 %	0 %	15639047
1099	NC_000919	TTC	2	6	62607	62612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639047
1100	NC_000919	GTT	2	6	62625	62630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639047
1101	NC_000919	TGCC	2	8	62634	62641	0 %	25 %	25 %	50 %	15639047
1102	NC_000919	C	6	6	62703	62708	0 %	0 %	0 %	100 %	15639047
1103	NC_000919	GC	3	6	62756	62761	0 %	0 %	50 %	50 %	15639047
1104	NC_000919	CAT	2	6	62787	62792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639047
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1107	NC_000919	CT	3	6	63034	63039	0 %	50 %	0 %	50 %	15639048
1108	NC_000919	GCA	2	6	63075	63080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639048
1109	NC_000919	T	6	6	63107	63112	0 %	100 %	0 %	0 %	15639048
1110	NC_000919	TGCG	2	8	63120	63127	0 %	25 %	50 %	25 %	15639048
1111	NC_000919	TG	3	6	63144	63149	0 %	50 %	50 %	0 %	15639048
1112	NC_000919	TGC	2	6	63157	63162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639048
1113	NC_000919	TGC	2	6	63238	63243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639048
1114	NC_000919	TGT	2	6	63316	63321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639048
1115	NC_000919	TGC	2	6	63373	63378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639048
1116	NC_000919	T	7	7	63379	63385	0 %	100 %	0 %	0 %	15639048
1117	NC_000919	CACT	2	8	63392	63399	25 %	25 %	0 %	50 %	15639048
1118	NC_000919	GGT	2	6	63400	63405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639048
1119	NC_000919	CAG	2	6	63419	63424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639048
1120	NC_000919	GGA	2	6	63461	63466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639048
1121	NC_000919	TTG	2	6	63482	63487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639048
1122	NC_000919	TG	3	6	63519	63524	0 %	50 %	50 %	0 %	15639048
1123	NC_000919	GAA	2	6	63602	63607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639048
1124	NC_000919	GAG	2	6	63632	63637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639048
1125	NC_000919	ATC	2	6	63672	63677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639048
1126	NC_000919	GCAG	2	8	63689	63696	25 %	0 %	50 %	25 %	15639048
1127	NC_000919	T	7	7	63738	63744	0 %	100 %	0 %	0 %	15639048
1128	NC_000919	GCCAC	2	10	63800	63809	20 %	0 %	20 %	60 %	15639048
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1130	NC_000919	TG	3	6	64228	64233	0 %	50 %	50 %	0 %	15639049
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1252	NC_000919	TG	3	6	71249	71254	0 %	50 %	50 %	0 %	15639058
1253	NC_000919	T	7	7	71392	71398	0 %	100 %	0 %	0 %	15639058
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1255	NC_000919	ATCG	2	8	71429	71436	25 %	25 %	25 %	25 %	15639058
1256	NC_000919	TTAC	2	8	71455	71462	25 %	50 %	0 %	25 %	15639058
1257	NC_000919	TTC	2	6	71466	71471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639058
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