MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_000919	TGT	2	6	719235	719240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639642
14002	NC_000919	CTT	2	6	719262	719267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639642
14003	NC_000919	CTT	2	6	719304	719309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639642
14004	NC_000919	CTT	2	6	719403	719408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639642
14005	NC_000919	GCA	2	6	719479	719484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639642
14006	NC_000919	AGA	3	9	719489	719497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639642
14007	NC_000919	TAC	2	6	719503	719508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639642
14008	NC_000919	CGAG	2	8	719523	719530	25 %	0 %	50 %	25 %	15639642
14009	NC_000919	GCA	2	6	719554	719559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639642
14010	NC_000919	TC	4	8	719718	719725	0 %	50 %	0 %	50 %	15639644
14011	NC_000919	CGC	2	6	719799	719804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639644
14012	NC_000919	AAT	2	6	719812	719817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639644
14013	NC_000919	CTT	2	6	719893	719898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639644
14014	NC_000919	CGA	2	6	719912	719917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639644
14015	NC_000919	GGA	2	6	720031	720036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639645
14016	NC_000919	GAA	2	6	720073	720078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639645
14017	NC_000919	CAA	2	6	720093	720098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639645
14018	NC_000919	CTGCA	2	10	720204	720213	20 %	20 %	20 %	40 %	15639645
14019	NC_000919	GAT	2	6	720230	720235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639645
14020	NC_000919	TAA	2	6	720269	720274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639645
14021	NC_000919	AAT	2	6	720353	720358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639645
14022	NC_000919	CTG	2	6	720698	720703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639646
14023	NC_000919	CGG	2	6	720714	720719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639646
14024	NC_000919	ATA	2	6	720880	720885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639646
14025	NC_000919	CTG	2	6	720948	720953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639646
14026	NC_000919	GC	4	8	720964	720971	0 %	0 %	50 %	50 %	15639646
14027	NC_000919	GAG	2	6	720979	720984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639646
14028	NC_000919	AGA	2	6	720985	720990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639646
14029	NC_000919	TGG	2	6	721027	721032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639646
14030	NC_000919	TGCATT	2	12	721206	721217	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15639646
14031	NC_000919	T	8	8	721259	721266	0 %	100 %	0 %	0 %	15639646
14032	NC_000919	TAC	2	6	721326	721331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639646
14033	NC_000919	TC	3	6	721395	721400	0 %	50 %	0 %	50 %	15639646
14034	NC_000919	GAC	2	6	721423	721428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639646
14035	NC_000919	AGCG	2	8	721452	721459	25 %	0 %	50 %	25 %	15639646
14036	NC_000919	ATC	2	6	721461	721466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639646
14037	NC_000919	GCT	2	6	721472	721477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639646
14038	NC_000919	CTGT	2	8	721552	721559	0 %	50 %	25 %	25 %	15639646
14039	NC_000919	TG	3	6	721568	721573	0 %	50 %	50 %	0 %	15639646
14040	NC_000919	TCC	2	6	721595	721600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639646
14041	NC_000919	CCG	2	6	721673	721678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639647
14042	NC_000919	TAA	2	6	721718	721723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639647
14043	NC_000919	TCA	2	6	721738	721743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639647
14044	NC_000919	TGT	2	6	721848	721853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639647
14045	NC_000919	A	6	6	721863	721868	100 %	0 %	0 %	0 %	15639647
14046	NC_000919	GT	3	6	721879	721884	0 %	50 %	50 %	0 %	15639647
14047	NC_000919	GCC	2	6	721933	721938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639647
14048	NC_000919	ACAGC	2	10	722006	722015	40 %	0 %	20 %	40 %	15639647
14049	NC_000919	TCCA	2	8	722026	722033	25 %	25 %	0 %	50 %	15639647
14050	NC_000919	CCTG	2	8	722074	722081	0 %	25 %	25 %	50 %	15639647
14051	NC_000919	CT	3	6	722105	722110	0 %	50 %	0 %	50 %	15639647
14052	NC_000919	TGC	2	6	722139	722144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639647
14053	NC_000919	TCC	2	6	722182	722187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639647
14054	NC_000919	TGAT	2	8	722293	722300	25 %	50 %	25 %	0 %	15639647
14055	NC_000919	CCA	2	6	722306	722311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639647
14056	NC_000919	CCA	2	6	722318	722323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639647
14057	NC_000919	GGC	2	6	722331	722336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639647
14058	NC_000919	GAA	2	6	722446	722451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639647
14059	NC_000919	CCCATC	2	12	722460	722471	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15639647
14060	NC_000919	TTG	2	6	722494	722499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639647
14061	NC_000919	A	7	7	722517	722523	100 %	0 %	0 %	0 %	15639647
14062	NC_000919	CAC	2	6	722706	722711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639647
14063	NC_000919	GTT	2	6	722731	722736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639647
14064	NC_000919	CTCATC	2	12	722811	722822	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15639647
14065	NC_000919	CCA	2	6	722864	722869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639647
14066	NC_000919	TGA	3	9	723037	723045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639647
14067	NC_000919	ACAG	2	8	723112	723119	50 %	0 %	25 %	25 %	15639647
14068	NC_000919	GCCA	2	8	723125	723132	25 %	0 %	25 %	50 %	15639647
14069	NC_000919	TCC	2	6	723169	723174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639647
14070	NC_000919	GTCT	2	8	723240	723247	0 %	50 %	25 %	25 %	15639647
14071	NC_000919	GAG	2	6	723267	723272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639647
14072	NC_000919	CG	3	6	723286	723291	0 %	0 %	50 %	50 %	15639647
14073	NC_000919	CGAA	2	8	723368	723375	50 %	0 %	25 %	25 %	15639647
14074	NC_000919	GGC	2	6	723392	723397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639647
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14076	NC_000919	GCA	2	6	723537	723542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639647
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14078	NC_000919	CG	3	6	723733	723738	0 %	0 %	50 %	50 %	15639648
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14080	NC_000919	AG	3	6	723809	723814	50 %	0 %	50 %	0 %	15639648
14081	NC_000919	CGA	2	6	723815	723820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639648
14082	NC_000919	CG	3	6	723843	723848	0 %	0 %	50 %	50 %	15639648
14083	NC_000919	AAG	2	6	723862	723867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639648
14084	NC_000919	CACG	2	8	723997	724004	25 %	0 %	25 %	50 %	15639648
14085	NC_000919	AC	3	6	724022	724027	50 %	0 %	0 %	50 %	15639648
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14087	NC_000919	CAA	2	6	724070	724075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639648
14088	NC_000919	CCTGC	2	10	724088	724097	0 %	20 %	20 %	60 %	15639648
14089	NC_000919	CTC	2	6	724131	724136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639648
14090	NC_000919	CTT	2	6	724298	724303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639649
14091	NC_000919	CG	3	6	724312	724317	0 %	0 %	50 %	50 %	15639649
14092	NC_000919	TGG	2	6	724357	724362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639649
14093	NC_000919	CGTA	2	8	724512	724519	25 %	25 %	25 %	25 %	15639649
14094	NC_000919	GCA	2	6	724546	724551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639649
14095	NC_000919	G	6	6	724611	724616	0 %	0 %	100 %	0 %	15639649
14096	NC_000919	T	7	7	724714	724720	0 %	100 %	0 %	0 %	15639649
14097	NC_000919	TAGTG	2	10	724747	724756	20 %	40 %	40 %	0 %	15639649
14098	NC_000919	TCG	2	6	724878	724883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639649
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14101	NC_000919	GC	3	6	725066	725071	0 %	0 %	50 %	50 %	15639649
14102	NC_000919	GAA	2	6	725076	725081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639649
14103	NC_000919	AC	3	6	725112	725117	50 %	0 %	0 %	50 %	15639649
14104	NC_000919	GTT	2	6	725147	725152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639649
14105	NC_000919	C	6	6	725570	725575	0 %	0 %	0 %	100 %	15639650
14106	NC_000919	GCG	2	6	725578	725583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639650
14107	NC_000919	TGC	2	6	725664	725669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639650
14108	NC_000919	TCA	2	6	725681	725686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639650
14109	NC_000919	CTGG	2	8	725820	725827	0 %	25 %	50 %	25 %	15639650
14110	NC_000919	GGT	2	6	725845	725850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639650
14111	NC_000919	GGT	2	6	725877	725882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639650
14112	NC_000919	GTGTGG	2	12	725896	725907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639650
14113	NC_000919	CTCG	2	8	725925	725932	0 %	25 %	25 %	50 %	15639650
14114	NC_000919	CCT	2	6	725970	725975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639650
14115	NC_000919	GAA	2	6	726003	726008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639650
14116	NC_000919	CA	4	8	726027	726034	50 %	0 %	0 %	50 %	15639650
14117	NC_000919	GC	3	6	726062	726067	0 %	0 %	50 %	50 %	15639650
14118	NC_000919	TAC	2	6	726099	726104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639650
14119	NC_000919	GAT	2	6	726120	726125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639650
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14121	NC_000919	GA	3	6	726223	726228	50 %	0 %	50 %	0 %	15639650
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14123	NC_000919	GGT	2	6	726250	726255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639650
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14244	NC_000919	TATTT	2	10	732114	732123	20 %	80 %	0 %	0 %	15639656
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14496	NC_000919	CGT	2	6	744453	744458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639667
14497	NC_000919	TCC	2	6	744520	744525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639667
14498	NC_000919	AAGG	2	8	744615	744622	50 %	0 %	50 %	0 %	15639667
14499	NC_000919	GA	3	6	744667	744672	50 %	0 %	50 %	0 %	15639667
14500	NC_000919	TGC	2	6	744852	744857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639667

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