MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 22198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_000919	GGCGCA	2	12	668420	668431	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15639603
13002	NC_000919	A	6	6	668431	668436	100 %	0 %	0 %	0 %	15639603
13003	NC_000919	ATG	2	6	668457	668462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639603
13004	NC_000919	CAG	2	6	668466	668471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639603
13005	NC_000919	GC	3	6	668541	668546	0 %	0 %	50 %	50 %	15639603
13006	NC_000919	CAC	2	6	668592	668597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639603
13007	NC_000919	CAGCG	2	10	668705	668714	20 %	0 %	40 %	40 %	15639604
13008	NC_000919	TGC	2	6	668739	668744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639604
13009	NC_000919	CT	4	8	668829	668836	0 %	50 %	0 %	50 %	15639604
13010	NC_000919	ACA	2	6	668889	668894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639604
13011	NC_000919	T	6	6	668901	668906	0 %	100 %	0 %	0 %	15639604
13012	NC_000919	TCA	2	6	668985	668990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639604
13013	NC_000919	ACA	2	6	669033	669038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639604
13014	NC_000919	GC	3	6	669039	669044	0 %	0 %	50 %	50 %	15639604
13015	NC_000919	ATC	2	6	669053	669058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639604
13016	NC_000919	GGT	2	6	669073	669078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639604
13017	NC_000919	CG	3	6	669093	669098	0 %	0 %	50 %	50 %	15639604
13018	NC_000919	GTG	2	6	669116	669121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639604
13019	NC_000919	A	7	7	669196	669202	100 %	0 %	0 %	0 %	15639604
13020	NC_000919	TGAC	2	8	669213	669220	25 %	25 %	25 %	25 %	15639604
13021	NC_000919	ATTTT	2	10	669228	669237	20 %	80 %	0 %	0 %	15639604
13022	NC_000919	CG	3	6	669241	669246	0 %	0 %	50 %	50 %	15639604
13023	NC_000919	CG	3	6	669287	669292	0 %	0 %	50 %	50 %	15639604
13024	NC_000919	TTG	2	6	669354	669359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639604
13025	NC_000919	CGCA	2	8	669360	669367	25 %	0 %	25 %	50 %	15639604
13026	NC_000919	CCT	2	6	669393	669398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639604
13027	NC_000919	GC	3	6	669418	669423	0 %	0 %	50 %	50 %	15639604
13028	NC_000919	AAACG	2	10	669502	669511	60 %	0 %	20 %	20 %	15639605
13029	NC_000919	GC	3	6	669537	669542	0 %	0 %	50 %	50 %	15639605
13030	NC_000919	AGT	2	6	669546	669551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639605
13031	NC_000919	GCACCG	2	12	669567	669578	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15639605
13032	NC_000919	CAG	2	6	669652	669657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639605
13033	NC_000919	ACC	2	6	669681	669686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639605
13034	NC_000919	CGAA	2	8	669696	669703	50 %	0 %	25 %	25 %	15639605
13035	NC_000919	GCG	2	6	669938	669943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639606
13036	NC_000919	CCT	2	6	670004	670009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639606
13037	NC_000919	GA	3	6	670085	670090	50 %	0 %	50 %	0 %	15639606
13038	NC_000919	CG	3	6	670099	670104	0 %	0 %	50 %	50 %	15639606
13039	NC_000919	CACG	2	8	670107	670114	25 %	0 %	25 %	50 %	15639606
13040	NC_000919	CAC	2	6	670134	670139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639606
13041	NC_000919	CTC	2	6	670171	670176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639606
13042	NC_000919	TTC	2	6	670184	670189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639606
13043	NC_000919	AAACG	2	10	670291	670300	60 %	0 %	20 %	20 %	15639607
13044	NC_000919	GC	3	6	670326	670331	0 %	0 %	50 %	50 %	15639607
13045	NC_000919	AGT	2	6	670335	670340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639607
13046	NC_000919	GCACCG	2	12	670356	670367	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15639607
13047	NC_000919	CCT	2	6	670419	670424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639607
13048	NC_000919	GCT	2	6	670492	670497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639607
13049	NC_000919	GAAA	2	8	670526	670533	75 %	0 %	25 %	0 %	15639607
13050	NC_000919	CGC	2	6	670573	670578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639607
13051	NC_000919	TAC	2	6	670593	670598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639607
13052	NC_000919	CCA	2	6	670722	670727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639607
13053	NC_000919	CCG	2	6	670817	670822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639607
13054	NC_000919	GA	4	8	670853	670860	50 %	0 %	50 %	0 %	15639607
13055	NC_000919	CGC	2	6	670867	670872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639607
13056	NC_000919	GC	3	6	670959	670964	0 %	0 %	50 %	50 %	15639607
13057	NC_000919	ACC	2	6	671035	671040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639607
13058	NC_000919	AGCA	2	8	671115	671122	50 %	0 %	25 %	25 %	15639608
13059	NC_000919	TTCA	2	8	671202	671209	25 %	50 %	0 %	25 %	15639608
13060	NC_000919	TAA	2	6	671228	671233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639608
13061	NC_000919	CAC	2	6	671314	671319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639608
13062	NC_000919	GGTG	2	8	671459	671466	0 %	25 %	75 %	0 %	15639608
13063	NC_000919	CAAAAT	2	12	671507	671518	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15639608
13064	NC_000919	CGCAG	2	10	671527	671536	20 %	0 %	40 %	40 %	15639608
13065	NC_000919	GCA	2	6	671537	671542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639608
13066	NC_000919	CCG	2	6	671567	671572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639608
13067	NC_000919	AGC	2	6	671617	671622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639608
13068	NC_000919	AGC	2	6	671668	671673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639608
13069	NC_000919	GACT	2	8	671692	671699	25 %	25 %	25 %	25 %	15639608
13070	NC_000919	CCT	2	6	672085	672090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639608
13071	NC_000919	TGTTT	2	10	672108	672117	0 %	80 %	20 %	0 %	15639608
13072	NC_000919	TCGT	2	8	672118	672125	0 %	50 %	25 %	25 %	15639608
13073	NC_000919	TGC	2	6	672151	672156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639608
13074	NC_000919	AGC	2	6	672190	672195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639608
13075	NC_000919	GTG	2	6	672256	672261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639608
13076	NC_000919	AGGA	2	8	672289	672296	50 %	0 %	50 %	0 %	15639608
13077	NC_000919	CCGGA	2	10	672364	672373	20 %	0 %	40 %	40 %	15639608
13078	NC_000919	CA	3	6	672452	672457	50 %	0 %	0 %	50 %	15639608
13079	NC_000919	GGAA	2	8	672511	672518	50 %	0 %	50 %	0 %	15639608
13080	NC_000919	AGA	2	6	672556	672561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639608
13081	NC_000919	CAGCTG	2	12	672586	672597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15639608
13082	NC_000919	CGG	2	6	672626	672631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639608
13083	NC_000919	TTC	2	6	672725	672730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639608
13084	NC_000919	GAGT	2	8	672777	672784	25 %	25 %	50 %	0 %	15639608
13085	NC_000919	AGC	2	6	672802	672807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639608
13086	NC_000919	CCTG	2	8	672843	672850	0 %	25 %	25 %	50 %	15639608
13087	NC_000919	CACT	2	8	672853	672860	25 %	25 %	0 %	50 %	15639608
13088	NC_000919	CTC	2	6	672865	672870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639608
13089	NC_000919	C	8	8	672885	672892	0 %	0 %	0 %	100 %	15639608
13090	NC_000919	CAG	2	6	672976	672981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639609
13091	NC_000919	AG	3	6	672994	672999	50 %	0 %	50 %	0 %	15639609
13092	NC_000919	TCT	2	6	673032	673037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639609
13093	NC_000919	GCA	2	6	673118	673123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639609
13094	NC_000919	CAC	2	6	673228	673233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639609
13095	NC_000919	CCG	2	6	673259	673264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639609
13096	NC_000919	TTA	2	6	673283	673288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639609
13097	NC_000919	GGTG	2	8	673359	673366	0 %	25 %	75 %	0 %	15639609
13098	NC_000919	AGA	2	6	673489	673494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639609
13099	NC_000919	AC	3	6	673558	673563	50 %	0 %	0 %	50 %	15639609
13100	NC_000919	ACGC	2	8	673599	673606	25 %	0 %	25 %	50 %	15639609
13101	NC_000919	CTG	2	6	673630	673635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639609
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13103	NC_000919	CTT	2	6	673668	673673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639609
13104	NC_000919	CAT	2	6	673723	673728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639609
13105	NC_000919	TGC	2	6	673811	673816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639609
13106	NC_000919	ATT	2	6	673885	673890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639609
13107	NC_000919	T	6	6	673889	673894	0 %	100 %	0 %	0 %	15639609
13108	NC_000919	CAC	2	6	673963	673968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639609
13109	NC_000919	GCA	2	6	673986	673991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639609
13110	NC_000919	GCG	2	6	674031	674036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639609
13111	NC_000919	CGG	2	6	674044	674049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639609
13112	NC_000919	GC	3	6	674157	674162	0 %	0 %	50 %	50 %	15639609
13113	NC_000919	TG	3	6	674288	674293	0 %	50 %	50 %	0 %	15639609
13114	NC_000919	CAG	2	6	674401	674406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639609
13115	NC_000919	TCT	2	6	674459	674464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639609
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13118	NC_000919	GCC	2	6	674665	674670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639609
13119	NC_000919	TCC	2	6	674705	674710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639609
13120	NC_000919	TTC	2	6	674771	674776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639609
13121	NC_000919	AGTGT	2	10	674802	674811	20 %	40 %	40 %	0 %	15639609
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